Biologisk Institut

 

 
  1. 2024
  2. Udgivet
  3. Udgivet

    Drosophila cytokine GBP2 exerts immune responses and regulates GBP1 expression through GPCR receptor Mthl10

    Ono, M., Matsumura, T., Sung, E. J., Koyama, Takashi, Ochiai, M., Shears, S. B. & Hayakawa, Y., 2024, I: Insect Biochemistry and Molecular Biology. 167, 7 s., 104086.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A druggable conformational switch in the c-MYC transactivation domain

    Lama, D., Vosselman, T., Sahin, Cagla, Liaño-pons, J., Cerrato, C. P., Nilsson, L., Teilum, Kaare, Lane, D. P., Landreh, M. & Arsenian Henriksson, M., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 14 s., 1865.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  5. Udgivet

    A mutational atlas for Parkin proteostasis

    Clausen, L., Voutsinos, Vasileios, Cagiada, Matteo, Johansson, Kristoffer Enøe, Grønbæk-Thygesen, Martin, Nariya, S., Powell, R. L., Have, M. K. N., Østergaard, Vibe Hallundbæk, Stein, Amelie, Fowler, D. M., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 17 s., 1541.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  6. Udgivet

    A pragmatic approach for integrating molecular tools into biodiversity conservation

    Bertola, L. D., Brüniche-Olsen, A., Kershaw, F., Russo, I. R. M., MacDonald, A. J., Sunnucks, P., Bruford, M. W., Cadena, C. D., Ewart, K. M., de Bruyn, M., Eldridge, M. D. B., Frankham, R., Guayasamin, J. M., Grueber, C. E., Hoareau, T. B., Hoban, S., Hohenlohe, P. A., Hunter, M. E., Kotze, A., Kuja, J. & 21 flere, Lacy, R. C., Laikre, L., Lo, N., Meek, M. H., Mergeay, J., Mittan-Moreau, C., Neaves, L. E., O'Brien, D., Ochieng, J. W., Ogden, R., Orozco-terWengel, P., Páez-Vacas, M., Pierson, J., Ralls, K., Shaw, R. E., Sogbohossou, E. A., Stow, A., Steeves, T., Vernesi, C., Watsa, M. & Segelbacher, G., 2024, I: Conservation Science and Practice. 6, 1, 15 s., e13053.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  7. Udgivet

    AI Implementation and Capability Development in Manufacturing: An Action Research Case

    Eklöf, Jon, Snis, U. L., Hamelryck, Thomas Wim, Grima, A. & Rønning, Ola, 2024, Proceedings of the 57th Hawaii International Conference on System Sciences - HICSS 2024. Hawaii International Conference on System Sciences, 10 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Acclimation of subarctic vegetation to warming and increased cloudiness

    Ndah, F. A., Maljanen, M., Kasurinen, A., Rinnan, Riikka, Michelsen, Anders, Kotilainen, T. & Kivimäenpää, M., 2024, I: Plant-Environment Interactions. 5, 1, 16 s., e10130.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Accounting for Winter Warming Events in the Ecosystem Model LPJ-GUESS: Evaluation and Outlook

    Pascual, D., Johansson, M., Pongracz, A. & Tang, Jing, 2024, I: Journal of Geophysical Research: Biogeosciences. 129, 3, 13 s., e2023JG007464.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  10. E-pub ahead of print

    Acid–base transporters in the context of tumor heterogeneity

    Pedersen, Stine Helene Falsig, 2024, (E-pub ahead of print) I: Pflugers Archiv European Journal of Physiology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  11. Udgivet

    African bushpigs exhibit porous species boundaries and appeared in Madagascar concurrently with human arrival

    Balboa, R. F., Bertola, L. D., Brüniche-Olsen, A., Rasmussen, M. S., Liu, X., Besnard, G., Salmona, J., Santander, C. G., He, S., Zinner, D., Pedrono, M., Muwanika, V., Masembe, C., Schubert, M., Kuja, J., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Stæger, F. F., Rakotoarivony, R., Henrique, M. & 14 flere, Lin, Long, Wang, X., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Hanghøj, Kristian Ebbesen, Sinding, Mikkel Holger Strander, Atickem, A., Chikhi, L., Roos, C., Gaubert, P., Siegismund, Hans Redlef, Moltke, Ida, Albrechtsen, Anders & Heller, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 15 s., 172.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  12. Udgivet

    An Exploration of Artificial Intelligence-Driven De Novo Peptide Sequencing: Towards Future Proteomics and Medicine

    Chang, Yuqi, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 108 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  13. Udgivet

    Analysis of Genomic and Transcriptomic Signatures Associated with Amyotrophic Lateral Sclerosis

    Guan, Liping, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 146 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  14. Udgivet

    Analysis of heterochromatin dynamics in Schizosaccharomyces pombe: With a special focus on the role of the replication factor Mrc1/Claspin in maintenance of epigenetic silencing

    Charlton, Sebastian Jespersen, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 138 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  15. E-pub ahead of print

    Antibiotic implant irrigation and deep infection: A retrospective study of 1508 patients undergoing breast reconstruction with implants

    Hemmingsen, Mathilde Nejrup, Bennedsen, A. K., Kullab, R. B., Weltz, T. K., Ørholt, M., Norlin, C. B., Kalstrup, J., Bredgaard, R., Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas, Hølmich, Lisbet Rosenkrantz, Damsgaard, T. E., Vester-Glowinski, Peter Viktor & Herly, Mikkel, 2024, (E-pub ahead of print) I: Plastic and Reconstructive Surgery. 26 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Bacterial chromosomes and their replication

    Frimodt-Møller, Jakob, Boesen, Thias Oberg, Charbon, Godefroid & Løbner-Olesen, Anders, 2024, Molecular Medical Microbiology. Tang, Y-W., Hindiyeh, M. Y., Liu, D., Sails, A., Spearman, P. & Zhang, J-R. (red.). 3 udg. Academic Press, Bind 1. s. 279-307 29 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  17. E-pub ahead of print

    BeetleAtlas: An Ontogenetic and Tissue-specific Transcriptomic Atlas of the Red Flour Beetle Tribolium castaneum

    Leader, D. P., Naseem, Muhammad Tayyib & Halberg, Kenneth Veland, 2024, (E-pub ahead of print) I: Journal of Molecular Biology. 168520.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  18. Udgivet

    BloodSpot 3.0: a database of gene and protein expression data in normal and malignant haematopoiesis

    Gíslason, M. H., Demircan, G. S., Prachar, Marek, Furtwängler, Benjamin, Schwaller, J., Schoof, E., Porse, Bo Torben, Rapin, N. & Bagger, F., 2024, I: Nucleic acids symposium series. 52, D1, s. D1138–D1142 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  19. Udgivet

    CI:Mor interactions in the lysogeny switches of Lactococcus lactis TP901-1 and Staphylococcus aureus φ13 bacteriophages

    Varming, A. K., Huang, Zhiyu, Hamad, G. M., Rasmussen, K. K., Ingmer, Hanne, Kilstrup, M. & Lo Leggio, Leila, 2024, I: Microbiome Research Reports. 3, 2, 16 s., 15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Cadmium accumulation in organisms from a spruce plantation amended with wood ash - an environmental risk?

    Ekelund, Flemming, Cruz-Paredes, C., Jørgensen, Christian Hviid Friis, Vestergård, M., Rasmussen, K. R., Mortensen, Louise Hindborg, Kindtler, Nikolaj Lunding, Rønn, R., Christensen, Søren, Johansen, Jesper Liengaard & Kjøller, Rasmus, 2024, I: Trees, Forests and People. 15, 6 s., 100499.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Calls of the little auk (Alle alle) chicks reflect their behavioural contexts

    Osiecka, A. N., Briefer, Elodie, Kidawa, D., Żurawska, F. & Wojczulanis-Jakubas, K., 2024, I: PLoS ONE. 19, 2, 14 s., e0299033.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Can large language models reason about medical questions?

    Liévin, V., Hother, C. E., Motzfeldt, A. G. & Winther, Ole, 2024, I: Patterns. 5, 3, 12 s., 100943.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Carving out a Glycoside Hydrolase Active Site for Incorporation into a New Protein Scaffold Using Deep Network Hallucination

    Hansen, A. L., Theisen, Frederik Friis, Crehuet, R., Marcos, E., Aghajari, N. & Willemoës, Martin, 2024, I: ACS Synthetic Biology. 13, 3, s. 862-875 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Changes in composition and function of soil microbial communities during secondary succession in oldfields on the Tibetan Plateau

    Ma, Hui, Yan, X., Gao, E., Qiu, Y., Sun, X., Wang, S., Wang, Y., Bruun, Hans Henrik, He, Z., Shi, X. & Zhao, Z., 2024, I: Plant and Soil. 495, s. 429–443 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Checkpoint activation by Spd1: a competition-based system relying on tandem disordered PCNA binding motifs

    Olsen, Johan Gotthardt, Prestel, Andreas, Kassem, N., Broendum, S. S., Hossain, Mohammad Shamim, Simonsen, Signe, Grysbæk, M., Mortensen, J., Rytkjær, L. L., Haxholm, G. W., Marabini, R., Holmberg, Christian, Carr, A. M., Crehuet, R., Nielsen, Olaf & Kragelund, Birthe Brandt, 2024, I: Nucleic acids symposium series. 52, 4, s. 2030–2044 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Circle-seq based method for eccDNA synthesis and its application as a canonical promoter independent vector for robust microRNA overexpression

    Yu, J., Zhang, H., Han, Peng, Jiang, X., Li, J., Li, B., Yang, S., He, C., Mao, S., Dang, Y. & Xiang, X., 2024, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 23, s. 358-368 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Comment on “DpCoA tagSeq: Barcoding dpCoA-Capped RNA for Direct Nanopore Sequencing via Maleimide-Thiol Reaction”

    Vinther, Jeppe, 2024, I: Analytical Chemistry. 96, 1, s. 606-609 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Comparison of the DNBSEQ platform and Illumina HiSeq 2000 for bacterial genome assembly

    Hu, T., Chen, J., Lin, X., He, W., Liang, H., Wang, M., Li, W., Wu, Z., Han, Mo, Jin, X., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 9 s., 1292.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Conformational ensembles of the human intrinsically disordered proteome

    Tesei, Giulio, Trolle, A. I., Jonsson, Nicolas, Betz, J., Knudsen, F. E., Pesce, Francesco, Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2024, I: Nature. 626, s. 897-904 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Crispr-Cas Repurposed: Defense and Counter-defense on Mobile Genetic Elements

    Camara, Sarah, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 186 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  31. Udgivet

    Cytotoxicity of Prymnesium parvum extracts and prymnesin analogs on epithelial fish gill cells RTgill‑W1 and the human colon cell line HCEC‑1CT

    Varga, E., Prause, H., Riepl, M., Hochmayr, N., Berk, D., Attakpah, E., Kiss, E., Medic, Nikola, Del Favero, G., Larsen, T. O., Hansen, Per Juel & Marko, D., 2024, I: Archives of Toxicology. 98, s. 999–1014 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  32. Udgivet

    DNA binding redistributes activation domain ensemble and accessibility in pioneer factor Sox2

    Bjarnason, S., McIvor, J. A. P., Prestel, Andreas, Demény, K. S., Bullerjahn, J. T., Kragelund, Birthe Brandt, Mercadante, D. & Heidarsson, P. O., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 1445.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  33. Udgivet

    DNA metabarcoding reveals the impact of Cu2+ on soil cercozoan diversity

    Lourenço, L., Ellegaard Bager, S., Ng, D. Y. K., Sheikh, Sanea, Kindtler, Nikolaj Lunding, Nielsen, Ida Broman, Frøslev, Tobias Guldberg & Ekelund, Flemming, 2024, I: Protist. 175, 2, 9 s., 126016.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  34. E-pub ahead of print

    Deciphering unique and shared interactions between the human gut microbiota and oral antidiabetic drugs

    Ren, H., Shi, Z., Yang, F., Wang, S., Yuan, F., Li, T., Li, M., Zhu, J., Li, J., Wu, K., Zhang, Y., Ning, G., Kristiansen, Karsten, Wang, W., Gu, Y. & Zhong, H., 2024, (E-pub ahead of print) I: iMeta. e179.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatfagfællebedømt

  35. Udgivet

    DeepLocRNA: an interpretable deep learning model for predicting RNA subcellular localization with domain-specific transfer-learning

    Wang, Jun, Horlacher, M., Cheng, L. & Winther, Ole, 2024, I: Bioinformatics. 40, 2, 10 s., btae065.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  36. Udgivet

    DiscoTope-3.0: improved B-cell epitope prediction using inverse folding latent representations

    Høie, M. H., Gade, F. S., Johansen, J., Würtzen, C., Winther, Ole, Nielsen, M. & Marcatili, P., 2024, I: Frontiers in Immunology. 15, 12 s., 1322712.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  37. E-pub ahead of print

    Dissolved organic matter offsets the detrimental effects of climate change in the nitrogen‐fixing cyanobacterium Crocosphaera

    Filella, A., Umbricht, J., Klett, A., Vogts, A., Vannier, T., Grosso, O., Voss, M., Riemann, Lasse & Benavides, M., 2024, (E-pub ahead of print) I: Limnology and Oceanography Letters.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Drosophila activins adapt gut size to food intake and promote regenerative growth

    Christensen, C. F., Laurichesse, Quentin Charles B, Loudhaief, Rihab, Colombani, Julien & Andersen, Ditte Skovaa, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 12 s., 273.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Dynamics of inflammation-associated plasma proteins following faecal microbiota transplantation in patients with psoriatic arthritis and healthy controls: exploratory findings from the FLORA trial [Inkl. Correction]

    Kragsnaes, M. S., Jensen, J. R. B., Nilsson, A. C., Malik, M. I., Munk, H. L., Pedersen, J. K., Horn, H. C., Kruhøffer, M., Kristiansen, Karsten, Mullish, B. H., Marchesi, J. R., Kjeldsen, J., Röttger, R. & Ellingsen, T., 2024, I: RMD Open. 10, 1, 13 s., e003750.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Editorial: Microbial fermentation for improved sensory properties and functionality of sustainable foods

    Verni, M., Holt, Sylvester & Rizzello, C. G., 2024, I: Frontiers in Microbiology. 15, 2 s., 1387745.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Editorial overview: New and revitalized old targets in metabolic disease

    Hansen, Jacob B. & Novak, Ivana, 2024, I: Current Opinion in Pharmacology. 75, 3 s., 102434.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Editorial: Optics and ecophysiology of coral reef organisms: volume II

    Bollati, Elena, Wangpraseurt, D., Larkum, A. W. D., Ferrier-Pagès, C. & Kühl, Michael, 2024, I: Frontiers in Marine Science. 11, 3 s., 1367849.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Effect of ecological and anthropogenic factors on grouping patterns in African lions across Kenya

    Chege, M., Bertola, Laura, De Snoo, G. R., Ngene, S., Otieno, T., Amoke, I., van 't Zelfde, M., Dolrenry, S., Broekhuis, F., Tamis, W., De Iongh, H. H. & Elliot, N. B., 2024, I: Ecology and Evolution. 14, 2, 14 s., e10982.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Efficient statistical and computational methods for large scale sequencing data

    Li, Zilong, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 149 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportDoktordisputats

  45. Udgivet

    Endogenous Tagging of Ciliary Genes in Human RPE1 Cells for Live-Cell Imaging

    Kuhns, S., Juhl, A. D., Anvarian, Zeinab, Wüstner, D., Pedersen, Lotte Bang & Andersen, J. S., 2024, Methods in Molecular Biology. Humana Press, s. 147-166 20 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2725).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Environmental DNA metabarcoding of Danish soil samples reveals new insight into the hidden diversity of eutardigrades in Denmark

    Pust, F. L., Frøslev, Tobias Guldberg, Kristensen, Reinhardt Møbjerg & Møbjerg, Nadja, 2024, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 200, 1, s. 20-33

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  47. Udgivet
  48. Udgivet

    FRETpredict: a Python package for FRET efficiency predictions using rotamer libraries

    Montepietra, D., Tesei, Giulio, Martins, J. M., Kunze, M. B. A., Best, R. B. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2024, I: Communications Biology . 7, 1, 10 s., 298.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Facing Danger: Exploring Personality and Reactions of European Hedgehogs (Erinaceus europaeus) towards Robotic Lawn Mowers

    Rasmussen, S. L., Schrøder, B. T., Berger, A., Macdonald, D. W., Pertoldi, C., Briefer, Elodie & Alstrup, A. K. O., 2024, I: Animals. 14, 1, 19 s., 2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Fine roots and extramatrical mycelia regulate the composition of soil organic carbon and nitrogen in a subtropical montane forest

    Zhao, X., Tian, Q., Michelsen, Anders, Chen, L., Yue, P., Feng, Z., Lin, Q., Zhao, R. & Liu, F., 2024, I: Forest Ecology and Management. 554, 8 s., 121661.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Flagellar interference with plasmid uptake in biofilms: a joint experimental and modeling study

    Røder, Henriette Lyng, Christidi, E., Amador Hierro, Cristina Isabel, Music, S., Olesen, Asmus Kalckar, Svensson, B., Madsen, Jonas Stenløkke, Herschend, J., Kreft, J. & Burmølle, Mette, 2024, I: Applied and Environmental Microbiology. 90, 1, 15 s., e01510-23.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 6 7 8 ...334 Næste