Albin Gustav Sandelin

Albin Gustav Sandelin

Professor


  1. Udgivet

    PROMoter uPstream Transcripts share characteristics with mRNAs and are produced upstream of all three major types of mammalian promoters

    Preker, P., Almvig, K., Christensen, M. S., Valen, E., Mapendano, C. K., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 19 maj 2011, I: Nucleic Acids Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Personalized B cell response to the Lactobacillus rhamnosus GG probiotic in healthy human subjects: a randomized trial

    Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Rago, Alfredo, Sloth, S., Hendel, J., Melsæther, C., Müller, C. V., Juul Nielsen, M., Strickertsson, J., Engelholm, Lars Henning, Vitting-Seerup, K., Jensen, Kim Bak, Baker, A. & Sandelin, Albin Gustav, 9 nov. 2020, I: Gut Microbes. 12, 1, s. 1-14 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality

    Ntini, E., Järvelin, A. I., Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Boyd, M., Jørgensen, M., Andersson, Robin, Hoof, I., Schein, A., Andersen, P. R., Andersen, P. K., Preker, P., Valen, E., Zhao, X., Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2013, I: Nature Structural and Molecular Biology. 20, s. 923-928 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data

    Chen, Y., Jørgensen, M., Kolde, R., Zhao, X., Parker, B., Valen, E., Wen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: BMC Genomics. 12, 1, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Prediction of regulatory elements

    Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Methods in Molecular Biology. 453, s. 233-44 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Principles for RNA metabolism and alternative transcription initiation within closely spaced promoters

    Chen, Y., Pai, A. A., Herudek, J., Lubas, M., Meola, N., Järvelin, A. I., Andersson, Robin, Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Nature Genetics. 48, 9, s. 984-994 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Regulating retrotransposon activity through the use of alternative transcription start sites

    Persson, J., Steglich, B., Smialowska, A., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Andersson, Robin, Schurra, C., Arcangioli, B., Sandelin, Albin Gustav, Nielsen, Olaf & Ekwall, K., 2016, I: E M B O Reports. 17, 5, s. 753-768 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Regulation of laminin γ2 expression by CDX2 in colonic epithelial cells is impaired during active inflammation

    Coskun, M., Soendergaard, C., Joergensen, S., Dahlgaard, K., Riis, Lene Buhl, Nielsen, Ole Haagen, Sandelin, Albin Gustav & Troelsen, J. T., 2017, I: Journal of Cellular Biochemistry. 118, 2, s. 298-307 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Relation between NOD2 genotype and changes in innate signaling in Crohn's disease on mRNA and miRNA levels

    Chen, Y., Salem, M., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Li, Yuan, Coskun, M., Seidelin, Jakob Benedict, Sandelin, Albin Gustav & Nielsen, Ole Haagen, 2017, I: npj Genomic Medicine. 2, 11 s., 3.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Remodeling of retrotransposon elements during epigenetic induction of adult visual cortical plasticity by HDAC inhibitors

    Lennartsson, A., Arner, E., Fagiolini, M., Saxena, A., Andersson, Robin, Takahashi, H., Noro, Y., Sng, J., Sandelin, Albin Gustav, Hensch, T. K. & Carninci, P., 2015, I: Epigenetics & Chromatin. 8, 15 s., 55.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Shared activity patterns arising at genetic susceptibility loci reveal underlying genomic and cellular architecture of human disease

    Baillie, J. K., Bretherick, A., Haley, C. S., Clohisey, S., Gray, A., Neyton, L. P. A., Barrett, J., Stahl, E. A., Tenesa, A., Andersson, R., Brown, J. B., Faulkner, G. J., Lizio, M., Schaefer, U., Daub, C., Itoh, M., Kondo, N., Lassmann, T., Kawai, J., Mole, D. & 14 flere, Bajic, V. B., Heutink, P., Rehli, M., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Suzuki, H., Satsangi, J., Wells, C. A., Hacohen, N., Freeman, T. C., Hayashizaki, Y., Carninci, P., Forrest, A. R. R. & Hume, D. A., 2018, I: PLoS Computational Biology. 14, 3, 24 s., e1005934.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Spatially resolved analysis of microenvironmental gradient impact on cancer cell phenotypes

    Auxillos, Jamie Yam, Crouigneau, R., Li, Y. F., Dai, Yifan, Stigliani, Arnaud, Tavernaro, I., Resch-Genger, U., Sandelin, Albin Gustav, Marie, R. & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2024, I: Science Advances. 10, 18, 17 s., eadn3448.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Systematic clustering of transcription start site landscapes

    Zhao, X., Valen, E., Parker, B. J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: P L o S One. 6, 8, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis

    Pauli, A., Valen, E., Lin, M. F., Garber, M., Vastenhouw, N. L., Levin, J. Z., Fan, L., Sandelin, Albin Gustav, Rinn, J. L., Regev, A. & Schier, A. F., 2012, I: Genome Research. 22, s. 577-591 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    The RNA exosome contributes to gene expression regulation during stem cell differentiation

    Llinares, M. L., Karadoulama, Evdoxia, Chen, Y., Wojenski, L. A., Villafano, G. J., Lange, Jette Bornholdt, Andersson, Robin, Core, L., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 21, s. 11502-11513

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    The RNA exosome shapes the expression of key protein-coding genes

    Wu, M., Karadoulama, Evdoxia, Lloret-llinares, M., Rouviere, J. O., Vaagensø, C. S., Moravec, M., Li, B., Wang, J., Wu, G., Gockert, M. A. M., Pelechano, V., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 15, s. 8509-8528

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    The Value of Example Solutions in Pharmacy Education: The role of seniority and gender.

    Sandelin, Albin Gustav, Hansen, H. R., Baldursdóttir, S. G., Kristensen, Anders Skov, Bak, Lasse Kristoffer, Christiansen, Frederik Voetmann & Selhuber-Unkel, C. J. M., 2011, I: Pharmacy Education. 11, 1, s. 32-37 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The adipose transcriptional response to insulin is determined by obesity, not insulin sensitivity

    Rydén, M., Hrydziuszko, O., Mileti, E., Raman, A., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Toft, E., Qvist, V., Näslund, E., Thorell, A., Andersson, D. P., Dahlman, I., Gao, H., Sandelin, Albin Gustav, Daub, C. O. & Arner, P., 2016, I: Cell Reports. 16, 9, s. 2317-2326 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    The constrained maximal expression level owing to haploidy shapes gene content on the mammalian X chromosome

    Hurst, L. D., Ghanbarian, A. T., Forrest, A. R. R., Huminiecki, L., Rehli, M., Kenneth Baillie, J., de Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E. & 243 flere, Schmidl, C., Schaefer, U., Medvedeva, Y. A., Plessy, C., Vitezic, M., Severin, J., Semple, C. A., Ishizu, Y., Young, R. S., Francescatto, M., Alam, I., Albanese, D., Altschuler, G. M., Arakawa, T., Archer, J. A. C., Arner, P., Babina, M., Baker, S., Balwierz, P. J., Beckhouse, A. G., Pradhan, S. B., Blake, J. A., Blumenthal, A., Bodega, B., Bonetti, A., Briggs, J., Brombacher, F., Maxwell Burroughs, A., Califano, A., Cannistraci, C. V., Carbajo, D., Chen, Y., Chierici, M., Ciani, Y., Clevers, H. C., Dalla, E., Davis, C. A., Detmar, M., Diehl, A. D., Dohi, T., Drabløs, F., Edge, A. S. B., Edinger, M., Ekwall, K., Endoh, M., Enomoto, H., Fagiolini, M., Fairbairn, L., Fang, H., Farach-Carson, M. C., Faulkner, G. J., Favorov, A. V., Fisher, M. E., Frith, M. C., Fujita, R., Fukuda, S., Furlanello, C., Furuno, M., Furusawa, J. I., Geijtenbeek, T. B., Gibson, A., Gingeras, T., Goldowitz, D., Gough, J., Guhl, S., Guler, R., Gustincich, S., Ha, T. J., Hamaguchi, M., Hara, M., Harbers, M., Harshbarger, J., Hasegawa, A., Hasegawa, Y., Hashimoto, T., Herlyn, M., Hitchens, K. J., Ho Sui, S. J., Hofmann, O. M., Hoof, I., Hori, F., Huminiecki, L., Iida, K., Ikawa, T., Jankovic, B. R., Jia, H., Joshi, A., Jurman, G., Kaczkowski, B., Kai, C., Kaida, K., Kaiho, A., Kajiyama, K., Kanamori, M. K., Kasianov, A. S., Kasukawa, T., Katayama, S., Kato, S., Kawaguchi, S., Kawamoto, H., Kawamura, Y. I., Kawashima, T., Kempfle, J. S., Kenna, T. J., Kere, J., Khachigian, L. M., Kitamura, T., Peter Klinken, S., Knox, A. J., Kojima, M., Kojima, S., Kondo, N., Koseki, H., Koyasu, S., Krampitz, S., Kubosaki, A., Kwon, A. T., Laros, J. F. J., Lee, W., Lennartsson, A., Li, K., Lilje, B., Lipovich, L., Mackay, A. S., Manabe, R., Mar, J. C., Marchand, B., Mathelier, A., Mejhert, N., Meynert, A., Mizuno, Y., de Lima Morais, D. A., Morikawa, H., Morimoto, M., Moro, K., Motakis, E., Motohashi, H., Mummery, C. L., Murata, M., Nagao, S. S., Nakachi, Y., Nakahara, F., Nakamura, T., Nakamura, Y., Nakazato, K., van Nimwegen, E., Ninomiya, N., Nishiyori, H., Noma, S., Nozaki, T., Ogishima, S., Ohkura, N., Ohmiya, H., Ohno, H., Ohshima, M., Okada, M. H., Okazaki, Y., Orlando, V., Ovchinnikov, D. A., Pain, A., Passier, R., Patrikakis, M., Persson, H., Piazza, S., Prendergast, J. G. D., Rackham, O. J. L., Ramilowski, J. A., Rashid, M., Ravasi, T., Rizzu, P., Roncador, M., Roy, S., Rye, M. B., Saijyo, E., Sajantila, A., Saka, A., Sakaguchi, S., Sakai, M., Sato, H., Satoh, H., Savvi, S., Saxena, A., Schneider, C., Schultes, E. A., Schulze-Tanzil, G. G., Schwegmann, A., Sengstag, T., Sheng, G., Shimoji, H., Shimoni, Y., Shin, J. W., Simon, C., Sugiyama, D., Sugiyama, T., Suzuki, M., Suzuki, N., Swoboda, R. K., 't Hoen, P. A. C., Tagami, M., Takahashi, N., Takai, J., Tanaka, H., Tatsukawa, H., Tatum, Z., Thompson, M., Toyoda, H., Toyoda, T., Valen, E., van de Wetering, M., van den Berg, L. M., Verardo, R., Vijayan, D., Vorontsov, I. E., Wasserman, W. W., Watanabe, S., Wells, C. A., Winteringham, L. N., Wolvetang, E., Wood, E. J., Yamaguchi, Y., Yamamoto, M., Yoneda, M., Yonekura, Y., Yoshida, S., Zabierowski, S. E., Zhang, P. G., Zhao, X., Zucchelli, S., Summers, K. M., Suzuki, H., Daub, C. O., Kawai, J., Heutink, P., Hide, W., Freeman, T. C., Lenhard, B., Bajic, V. B., Taylor, M. S., Makeev, V. J., Sandelin, Albin Gustav, Hume, D. A., Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2015, I: PLoS Biology. 13, 12, 48 s., e1002315.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    The frequent evolutionary birth and death of functional promoters in mouse and human

    Young, R. S., Hayashizaki, Y., Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Kawaji, H., Itoh, M., Lassmann, T., Carninci, P., Bickmore, W. A., Forrest, A. R. & Taylor, M. S., 2015, I: Genome Research. 25, s. 1546-1557 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    The genome landscape of ER{alpha}- and ER{beta}-binding DNA regions.

    Liu, Y., Gao, H., Marstrand, T. T., Ström, A., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Gustafsson, J. & Dahlman-Wright, K., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The landscape of isoform switches in human cancers

    Vitting-Seerup, K. & Sandelin, Albin Gustav, sep. 2017, I: Molecular Cancer Research. 15, 9, s. 1206-1220 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line

    Suzuki, H., Forrest, A. R. R., van Nimwegen, E., Daub, C. O., Balwierz, P. J., Irvine, K. M., Lassmann, T., Ravasi, T., Hasegawa, Y., de Hoon, M. J. L., Katayama, S., Schroder, K., Carninci, P., Tomaru, Y., Kanamori-Katayama, M., Kubosaki, A., Akalin, A., Ando, Y., Arner, E., Asada, M. & 31 flere, Asahara, H., Bailey, T., Bajic, V. B., Bauer, D., Beckhouse, A. G., Bertin, N., Björkegren, J., Brombacher, F., Bulger, E., Chalk, A. M., Chiba, J., Cloonan, N., Dawe, A., Dostie, J., Engström, P. G., Essack, M., Faulkner, G. J., Fink, J. L., Fredman, D., Fujimori, K., Furuno, M., Gojobori, T., Gough, J., Grimmond, S. M., Jacobsen, A., Krogh, Anders, Nygaard, S., Sandelin, Albin Gustav, Valen, E., Winther, Ole & Riken Omics Science Center, R. O. S. C., 2009, I: Nature Genetics. 41, 5, s. 553-62 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    TrancriptomeReconstructoR: data-driven annotation of complex transcriptomes

    Ivanov, M., Sandelin, Albin Gustav & Marquardt, Sebastian, 2021, I: BMC Bioinformatics. 22, 15 s., 290.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells

    Arner, E., Daub, C. O., Vitting-Seerup, K., Andersson, R., Lilje, B., Drabløs, F., Lennartsson, A., Rönnerblad, M., Hrydziuszko, O., Vitezic, M., Freeman, T. C., Alhendi, A. M. N., Arner, P., Axton, R., Baillie, J. K., Beckhouse, A., Bodega, B., Briggs, J., Brombacher, F., Davis, M. & 89 flere, Detmar, M., Ehrlund, A., Endoh, M., Eslami, A., Fagiolini, M., Fairbairn, L., Faulkner, G. J., Ferrai, C., Fisher, M. E., Forrester, L., Goldowitz, D., Guler, R., Ha, T., Hara, M., Herlyn, M., Ikawa, T., Kai, C., Kawamoto, H., Khachigian, L. M., Klinken, S. P., Kojima, S., Koseki, H., Klein, S., Mejhert, N., Miyaguchi, K., Mizuno, Y., Morimoto, M., Morris, K. J., Mummery, C., Nakachi, Y., Ogishima, S., Okada-Hatakeyama, M., Okazaki, Y., Orlando, V., Ovchinnikov, D., Passier, R., Patrikakis, M., Pombo, A., Qin, X., Roy, S., Sato, H., Savvi, S., Saxena, A., Schwegmann, A., Sugiyama, D., Swoboda, R., Tanaka, H., Tomoiu, A., Winteringham, L. N., Wolvetang, E., Yanagi-Mizuochi, C., Yoneda, M., Zabierowski, S., Zhang, P., Abugessaisa, I., Bertin, N., Diehl, A. D., Fukuda, S., Furuno, M., Harshbarger, J., Hasegawa, A., Hori, F., Ishikawa-Kato, S., Ishizu, Y., Itoh, M., Kawashima, T., Kojima, M., Kondo, N., Lizio, M., Meehan, T. F., Mungall, C. J., Murata, M., Nishiyori-Sueki, H., Sahin, S., Nagao-Sato, S., Severin, J., de Hoon, M. J. L., Kawai, J., Kasukawa, T., Lassmann, T., Suzuki, H., Kawaji, H., Summers, K. M., Wells, C., Hume, D. A., Forrest, A. R. R., Sandelin, Albin Gustav, Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2015, I: Science (New York, N.Y.). 347, 6225, s. 1010-1014 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 5007