Biologisk Institut

 

 
  1. 2024
  2. Udgivet

    Comment on “DpCoA tagSeq: Barcoding dpCoA-Capped RNA for Direct Nanopore Sequencing via Maleimide-Thiol Reaction”

    Vinther, Jeppe, 2024, I: Analytical Chemistry. 96, 1, s. 606-609 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Comparison of the DNBSEQ platform and Illumina HiSeq 2000 for bacterial genome assembly

    Hu, T., Chen, J., Lin, X., He, W., Liang, H., Wang, M., Li, W., Wu, Z., Han, Mo, Jin, X., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 9 s., 1292.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Conformational ensembles of the human intrinsically disordered proteome

    Tesei, Giulio, Trolle, A. I., Jonsson, Nicolas, Betz, J., Knudsen, F. E., Pesce, Francesco, Johansson, Kristoffer Enøe & Lindorff-Larsen, Kresten, 2024, I: Nature. 626, s. 897-904 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Crispr-Cas Repurposed: Defense and Counter-defense on Mobile Genetic Elements

    Camara, Sarah, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 186 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  6. Udgivet

    Cytotoxicity of Prymnesium parvum extracts and prymnesin analogs on epithelial fish gill cells RTgill‑W1 and the human colon cell line HCEC‑1CT

    Varga, E., Prause, H., Riepl, M., Hochmayr, N., Berk, D., Attakpah, E., Kiss, E., Medic, Nikola, Del Favero, G., Larsen, T. O., Hansen, Per Juel & Marko, D., 2024, I: Archives of Toxicology. 98, s. 999–1014 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  7. Udgivet

    DNA binding redistributes activation domain ensemble and accessibility in pioneer factor Sox2

    Bjarnason, S., McIvor, J. A. P., Prestel, Andreas, Demény, K. S., Bullerjahn, J. T., Kragelund, Birthe Brandt, Mercadante, D. & Heidarsson, P. O., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 1445.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  8. Udgivet

    DNA metabarcoding reveals the impact of Cu2+ on soil cercozoan diversity

    Lourenço, L., Ellegaard Bager, S., Ng, D. Y. K., Sheikh, Sanea, Kindtler, Nikolaj Lunding, Nielsen, Ida Broman, Frøslev, Tobias Guldberg & Ekelund, Flemming, 2024, I: Protist. 175, 2, 9 s., 126016.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  9. E-pub ahead of print

    Deciphering unique and shared interactions between the human gut microbiota and oral antidiabetic drugs

    Ren, H., Shi, Z., Yang, F., Wang, S., Yuan, F., Li, T., Li, M., Zhu, J., Li, J., Wu, K., Zhang, Y., Ning, G., Kristiansen, Karsten, Wang, W., Gu, Y. & Zhong, H., 2024, (E-pub ahead of print) I: iMeta. e179.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatfagfællebedømt

  10. Udgivet

    DeepLocRNA: an interpretable deep learning model for predicting RNA subcellular localization with domain-specific transfer-learning

    Wang, Jun, Horlacher, M., Cheng, L. & Winther, Ole, 2024, I: Bioinformatics. 40, 2, 10 s., btae065.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  11. Udgivet

    DiscoTope-3.0: improved B-cell epitope prediction using inverse folding latent representations

    Høie, M. H., Gade, F. S., Johansen, J., Würtzen, C., Winther, Ole, Nielsen, M. & Marcatili, P., 2024, I: Frontiers in Immunology. 15, 12 s., 1322712.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  12. E-pub ahead of print

    Dissolved organic matter offsets the detrimental effects of climate change in the nitrogen‐fixing cyanobacterium Crocosphaera

    Filella, A., Umbricht, J., Klett, A., Vogts, A., Vannier, T., Grosso, O., Voss, M., Riemann, Lasse & Benavides, M., 2024, (E-pub ahead of print) I: Limnology and Oceanography Letters.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Drosophila activins adapt gut size to food intake and promote regenerative growth

    Christensen, C. F., Laurichesse, Quentin Charles B, Loudhaief, Rihab, Colombani, Julien & Andersen, Ditte Skovaa, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 12 s., 273.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Dynamics of inflammation-associated plasma proteins following faecal microbiota transplantation in patients with psoriatic arthritis and healthy controls: exploratory findings from the FLORA trial [Inkl. Correction]

    Kragsnaes, M. S., Jensen, J. R. B., Nilsson, A. C., Malik, M. I., Munk, H. L., Pedersen, J. K., Horn, H. C., Kruhøffer, M., Kristiansen, Karsten, Mullish, B. H., Marchesi, J. R., Kjeldsen, J., Röttger, R. & Ellingsen, T., 2024, I: RMD Open. 10, 1, 13 s., e003750.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Editorial: Microbial fermentation for improved sensory properties and functionality of sustainable foods

    Verni, M., Holt, Sylvester & Rizzello, C. G., 2024, I: Frontiers in Microbiology. 15, 2 s., 1387745.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Editorial overview: New and revitalized old targets in metabolic disease

    Hansen, Jacob B. & Novak, Ivana, 2024, I: Current Opinion in Pharmacology. 75, 3 s., 102434.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Editorial: Optics and ecophysiology of coral reef organisms: volume II

    Bollati, Elena, Wangpraseurt, D., Larkum, A. W. D., Ferrier-Pagès, C. & Kühl, Michael, 2024, I: Frontiers in Marine Science. 11, 3 s., 1367849.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Effect of ecological and anthropogenic factors on grouping patterns in African lions across Kenya

    Chege, M., Bertola, Laura, De Snoo, G. R., Ngene, S., Otieno, T., Amoke, I., van 't Zelfde, M., Dolrenry, S., Broekhuis, F., Tamis, W., De Iongh, H. H. & Elliot, N. B., 2024, I: Ecology and Evolution. 14, 2, 14 s., e10982.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Efficient statistical and computational methods for large scale sequencing data

    Li, Zilong, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 149 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportDoktordisputats

  20. Udgivet

    Endogenous Tagging of Ciliary Genes in Human RPE1 Cells for Live-Cell Imaging

    Kuhns, S., Juhl, A. D., Anvarian, Zeinab, Wüstner, D., Pedersen, Lotte Bang & Andersen, J. S., 2024, Methods in Molecular Biology. Humana Press, s. 147-166 20 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2725).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Environmental DNA metabarcoding of Danish soil samples reveals new insight into the hidden diversity of eutardigrades in Denmark

    Pust, F. L., Frøslev, Tobias Guldberg, Kristensen, Reinhardt Møbjerg & Møbjerg, Nadja, 2024, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 200, 1, s. 20-33

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  22. Udgivet
  23. Udgivet

    FRETpredict: a Python package for FRET efficiency predictions using rotamer libraries

    Montepietra, D., Tesei, Giulio, Martins, J. M., Kunze, M. B. A., Best, R. B. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2024, I: Communications Biology . 7, 1, 10 s., 298.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Facing Danger: Exploring Personality and Reactions of European Hedgehogs (Erinaceus europaeus) towards Robotic Lawn Mowers

    Rasmussen, S. L., Schrøder, B. T., Berger, A., Macdonald, D. W., Pertoldi, C., Briefer, Elodie & Alstrup, A. K. O., 2024, I: Animals. 14, 1, 19 s., 2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Fine roots and extramatrical mycelia regulate the composition of soil organic carbon and nitrogen in a subtropical montane forest

    Zhao, X., Tian, Q., Michelsen, Anders, Chen, L., Yue, P., Feng, Z., Lin, Q., Zhao, R. & Liu, F., 2024, I: Forest Ecology and Management. 554, 8 s., 121661.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Flagellar interference with plasmid uptake in biofilms: a joint experimental and modeling study

    Røder, Henriette Lyng, Christidi, E., Amador Hierro, Cristina Isabel, Music, S., Olesen, Asmus Kalckar, Svensson, B., Madsen, Jonas Stenløkke, Herschend, J., Kreft, J. & Burmølle, Mette, 2024, I: Applied and Environmental Microbiology. 90, 1, 15 s., e01510-23.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt