Albin Gustav Sandelin
Professor
Bioinformatik og RNA Biologi
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- Udgivet
PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells
Agrawal-Singh, S., Lerdrup, Mads, Gomes, A. R., van de Werken, H. J. G., Johansen, Jens Vilstrup, Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Helin, K. & Hansen, K., 2019, I: eLife. 8, s. 1-32 32 s., e40364.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dioxin increases the interaction between aryl hydrocarbon receptor and estrogen receptor alpha at human promoters
Ahmed, S., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav & Matthews, J., 2009, I: Toxicological Sciences. 111, 2, s. 254-266Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species
Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An atlas of active enhancers across human cell types and tissues
Andersson, R., Gebhard, C., Miguel-Escalada, I., Hoof, I., Lange, J. B., Boyd, M., Chen, Y., Zhao, X., Schmidl, C., Suzuki, T., Ntini, E., Arner, E., Valen, E., Li, K., Schwarzfischer, L., Glatz, D., Raithel, J., Lilje, B., Rapin, N., Bagger, F. O. & 30 flere, , 2014, I: Nature. 507, 7493, s. 455-461 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A unified architecture of transcriptional regulatory elements
Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav & Danko, C. G., aug. 2015, I: Trends in Genetics. 31, 8, s. 426-433 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Human gene promoters are intrinsically bidirectional
Andersson, Robin, Chen, Y., Core, L., Lis, J. T., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2015, I: Molecular Cell. 60, 3, s. 346-347 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements
Andersson, Robin & Sandelin, Albin Gustav, 2020, I: Nature Reviews Genetics. 21, 2, s. 71-87 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells
Arner, E., Daub, C. O., Vitting-Seerup, K., Andersson, R., Lilje, B., Drabløs, F., Lennartsson, A., Rönnerblad, M., Hrydziuszko, O., Vitezic, M., Freeman, T. C., Alhendi, A. M. N., Arner, P., Axton, R., Baillie, J. K., Beckhouse, A., Bodega, B., Briggs, J., Brombacher, F., Davis, M. & 89 flere, , 2015, I: Science (New York, N.Y.). 347, 6225, s. 1010-1014 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shared activity patterns arising at genetic susceptibility loci reveal underlying genomic and cellular architecture of human disease
Baillie, J. K., Bretherick, A., Haley, C. S., Clohisey, S., Gray, A., Neyton, L. P. A., Barrett, J., Stahl, E. A., Tenesa, A., Andersson, R., Brown, J. B., Faulkner, G. J., Lizio, M., Schaefer, U., Daub, C., Itoh, M., Kondo, N., Lassmann, T., Kawai, J., Mole, D. & 14 flere, , 2018, I: PLoS Computational Biology. 14, 3, 24 s., e1005934.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project.
Birney, E., Stamatoyannopoulos, J. A., Dutta, A., Guigó, R., Gingeras, T. R., Margulies, E. H., Weng, Z., Snyder, M., Dermitzakis, E. T., Thurman, R. E., Kuehn, M. S., Taylor, C. M., Neph, S., Koch, C. M., Asthana, S., Malhotra, A., Adzhubei, I., Greenbaum, J. A., Andrews, R. M., Flicek, P. & 36 flere, , 2007, I: Nature. 447, 7146, s. 799-816 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Personalized B cell response to the Lactobacillus rhamnosus GG probiotic in healthy human subjects: a randomized trial
Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Rago, Alfredo, Sloth, S., Hendel, J., Melsæther, C., Müller, C. V., Juul Nielsen, M., Strickertsson, J., Engelholm, Lars Henning, Vitting-Seerup, K., Jensen, Kim Bak, Baker, A. & Sandelin, Albin Gustav, 9 nov. 2020, I: Gut Microbes. 12, 1, s. 1-14 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detecting host responses to microbial stimulation using primary epithelial organoids
Lange, Jette Bornholdt, Müller, C. V., Nielsen, M. J., Strickertsson, J., Rago, D., Chen, Y., Maciag, Grzegorz Jerzy, Skov, Jonathan, Wellejus, A., Schweiger, P. J., Hansen, Stine Lind, Broholm, C., Gögenur, Ismail, Maimets, Martti, Sloth, S., Hendel, J., Baker, A., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, Kim Bak, 2023, I: Gut Microbes. 15, 2, 16 s., 2281012.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2
Boyd, M., Coskun, M., Lilje, B., Andersson, Robin, Hoof, I., Lange, Jette Bornholdt, Dahlgaard, K., Olsen, Jørgen, Vitezic, M., Bjerrum, Jakob Tveiten , Seidelin, Jakob Benedict, Nielsen, Ole Haagen, Troelsen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: D N A Research. 21, 6, s. 569-583 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of the enhancer and promoter landscape of inflammatory bowel disease from human colon biopsies
Boyd, M., Thodberg, M., Vitezic, M., Lange, J. B., Vitting-Seerup, K., Chen, Y., Coskun, M., Li, Y., Lo, B. Z. S., Klausen, P., Schweiger, P., Pedersen, A. G., Rapin, N. P. J-P., Skovgaard, K., Dahlgaard, K., Andersson, R., Terkelsen, T. B., Lilje, B., Troelsen, J. T., Petersen, A. M. & 7 flere, , 2018, I: Nature Communications. 9, 19 s., 1661.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.
Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR 2022: the 9th release of the open-access database of transcription factor binding profiles
Castro-Mondragon, J. A., Riudavets-Puig, R., Rauluseviciute, I., Lemma, R. B., Turchi, L., Blanc-Mathieu, R., Lucas, J., Boddie, P., Khan, A., Perez, N. M., Fornes, O., Leung, T. Y., Aguirre, A., Hammal, F., Schmelter, D., Baranasic, D., Ballester, B., Sandelin, A., Lenhard, B., Vandepoele, K. & 3 flere, , 2022, I: Nucleic acids symposium series. 50, D1, s. D165-D173 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Principles for RNA metabolism and alternative transcription initiation within closely spaced promoters
Chen, Y., Pai, A. A., Herudek, J., Lubas, M., Meola, N., Järvelin, A. I., Andersson, Robin, Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Nature Genetics. 48, 9, s. 984-994 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data
Chen, Y., Jørgensen, M., Kolde, R., Zhao, X., Parker, B., Valen, E., Wen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: BMC Genomics. 12, 1, 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Relation between NOD2 genotype and changes in innate signaling in Crohn's disease on mRNA and miRNA levels
Chen, Y., Salem, M., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Li, Yuan, Coskun, M., Seidelin, Jakob Benedict, Sandelin, Albin Gustav & Nielsen, Ole Haagen, 2017, I: npj Genomic Medicine. 2, 11 s., 3.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regulation of laminin γ2 expression by CDX2 in colonic epithelial cells is impaired during active inflammation
Coskun, M., Soendergaard, C., Joergensen, S., Dahlgaard, K., Riis, Lene Buhl, Nielsen, Ole Haagen, Sandelin, Albin Gustav & Troelsen, J. T., 2017, I: Journal of Cellular Biochemistry. 118, 2, s. 298-307 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Crosstalk between tumor acidosis, p53 and extracellular matrix regulates pancreatic cancer aggressiveness
Czaplinska, D., Ialchina, Renata, Andersen, Henriette Berg, Yao, Jiayi, Stigliani, Arnaud, Dannesboe, Johs, Flinck, M., Chen, X., Mitrega, J., Gnosa, S. P., Dmytriyeva, O., Alves, F., Napp, J., Sandelin, Albin Gustav & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2023, I: International Journal of Cancer. 152, 6, s. 1210-1225 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions
Davis, M. R., Andersson, Robin, Severin, J., de Hoon, M., Bertin, N., Baillie, J. K., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Forrest, A. R. R. & Summers, K. M., 2014, I: Molecular Genetics and Metabolism. 112, 3, s. 73-83 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional dynamics during human adipogenesis and its link to adipose morphology and distribution
Ehrlund, A., Mejhert, N., Björk, C., Andersson, Robin, Kulyté, A., Åström, G., Itoh, M., Kawaji, H., Lassmann, T., Daub, C. O., Carninci, P., Forrest, A. R. R., Hayashizaki, Y., Sandelin, Albin Gustav, Ingelsson, E., FANTOM Consortium, Rydén, M., Laurencikiene, J., Arner, P. & Arner, E., 2017, I: Diabetes. 66, 1, s. 218-230 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A promoter-level mammalian expression atlas
Forest, A. R. R., Kawaji, H., Rehli, M., Baillie, J. K., De Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E., Schmidl, C., Schaefer, U. & 241 flere, , 2014, I: Nature. 507, 7493, s. 462-470 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5007
Flest downloads
-
3482
downloads
spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3337
downloads
Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2986
downloads
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet