Jakob R. Winther
Professor
Biomolecular Sciences
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
Kommentarer til publikationsliste
Publikationslisten gælder kun fra ansættelse på Københavns Universitet, Feb 2005. Der ligger 45 publikationer før dette tidspunkt.- 2023
- Udgivet
Global analysis of multi-mutants to improve protein function
Johansson, Kristoffer Enøe, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 8, 15 s., 168034.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Co-evolution of drug resistance and broadened substrate recognition in HIV protease variants isolated from an Escherichia coli genetic selection system
Koivisto, J. M., Poulsen, N. R., Larsen, B. S., Weibull, M. G. M., Stein, Amelie, Doro, F., Winther, Jakob R., Lindorff-Larsen, Kresten & Willemoës, Martin, 2022, I: The Biochemical journal. 479, 4, s. 479-501Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Engineering Bifidobacterium longum Endo-α-N-acetylgalactosaminidase for Neu5Acα2-3Ga1β1-3Ga1NAc reactivity on Fetuin
Hansen, D. K., Hansen, A. L., Koivisto, J. M., Shuoker, B., Abou Hachem, M., Winther, Jakob R. & Willemoës, Martin, 2022, I: Archives of Biochemistry and Biophysics. 725, 8 s., 109280.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Increasing protein stability by inferring substitution effects from high-throughput experiments
Norrild, R. K., Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Morth, J. P., Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 11, 11 s., 100333.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The functional role of the autolysis loop in the regulation of factor X upon hemostatic response
Bonde, A. C., Lund, J., Hansen, J. J., Winther, Jakob R., Nielsen, P. F., Zahn, S., Tiainen, P., Olsen, O. H., Petersen, H. H. & Rose Bjelke, J., 2022, I: Journal of Thrombosis and Haemostasis. 20, 3, s. 589-599 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
VM i molekylære puslespil
Abildgaard, A. B., Winther, Jakob R., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 16 apr. 2021, I: Weekendavisen: Ideer. 15, s. 11Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling
- Udgivet
Molekylære stavefejl
Abildgaard, A. B., Winther, Jakob R., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 28 jan. 2021, I: Weekendavisen, Ideer.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling
- Udgivet
Charge Engineering Reveals the Roles of Ionizable Side Chains in Electrospray Ionization Mass Spectrometry
Abramsson, M. L., Sahin, C., Hopper, J. T. S., Branca, R. M. M., Danielsson, J., Xu, M., Chandler, S. A., Österlund, N., Ilag, L. L., Leppert, A., Costeira-Paulo, J., Lang, L., Teilum, K., Laganowsky, A., Benesch, J. L. P., Oliveberg, M., Robinson, C. V., Marklund, E. G., Allison, T. M., Winther, J. R. & 1 flere, , 2021, I: JACS Au. 1, 12, s. 2385-2393 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Charge Interactions in a Highly Charge-Depleted Protein
Hervø-Hansen, S., Højgaard, C., Johansson, Kristoffer Enøe, Wang, Yong, Wahni, K., Young, D., Messens, J., Teilum, Kaare, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: Journal of the American Chemical Society. 143, 6, s. 2500-2508 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational and Experimental Assessment of Backbone Templates for Computational Redesign of the Thioredoxin Fold
Marin, Frederikke Isa, Johansson, Kristoffer Enøe, O'Shea, Charlotte, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2021, I: The Journal of Physical Chemistry B. 125, 40, s. 11141-11149Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Flash properties of Gaussia luciferase are the result of covalent inhibition after a limited number of cycles
Dijkema, F. M., Nordentoft, M. K., Didriksen, A. K., Corneliussen, A. S., Willemoës, Martin & Winther, Jakob R., 2021, I: Protein Science. 30, 3, s. 638-649 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rational Protein Engineering to Increase the Activity and Stability of IsPETase Using the PROSS Algorithm
Rennison, A., Winther, Jakob R. & Varrone, C., 2021, I: Polymers. 13, 22, 11 s., 3884.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substitutional landscape of a split fluorescent protein fragment using high-density peptide microarrays
Antonescu, O. N., Rasmussen, A., Damm, N. A. M., Heidemann, Ditte Fogh, Popov, R., Nesterov-Mueller, A., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 2, 17 s., e0241461.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Mutations in a Single Signaling Pathway Allow Cell Growth in Heavy Water
Kampmeyer, Caroline, Johansen, Jens Vilstrup, Holmberg, Christian, Karlson, M., Andersen, Sarah Gersing, Nunes Bordallo, Heloisa, Kragelund, Birthe Brandt, Lerche, M. H., Jourdain, I., Winther, Jakob R. & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2020, I: A C S Synthetic Biology. 9, 4, s. 733-748 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Improving folding properties of computationally designed proteins
Bjerre, B., Nissen, J., Madsen, M., Kamarauskaite, J., Norrild, R. K., Holm, Peter Christoffer, Nordentoft, M. K., O'Shea, Charlotte, Willemoës, Martin, Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 13 dec. 2019, I: Protein Engineering Design and Selection (Print). 32, 3, s. 145-151 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shining light on split fluorescent protein fitness landscapes using peptide array-based deep substitutional scanning
ANTONESCU, O., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 30 jun. 2019.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pulmonary effects of nanofibrillated celluloses in mice suggest that carboxylation lowers the inflammatory and acute phase responses
Hadrup, N., Knudsen, K. B., Berthing, T., Wolff, H., Bengtson, S., Kofoed, Christian, Espersen, R., Højgaard, C., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin, Wedin, I., Nuopponen, M., Alenius, H., Norppa, H., Wallin, H. & Vogel, U., 2019, I: Environmental Toxicology and Pharmacology. 66, s. 116-125 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Steady state kinetic analysis of O-linked GalNAc glycan release catalyzed by endo-α-N-acetylgalactosaminidase
Hansen, D. K., Winther, Jakob R. & Willemoës, Martin, 2019, I: Carbohydrate Research. 480, s. 54-60Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Comprehensive mapping of GFP structure-function relationship using high-density peptide arrays
Antonescu, O., Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 10 jul. 2018.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Robust Proton Flux (pHlux) Assay for Studying the Function and Inhibition of the Influenza A M2 Proton Channel
Santner, P., Martins, J. M. D. S., Laursen, J. S., Behrendt, L., Riber, Leise, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5949-5956Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Can a Charged Surfactant Unfold an Uncharged Protein?
Højgaard, C., Sørensen, H. V., Pedersen, J. S., Winther, Jakob R. & Otzen, D. E., 2018, I: Biophysical Journal. 115, 11, s. 2081-2086 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Editorial overview: A perspective on protein evolution
Hoecker, B. & Winther, Jakob R., 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. viii-ix 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nanofibrillated cellulose causes acute pulmonary inflammation that subsides within a month
Ilves, M., Vilske, S., Aimonen, K., Lindberg, H. K., Pesonen, S., Wedin, I., Nuopponen, M., Vanhala, E., Højgaard, C., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin, Vogel, U., Wolff, H., Norppa, H., Savolainen, K. & Alenius, H., 2018, I: Nanotoxicology. 12, 7, s. 729-746 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein evolution: Hacking an enzyme
Johansson, Kristoffer Enøe & Winther, Jakob R., 2018, I: Nature Chemical Biology. 14, 3, s. 202-204 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Random mutagenesis analysis of the Influenza A M2 proton channel reveals novel resistance mutants
Santner, P., Martins, J. M. D. S., Kampmeyer, Caroline, Hartmann-Petersen, Rasmus, Laursen, J. S., Stein, Amelie, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5957-5968Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Evolution i overhalingsbanen
Abildgaard, A. B., Hartmann-Petersen, Rasmus, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 15 dec. 2017, I: Weekendavisen. 2017, 50, s. Ideer: 13 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling
- Udgivet
Endoplasmic reticulum transport of glutathione by Sec61 is regulated by Ero1 and Bip
Ponsero, A. J., Igbaria, A., Darch, M. A., Miled, S., Outten, C. E., Winther, Jakob R., Palais, G., D'Autréaux, B., Delaunay-Moisan, A. & Toledano, M. B., 21 sep. 2017, I: Molecular Cell. 67, 6, s. 962-973.e5 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Positive staining for cellulose in oral pulse granuloma
Virkkunen, S., Wolff, H., Haglund, C., Højgaard, C., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin, Vogel, U. & Hagström, J., apr. 2017, I: Oral Surgery, Oral Medicine, Oral Pathology and Oral Radiology. 123, 4, s. 464-467 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the antigenic response to multiplexed immunizations in a chicken model of antibody production
Kousted, T. M., Kalliokoski, Otto, Christensen, S. K., Winther, Jakob R. & Hau, Jann, mar. 2017, I: Heliyon. 3, 3, 19 s., e00267.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
A soluble, folded protein without charged amino acid residues
Højgaard, C., Kofoed, Christian, Espersen, R., Johansson, Kristoffer Enøe, Villa, M., Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Teilum, Kaare & Winther, Jakob R., 2016, I: Biochemistry. 55, 28, s. 3949–3956 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template
Johansson, Kristoffer Enøe, Johansen, Nicolai Tidemand, Christensen, S., Horowitz, S., Bardwell, J. C. A., Olsen, Johan Gotthardt, Willemoës, Martin, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, Thomas Wim & Winther, Jakob R., 2016, I: Journal of Molecular Biology. 428, 21, s. 4361-4377 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
Mutational analysis of divalent metal ion binding in the active site of class II α-mannosidase from Sulfolobus solfataricus
Hansen, D., Webb, H., Nielsen, J. W., Harris, P., Winther, Jakob R. & Willemoës, Martin, 2015, I: Biochemistry. 54, 11, s. 2032-2039 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Visualization of nanofibrillar cellulose in biological tissues using a biotinylated carbohydrate binding module of β-1,4-Glycanase
Knudsen, K. B., Kofoed, Christian, Espersen, R., Højgaard, C., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin, Wedin, I., Nuopponen, M., Vilske, S., Aimonen, K., Weydahl, I. E. K., Alenius, H., Norppa, H., Wolff, H., Wallin, E. H. R. & Vogel, U., 2015, I: Chemical Research in Toxicology. 28, 8, s. 1627-1635 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
In Silico prediction of mutant HIV-1 proteases cleaving a target sequence
Jensen, Jan Halborg, Willemoës, Martin, Winther, Jakob R. & De Vico, L., 2014, I: P L o S One. 9, 5, 11 s., 5.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Catalytic site interactions in yeast OMP synthase
Hansen, M. R., Barr, E. W., Jensen, K. F., Willemoës, Martin, Grubmeyer, C. & Winther, Jakob R., 2014, I: Archives of Biochemistry and Biophysics. 542, s. 28-38 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Non-invasive in-cell determination of free cytosolic [NAD+]/[NADH] ratios using hyperpolarized glucose show large variations in metabolic phenotypes
Christensen, Caspar Elo, Karlsson, M., Winther, Jakob R., Jensen, P. R. & Lerche, M. H., 2014, I: The Journal of Biological Chemistry. 289, 4, s. 2344-2352 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantification of thiols and disulfides
Winther, Jakob R. & Thorpe, C., 2014, I: BBA General Subjects. 1840, 2, s. 838-846 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris
Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D., Winther, Jakob R. & Kühl, Michael, 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The pKa value and accessibility of cysteine residues are key determinants for protein substrate discrimination by glutaredoxin
Jensen, K. S., Pedersen, J. T., Winther, Jakob R. & Teilum, Kaare, 2014, I: Biochemistry. 53, 15, s. 2533-2540 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
Intracellular glutathione pools are heterogeneously concentrated
Montero, D., Tachibana, C., Winther, Jakob R. & Appenzeller-Herzog, C., 2013, I: Redox Biology. 1, 1, s. 508-513 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying changes in the cellular thiol-disulfide status during differentiation of B cells into antibody-secreting plasma cells
Hansen, R. R. E., Otsu, M., Braakman, I. & Winther, Jakob R., 2013, I: International Journal of Cell Biology. 2013, 10 s., 898563.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Redox control: a black hole for oxidized glutathione
Winther, Jakob R. & Jakob, U., 2013, I: Nature Chemical Biology. 9, 2, s. 69-70 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Saccharopepsin
Winther, Jakob R., Webb, H. & Kay, J., 2013, Handbook of Proteolytic Enzymes. Rawlings, N. D. & Salvesen, G. (red.). Third Edition udg. Academic Press, Bind 1. s. 128-133 6 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
A fluorescent probe which allows highly specific thiol labeling at low pH
Nielsen, J. W., Jensen, K. S., Hansen, R. R. E., Gotfredsen, C. H. & Winther, Jakob R., 2012, I: Analytical Biochemistry. 421, 1, s. 115-120 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metal-ion dependent catalytic properties of Sulfolobus solfataricus class II α-mannosidase
Nielsen, J. W., Poulsen, N. R., Johnsson, A. M. S., Winther, Jakob R., Stipp, S. L. S. & Willemoës, Martin, 2012, I: Biochemistry. 51, 40, s. 8039-8046 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Polysaccharide effects on calcite growth: the influence of composition and branching
Nielsen, J. W., Sand, Karina Krarup, Pedersen, C. S., Lakshtanov, L. Z., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Stipp, S. L. S., 2012, I: Crystal Growth & Design. 12, 10, s. 4906-4910 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The human selenoprotein VCP-interacting membrane protein (VIMP) is non-globular and harbors a reductase function in an intrinsically disordered region
Christensen, L. C., Jensen, N. W., Lages Lino Vala, A., Kamarauskaite, J., Johansson, L. C., Winther, Jakob R., Hofmann, K., Teilum, Kaare & Ellgaard, Lars, 2012, I: Journal of Biological Chemistry. 287, 31, s. 26388-26399 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
Millisecond dynamics in glutaredoxin during catalytic turnover is dependent on substrate binding and absent in the resting states
Jensen, K. S., Winther, Jakob R. & Teilum, Kaare, 2011, I: Journal of the American Chemical Society. 133, 9, s. 3034-42 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Trisulfides in Proteins
Nielsen, R. W., Tachibana, C., Hansen, N. E. & Winther, Jakob R., 2011, I: Antioxidants & Redox Signaling. 15, 1, s. 67-75 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5143
Flest downloads
-
1608
downloads
In Silico prediction of mutant HIV-1 proteases cleaving a target sequence
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
266
downloads
A soluble, folded protein without charged amino acid residues
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
225
downloads
Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet