Biologisk Institut

 

 
  1. 2024
  2. Udgivet

    Horizontal transmission of a multidrug-resistant IncN plasmid isolated from urban wastewater

    Yu, Z., Wang, Q., Pinilla Redondo, Rafael, Madsen, Jonas Stenløkke, Clasen, K. A. D., Ananbeh, H., Olesen, Asmus Kalckar, Gong, Zhuang, Yang, Nan, Dechesne, A., Smets, B., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Ecotoxicology and Environmental Safety. 271, 12 s., 115971.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Host-gut microbiota interactions shape parasite infections in farmed Atlantic salmon

    Brealey, Jaelle, Kodama, M., Rasmussen, Jacob Agerbo, Hansen, Søren Blikdal, Santos-Bay, Luisa, Lecaudey, L. A., Hansen, M., Fjære, E., Myrmel, L. S., Madsen, L., Bernhard, A., Sveier, H., Kristiansen, Karsten, Gilbert, M Thomas P, Martin, M. D. & Limborg, Morten Tønsberg, 2024, I: mSystems. 9, 2, 29 s., e01043-23.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Hourly methane and carbon dioxide fluxes from temperate ponds

    Sø, Jonas Stage, Martinsen, K. T., Kragh, T. & Sand-Jensen, Kaj, 2024, I: Biogeochemistry. 167, s. 177-195 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet
  6. Udgivet

    Hymenopteran parasitoids reared from European gall midges (Diptera, Cecidomyiidae)

    Bruun, Hans Henrik, Haarder, S., Buhl, P. N. & Askew, R. R., 2024, I: Biodiversity Data Journal. 12, 34 s., e118487.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. E-pub ahead of print

    Hypoxia in tomato (Solanum lycopersicum) fruit during ripening: Biophysical elucidation by a 3D reaction–diffusion model

    Xiao, H., Verboven, P., Tong, Shuai, Pedersen, Ole & Nicolaï, B., 2024, (E-pub ahead of print) I: Plant Physiology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes

    Kuderna, L. F. K., Ulirsch, J. C., Rashid, S., Ameen, M., Sundaram, L., Hickey, G., Cox, A. J., Gao, H., Kumar, A., Aguet, F., Christmas, M. J., Clawson, H., Haeussler, M., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J. & 72 flere, Rouselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., KU, thw266, Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Karakikes, I., Wang, K. C., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Siepel, A., Kundaje, A., Paten, B., Lindblad-Toh, K., Rogers, J., Marques Bonet, T. & Farh, K. K. H., 2024, I: Nature. 625, s. 735–742 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Imaging of extracellular and intracellular ATP in pancreatic beta cells reveals correlation between glucose metabolism and purinergic signalling

    Ghiasi, S. M., Christensen, Nynne, Pedersen, Per Amstrup, Skovhøj, Emil Zeng & Novak, Ivana, 2024, I: Cellular Signalling. 117, 12 s., 111109.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Impact of salinity and temperature on the vital rates of co-occurring Calanus glacialis and C. finmarchicus from West Greenland

    Makri, M., Hansen, Per Juel & Gissel Nielsen, T., 2024, I: Marine Ecology - Progress Series. 729, s. 47-62 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. E-pub ahead of print

    Impact of the early COVID-19 pandemic on adult mental health-related dispensed medications, hospitalizations and specialist outpatient visits in Norway and Sweden: Interrupted time series analysis

    Moreno-Martos, D., Zhao, J., Li, H., Nyberg, F., Bjørndal, L. D., Hajiebrahimi, M., Wettermark, B., Aakjær, Mia, Andersen, Morten, Sessa, Maurizio, Lupattelli, A., Nordeng, H. & Morales, D. R., 2024, (E-pub ahead of print) I: British Journal of Clinical Pharmacology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. E-pub ahead of print

    Importance of integrating mixoplankton into marine ecosystem policy and management—Examples from the Marine Strategy Framework Directive

    Anschütz, A., Maselli, Maira, Traboni, C., Boon, A. R. & Stolte, W., 2024, (E-pub ahead of print) I: Integrated Environmental Assessment and Management.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Inhibitors of bacterial immune systems: discovery, mechanisms and applications

    Mayo-Muñoz, D., Pinilla Redondo, Rafael, Camara, Sarah, Birkholz, N. & Fineran, P. C., 2024, I: Nature Reviews Genetics. 25, 4, s. 237-254 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Insights into the circular: The cryptic plasmidome and its derived antibiotic resistome in the urban water systems

    Yu, Z., He, Wanli, Klincke, F., Madsen, Jonas Stenløkke, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Environment International. 183, 12 s., 108351.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Intake of different types of seafood and meat and risk of type 2 diabetes in women: a prospective study supported by a dietary intervention in mice

    Myrmel, L. S., Øyen, J., Brantsæter, A. L., Fjære, E., Haugvaldstad, K., Birkeland, K. I., Nygård, O., Kristiansen, Karsten, Egeland, G. M. & Madsen, L., 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 14 s., 8950.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Integrating coarse-grained molecular dynamics simulations with small-angle X-ray scattering data to characterize multidomain proteins and their assemblies

    Thomasen, Emil, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 205 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  17. E-pub ahead of print

    International consensus guidelines for the definition, detection, and interpretation of autophagy-dependent ferroptosis

    Chen, X., Tsvetkov, A. S., Shen, H., Isidoro, C., Ktistakis, N. T., Linkermann, A., Koopman, W. J. H., Simon, H., Galluzzi, L., Luo, S., Xu, D., Gu, W., Peulen, O., Cai, Q., Rubinsztein, D. C., Chi, J., Zhang, D. D., Li, C., Toyokuni, S., Liu, J. & 49 flere, Roh, J., Dai, E., Juhasz, G., Liu, W., Zhang, J., Yang, M., Liu, J., Zhu, L., Zou, W., Piacentini, M., Ding, W., Yue, Z., Xie, Y., Petersen, Morten, Gewirtz, D. A., Mandell, M. A., Chu, C. T., Sinha, D., Eftekharpour, E., Zhivotovsky, B., Besteiro, S., Gabrilovich, D. I., Kim, D., Kagan, V. E., Bayir, H., Chen, G., Ayton, S., Lünemann, J. D., Komatsu, M., Krautwald, S., Loos, B., Baehrecke, E. H., Wang, J., Lane, J. D., Sadoshima, J., Yang, W. S., Gao, M., Münz, C., Thumm, M., Kampmann, M., Yu, D., Lipinski, M. M., Jones, J. W., Jiang, X., Zeh, H. J., Kang, R., Klionsky, D. J., Kroemer, G. & Tang, D., 2024, (E-pub ahead of print) I: Autophagy. s. 1-34

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Interphylum dissemination of NDM-5-positive plasmids in hospital wastewater from Fuzhou, China: a single-centre, culture-independent, plasmid transmission study

    Yang, Q. E., Ma, X., Zeng, L., Wang, Q., Li, M., Teng, L., He, M., Liu, C., Zhao, M., Wang, M., Hui, D., Madsen, Jonas Stenløkke, Liao, H., Walsh, T. R. & Zhou, S., 2024, I: The Lancet Microbe. 5, 1, s. e13-e23 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Interspecies interactions in dairy biofilms drive community structure and response against cleaning and disinfection

    Sadiq, F. A., De Reu, K., Yang, Nan, Burmølle, Mette & Heyndrickx, M., 2024, I: Biofilm. 7, 13 s., 100195.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Interspecific interactions facilitate keystone species in a multispecies biofilm that promotes plant growth

    Yang, Nan, Røder, Henriette Lyng, Wicaksono, W. A., Wassermann, B., Russel, J., Li, Xuan Ji, Nesme, Joseph, Berg, G., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2024, I: The ISME Journal. 18, 1, 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Intra-colony spatial variance of oxyregulation and hypoxic thresholds for key Acropora coral species

    Dilernia, N. J., Woodcock, S., Camp, E. F., Hughes, D. J., Kühl, Michael & Suggett, D. J., 2024, I: Ecology and Evolution. 14, 3, 16 s., e11100.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Introgression and disruption of migration routes have shaped the genetic integrity of wildebeest populations

    Liu, X., Lin, L., Sinding, M. H. S., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Pečnerová, P., Balboa, R. F., Li, Z., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pinto, R. R., Wang, X., Kuja, J., Brüniche-Olsen, A., Meisner, J., Santander, C. G. & 8 flere, Ogutu, J. O., Masembe, C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Muwanika, V., Siegismund, Hans Redlef, Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida & Heller, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2921.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Investigations on Microbes Attached to the Cuticle of Phytonematodes

    Topalovic, Olivera, Radaković, Z. S., Elhady, A., Bredenbruch, S. & Heuer, H., 2024, Plant-Nematode Interactions. Molinari, S. (red.). Bind 2756. s. 257-270 14 s. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Isochrony in barks of Cape fur seal (Arctocephalus pusillus pusillus) pups and adults

    Osiecka, A. N., Fearey, J., Ravignani, A. & Burchardt, L. S., 2024, I: Ecology and Evolution. 14, 3, 11 s., e11085.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Isolation of potentially novel species expands the genomic and functional diversity of Lachnospiraceae

    Lin, X., Hu, T., Wu, Z., Li, L., Wang, Y., Wen, D., Liu, X., Li, W., Liang, H., Jin, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2024, I: iMeta. 3, 2, 18 s., e174.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Rauluseviciute, I., Riudavets-puig, R., Blanc-mathieu, R., Castro-mondragon, J., Ferenc, K., Kumar, V., Lemma, R. B., Lucas, J., Chèneby, J., Baranasic, D., Khan, A., Fornes, O., Gundersen, S., Johansen, M., Hovig, E., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav, Wasserman, W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2024, I: Nucleic Acids Symposium Series. 52, D1, s. D174–D182 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt