Albin Gustav Sandelin
Professor
Bioinformatik og RNA Biologi
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- Udgivet
spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data
Vitting-Seerup, K., Porse, Bo Torben, Sandelin, Albin Gustav & Waage, J., 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, s. 1-7 7 s., 81.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Update of the FANTOM web resource: high resolution transcriptome of diverse cell types in mammals
Lizio, M., Harshbarger, J., Abugessaisa, I., Noguchi, S., Kondo, A., Severin, J., Mungall, C., Arenillas, D., Mathelier, A., Medvedeva, Y. A., Lennartsson, A., Drabløs, F., Ramilowski, J. A., Rackham, O., Gough, J., Andersson, R., Sandelin, A. G., Ienasescu, H-I., Ono, H., Bono, H. & 5 flere, , 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, D1, s. D737-D743 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptome analysis of recurrently deregulated genes across multiple cancers identifies new pan-cancer biomarkers
Kaczkowski, B., Tanaka, Y., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Andersson, Robin, Itoh, M., Lassmann, T., the FANTOM5 consortium, Hayashizaki, Y., Carninci, P. & Forrest, A. R. R., 2016, I: Cancer Research. 76, 2, s. 216-226Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional regulation of gene expression clusters in motor neurons following spinal cord injury
Ryge, J., Winther, Ole, Wienecke, Jacob, Sandelin, Albin Gustav, Westerdahl, A., Hultborn, Hans & Kiehn, O., 2010, I: BMC Genomics. 11, 1, s. 365 22 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions
Davis, M. R., Andersson, Robin, Severin, J., de Hoon, M., Bertin, N., Baillie, J. K., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Forrest, A. R. R. & Summers, K. M., 2014, I: Molecular Genetics and Metabolism. 112, 3, s. 73-83 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional dynamics during human adipogenesis and its link to adipose morphology and distribution
Ehrlund, A., Mejhert, N., Björk, C., Andersson, Robin, Kulyté, A., Åström, G., Itoh, M., Kawaji, H., Lassmann, T., Daub, C. O., Carninci, P., Forrest, A. R. R., Hayashizaki, Y., Sandelin, Albin Gustav, Ingelsson, E., FANTOM Consortium, Rydén, M., Laurencikiene, J., Arner, P. & Arner, E., 2017, I: Diabetes. 66, 1, s. 218-230 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional and epigenomic profiling identifies YAP signaling as a key regulator of intestinal epithelium maturation
Pikkupeura, Laura Maarit, Bardini Bressan, Raul, Guiu, J., Chen, Y., Maimets, Martti, Mayer, Daniela, Schweiger, P. J., Hansen, Stine Lind, Maciag, Grzegorz Jerzy, Larsen, Hjalte List, Lõhmussaar, Kadi, Pedersen, M. T., Teves, Joji Marie Yap, Lange, Jette Bornholdt, Benes, V., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, Kim Bak, 2023, I: Science Advances. 9, 28, 16 s., eadf9460.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells
Arner, E., Daub, C. O., Vitting-Seerup, K., Andersson, R., Lilje, B., Drabløs, F., Lennartsson, A., Rönnerblad, M., Hrydziuszko, O., Vitezic, M., Freeman, T. C., Alhendi, A. M. N., Arner, P., Axton, R., Baillie, J. K., Beckhouse, A., Bodega, B., Briggs, J., Brombacher, F., Davis, M. & 89 flere, , 2015, I: Science (New York, N.Y.). 347, 6225, s. 1010-1014 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
TrancriptomeReconstructoR: data-driven annotation of complex transcriptomes
Ivanov, M., Sandelin, Albin Gustav & Marquardt, Sebastian, 2021, I: BMC Bioinformatics. 22, 15 s., 290.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line
Suzuki, H., Forrest, A. R. R., van Nimwegen, E., Daub, C. O., Balwierz, P. J., Irvine, K. M., Lassmann, T., Ravasi, T., Hasegawa, Y., de Hoon, M. J. L., Katayama, S., Schroder, K., Carninci, P., Tomaru, Y., Kanamori-Katayama, M., Kubosaki, A., Akalin, A., Ando, Y., Arner, E., Asada, M. & 31 flere, , 2009, I: Nature Genetics. 41, 5, s. 553-62 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The landscape of isoform switches in human cancers
Vitting-Seerup, K. & Sandelin, Albin Gustav, sep. 2017, I: Molecular Cancer Research. 15, 9, s. 1206-1220 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome landscape of ER{alpha}- and ER{beta}-binding DNA regions.
Liu, Y., Gao, H., Marstrand, T. T., Ström, A., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Gustafsson, J. & Dahlman-Wright, K., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The frequent evolutionary birth and death of functional promoters in mouse and human
Young, R. S., Hayashizaki, Y., Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Kawaji, H., Itoh, M., Lassmann, T., Carninci, P., Bickmore, W. A., Forrest, A. R. & Taylor, M. S., 2015, I: Genome Research. 25, s. 1546-1557 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The constrained maximal expression level owing to haploidy shapes gene content on the mammalian X chromosome
Hurst, L. D., Ghanbarian, A. T., Forrest, A. R. R., Huminiecki, L., Rehli, M., Kenneth Baillie, J., de Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E. & 243 flere, , 2015, I: PLoS Biology. 13, 12, 48 s., e1002315.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The adipose transcriptional response to insulin is determined by obesity, not insulin sensitivity
Rydén, M., Hrydziuszko, O., Mileti, E., Raman, A., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Toft, E., Qvist, V., Näslund, E., Thorell, A., Andersson, D. P., Dahlman, I., Gao, H., Sandelin, Albin Gustav, Daub, C. O. & Arner, P., 2016, I: Cell Reports. 16, 9, s. 2317-2326 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Value of Example Solutions in Pharmacy Education: The role of seniority and gender.
Sandelin, Albin Gustav, Hansen, H. R., Baldursdóttir, S. G., Kristensen, Anders Skov, Bak, Lasse Kristoffer, Christiansen, Frederik Voetmann & Selhuber-Unkel, C. J. M., 2011, I: Pharmacy Education. 11, 1, s. 32-37 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The RNA exosome shapes the expression of key protein-coding genes
Wu, M., Karadoulama, Evdoxia, Lloret-llinares, M., Rouviere, J. O., Vaagensø, C. S., Moravec, M., Li, B., Wang, J., Wu, G., Gockert, M. A. M., Pelechano, V., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 15, s. 8509-8528Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The RNA exosome contributes to gene expression regulation during stem cell differentiation
Llinares, M. L., Karadoulama, Evdoxia, Chen, Y., Wojenski, L. A., Villafano, G. J., Lange, Jette Bornholdt, Andersson, Robin, Core, L., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 21, s. 11502-11513Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis
Pauli, A., Valen, E., Lin, M. F., Garber, M., Vastenhouw, N. L., Levin, J. Z., Fan, L., Sandelin, Albin Gustav, Rinn, J. L., Regev, A. & Schier, A. F., 2012, I: Genome Research. 22, s. 577-591 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Systematic clustering of transcription start site landscapes
Zhao, X., Valen, E., Parker, B. J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: P L o S One. 6, 8, 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatially resolved analysis of microenvironmental gradient impact on cancer cell phenotypes
Auxillos, Jamie Yam, Crouigneau, R., Li, Y. F., Dai, Yifan, Stigliani, Arnaud, Tavernaro, I., Resch-Genger, U., Sandelin, Albin Gustav, Marie, R. & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2024, I: Science Advances. 10, 18, 17 s., eadn3448.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shared activity patterns arising at genetic susceptibility loci reveal underlying genomic and cellular architecture of human disease
Baillie, J. K., Bretherick, A., Haley, C. S., Clohisey, S., Gray, A., Neyton, L. P. A., Barrett, J., Stahl, E. A., Tenesa, A., Andersson, R., Brown, J. B., Faulkner, G. J., Lizio, M., Schaefer, U., Daub, C., Itoh, M., Kondo, N., Lassmann, T., Kawai, J., Mole, D. & 14 flere, , 2018, I: PLoS Computational Biology. 14, 3, 24 s., e1005934.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Remodeling of retrotransposon elements during epigenetic induction of adult visual cortical plasticity by HDAC inhibitors
Lennartsson, A., Arner, E., Fagiolini, M., Saxena, A., Andersson, Robin, Takahashi, H., Noro, Y., Sng, J., Sandelin, Albin Gustav, Hensch, T. K. & Carninci, P., 2015, I: Epigenetics & Chromatin. 8, 15 s., 55.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Relation between NOD2 genotype and changes in innate signaling in Crohn's disease on mRNA and miRNA levels
Chen, Y., Salem, M., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Li, Yuan, Coskun, M., Seidelin, Jakob Benedict, Sandelin, Albin Gustav & Nielsen, Ole Haagen, 2017, I: npj Genomic Medicine. 2, 11 s., 3.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regulation of laminin γ2 expression by CDX2 in colonic epithelial cells is impaired during active inflammation
Coskun, M., Soendergaard, C., Joergensen, S., Dahlgaard, K., Riis, Lene Buhl, Nielsen, Ole Haagen, Sandelin, Albin Gustav & Troelsen, J. T., 2017, I: Journal of Cellular Biochemistry. 118, 2, s. 298-307 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regulating retrotransposon activity through the use of alternative transcription start sites
Persson, J., Steglich, B., Smialowska, A., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Andersson, Robin, Schurra, C., Arcangioli, B., Sandelin, Albin Gustav, Nielsen, Olaf & Ekwall, K., 2016, I: E M B O Reports. 17, 5, s. 753-768 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Principles for RNA metabolism and alternative transcription initiation within closely spaced promoters
Chen, Y., Pai, A. A., Herudek, J., Lubas, M., Meola, N., Järvelin, A. I., Andersson, Robin, Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Nature Genetics. 48, 9, s. 984-994 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of regulatory elements
Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Methods in Molecular Biology. 453, s. 233-44 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data
Chen, Y., Jørgensen, M., Kolde, R., Zhao, X., Parker, B., Valen, E., Wen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: BMC Genomics. 12, 1, 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality
Ntini, E., Järvelin, A. I., Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Boyd, M., Jørgensen, M., Andersson, Robin, Hoof, I., Schein, A., Andersen, P. R., Andersen, P. K., Preker, P., Valen, E., Zhao, X., Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2013, I: Nature Structural and Molecular Biology. 20, s. 923-928 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Personalized B cell response to the Lactobacillus rhamnosus GG probiotic in healthy human subjects: a randomized trial
Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Rago, Alfredo, Sloth, S., Hendel, J., Melsæther, C., Müller, C. V., Juul Nielsen, M., Strickertsson, J., Engelholm, Lars Henning, Vitting-Seerup, K., Jensen, Kim Bak, Baker, A. & Sandelin, Albin Gustav, 9 nov. 2020, I: Gut Microbes. 12, 1, s. 1-14 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PROMoter uPstream Transcripts share characteristics with mRNAs and are produced upstream of all three major types of mammalian promoters
Preker, P., Almvig, K., Christensen, M. S., Valen, E., Mapendano, C. K., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 19 maj 2011, I: Nucleic Acids Research.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells
Agrawal-Singh, S., Lerdrup, Mads, Gomes, A. R., van de Werken, H. J. G., Johansen, Jens Vilstrup, Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Helin, K. & Hansen, K., 2019, I: eLife. 8, s. 1-32 32 s., e40364.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PAMP-triggered genetic reprogramming involves widespread alternative transcription initiation and an immediate transcription factor wave
Thieffry, A., López Márquez, Diego, Lange, Jette Bornholdt, Gholami Malekroudi, M., Bressendorff, Simon, Barghetti, A., Sandelin, Albin Gustav & Brodersen, Peter, 2022, I: The Plant Cell. 34, 7, 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Organismal benefits of transcription speed control at gene boundaries
Leng, Xueyuan, Ivanov, M., Kindgren, P., Malik, I., Thieffry, A., Brodersen, Peter, Sandelin, Albin Gustav, Kaplan, C. D. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: EMBO Reports. 21, 4, 16 s., e49315.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase
Ienasescu, H., Li, K., Andersson, Robin, Vitezic, M., Rennie, Sarah, Chen, Y., Vitting-Seerup, K., Lagoni, E., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, de Hoon, M. J. L., Kawaji, H., Lassmann, T., FANTOM Consortium, F. C., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2016, 0, 10 s., baw144.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species
Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
New histone supply regulates replication fork speed and PCNA unloading
Mejlvang, J., Feng, Y., Alabert, C., Neelsen, K. J., Jasencakova, Zuzana, Zhao, X., Lees, M., Sandelin, Albin Gustav, Pasero, P., Lopes, M. & Groth, Anja, 6 jan. 2014, I: Journal of Cell Biology. 204, 1, s. 29-43 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular architecture of transcription factor hotspots in early adipogenesis
Siersbæk, R., Baek, S., Rabiee, A., Nielsen, R., Traynor, S., Clarke, N., Sandelin, Albin Gustav, Jensen, O. N., Sung, M., Hager, G. L. & Mandrup, S., 2014, I: Cell Reports. 7, 5, s. 1434-1442 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling promoter grammars with evolving hidden Markov models
Won, K., Sandelin, Albin Gustav, Marstrand, T. T. & Krogh, Anders, 2008, I: Bioinformatics. 24, 15, s. 1669-75 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation
Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Carninci, P., 2012, I: Nature Reviews. Genetics. 13, 4, s. 233-245 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mesenchymal-epithelial crosstalk shapes intestinal regionalisation via Wnt and Shh signalling
Maimets, Martti, Pedersen, M. T., Guiu, J., Dreier, J., Thodberg, Malte, Antoku, Yasuko, Schweiger, P. J., Rib, Leonor, Bardini Bressan, Raul, Miao, Y., Garcia, K. C., Sandelin, Albin Gustav, Serup, Palle & Jensen, Kim Bak, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 715.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mammalian RNA polymerase II core promoters: insights from genome-wide studies.
Sandelin, Albin Gustav, Carninci, P., Lenhard, B., Ponjavic, J., Hayashizaki, Y. & Hume, D. A., 2007, I: Nature Reviews. Genetics. 8, 6, s. 424-36 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lactate receptor GPR81 drives breast cancer growth and invasiveness through regulation of ECM properties and Notch ligand DLL4
Jørgensen, Kathrine Lundø, Dmytriyeva, O., Spøhr, L., Alves, Eliana Carolina Goncalves, Yao, Jiayi, Puig Blasco, Laia, Trauelsen, Mette, Ponniah, M., Severin, M., Sandelin, Albin Gustav, Kveiborg, Marie, Schwartz, Thue W. & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2023, I: BMC Cancer. 23, 1, 20 s., 1136.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.
Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles
Rauluseviciute, I., Riudavets-puig, R., Blanc-mathieu, R., Castro-mondragon, J., Ferenc, K., Kumar, V., Lemma, R. B., Lucas, J., Chèneby, J., Baranasic, D., Khan, A., Fornes, O., Gundersen, S., Johansen, M., Hovig, E., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav, Wasserman, W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2024, I: Nucleic Acids Symposium Series. 52, D1, s. D174–D182 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR 2022: the 9th release of the open-access database of transcription factor binding profiles
Castro-Mondragon, J. A., Riudavets-Puig, R., Rauluseviciute, I., Lemma, R. B., Turchi, L., Blanc-Mathieu, R., Lucas, J., Boddie, P., Khan, A., Perez, N. M., Fornes, O., Leung, T. Y., Aguirre, A., Hammal, F., Schmelter, D., Baranasic, D., Ballester, B., Sandelin, A., Lenhard, B., Vandepoele, K. & 3 flere, , 2022, I: Nucleic acids symposium series. 50, D1, s. D165-D173 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor binding profiles
Fornes, O., Castro-Mondragon, J. A., Khan, A., van der Lee, R., Zhang, X., Richmond, P. A., Modi, B. P., Correard, S., Gheorghe, M., Baranašić, D., Santana-Garcia, W., Tan, G., Chèneby, J., Ballester, B., Parcy, F., Sandelin, Albin Gustav, Lenhard, B., Wasserman, W. W. & Mathelier, A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, D1, s. D87-D92 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR 2018: update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework
Khan, A., Fornes, O., Stigliani, A., Gheorghe, M., Castro-Mondragon, J. A., van der Lee, R., Bessy, A., Chèneby, J., Kulkarni, S. R., Tan, G., Baranasic, D., Arenillas, D. J., Sandelin, Albin Gustav, Vandepoele, K., Lenhard, B., Ballester, B., Wasserman, W. W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, D1, s. D260-D266 7 s., gkx1126.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5007
Flest downloads
-
3493
downloads
spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3341
downloads
Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2988
downloads
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet