Josefin Stiller

Josefin Stiller

Adjunkt


  1. 2024
  2. Udgivet

    A region of suppressed recombination misleads neoavian phylogenomics

    Mirarab, S., Rivas-González, I., Feng, S., Stiller, Josefin, Fang, Q., Mai, U., Hickey, G., Chen, G., Brajuka, N., Fedrigo, O., Formenti, G., Wolf, J. B. W., Howe, K., Antunes, A., Schierup, M. H., Paten, B., Jarvis, E. D., KU, thw266 & Braun, E. L., 1 apr. 2024, I: Proceedings of the National Academy of Sciences. 121, 15, 10 s., e2319506121.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes

    Stiller, J., Feng, S., Chowdhury, A-A., Rivas-González, I., Duchêne, D. A., Fang, Q., Deng, Y., Kozlov, A., Stamatakis, A., Claramunt, S., Nguyen, J. M. T., Ho, S. Y. W., Faircloth, B. C., Haag, J., Houde, P., Cracraft, J., Balaban, M., Mai, U., Chen, G., Gao, R. & 32 flere, Zhou, C., Xie, Y., Huang, Z., Cao, Z., Yan, Z., Ogilvie, H. A., Nakhleh, L., Lindow, Bent Erik Kramer, Morel, B., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, da Fonseca, R. R., Petersen, Bent, Tobias, J. A., Székely, T., Kennedy, J. D., Reeve, A. H., Liker, A., Stervander, M., Antunes, A., Tietze, D. T., Bertelsen, Mads, Lei, F., Rahbek, Carsten, Graves, G. R., Schierup, M. H., Warnow, T., Braun, E. L., Gilbert, M Thomas P, Jarvis, E. D., Mirarab, S. & KU, thw266, 1 apr. 2024, I: Nature.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    ClockstaRX: Testing molecular clock hypotheses with genomic data

    Duchene, David, Duchêne, S., Stiller, Josefin, Heller, Rasmus & Ho, S. Y. W., 1 mar. 2024, I: Genome Biology and Evolution. s. evae064

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. 2023
  6. Udgivet

    Xyloplax princealberti (Asteroidea, Echinodermata): A New Species That Is Not Always Associated with Wood Falls

    Payne, C. Y., Tilic, E., Boschen-Rose, R. E., Gannon, A., Stiller, Josefin, Hiley, A. S., Grupe, B. M., Mah, C. L. & Rouse, G. W., 2023, I: Diversity. 15, 12, 21 s., 1212.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    ClockstaRX: testing molecular clock hypotheses with genomic data

    Duchene, David, Duchêne, S., Stiller, Josefin, Heller, Rasmus & Ho, S. Y. W., 2023, bioRxiv, 15 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  8. Udgivet

    Confusion will be my epitaph: genome-scale discordance stifles phylogenetic resolution of Holothuroidea

    Koch, N. M., Tilic, E., Miller, A. K., Stiller, Josefin & Rouse, G. W., 2023, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 290, 2002, 11 s., 20230988.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Evolution of the germline mutation rate across vertebrates

    Bergeron, Lucie Adrienne, Besenbacher, S., Zheng, J., Li, P., Bertelsen, Mads Frost, Quintard, B., Hoffman, J. I., Li, Z., Leger, J. S., Shao, C., Stiller, Josefin, Gilbert, M Thomas P, Schierup, M. H. & KU, thw266, 2023, I: Nature. 615, s. 285-291

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Molecular exploration of fossil eggshell uncovers hidden lineage of giant extinct bird

    Grealy, A., Miller, G. H., Phillips, M. J., Clarke, S. J., Fogel, M., Patalwala, D., Rigby, P., Hubbard, A., Demarchi, B., Collins, Matthew James, Mackie, Meaghan, Sakalauskaite, J., Stiller, Josefin, Clarke, J. A., Legendre, L. J., Douglass, K., Hansford, J., Haile, J. & Bunce, M., 2023, I: Nature Communications. 14, 14 s., 914.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Range-wide population genomics of common seadragons shows secondary contact over a former barrier and insights on illegal capture

    Stiller, Josefin, Wilson, N. G. & Rouse, G., 2023, I: BMC Biology. 21, 17 s., 129.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics

    Mc Cartney, A. M., Formenti, G., Mouton, A., Panis, D. D., Marins, L. S., Leitão, H. G., Diedericks, G., Kirangwa, J., Morselli, M., Salces-Ortiz, J., Escudero, N., Iannucci, A., Natali, C., Svardal, H., Fernández, R., Pooter, T. D., Joris, G., Strazisar, M., Wood, J., Herron, K. E. & 30 flere, Seehausen, O., Watts, P. C., Shaw, F., Davey, R. P., Minotto, A., Fernández, J. M., Böhne, A., Alegria, C., Alioto, T., Alves, P. C., Amorim, I. R., Aury, J., Backstrom, N., Baldrian, P., Baltrunaite, L., Barta, E., Bed’Hom, B., Belser, C., Bergsten, J., Bertrand, L., Bilandžija, H., Binzer-Panchal, M., Bista, I., Blaxter, M., Borges, P. A., Dias, G. B., Bosse, M., Garg, S., Madsen, O. & Stiller, Josefin, 2023, 51 s. (bioRxiv).

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  13. Accepteret/In press

    Whole-genomes from the extinct Xerces Blue butterfly can help identify declining insect species

    de-Dios, T., Fontsere, Claudia, Renom, P., Stiller, Josefin, Llovera, L., Uliano-Silva, M., Sánchez-Gracia, A., Wright, C., Lizano, E., Caballero, B., Navarro, A., Civit, S., Robbins, R. K., Blaxter, M., Marquès-Bonet, T., Vila, R. & Lalueza-Fox, C., 2023, (Accepteret/In press) I: eLife. 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. 2022
  15. Udgivet

    Ancient proteins resolve controversy over the identity of Genyornis eggshell

    Demarchi, B., Stiller, Josefin, Grealy, A., Mackie, Meaghan, Deng, Y., Gilbert, M Thomas P, Clarke, J., Legendre, L. J., Boano, R., Sicheritz-Pontén, Thomas, Magee, J., KU, thw266, Bunce, M., Collins, Matthew James & Miller, G., 2022, I: PNAS. 119, 43, 9 s., e2109326119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Confusion will be my epitaph: Genome-scale discordance stifles phylogenetic resolution of Holothuroidea

    Koch, N. M., Tilic, E., Miller, A. K., Stiller, Josefin & Rouse, G. W., 2022, bioRxiv, 42 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  17. Udgivet

    Epistatic Effects Between Amino Acid Insertions and Substitutions Mediate Toxin resistance of Vertebrate Na+, K+-ATPases

    Mohammadi, S., Özdemir, H. İ., Ozbek, P., Sumbul, F., Stiller, Josefin, Deng, Y., Crawford, A. J., Rowland, H., Storz, J., Andolfatto, P. & Dobler, S., 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 12, 13 s., msac258.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Phylogenomic analyses of mud dragons (Kinorhyncha)

    Herranz, Maria, Stiller, Josefin, Worsaae, Katrine & Sørensen, Martin Vinther, 2022, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 168, 10 s., 107375.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Phylogenomic analysis of Syngnathidae reveals novel relationships, origins of endemic diversity and variable diversification rates

    Stiller, Josefin, Short, G., Hamilton, H., Saarman, N., Longo, S., Wainwright, P., Rouse, G. W. & Simison, W. B., 2022, I: BMC Biology. 20, 1, 75.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Phylogenomics resolves ambiguous relationships within Aciculata (Errantia, Annelida)

    Tilic, E., Stiller, Josefin, Campos, E., Pleijel, F. & Rouse, G. W., 2022, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 166, 10 s., 107339.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. 2021
  22. Udgivet

    Multiple origins of a frameshift insertion in a mitochondrial gene in birds and turtles

    Andreu-Sánchez, S., Chen, W., Stiller, Josefin & KU, thw266, 2021, I: GigaScience. 10, 1, 11 s., giaa161.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Using UCEs to track the influence of sea‐level change on leafy seadragon populations

    Stiller, Josefin, Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Alfaro, M. E., Faircloth, B. C., Wilson, N. G. & Rouse, G. W., 2021, I: Molecular Ecology. s. 1364-1380

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2020
  25. Udgivet

    An Indo-Pacific Humpback Dolphin Genome Reveals Insights into Chromosome Evolution and the Demography of a Vulnerable Species

    Zhang, P., Zhao, Y., Li, C., Lin, M., Dong, L., Zhang, R., Liu, M., Li, K., Zhang, H., Liu, X., Zhang, Y., Yuan, Y., Liu, H., Seim, I., Sun, S., Du, X., Chang, Y., Li, F., Liu, S., Lee, S. M. Y. & 13 flere, Wang, K., Wang, D., Wang, X., McGowen, M. R., Jefferson, T. A., Olsen, Morten Tange, Stiller, Josefin, KU, thw266, Xu, X., Yang, H., Fan, G., Liu, X. & Li, S., 2020, I: iScience. 23, 10, 52 s., 101640.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics

    Feng, S., Stiller, J., Deng, Y., Armstrong, J., Fang, Q., Hart Reeve, A., Xie, D., Chen, G., Guo, C., Faircloth, B. C., Petersen, B., Wang, Z., Zhou, Q., Diekhans, M., Chen, W., Andreu-Sánchez, S., Margaryan, A., Howard, J. T., Parent, C., Pacheco, G. & 130 flere, Sinding, Mikkel Holger Strander, Puetz, Lara Christine, Cavill, Emily Louisa, Ribeiro, Â. M., Eckhart, L., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Brumfield, R. T., Christidis, L., Bertelsen, Mads Frost, Sicheritz-Pontén, Thomas, Tietze, D. T., Robertson, B. C., Song, G., Borgia, G., Claramunt, S., Lovette, I. J., Cowen, S. J., Njoroge, P., Dumbacher, J. P., Ryder, O. A., Fuchs, J., Bunce, M., Burt, D. W., Cracraft, J., Meng, G., Hackett, S. J., Ryan, P. G., Jønsson, Knud Andreas, Jamieson, I. G., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Braun, E. L., Houde, P., Mirarab, S., Suh, A., Hansson, B., Ponnikas, S., Sigeman, H., Stervander, M., Frandsen, P. B., van der Zwan, H., van der Sluis, R., Visser, C., Balakrishnan, C. N., Clark, A. G., Fitzpatrick, J. W., Bowman, R., Chen, N., Cloutier, A., Sackton, T. B., Edwards, S. V., Foote, D. J., Shakya, S. B., Sheldon, F. H., Vignal, A., Soares, A. E. R., Shapiro, B., González-Solís, J., Ferrer-Obiol, J., Rozas, J., Riutort, M., Tigano, A., Friesen, V., Dalén, L., Urrutia, A. O., Székely, T., Liu, Y., Campana, M. G., Corvelo, A., Fleischer, R. C., Rutherford, K. M., Gemmell, N. J., Dussex, N., Mouritsen, H., Thiele, N., Delmore, K., Liedvogel, M., Franke, A., Hoeppner, M. P., Krone, O., Fudickar, A. M., Milá, B., Ketterson, E. D., Fidler, A. E., Friis, G., Parody-Merino, Á. M., Battley, P. F., Cox, M. P., Lima, N. C. B., Prosdocimi, F., Parchman, T. L., Schlinger, B. A., Loiselle, B. A., Blake, J. G., Lim, H. C., Day, L. B., Fuxjager, M. J., Baldwin, M. W., Braun, M. J., Wirthlin, M., Dikow, R. B., Ryder, T. B., Camenisch, G., Keller, L. F., Dacosta, J. M., Hauber, M. E., Louder, M. I. M., Witt, C. C., McGuire, J. A., Mudge, J., Megna, L. C., Carling, M. D., Wang, B., Taylor, S. A., Del-Rio, G., Aleixo, A., Vasconcelos, A. T. R., Mello, C. V., Weir, J. T., Haussler, D., Li, Q., Yang, H., Wang, J., Lei, F., Rahbek, Carsten, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R., Jarvis, E. D., Paten, B. & KU, thw266, 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 252-257

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Evolutionary History, Genomic Adaptation to Toxic Diet, and Extinction of the Carolina Parakeet

    Gelabert, P., Sandoval-Velasco, M., Serres, A., de Manuel, M., Renom, P., Margaryan, A., Stiller, J., de-Dios, T., Fang, Q., Feng, S., Mañosa, S., Pacheco, G., Ferrando-Bernal, M., Shi, G., Hao, F., Chen, X., Petersen, B., Olsen, R-A., Navarro, A., Deng, Y. & 6 flere, Dalén, L., Marquès-Bonet, T., KU, thw266, Antunes, A., Gilbert, M Thomas P & Lalueza-Fox, C., 2020, I: Current Biology. 30, 1, s. 108-114, e1-e5

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    More is needed — Thousands of loci are required to elucidate the relationships of the ‘flowers of the sea’ (Sabellida, Annelida)

    Tilic, E., Sayyari, E., Stiller, Josefin, Mirarab, S. & Rouse, G. W., 2020, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 9 s., 106892.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Progressive Cactus is a multiple-genome aligner for the thousand-genome era

    Armstrong, J., Hickey, G., Diekhans, M., Fiddes, I. T., Novak, A. M., Deran, A., Fang, Q., Xie, D., Feng, S., Stiller, J., Genereux, D., Johnson, J., Marinescu, V. D., Alföldi, J., Harris, R. S., Lindblad-Toh, K., Haussler, D., Karlsson, E., Jarvis, E. D., Zhang, G. & 1 flere, Paten, B., 2020, I: Nature. 587, 7833, s. 246-251

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Spaghetti to a Tree: A Robust Phylogeny for Terebelliformia (Annelida) Based on Transcriptomes, Molecular and Morphological Data

    Stiller, Josefin, Tilic, E., Rousset, V., Pleijel, F. & Rouse, G. W., 2020, I: Biology. 9, 4, 28 s., 73.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. 2019
  32. Udgivet

    Comparative Phylogenomics, a Stepping Stone for Bird Biodiversity Studies

    Stiller, Josefin & KU, thw266, 2019, I: Diversity. 11, 7, 19 s., 115.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. 2017
  34. Between Hot Rocks and Dry Places: The Status of the Dixie Valley Toad

    Forrest, M. J., Stiller, Josefin, King, T. L. & Rouse, G. W., jul. 2017, I: Western North American Naturalist. 77, 2, s. 162-175

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Barriers to gene flow in common seadragons (Syngnathidae: Phyllopteryx taeniolatus)

    Wilson, N. G., Stiller, Josefin & Rouse, G. W., 2017, I: Conservation Genetics. 18, 1, s. 53-66

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Do ampharetids take sedimented steps between vents and seeps? Phylogeny and habitat-use of Ampharetidae (Annelida, Terebelliformia) in chemosynthesis-based ecosystems

    Eilertsen, M. H., Kongsrud, J. A., Alvestad, T., Stiller, Josefin, Rouse, G. W. & Rapp, H. T., 2017, I: BMC Evolutionary Biology. 17, 15 s., 222.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. First live records of the ruby seadragon (Phyllopteryx dewysea, Syngnathidae)

    Rouse, G. W., Stiller, Josefin & Wilson, N. G., 2017, I: Marine Biodiversity Records. 10, 4 s., 2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. The Leafy Seadragon, Phycodurus eques, a Flagship Species with Low But Structured Genetic Variability

    Stiller, Josefin, Wilson, N. G., Donnellan, S. & Rouse, G. W., 2017, I: Journal of Heredity. 108, 2, s. 152-162

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. 2015
  40. A spectacular new species of seadragon (Syngnathidae)

    Stiller, Josefin, Wilson, N. G. & Rouse, G., 2015, I: Royal Society Open Science. 2, 2, 12 s., 140458.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. 2013
  42. Phylogeny, biogeography and systematics of hydrothermal vent and methane seep Amphisamytha (Ampharetidae, Annelida), with descriptions of three new species

    Stiller, Josefin, Rousset, V., Pleijel, F., Chevaldonne, P., Vrijenhoek, R. C. & Rouse, G. W., 2013, I: Systematics and Biodiversity. 11, 1, s. 35-65

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. 2012
  44. Can insect egg deposition 'warn' a plant of future feeding damage by herbivorous larvae?

    Beyaert, I., Köpke, D., Stiller, Josefin, Hammerbacher, A., Yoneya, K., Schmidt, A., Gershenzon, J. & Hilker, M., 2012, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 279, 1726, s. 101-108

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 184189534