Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- 2024
- E-pub ahead of print
Antibiotic implant irrigation and deep infection: A retrospective study of 1508 patients undergoing breast reconstruction with implants
Hemmingsen, Mathilde Nejrup, Bennedsen, A. K., Kullab, R. B., Weltz, T. K., Ørholt, M., Norlin, C. B., Kalstrup, J., Bredgaard, R., Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas, Hølmich, Lisbet Rosenkrantz, Damsgaard, T. E., Vester-Glowinski, Peter Viktor & Herly, Mikkel, 2024, (E-pub ahead of print) I: Plastic and Reconstructive Surgery. 26 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Insights into the circular: The cryptic plasmidome and its derived antibiotic resistome in the urban water systems
Yu, Z., He, Wanli, Klincke, F., Madsen, Jonas Stenløkke, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Environment International. 183, 12 s., 108351.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Interspecific interactions facilitate keystone species in a multispecies biofilm that promotes plant growth
Yang, Nan, Røder, Henriette Lyng, Wicaksono, W. A., Wassermann, B., Russel, J., Li, X., Nesme, Joseph, Berg, G., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2024, I: The ISME Journal. 18, 1, 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Long-term conservation tillage with reduced nitrogen fertilization intensity can improve winter wheat health via positive plant–microorganism feedback in the rhizosphere
Behr, J. H., Kuhl-Nagel, T., Sommermann, L., Moradtalab, N., Chowdhury, S. P., Schloter, M., Windisch, S., Schellenberg, I., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K., Ludewig, U., Neumann, G., Grosch, R. & Babin, D., 2024, I: FEMS Microbiology Ecology. 100, 2, 18 s., fiae003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Hordeum vulgare differentiates its response to beneficial bacteria
Duan, Y., Han, M., Grimm, M., Schierstaedt, J., Imani, J., Cardinale, M., Le Jean, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Schikora, A., 2023, I: BMC Plant Biology. 23, 1, 16 s., 460.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
An overview of plasmid transfer in the plant microbiome
Sánchez-Salazar, A. M., Taparia, Tanvi, Olesen, Asmus Kalckar, Acuña, J. J., Sørensen, Søren Johannes & Jorquera, M. A., 2023, I: Plasmid. 127, 11 s., 102695.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Associational Resistance to Predation by Protists in a Mixed Species Biofilm
Goh, Y. F., Røder, Henriette Lyng, Chan, S. H., Ismail, M. H., Madsen, Jonas Stenløkke, Lee, K. W. K., Sørensen, Søren Johannes, Givskov, Michael, Burmølle, Mette, Rice, S. A. & McDougald, D., 2023, I: Applied and Environmental Microbiology. 89, 2, 16 s., e0174122.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacteriophages suppress CRISPR–Cas immunity using RNA-based anti-CRISPRs
Camara, Sarah, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Fagerlund, R. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C., Sørensen, Søren Johannes & Pinilla Redondo, Rafael, 2023, I: Nature. 623, 7987, s. 601-607 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan
Johansen, Joachim, Atarashi, K., Arai, Y., Hirose, N., Sørensen, Søren Johannes, Vatanen, T., Knip, M., Honda, K., Xavier, R. J., Rasmussen, Simon & Plichta, D. R., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1064-1078 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Cooperative microbial interactions drive spatial segregation in porous environments
Wu, Y., Fu, C., Peacock, C. L., Sørensen, Søren Johannes, Redmile-Gordon, M. A., Xiao, K. Q., Gao, C., Liu, J., Huang, Q., Li, Z., Song, P., Zhu, Y., Zhou, J. & Cai, P., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 14 s., 4226.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Differential responses of the gut microbiome and resistome to antibiotic exposures in infants and adults
Li, X., Brejnrod, A., Thorsen, J., Zachariasen, Trine, Trivedi, Urvish, Russel, J., Vestergaard, G. A., Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt & Sørensen, Søren Johannes, 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 16 s., 8526.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genomes of seven isolates from Danish wastewater facilities belonging to Pseudomonas, Bacillus, Pseudochrobactrum, Brevundimonas, and Pandoraea
Maccario, Lorrie, Silva, A. F., Nesme, Joseph, Amador Hierro, Cristina Isabel, Sørensen, Søren Johannes, Cooper, V. S. & Røder, Henriette Lyng, 2023, I: Microbiology resource announcements. 12, 12, 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › fagfællebedømt
- Udgivet
Expanding known viral diversity in the healthy infant gut
Shah, S. A., Deng, L., Thorsen, J., Pedersen, A. G., Dion, M. B., Castro-Mejía, J. L., Silins, R., Romme, F. O., Sausset, R., Jessen, L. E., Ndela, E. O., Hjelmsø, M., Rasmussen, M. A., Redgwell, T. A., Rodríguez, C. L., Vestergaard, G., Zhang, Y., Chawes, B., Bønnelykke, K., Sørensen, S. J. & 6 flere, , 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 986–998Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Fungi and bacteria in the beds of rural and urban infants correlate with later risk of atopic diseases
Lehtimäki, J., Gupta, S., Hjelmsø, M., Shah, S., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Soverini, M., Li, X., Russel, J., Trivedi, Urvish, Brix, S., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Clinical and Experimental Allergy. 53, 12, s. 1268-1278 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Oropharyngeal Microbiota Clusters in Children with Asthma or Wheeze Associate with Allergy, Blood Transcriptomic Immune Pathways, and Exacerbation Risk
U-BIOPRED Study Group, U. S. G., 2023, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 208, 2, s. 142-154 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Pharmacokinetics of Locally Applied Antibiotic Prophylaxis for Implant-Based Breast Reconstruction
Hemmingsen, Mathilde Nejrup, Bennedsen, A. K., Kullab, R. B., Norlin, C. B., Ørholt, M., Larsen, A., Bue, M., Lichtenberg, Mads, Hertz, Frederik Boëtius, Damsgaard, T. E., Vester-Glowinski, Peter Viktor, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas & Herly, Mikkel, 2023, I: JAMA network open. 6, 12, 11 s., E2348414.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmid permissiveness of wastewater microbiomes can be predicted from 16S rRNA sequences by machine learning
Moradigaravand, D., Li, L., Dechesne, A., Nesme, Joseph, de la Cruz, R., Ahmad, H., Banzhaf, M., Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F. & Kreft, J. U., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 7, 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The airway microbiota of neonates colonized with asthma-associated pathogenic bacteria
Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Li, X. J., Peng, Shuang, Sunde, R. B., Shah, S. A., Bhattacharyya, M., Poulsen, C. S., Poulsen, Christina Egeø, Leal Rodriguez, C., Widdowson, Michael Lawrence, Neumann, A. U., Trivedi, Urvish, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Nature Communications. 14, 12 s., 6668.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The infant gut virome is associated with preschool asthma risk independently of bacteria
Rodríguez, C. L., Shah, S. A., Rasmussen, Morten Arendt, Thorsen, J., Boulund, U., Pedersen, C. T., Castro-Mejía, J. L., Poulsen, Christina Egeø, Poulsen, C. S., Deng, Ling, Larsen, Frej Andreas Nøhr, Widdowson, Michael Lawrence, Zhang, Yichang, Sørensen, Søren Johannes, Moineau, S., Petit, M. A., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Nielsen, Dennis Sandris & Stokholm, Jakob, 2023, I: Nature Medicine. 30, s. 138-148 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Warmer winters result in reshaping of the European beech forest soil microbiome (bacteria, archaea and fungi) - With potential implications for ecosystem functioning
Dahl, M. B., Kreyling, J., Petters, S., Wang, H., Mortensen, M. S., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Urich, T. & Weigel, R., 2023, I: Environmental Microbiology. 25, 6, 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
A novel and affordable bioaugmentation strategy with microbial extracts to accelerate the biodegradation of emerging contaminants in different media
Aguilar-Romero, I., van Dillewijn, P., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Nogales, R., Delgado-Moreno, L. & Romero, E., 2022, I: Science of the Total Environment. 834, 10 s., 155234.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Artificial selection of stable rhizosphere microbiota leads to heritable plant phenotype changes
Jacquiod, S., Spor, A., Wei, S., Munkager, V., Bru, D., Sørensen, Søren Johannes, Salon, C., Philippot, L. & Blouin, M., 2022, I: Ecology Letters. 25, 1, s. 189-201 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Asthma and Wheeze Severity and the Oropharyngeal Microbiota in Children and Adolescents
Thorsen, J., Stokholm, J., Rasmussen, M. A., Roggenbuck-Wedemeyer, M., Vissing, N. H., Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Fleming, L., Bush, A., Roberts, G., Singer, F., Frey, U., Hedlin, G., Nordlund, B., Murray, C. S., Abdel-Aziz, M. I., Hashimoto, S., van Aalderen, W., Maitland-van der Zee, A. H., Shaw, D. & 13 flere, , 2022, I: Annals of the American Thoracic Society. 19, 12, s. 2031-2043 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Barley Rhizosphere Microbiome Transplantation: A Strategy to Decrease Susceptibility of Barley Grown in Soils With Low Microbial Diversity to Powdery Mildew
Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 14 s., 830905.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Biosolids for safe land application: does wastewater treatment plant size matters when considering antibiotics, pollutants, microbiome, mobile genetic elements and associated resistance genes?
Wolters, B., Hauschild, K., Blau, K., Mulder, I., Heyde, B. J., Sørensen, Søren Johannes, Siemens, J., Jechalke, S., Smalla, K. & Nesme, Joseph, 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 3, s. 1573-1589 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids
Pinilla Redondo, Rafael, Russel, J., Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A., Garrett, Roger Antony, Nesme, Joseph, Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 8, s. 4315-4328Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges
Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. & 83 flere, , 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 429-440Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Deciphering bacteria associated with a pre-parasitic stage of the root-knot nematode Meloidogyne hapla in nemato-suppressive and nemato-conducive soils
Topalović, O., Santos, S. S., Heuer, H., Nesme, Joseph, Kanfra, X., Hallmann, J., Sørensen, Søren Johannes & Vestergård, M., 2022, I: Applied Soil Ecology. 172, 9 s., 104344.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome binning of viral entities from bulk metagenomics data
Johansen, Joachim, Plichta, D. R., Nissen, J. N., Jespersen, Marie Louise, Shah, S. A., Deng, Ling, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes & Rasmussen, Simon, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 965.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Horizontal Gene Transfer of an IncP1 Plasmid to Soil Bacterial Community Introduced by Escherichia coli through Manure Amendment in Soil Microcosms
Macedo, G., Olesen, Asmus Kalckar, Maccario, Lorrie, Leal, L. H., v. d. Maas, P., Heederik, D., Mevius, D., Sørensen, Søren Johannes & Schmitt, H., 2022, I: Environmental Science & Technology. 56, 16, s. 11398-11408 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of intensive lifestyle intervention on gut microbiota composition in type 2 diabetes: a post-hoc analysis of a randomized clinical trial
Wei, S., Brejnrod, A. D., Trivedi, Urvish, Mortensen, M. S., Johansen, M. Y., Karstoft, Kristian, Vaag, A. A., Ried-Larsen, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Gut Microbes. 14, 1, 15 s., 2005407.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Importance of substrate quality and clay content on microbial extracellular polymeric substances production and aggregate stability in soils
Olagoke, F. K., Bettermann, A., Nguyen, P. T. B., Redmile-Gordon, M., Babin, D., Smalla, K., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Kalbitz, K. & Vogel, C., 2022, I: Biology and Fertility of Soils. 58, 4, s. 435-457 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
IncHI1A plasmids potentially facilitate horizontal flow of antibiotic resistance genes to pathogens in microbial communities of urban residential sewage
Olesen, Asmus Kalckar, Pinilla Redondo, Rafael, Hansen, Mads Frederik, Russel, J., Dechesne, A., Smets, B. F., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Molecular Ecology. 31, 5, s. 1595-1608Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Influence of sewage sludge stabilization method on microbial community and the abundance of antibiotic resistance genes
Major, N., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Goreta Ban, S., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D., Grosch, R., Schikora, A. & Schierstaedt, J., 2022, I: Waste Management. 154, s. 126-135 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Long-Range PCR Reveals the Genetic Cargo of IncP-1 Plasmids in the Complex Microbial Community of an On-Farm Biopurification System Treating Pesticide-Contaminated Wastewater
Dunon, V., Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Lavigne, R., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K., Top, E. M. & Springael, D., 2022, I: Applied and Environmental Microbiology. 88, 3, 17 s., e01648-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Long-Term Fertilization Strategy Impacts Rhizoctonia solani–Microbe Interactions in Soil and Rhizosphere and Defense Responses in Lettuce
Sommermann, L., Babin, D., Behr, J. H., Chowdhury, S. P., Sandmann, M., Windisch, S., Neumann, G., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K. & Grosch, R., 2022, I: Microorganisms. 10, 9, 27 s., 1717.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Metabolic Profiling of Interspecies Interactions During Sessile Bacterial Cultivation Reveals Growth and Sporulation Induction in Paenibacillus amylolyticus in Response to Xanthomonas retroflexus
Herschend, J., Ernst, M., Koren, K., Melnik, A. V., da Silva, R. R., Røder, Henriette Lyng, Damholt, Z. B. V., Hägglund, Per Mårten, Svensson, B., Sørensen, Søren Johannes, Kühl, Michael, Dorrestein, P. C. & Burmølle, Mette, 2022, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 12, 17 s., 805473.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs
Li, X., Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Neonatal metabolome of caesarean section and risk of childhood asthma
Gürdeniz, G., Ernst, M., Rago, D., Kim, M., Courraud, J., Stokholm, Jakob, Bønnelykke, Klaus, Björkbom, A., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Brix, Susanne, Hougaard, D., Rasmussen, Morten Arendt, Cohen, A. S., Bisgaard, H. & Chawes, Bo Lund Krogsgaard, 2022, I: The European Respiratory Journal. 59, 6, 11 s., 2102406.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Prophylactic treatment of breast implants with a solution of gentamicin, vancomycin and cefazolin antibiotics for women undergoing breast reconstructive surgery: protocol for a randomised, double-blind, placebo-controlled trial (The BREAST-AB trial)
Hemmingsen, M. N., Larsen, A., Weltz, T. K., Ørholt, M., Wiberg, S., Bennedsen, A. K., Bille, C., Carstensen, L. F., Jensen, L. T., Bredgaard, R., Koudahl, V., Schmidt, Volker-Jürgen, Vester-Glowinski, Peter Viktor, Hølmich, Lisbet Rosenkrantz, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas, Damsgaard, Tine M Engberg & Herly, Mikkel, 2022, I: BMJ Open. 12, 9, s. e058697Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Soil texture is a stronger driver of the maize rhizosphere microbiome and extracellular enzyme activities than soil depth or the presence of root hairs
Yim, B., Ibrahim, Z., Rüger, L., Ganther, M., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Heintz-Buschart, A., Tarkka, M. T., Vetterlein, D., Bonkowski, M., Blagodatskaya, E. & Smalla, K., 2022, I: Plant and Soil. 478, 1-2, s. 229-251 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The developing airway and gut microbiota in early life is influenced by age of older siblings
Christensen, E. D., Hjelmsø, M. H., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Shah, S., Redgwell, T., Poulsen, Christina Egeø, Trivedi, Urvish, Russel, J., Gupta, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2022, I: Microbiome. 10, 15 s., 106.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Unexpected diversity among small-scale sample replicates of defined plant root compartments
Attia, S., Russel, J., Mortensen, M. S., Madsen, Jonas Stenløkke & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: ISME Journal. 16, 4, s. 997-1003 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Vaginal dysbiosis in pregnancy associates with risk of emergency caesarean section: a prospective cohort study
Haahr, T., Clausen, Tine Dalsgaard, Thorsen, J., Rasmussen, Morten Arendt, Mortensen, M. S., Lehtimäki, J., Shah, S. A., Hjelmsø, M. H., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Vestergaard, G., Jacobsson, B., Larsson, P., Brix, S., Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2022, I: Clinical Microbiology and Infection. 28, 4, s. Pages 588-595Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
A community resource for paired genomic and metabolomic data mining
Schorn, M. A., Verhoeven, S., Ridder, L., Huber, F., Acharya, D. D., Aksenov, A. A., Aleti, G., Moghaddam, J. A., Aron, A. T., Aziz, S., Bauermeister, A., Bauman, K. D., Baunach, M., Beemelmanns, C., Beman, J. M., Berlanga-Clavero, M. V., Blacutt, A. A., Bode, H. B., Boullie, A., Brejnrod, A. & 90 flere, , 2021, I: Nature Chemical Biology. 17, 4, s. 363-368Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Broad Dissemination of Plasmids across Groundwater-Fed Rapid Sand Filter Microbiomes
Pinilla Redondo, Rafael, Olesen, Asmus Kalckar, Russel, J., de Vries, L. E., Christensen, L. D., Musovic, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: mBio. 12, 6, 13 s., e0306821.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production
Kang, D., Shoaie, S., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Ledesma-Amaro, R., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 15 s., 1042.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative analysis of the alveolar microbiome in COPD, ECOPD, Sarcoidosis, and ILD patients to identify respiratory illnesses specific microbial signatures
Gupta, S., Shariff, M., Chaturvedi, G., Sharma, A., Goel, N., Yadav, M., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Mukerji, M. & Chauhan, N. S., 2021, I: Scientific Reports. 11, 11 s., 3963.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Distinct rhizomicrobiota assemblages and plant performance in lettuce grown in soils with different agricultural management histories
Babin, D., Sommermann, L., Chowdhury, S. P., Behr, J. H., Sandmann, M., Neumann, G., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K. & Grosch, R., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 21 s., fiab027.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
EMBRACE-WATERS statement: Recommendations for reporting of studies on antimicrobial resistance in wastewater and related aquatic environments
Hassoun-Kheir, N., Stabholz, Y., Kreft, J-U., de la Cruz, R., Dechesne, A., Smets, B. F., Romalde, J. L., Lema, A., Balboa, S., García-Riestra, C., Torres-Sangiao, E., Neuberger, A., Graham, D., Quintela-Baluja, M., Stekel, D. J., Graham, J., Pruden, A., Nesme, J., Sørensen, S. J., Hough, R. & 1 flere, , 2021, I: One Health. 13, 9 s., 100339.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergent bacterial community properties induce enhanced drought tolerance in Arabidopsis
Yang, Nan, Nesme, Joseph, Røder, Henriette Lyng, Li, X., Zuo, Zhangli Thomsen, Petersen, Morten, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: npj Biofilms and Microbiomes. 7, 11 s., 82.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Extended-Spectrum β-Lactamase and Carbapenemase Genes are Substantially and Sequentially Reduced during Conveyance and Treatment of Urban Sewage
Li, L., Nesme, Joseph, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Hashsham, S., Williams, M. R., Yu, Z., Sørensen, Søren Johannes, Graham, D. W., Romalde, J. L., Dechesne, A. & Smets, B. F., 2021, I: Environmental Science & Technology. 55, 9, s. 5939-5949 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of Beneficial Microbial Consortia and Bioactive Compounds with Potential as Plant Biostimulants for a Sustainable Agriculture
Tabacchioni, S., Passato, S., Ambrosino, P., Huang, L., Caldara, M., Cantale, C., Hett, J., Del Fiore, A., Fiore, A., Schlüter, A., Sczyrba, A., Maestri, E., Marmiroli, N., Neuhoff, D., Nesme, J., Sørensen, S. J., Aprea, G., Nobili, C., Presenti, O., Giovannetti, G. & 4 flere, , 2021, I: Microorganisms. 9, 2, 23 s., 426.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of Long-Term Organic and Mineral Fertilization on Rhizosphere Metabolites, Root–Microbial Interactions and Plant Health of Lettuce
Windisch, S., Sommermann, L., Babin, D., Chowdhury, S. P., Grosch, R., Moradtalab, N., Walker, F., Höglinger, B., El-Hasan, A., Armbruster, W., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Geistlinger, J., Smalla, K., Rothballer, M., Ludewig, U. & Neumann, G., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 11, 26 s., 597745.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of Tellurite on the Metabolism of Paenibacillus pabuli AL109b With Flagellin Production Explaining High Reduction Capacity
Farias, P., Francisco, R., Maccario, Lorrie, Herschend, J., Piedade, A. P., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 15 s., 718963.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Importance of microbial communities at the root-soil interface for extracellular polymeric substances and soil aggregation in semiarid grasslands
Bettermann, A., Zethof, J. H. T., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Kalbitz, K., Smalla, K. & Vogel, C., 2021, I: Soil Biology & Biochemistry. 159, 14 s., 108301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Kin discrimination promotes horizontal gene transfer between unrelated strains in Bacillus subtilis
Stefanic, P., Belcijan, K., Kraigher, B., Kostanjšek, R., Nesme, Joseph, Madsen, Jonas Stenløkke, Kovac, J., Sørensen, Søren Johannes, Vos, M. & Mandic-Mulec, I., 2021, I: Nature Communications. 12, 11 s., 3457.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition
Kurilshikov, A., Medina-Gomez, C., Bacigalupe, R., Radjabzadeh, D., Wang, J., Demirkan, A., Le Roy, C. I., Raygoza Garay, J. A., Finnicum, C. T., Liu, X., Zhernakova, D. V., Bonder, M. J., Hansen, T. H., Frost, F., Rühlemann, M. C., Turpin, W., Moon, J. Y., Kim, H. N., Lüll, K., Barkan, E. & 84 flere, , 2021, I: Nature Genetics. 53, s. 156-165 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Lead Drives Complex Dynamics of a Conjugative Plasmid in a Bacterial Community
Cyriaque, V., Madsen, Jonas Stenløkke, Fievez, L., Leroy, B., Hansen, Lars Hestbjerg, Bureau, F., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 655903.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms
Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial community analysis of soils under different soybean cropping regimes in the Argentinean south-eastern Humid Pampas
Fernandez-Gnecco, G., Smalla, K., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Barbieri, P., Consolo, V. F., Covacevich, F. & Babin, D., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab007.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling transfer of vaginal microbiota from mother to infant in early life
Mortensen, M. S., Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Balle, C., Thorsen, J., Krogfelt, K. A., Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: eLife. 10, 19 s., e57051.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Reduced tillage, cover crops and organic amendments affect soil microbiota and improve soil health in Uruguayan vegetable farming systems
Cerecetto, V., Smalla, K., Nesme, Joseph, Garaycochea, S., Fresia, P., Sørensen, Søren Johannes, Babin, D. & Leoni, C., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab023.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Root exposure to apple replant disease soil triggers local defense response and rhizoplane microbiome dysbiosis
Balbín-Suárez, A., Jacquiod, S., Rohr, A. D., Liu, B., Flachowsky, H., Winkelmann, T., Beerhues, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Vetterlein, D. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 14 s., fiab031.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatial analysis of the root system coupled to microbial community inoculation shed light on rhizosphere bacterial community assembly
Wei, S., Jacquiod, S., Philippot, L., Blouin, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Biology and Fertility of Soils. 57, 7, s. 973-989 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Temporal oral microbiome changes with brushing in children with cleft lip and palate
Rodrigues, R., Chung, A. P., Mortensen, M. S., Fernandes, M. H., Monteiro, A. B., Furfuro, R., Silva, C. C., Manso, M. C., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2021, I: Heliyon. 7, 9 s., e06513.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The Airway Microbiota Modulates Effect of Azithromycin Treatment for Episodes of Recurrent Asthma-like Symptoms in Preschool Children: A Randomized Clinical Trial
Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt, Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Hjelmsø, M., Shah, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2021, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 204, 2, s. 149-158Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The effect of early probiotic exposure on the preterm infant gut microbiome development
Hui, Yan, Smith, Birgitte, Mortensen, M. S., Krych, Lukasz, Sørensen, Søren Johannes, Greisen, Gorm, Krogfelt, K. A. & Nielsen, Dennis Sandris, 2021, I: Gut Microbes. 13, 1, 15 s., 1951113.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The infant gut resistome associates with E. coli, environmental exposures, gut microbiome maturity, and asthma-associated bacterial composition
Li, X., Stokholm, Jakob, Brejnrod, A., Vestergaard, G. A., Russel, J., Trivedi, Urvish, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Gupta, S., Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Cell Host & Microbe. 29, 6, s. 975–987.e4 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The initial inoculation ratio regulates bacterial coculture interactions and metabolic capacity
Gao, C., Cao, H., Cai, P. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: ISME Journal. 15, s. 29-40 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The treasure inside barley seeds: microbial diversity and plant beneficial bacteria
Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Straube, B., Wehner, G., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: Environmental Microbiomes. 16, 21 s., 20.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Tillage shapes the soil and rhizosphere microbiome of barley - but not its susceptibility towards Blumeria graminis f. sp. hordei
Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Douchkov, D., Lueck, S., Babin, D., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Urbanized microbiota in infants, immune constitution and later risk of atopic diseases
Lehtimäki, J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Hjelmsø, M., Shah, S., Mortensen, M. S., Trivedi, Urvish, Vestergaard, G., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Brix, S., Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2021, I: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 148, 1, s. 234-243 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Salmonella persistence in soil depends on reciprocal interactions with indigenous microorganisms
Schierstaedt, J., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Neuhaus, K., Sørensen, Søren Johannes, Grosch, R., Smalla, K. & Schikora, A., 2020, I: Environmental Microbiology. 22, 7, s. 2639-2652 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
A converging subset of soil bacterial taxa is permissive to the IncP-1 plasmid pKJK5 across a range of soil copper contamination
Song, J., Klümper, U., Riber, Leise, Dechesne, A., Smets, B. F., Sørensen, Søren Johannes & Brandt, Kristian Koefoed, 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 11, 10 s., fiaa200.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Azo dying of α-keratin material improves microbial keratinase screening and standardization
Gonzalo, M., Espersen, R., Al-Soud, W. A., Cristiano Falco, F., Hägglund, Per Mårten, Sørensen, Søren Johannes, Svensson, B. & Jacquiod, S., 2020, I: Microbial Biotechnology. 13, 4, s. 984-996Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Biocontrol of Bacterial Wilt Disease Through Complex Interaction Between Tomato Plant, Antagonists, the Indigenous Rhizosphere Microbiota, and Ralstonia solanacearum
Elsayed, T. R., Jacquiod, S., Nour, E. H., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 15 s., 2835.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
CRISPRCasTyper: Automated Identification, Annotation, and Classification of CRISPR-Cas Loci
Russel, J., Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: CRISPR Journal. 3, 6, s. 462-469 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Community-intrinsic properties enhance keratin degradation from bacterial consortia
Nasipuri, P., Herschend, J., Brejnrod, A. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Espersen, R., Svensson, B., Burmølle, Mette, Jacquiod, S. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: PLoS ONE. 15, 1, 26 s., e0228108.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparison of antibiotic-resistant bacteria and antibiotic resistance genes abundance in hospital and community wastewater: A systematic review
Hassoun-Kheir, N., Stabholz, Y., Kreft, J., de la Cruz, R., Romalde, J. L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F., Graham, D. & Paul, M., 2020, I: Science of the Total Environment. 743, 11 s., 140804.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › fagfællebedømt
- Udgivet
Compatibility of X-ray computed tomography with plant gene expression, rhizosphere bacterial communities and enzyme activities
Ganther, M., Yim, B., Ibrahim, Z., Bienert, M. D., Lippold, E., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Bienert, G. P., Vetterlein, D., Heintz-Buschart, A., Blagodatskaya, E., Smalla, K. & Tarkka, M. T., 2020, I: Journal of Experimental Botany. 71, 18, s. 5603-5614 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Composted sewage sludge influences the microbiome and persistence of human pathogens in soil
Major, N., Schierstaedt, J., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Ban, S. G., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D. & Schikora, A., 2020, I: Microorganisms. 8, 7, 14 s., 1020.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction of Simplified Microbial Consortia to Degrade Recalcitrant Materials Based on Enrichment and Dilution-to-Extinction Cultures
Kang, D., Jacquiod, S., Herschend, J., Wei, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 10 s., 3010.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Delivery mode and gut microbial changes correlate with an increased risk of childhood asthma
Stokholm, Jakob, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Blaser, M. J., Rasmussen, Morten Arendt, Hjelmsø, M., Shah, S., Christensen, E. D., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Brix, S., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Vestergaard, G., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2020, I: Science Translational Medicine. 12, 569, 14 s., eaax9929.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Discovery of multiple anti-CRISPRs highlights anti-defense gene clustering in mobile genetic elements
Pinilla Redondo, Rafael, Shehreen, S., Marino, N. D., Fagerlund, R. D., Brown, C. M., Sørensen, Søren Johannes, Fineran, P. C. & Bondy-Denomy, J., 2020, I: Nature Communications. 11, 11 s., 5652.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecological succession in the vaginal microbiota during pregnancy and birth
Rasmussen, Morten Arendt, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Dominguez-Bello, M. G., Blaser, M. J., Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Shah, S. A., Hjelmsø, M. H., Lehtimäki, J., Trivedi, Urvish, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2020, I: The ISME Journal. 14, 9, s. 2325-2335 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Environmental shaping of the bacterial and fungal community in infant bed dust and correlations with the airway microbiota
Gupta, S., Hjelmsø, M. H., Lehtimäki, J., Li, X., Mortensen, M. S., Russel, J., Trivedi, Urvish, Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: Microbiome. 8, 16 s., 115.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetic landscape links upper airway microbiota in infancy with allergic rhinitis at 6 years of age
Morin, A., McKennan, C. G., Pedersen, C. T., Stokholm, Jakob, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Schoos, A. M., Naughton, K. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Mortensen, M. S., Vercelli, D., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H., Nicolae, D. L., Bønnelykke, Klaus & Ober, C., 2020, I: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 146, 6, s. 1358-1366Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring microbial determinants of apple replant disease (ARD): a microhabitat approach under split-root design
Balbín-Suárez, A., Lucas, M., Vetterlein, D., Sørensen, Søren Johannes, Winkelmann, T., Smalla, K. & Jacquiod, S., 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 12, 12 s., fiaa211.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Interspecific interactions in dual-species biofilms of soil bacteria: effects of fertilization practices
Sun, X., Cai, P., Sørensen, Søren Johannes, Mortimer, M., Gao, C., Huang, Q., Wang, Y., Lin, X., Wu, Y., Zhu, D. & Chen, R., 2020, I: Journal of Soils and Sediments. 20, 3, s. 1494-1501 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Metal-induced bacterial interactions promote diversity in river-sediment microbiomes
Cyriaque, V., Géron, A., Billon, G., Nesme, Joseph, Werner, J., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: F E M S Microbiology Ecology. 96, 6, 12 s., fiaa076.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Persistence and progression of staphylococcal infection in the presence of public goods
Trivedi, Urvish, Fell, C., Madsen, Jonas Stenløkke, Everett, J., Burmølle, Mette, Rumbaugh, K. P. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: npj Biofilms and Microbiomes. 6, 5 s., 55.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmids persist in a microbial community by providing fitness benefit to multiple phylotypes
Li, L., Dechesne, A., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2020, I: I S M E Journal. 14, 5, s. 1170-1181 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Prenatal dietary supplements influence the infant airway microbiota in a randomized factorial clinical trial
Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Vestergaard, G., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Brix, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Stokholm, Jakob & Bisgaard, H., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 426.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Prokaryotic Community Composition and Extracellular Polymeric Substances Affect Soil Microaggregation in Carbonate Containing Semiarid Grasslands
Zethof, J. H. T., Bettermann, A., Vogel, C., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Woche, S. K., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Kalbitz, K., 2020, I: Frontiers in Environmental Science. 8, 19 s., 51.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Rhizosphere microbial communities associated to rose replant disease: links to plant growth and root metabolites
Yim, B., Baumann, A., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Zühlke, S., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Horticulture Research. 7, 16 s., 144.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Rose replant disease: detailed analyses of plant reactions, root endophytes and rhizosphere microbial communities
Baumann, A., Yim, B., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Acta Horticulturae. 1283, s. 97-104 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments
Cyriaque, V., Jacquiod, S. J. A., Riber, Leise, Abu Al-Soud, W., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: Journal of Hazardous Materials. 382, 10 s., 121173.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
The microbiome of captive hamadryas baboons
Li, X. J., Trivedi, Urvish, Brejnrod, A. D., Vestergaard, G. A., Mortensen, M. S., Bertelsen, Mads Frost & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: BMC Animal Microbiome. 2, 10 s., 25.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
- Udgivet
Type IV CRISPR-Cas systems are highly diverse and involved in competition between plasmids
Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Garrett, Roger Antony, Randau, L., Sørensen, Søren Johannes & Shah, S. A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 4, s. 2000-2012 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
ID: 4269
Flest downloads
-
5094
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
Udgivet -
3021
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2827
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › fagfællebedømt
Udgivet