Sarah Rennie

Sarah Rennie

Adjunkt

Medlem af:

    ORCID: 0000-0001-9731-6957

    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 18 ud af 18Pr. side: 500
    Sortering: Udgivelsesdato
    1. 2024
    2. Udgivet

      Recommendations for Bioinformatic Tools in lncRNA Research

      Distefano, R., Ilieva, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2024, I: Current Bioinformatics. 19, 1, s. 14-20 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    3. 2023
    4. Udgivet

      Benchmarking RNA Editing Detection Tools

      Morales, D. R., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: BioTech. 12, 3, 18 s., 56.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      DoxoDB: A Database for the Expression Analysis of Doxorubicin-Induced lncRNA Genes

      Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 4, 24 s., 39.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      Plant YTHDF proteins are direct effectors of antiviral immunity against an N6-methyladenosine-containing RNA virus

      Martínez-Pérez, M., Aparicio, F., Arribas Hernandez, Laura, Tankmar, Mathias Due, Rennie, Sarah, von Bülow, Sören, Lindorff-Larsen, Kresten, Brodersen, Peter & Pallas, V., 2023, I: EMBO Journal. 42, 18, 17 s., e113378.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      Potential usages of A-to-I RNA editing patterns as diagnostic biomarkers

      Rodriguez Morales, D., Ilieva, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: American journal of physiology. Cell physiology. 324, 4, s. C837-C842 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      Systematic Analysis of Long Non-Coding RNAs in Inflammasome Activation in Monocytes/Macrophages

      Qian, N., Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 5, 16 s., 50.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      T2DB: A Web Database for Long Non-Coding RNA Genes in Type II Diabetes

      Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Ishii, H., Aikawa, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 3, 20 s., 30.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Transcription factor expression is the main determinant of variability in gene co-activity

      van Duin, Lucas, Krautz, Robert, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2023, I: Molecular Systems Biology. 19, 7, 17 s., e11392.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. 2022
    12. Udgivet

      Plant YTHDF proteins are direct effectors of antiviral immunity against an m6A-containing RNA virus

      Martínez-Pérez, M., Aparicio, F., Arribas Hernandez, Laura, Tankmar, Mathias Due, Rennie, Sarah, Brodersen, Peter & Pallas, V., 2022, 36 s.

      Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

    13. Udgivet

      Promoter sequence and architecture determine expression variability and confer robustness to genetic variants

      Einarsson, H., Salvatore, Marco, Vaagenso, C., Alcaraz, N., Lange, Jette Bornholdt, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2022, I: eLife. 2022, 36 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      Transcription factor expression is the main determinant of variability in gene co-activity

      van Duin, Lucas, Krautz, Robert, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2022, 30 s.

      Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

    15. 2021
    16. Udgivet

      Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network

      Grapotte, M., Saraswat, M., Bessière, C., Menichelli, C., Ramilowski, J. A., Severin, J., Hayashizaki, Y., Itoh, M., Tagami, M., Murata, M., Kojima-Ishiyama, M., Noma, S., Noguchi, S., Kasukawa, T., Hasegawa, A., Suzuki, H., Nishiyori-Sueki, H., Frith, M. C., Abugessaisa, I., Aitken, S. & 31 flere, Aken, B. L., Alam, I., Alam, T., Alasiri, R., Alhendi, A. M. N., Alinejad-Rokny, H., Alvarez, M. J., Andersson, Robin, Arakawa, T., Araki, M., Arbel, T., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Chen, Y., Coskun, M., Dalby, M., Ienasescu, H., Jørgensen, M., Kaczkowski, B., Kere, J., Li, K., Lilje, B., Nepal, C., Nguyen, Q. H., Nielsen, L. K., Rennie, Sarah, Sandelin, Albin Gustav, Valen, E., Vitezic, M., Vitting-Seerup, K. & FANTOM Consortium, F. C., 2021, I: Nature Communications. 12, 18 s., 3297.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      Principles of mRNA targeting via the Arabidopsis m6A-binding protein ECT2

      Arribas Hernandez, Laura, Rennie, Sarah, Köster, T., Porcelli, C., Lewinski, M., Staiger, D., Andersson, Robin & Brodersen, Peter, 2021, I: eLife. 10, 33 s., e72375.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      The YTHDF proteins ECT2 and ECT3 bind largely overlapping target sets and influence target mRNA abundance, not alternative polyadenylation

      Arribas Hernandez, Laura, Rennie, Sarah, Schon, M., Porcelli, C., Enugutti, B., Andersson, Robin, Nodine, M. D. & Brodersen, Peter, 2021, I: eLife. 10, 27 s., e72377.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      hyperTRIBER: a flexible R package for the analysis of differential RNA editing

      Rennie, Sarah, Magnusson, D. H. & Andersson, Robin, 2021, 12 s.

      Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

    20. 2018
    21. Udgivet

      Transcription start site analysis reveals widespread divergent transcription in D. melanogaster and core promoter-encoded enhancer activities

      Rennie, Sarah, Dalby, M., Lloret-Llinares, M., Bakoulis, Stylianos, Dalager Vaagensø, C., Jensen, T. H. & Andersson, Robin, 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 11, s. 5455-5469 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Transcriptional decomposition reveals active chromatin architectures and cell specific regulatory interactions

      Rennie, Sarah, Dalby, M., van Duin, Lucas & Andersson, Robin, 2018, I: Nature Communications. 9, 16 s., 487.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. 2016
    24. Udgivet

      On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase

      Ienasescu, H., Li, K., Andersson, Robin, Vitezic, M., Rennie, Sarah, Chen, Y., Vitting-Seerup, K., Lagoni, E., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, de Hoon, M. J. L., Kawaji, H., Lassmann, T., FANTOM Consortium, F. C., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2016, 0, 10 s., baw144.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    ID: 143262591