Biologisk Institut

 

 
  1. 2024
  2. Udgivet

    PRKN-linked familial Parkinson’s disease: cellular and molecular mechanisms of disease-linked variants

    Clausen, L., Okarmus, J., Voutsinos, Vasileios, Meyer, M., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2024, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 81, 1, 17 s., 223.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Phytoplankton community changes in relation to nutrient fluxes along a quasi-stationary front

    Bendtsen, Jørgen, Daugbjerg, Niels, Jensen, R. S., dbt998, dbt998, Nielsen, M. H., Hansen, J. L. S. & Richardson, Katherine, 2024, I: Marine Ecology - Progress Series. 727, s. 67-80 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Phytoremediation in the Guadiamar Green Corridor (SW Spain): Trace element uptake by plants and effects on soil fungal diversity

    Madejón, P., Domínguez, M. T., Gil-Martínez, M. & Madejón, E., 2024, I: Advances in Botanical Research. 109, s. 255-294 40 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Plant trait and vegetation data along a 1314 m elevation gradient with fire history in Puna grasslands, Perú

    Halbritter, A. H., Vandvik, V., Cotner, S. H., Farfan-Rios, W., Maitner, B. S., Michaletz, S. T., Oliveras Menor, I., Telford, R. J., Ccahuana, A., Cruz, R., Sallo-Bravo, J., Santos-Andrade, P. E., Vilca-Bustamante, L. L., Castorena, M., Chacón-Labella, J., Christiansen, C. T., Duran, S. M., Egelkraut, D. D., Gya, R., Haugum, S. V. & 42 flere, Seltzer, L., Silman, M. R., Strydom, T., Spiegel, M. P., Barros, A., Birkeli, K., Boakye, M., Chiappero, F., Chmurzynski, A., Garen, J. C., Gaudard, J., Gauthier, T. L. J., Geange, S. R., Gonzales, F. N., Henn, J. J., Hošková, K., Isaksen, A., Jessup, L. H., Johnson, W., Kusch, E., Lepley, K., Lift, M., Martyn, T. E., Muñoz Mazon, M., Middleton, S. L., Quinteros Casaverde, N. L., Navarro, J., Zepeda, V., Ocampo-Zuleta, K., Palomino-Cardenas, A. C., Pastor Ploskonka, S., Pierfederici, M. E., Pinelli, V., Rickenback, J., Roos, R. E., Rui, H. S., Sanchez Diaz, E., Sánchez-Tapia, A., Smith, A., Urquiaga-Flores, E., von Oppen, J. & Enquist, B. J., 2024, I: Scientific Data. 11, 1, 18 s., 225.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Accepteret/In press

    Plocamiomonas psychrophila gen. et sp. nov. (Pelagophyceae, Heterokontophyta), an Arctic marine nanoflagellate characterized by microscopy, pigments and molecular phylogeny.

    Daugbjerg, Niels, Lara, C. H., Frøsig Gai, F. & Lovejoy, C., 2024, (Accepteret/In press) I: European Journal of Phycology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Population Genomics Reveals the Underlying Structure of the Small Pelagic European Sardine and Suggests Low Connectivity within Macaronesia

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Campos, P. F., Rey de la Iglesia, Alba, Barroso, G. V., Bergeron, Lucie Adrienne, Nande, M., Tuya, F., Abidli, S., Pérez, M., Riveiro, I., Carrera, P., Jurado-Ruzafa, A., Santamaría, M. T. G., Faria, R., Machado, A. M., Fonseca, M. M., Froufe, E. & Castro, L. F. C., 2024, I: Genes. 15, 2, 15 s., 170.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Population genomics of the muskox' resilience in the near absence of genetic variation

    Pečnerová, P., Lord, E., Garcia-Erill, G., Hanghøj, K., Rasmussen, M. S., Meisner, J., Liu, X., van der Valk, T., Santander, C. G., Quinn, L., Lin, L., Liu, S., Carøe, C., Dalerum, F., Götherström, A., Måsviken, J., Vartanyan, S., Raundrup, K., Al-Chaer, A., Rasmussen, L. & 11 flere, Hvilsom, C., Heide-Jørgensen, M. P., Sinding, Mikkel Holger Strander, Aastrup, P., Van Coeverden de Groot, P. J., Schmidt, N. M., Albrechtsen, Anders, Dalén, L., Heller, Rasmus, Moltke, Ida & Siegismund, Hans Redlef, 2024, I: Molecular Ecology. 33, 2, 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Population size and social structure of lions in a west African protected area

    Gueye, M., Pellaton, R., Van Cauteren, D., Mengual, L., Van Dongen, S., Leirs, H., Bertola, Laura, Faye, P. M., Diop, B., Diop, M. M., Kanté, A. & de Iongh, H., 2024, I: African Journal of Ecology. 62, 1, 11 s., e13226.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Population structure and migration in the Eastern Highlands of Papua New Guinea, a region impacted by the kuru epidemic

    Quinn, Liam James Elgaard, Whitfield, J., Alpers, M. P., Campbell, T., Hummerich, H., Pomat, W., Siba, P., Koki, G., Moltke, Ida, Collinge, J., Hellenthal, G. & Mead, S., 2024, I: American Journal of Human Genetics. 111, 4, s. 668-679 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Positive selection has shaped the evolution of Argentine ant immune genes both in native and introduced supercolonies

    Holmberg, I., Tolonen, L., Paviala, J., Pedersen, Jes Søe, Helanterä, H. & Viljakainen, L., 2024, I: Journal of Evolutionary Biology. 37, 2, s. 131–140 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Postembryonic development and male paedomorphosis in Osedax (Siboglinidae, Annelida)

    Worsaae, Katrine, Rouan, Alice Jeanne Monique Nadja, Seaver, E., Miyamoto, N. & Tilic, E., 2024, I: Frontiers in Neuroscience. 18, 18 s., 1369274.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Predicting peptide–MHC stability and immunogenicity with deep learning

    Prachar, Marek, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 258 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  14. Udgivet

    Protein kinase C-inhibition reduces critical weight loss and improves functional outcome after experimental subarachnoid haemorrhage

    Bömers, J. P., Holm, A., Kazantzi, Spyridoula, Edvinsson, L., Mathiesen, Tiit Illimar & Haanes, Kristian Agmund, 2024, I: Journal of Stroke and Cerebrovascular Diseases. 33, 7, 11 s., 107728.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Protein variant effect prediction using machine learning

    Blaabjerg, Lasse Møller, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 164 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  16. Udgivet

    Protocol for genomic recombineering in Yersinia ruckeri using CRISPR Cas12a coupled with the λ Red system

    Ejaz, Rooshanie Nadia, Taylor, Nicholas M I & Rebrova, Eva Maria, 2024, I: STAR Protocols. 5, 2, 17 s., 103014.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Reading tea leaves worldwide: Decoupled drivers of initial litter decomposition mass-loss rate and stabilization

    Sarneel, J. M., Hefting, M. M., Sandén, T., van den Hoogen, J., Routh, D., Adhikari, B. S., Alatalo, J. M., Aleksanyan, A., Althuizen, I. H. J., Alsafran, M. H. S. A., Atkins, J. W., Augusto, L., Aurela, M., Azarov, A. V., Barrio, I. C., Beier, C., Bejarano, M. D., Benham, S. E., Berg, B., Bezler, N. V. & 88 flere, Björnsdóttir, K., Bolinder, M. A., Carbognani, M., Cazzolla Gatti, R., Chelli, S., Chistotin, M. V., Christiansen, C. T., Courtois, P., Crowther, T. W., Dechoum, M. S., Djukic, I., Duddigan, S., Egerton-Warburton, L. M., Fanin, N., Fantappiè, M., Fares, S., Fernandes, G. W., Filippova, N. V., Fliessbach, A., Fuentes, D., Godoy, R., Grünwald, T., Guzmán, G., Hawes, J. E., He, Y., Hero, J. M., Hess, L. L., Hogendoorn, K., Høye, T. T., Jans, W. W. P., Jónsdóttir, I. S., Keller, S., Kepfer Rojas, Sebastian, Kuz'menko, N. N., Larsen, Klaus Steenberg, Laudon, H., Lembrechts, J. J., Li, J., Limousin, J. M., Lukin, S. M., Marques, R., Marín, C., McDaniel, M. D., Meek, Q., Merzlaya, G. E., Michelsen, Anders, Montagnani, L., Mueller, P., Murugan, R., Myers-Smith, I. H., Nolte, S., Ochoa-Hueso, R., Okafor, B. N., Okorkov, V. V., Onipchenko, V. G., Orozco, M. C., Parkhurst, T., Peres, C. A., Petit Bon, M., Petraglia, A., Pingel, M., Rebmann, C., Scheffers, B. R., Schmidt, Inger Kappel, Scholes, M. C., Sheffer, E., Shevtsova, L. K., Smith, S. W., Sofo, A., Stevenson, P. R., Strouhalová, B., Sundsdal, A., Sühs, R. B., Tamene, G., Thomas, H. J. D., Tolunay, D., Tomaselli, M., Tresch, S., Tucker, D. L., Ulyshen, M. D., Valdecantos, A., Vandvik, V., Vanguelova, E. I., Verheyen, K., Wang, X., Yahdjian, L., Yumashev, X. S. & Keuskamp, J. A., 2024, I: Ecology Letters. 27, 5, 14 s., e14415.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Recent progress in understanding the cellular and genetic basis of plant responses to low oxygen holds promise for developing flood-resilient crops

    Fagerstedt, K. V., Pucciariello, C., Pedersen, Ole & Perata, P., 2024, I: Journal of Experimental Botany. 75, 5, s. 1217–1233 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Recommendations for Bioinformatic Tools in lncRNA Research

    Distefano, R., Ilieva, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2024, I: Current Bioinformatics. 19, 1, s. 14-20 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Reconstructing colonization dynamics to establish how human activities transformed island biodiversity

    Tomlinson, S., Lomolino, M. V., Anderson, A., Austin, J. J., Brown, S. C., Haythorne, S., Perry, G. L. W., Wilmshurst, J. M., Wood, J. R. & Fordham, D. A., 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 13 s., 5261.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Regional impacts of warming on biodiversity and biomass in high latitude stream ecosystems across the Northern Hemisphere

    Jackson, M. C., Friberg, N., Moliner Cachazo, L., Clark, D. R., Mutinova, P. T., O’Gorman, E. J., Kordas, R. L., Gallo, B., Pichler, D. E., Bespalaya, Y., Aksenova, O. V., Milner, A., Brooks, S. J., Dunn, N., Lee, K. W. K., Ólafsson, J. S., Gíslason, G. M., Millan, L., Bell, T., Dumbrell, A. J. & 1 flere, Woodward, G., 2024, I: Communications Biology . 7, 1, 8 s., 316.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Regulation of polycystin-2 trafficking to and at the primary cilium in kidney epithelial cells

    Rezi, Csenge Kata, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 188 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  23. Udgivet

    Regulatory sequence-based discovery of anti-defense genes in archaeal viruses

    Bhoobalan, Yuvaraj, Xu, Shuanshuan, Martinez Alvarez, Laura, Karamycheva, S., Makarova, K. S., Koonin, E. V. & Peng, Xu, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 13 s., 3699.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Relationship between the female cervico-vaginal microbiome and women’s health

    Chen, Chen, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 141 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  25. Udgivet

    Removal from the wild endangers the once widespread long-tailed macaque

    Gamalo, L. E., Ilham, K., Jones-Engel, L., Gill, M., Sweet, R., Aldrich, B., Phiapalath, P., Van Bang, T., Ahmed, T., Kite, S., Paramasivam, S., Seiha, H., Zainol, M. Z., Nielsen, D. R. K., Ruppert, N., Fuentes, A. & Hansen, Malene Friis, 2024, I: American Journal of Primatology. 86, 3, 10 s., e23547.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Response of underwater photosynthesis to light, CO2, temperature, and submergence time of Taxodium distichum, a flood-tolerant tree

    Guo, J., Xue, J., Yin, Y., Pedersen, Ole & Hua, J., 2024, I: Frontiers in Plant Science. 15, 13 s., 1355729.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt