Sarah Rennie
Adjunkt
- 2024
- E-pub ahead of print
High N6-methyladenosine-activated TCEAL8 mRNA is a novel pancreatic cancer marker
Hara, T., Meng, S., Sato, H., Tatekawa, S., Sasaki, K., Takeda, Y., Tsuji, Y., Arao, Y., Ofusa, K., Kitagawa, T., Yamada, D., Takahashi, H., Kobayashi, S., Motooka, D., Suzuki, Y., Rennie, S., Uchida, S., Mori, M., Ogawa, K., Doki, Y. & 2 flere, , 2024, (E-pub ahead of print) I: Cancer Science.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recommendations for Bioinformatic Tools in lncRNA Research
Distefano, R., Ilieva, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2024, I: Current Bioinformatics. 19, 1, s. 14-20 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Benchmarking RNA Editing Detection Tools
Morales, D. R., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: BioTech. 12, 3, 18 s., 56.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DoxoDB: A Database for the Expression Analysis of Doxorubicin-Induced lncRNA Genes
Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 4, 24 s., 39.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plant YTHDF proteins are direct effectors of antiviral immunity against an N6-methyladenosine-containing RNA virus
Martínez-Pérez, M., Aparicio, F., Arribas Hernandez, Laura, Tankmar, Mathias Due, Rennie, Sarah, von Bülow, Sören, Lindorff-Larsen, Kresten, Brodersen, Peter & Pallas, V., 2023, I: EMBO Journal. 42, 18, 17 s., e113378.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Potential usages of A-to-I RNA editing patterns as diagnostic biomarkers
Rodriguez Morales, D., Ilieva, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: American journal of physiology. Cell physiology. 324, 4, s. C837-C842 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Systematic Analysis of Long Non-Coding RNAs in Inflammasome Activation in Monocytes/Macrophages
Qian, N., Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 5, 16 s., 50.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
T2DB: A Web Database for Long Non-Coding RNA Genes in Type II Diabetes
Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Ishii, H., Aikawa, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 3, 20 s., 30.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcription factor expression is the main determinant of variability in gene co-activity
van Duin, Lucas, Krautz, Robert, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2023, I: Molecular Systems Biology. 19, 7, 17 s., e11392.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
- Udgivet
Promoter sequence and architecture determine expression variability and confer robustness to genetic variants
Einarsson, H., Salvatore, Marco, Vaagenso, C., Alcaraz, N., Lange, Jette Bornholdt, Rennie, Sarah & Andersson, Robin, 2022, I: eLife. 2022, 36 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- 2021
- Udgivet
Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network
Grapotte, M., Saraswat, M., Bessière, C., Menichelli, C., Ramilowski, J. A., Severin, J., Hayashizaki, Y., Itoh, M., Tagami, M., Murata, M., Kojima-Ishiyama, M., Noma, S., Noguchi, S., Kasukawa, T., Hasegawa, A., Suzuki, H., Nishiyori-Sueki, H., Frith, M. C., Abugessaisa, I., Aitken, S. & 31 flere, , 2021, I: Nature Communications. 12, 18 s., 3297.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Principles of mRNA targeting via the Arabidopsis m6A-binding protein ECT2
Arribas Hernandez, Laura, Rennie, Sarah, Köster, T., Porcelli, C., Lewinski, M., Staiger, D., Andersson, Robin & Brodersen, Peter, 2021, I: eLife. 10, 33 s., e72375.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The YTHDF proteins ECT2 and ECT3 bind largely overlapping target sets and influence target mRNA abundance, not alternative polyadenylation
Arribas Hernandez, Laura, Rennie, Sarah, Schon, M., Porcelli, C., Enugutti, B., Andersson, Robin, Nodine, M. D. & Brodersen, Peter, 2021, I: eLife. 10, 27 s., e72377.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
hyperTRIBER: a flexible R package for the analysis of differential RNA editing
Rennie, Sarah, Magnusson, D. H. & Andersson, Robin, 2021, 12 s.Publikation: Working paper › Preprint › Forskning
- 2018
- Udgivet
Transcription start site analysis reveals widespread divergent transcription in D. melanogaster and core promoter-encoded enhancer activities
Rennie, Sarah, Dalby, M., Lloret-Llinares, M., Bakoulis, Stylianos, Dalager Vaagensø, C., Jensen, T. H. & Andersson, Robin, 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 11, s. 5455-5469 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional decomposition reveals active chromatin architectures and cell specific regulatory interactions
Rennie, Sarah, Dalby, M., van Duin, Lucas & Andersson, Robin, 2018, I: Nature Communications. 9, 16 s., 487.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase
Ienasescu, H., Li, K., Andersson, Robin, Vitezic, M., Rennie, Sarah, Chen, Y., Vitting-Seerup, K., Lagoni, E., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, de Hoon, M. J. L., Kawaji, H., Lassmann, T., FANTOM Consortium, F. C., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2016, 0, 10 s., baw144.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 143262591
Flest downloads
-
225
downloads
Transcriptional decomposition reveals active chromatin architectures and cell specific regulatory interactions
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
176
downloads
On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
112
downloads
Transcription start site analysis reveals widespread divergent transcription in D. melanogaster and core promoter-encoded enhancer activities
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet