"Tro på tvivl" diskuterer og belyser fundamentalisme som en tendens og en fare, der trives i såvel videnskabems og rationalitetens verden som inden for samfundsliv, politik og religion.

Darwins opdagelser og tanker om arternes oprindelse konfronteres med religiøs og nationalistisk dæmagogi, darwinisme står over for intelligent design, rationalitet over for tro, videnskabeligt stivsind og snæversyn over for overtro og virkelighedsflugt,