Albin Gustav Sandelin

Albin Gustav Sandelin

Professor


  1. 2006
  2. Udgivet

    Dynamic usage of transcription start sites within core promoters.

    Kawaji, H., Frith, M. C., Katayama, S., Sandelin, Albin Gustav, Kai, C., Kawai, J., Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2006, I: Genome Biology. 7, 12, s. R118

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2007
  4. Udgivet

    A code for transcription initiation in mammalian genomes

    Frith, M. C., Valen, E. D., Krogh, Anders, Hayashizaki, Y., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2007, I: Genome Research. 18, 1, s. 1-12 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Genome-wide identification of estrogen receptor alpha-binding sites in mouse liver.

    Gao, H., Fält, S., Sandelin, Albin Gustav, Gustafsson, J. & Dahlman-Wright, K., 2007, I: Molecular Endocrinology. 22, 1, s. 10-22 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project.

    Birney, E., Stamatoyannopoulos, J. A., Dutta, A., Guigó, R., Gingeras, T. R., Margulies, E. H., Weng, Z., Snyder, M., Dermitzakis, E. T., Thurman, R. E., Kuehn, M. S., Taylor, C. M., Neph, S., Koch, C. M., Asthana, S., Malhotra, A., Adzhubei, I., Greenbaum, J. A., Andrews, R. M., Flicek, P. & 36 flere, Boyle, P. J., Cao, H., Carter, N. P., Clelland, G. K., Davis, S., Day, N., Dhami, P., Dillon, S. C., Dorschner, M. O., Fiegler, H., Giresi, P. G., Goldy, J., Hawrylycz, M., Haydock, A., Humbert, R., James, K. D., Johnson, B. E., Johnson, E. M., Frum, T. T., Rosenzweig, E. R., Karnani, N., Lee, K., Lefebvre, G. C., Navas, P. A., Neri, F., Parker, S. C. J., Sabo, P. J., Sandstrom, R., Sandelin, Albin Gustav, Pedersen, J. S., ENCODE Project Consortium, E. P. C., NISC Comparative Sequencing Program, N. C. S. P., Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center, B. C. O. M. H. G. S. C., Washington University Genome Sequencing Center, W. U. G. S. C., Broad Institute, B. I. & Children's Hospital Oakland Research Institute, C. H. O. R. I., 2007, I: Nature. 447, 7146, s. 799-816 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Mammalian RNA polymerase II core promoters: insights from genome-wide studies.

    Sandelin, Albin Gustav, Carninci, P., Lenhard, B., Ponjavic, J., Hayashizaki, Y. & Hume, D. A., 2007, I: Nature Reviews. Genetics. 8, 6, s. 424-36 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. 2008
  9. Udgivet

    Hidden layers of human small RNAs

    Kawaji, H., Nakamura, M., Takahashi, Y., Sandelin, Albin Gustav, Katayama, S., Fukuda, S., Daub, C. O., Kai, C., Kawai, J., Yasuda, J., Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2008, I: BMC Genomics. 9, s. 157

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.

    Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Modeling promoter grammars with evolving hidden Markov models

    Won, K., Sandelin, Albin Gustav, Marstrand, T. T. & Krogh, Anders, 2008, I: Bioinformatics. 24, 15, s. 1669-75 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Prediction of regulatory elements

    Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Methods in Molecular Biology. 453, s. 233-44 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The genome landscape of ER{alpha}- and ER{beta}-binding DNA regions.

    Liu, Y., Gao, H., Marstrand, T. T., Ström, A., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Gustafsson, J. & Dahlman-Wright, K., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. 2009
  15. Udgivet

    Dioxin increases the interaction between aryl hydrocarbon receptor and estrogen receptor alpha at human promoters

    Ahmed, S., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav & Matthews, J., 2009, I: Toxicological Sciences. 111, 2, s. 254-266

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Discovery of regulatory elements is improved by a discriminatory approach

    Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Krogh, Anders, 2009, I: PLoS Computational Biology. 5, 11, s. e1000562

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Genome-wide detection and analysis of hippocampus core promoters using DeepCAGE

    Valen, E., Pascarella, G., Chalk, A., Maeda, N., Kojima, M., Kawazu, C., Murata, M., Nishiyori, H., Lazarevic, D., Motti, D., Marstrand, T. T., Tang, M-H. E., Zhao, X., Krogh, A., Winther, O., Arakawa, T., Kawai, J., Wells, C., Daub, C., Harbers, M. & 4 flere, Hayashizaki, Y., Gustincich, S., Sandelin, Albin Gustav & Carninci, P., 2009, I: Genome Research. 19, 2, s. 255-65 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    JASPAR 2010: the greatly expanded open-access database of transcription factor binding profiles

    Portales-Casamar, E., Thongjuea, S., Kwon, A. T., Arenillas, D., Zhao, X., Valen, E., Yusuf, D., Lenhard, B., Wasserman, W. W. & Sandelin, Albin Gustav, 2009, I: Nucleic Acids Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line

    Suzuki, H., Forrest, A. R. R., van Nimwegen, E., Daub, C. O., Balwierz, P. J., Irvine, K. M., Lassmann, T., Ravasi, T., Hasegawa, Y., de Hoon, M. J. L., Katayama, S., Schroder, K., Carninci, P., Tomaru, Y., Kanamori-Katayama, M., Kubosaki, A., Akalin, A., Ando, Y., Arner, E., Asada, M. & 31 flere, Asahara, H., Bailey, T., Bajic, V. B., Bauer, D., Beckhouse, A. G., Bertin, N., Björkegren, J., Brombacher, F., Bulger, E., Chalk, A. M., Chiba, J., Cloonan, N., Dawe, A., Dostie, J., Engström, P. G., Essack, M., Faulkner, G. J., Fink, J. L., Fredman, D., Fujimori, K., Furuno, M., Gojobori, T., Gough, J., Grimmond, S. M., Jacobsen, A., Krogh, Anders, Nygaard, S., Sandelin, Albin Gustav, Valen, E., Winther, Ole & Riken Omics Science Center, R. O. S. C., 2009, I: Nature Genetics. 41, 5, s. 553-62 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. 2010
  21. Udgivet

    3-methylcholanthrene induces differential recruitment of aryl hydrocarbon receptor to human promoters

    Pansoy, A., Ahmed, S., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav & Matthews, J., 2010, I: Toxicological Sciences. 117, 1, s. 90-100 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Gene expression analysis of the emergence of epileptiform activity after focal injection of kainic acid into mouse hippocampus

    Motti, D., Le Duigou, C., Eugène, E., Chemaly, N., Wittner, L., Lazarevic, D., Krmac, H., Marstrand, T., Valen, E., Sanges, R., Stupka, E., Sandelin, Albin Gustav, Cherubini, E., Gustincich, S. & Miles, R., 2010, I: European Journal of Neuroscience. 32, 8, s. 1364-79 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements

    Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Transcriptional regulation of gene expression clusters in motor neurons following spinal cord injury

    Ryge, J., Winther, Ole, Wienecke, Jacob, Sandelin, Albin Gustav, Westerdahl, A., Hultborn, Hans & Kiehn, O., 2010, I: BMC Genomics. 11, 1, s. 365 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    A conceptual framework for the identification of candidate drugs and drug targets in acute promyelocytic leukemia

    Marstrand, T. T., Borup, R., Willer, A., Borregaard, N., Sandelin, Albin Gustav, Porse, Bo Torben & Theilgaard-Mønch, Kim, jul. 2010, I: Leukemia. 24, 7, s. 1265-75 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2011
  27. Udgivet

    Biogenic mechanisms and utilization of small RNAs derived from human protein-coding genes

    Valen, E., Preker, P., Andersen, P. R., Zhao, X., Chen, Y., Ender, C., Dueck, A., Meister, G., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2011, I: Nature Structural and Molecular Biology. 18, 9, s. 1075–1082 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Cross species comparison of C/EBPa and PPAR¿ profiles in mouse and human adipocytes reveals interdependent retention of binding sites

    Schmidt, S. F., Jørgensen, M., Chen, Y., Nielsen, R., Sandelin, Albin Gustav & Mandrup, S., 2011, I: BMC Genomics. 12, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Genomic and chromatin signals underlying transcription start-site selection

    Valen, E. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: Trends in Genetics. 27, 11, s. 475-485 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data

    Chen, Y., Jørgensen, M., Kolde, R., Zhao, X., Parker, B., Valen, E., Wen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: BMC Genomics. 12, 1, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Systematic clustering of transcription start site landscapes

    Zhao, X., Valen, E., Parker, B. J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: P L o S One. 6, 8, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    The Value of Example Solutions in Pharmacy Education: The role of seniority and gender.

    Sandelin, Albin Gustav, Hansen, H. R., Baldursdóttir, S. G., Kristensen, Anders Skov, Bak, Lasse Kristoffer, Christiansen, Frederik Voetmann & Selhuber-Unkel, C. J. M., 2011, I: Pharmacy Education. 11, 1, s. 32-37 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    PROMoter uPstream Transcripts share characteristics with mRNAs and are produced upstream of all three major types of mammalian promoters

    Preker, P., Almvig, K., Christensen, M. S., Valen, E., Mapendano, C. K., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 19 maj 2011, I: Nucleic Acids Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. 2012
  35. Udgivet

    Cross-species ChIP-seq studies provide insights into regulatory strategies of PPAR¿ in adipocytes

    Schmidt, S. F., Jørgensen, M., Sandelin, Albin Gustav & Mandrup, S., 2012, I: Transcription. 3, 1, s. 19-24 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    GMD: measuring the distance between histograms with applications on high-throughput sequencing reads

    Zhao, X. & Sandelin, Albin Gustav, 2012, I: Bioinformatics. 28, 8, s. 1164-1165 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Interaction of antidepressants with the serotonin and norepinephrine transporters: mutational studies of the S1 substrate binding pocket

    Sørensen, L., Andersen, J., Thomsen, M., Hansen, S. M. R., Zhao, X., Sandelin, Albin Gustav, Strømgaard, Kristian & Kristensen, Anders Skov, 2012, I: The Journal of Biological Chemistry. 287, 52, s. 43694-43707 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Interaction of antidepressants with the serotonin and norepinephrine transporters: mutational studies of the S1 substrate binding pocket

    Sørensen, L., Andersen, J., Thomsen, M., Hansen, S. M. R., Zhao, X., Sandelin, Albin Gustav, Strømgaard, Kristian & Kristensen, Anders Skov, 2012, I: Journal of Biological Chemistry. 287, s. 43694-43707 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation

    Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Carninci, P., 2012, I: Nature Reviews. Genetics. 13, 4, s. 233-245 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis

    Pauli, A., Valen, E., Lin, M. F., Garber, M., Vastenhouw, N. L., Levin, J. Z., Fan, L., Sandelin, Albin Gustav, Rinn, J. L., Regev, A. & Schier, A. F., 2012, I: Genome Research. 22, s. 577-591 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. 2013
  42. Udgivet

    Acute Genome-wide effects of Rosiglitazone on PPARγ transcriptional networks in Adipocytes

    Haakonsson, A. K., Madsen, M. S., Nielsen, R., Sandelin, Albin Gustav & Mandrup, S., 2013, I: Molecular Endocrinology. 27, 9, s. 1536-1549 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Detection of reverse transcriptase termination sites using cDNA ligation and massive parallel sequencing

    Kielpinski, L. J., Boyd, M., Sandelin, Albin Gustav & Vinther, Jeppe, 2013, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1038, s. 213-31 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality

    Ntini, E., Järvelin, A. I., Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Boyd, M., Jørgensen, M., Andersson, Robin, Hoof, I., Schein, A., Andersen, P. R., Andersen, P. K., Preker, P., Valen, E., Zhao, X., Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2013, I: Nature Structural and Molecular Biology. 20, s. 923-928 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. 2014
  46. Udgivet

    A promoter-level mammalian expression atlas

    Forest, A. R. R., Kawaji, H., Rehli, M., Baillie, J. K., De Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E., Schmidl, C., Schaefer, U. & 241 flere, Medvedeva, Y. A., Plessy, C., Vitezic, M., Severin, J., Semple, C. A., Ishizu, Y., Young, R. S., Francescatto, M., Altschuler, I. A., Albanese, D., Altschule, G. M., Arakawa, T., Archer, J. A. C., Arner, P., Babina, M., Rennie, S., Balwierz, P. J., Beckhouse, A. G., Pradhan-Bhatt, S., Blake, J. A., Blumenthal, A., Bodega, B., Bonetti, A., Briggs, J., Brombacher, F., Burroughs, A. M., Califano, A., Cannistraci, C. V., Carbajo, D., Chen, Y., Chierici, M., Ciani, Y., Clevers, H. C., Dalla, E., Davis, C. A., Detmar, M., Diehl, A. D., Dohi, T., Drabløs, F., Edge, A. S. B., Edinger, M., Ekwall, K., Endoh, M., Enomoto, H., Fagiolini, M., Fairbairn, L., Fang, H., Farach-Carson, M. C., Faulkner, G. J., Favorov, A. V., Fisher, M. E., Frith, M. C., Fujita, R., Fukuda, S., Furlanello, C., Furuno, M., Furusawa, J. I., Geijtenbeek, T. B., Gibson, A. P., Gingeras, T., Goldowitz, D., Gough, J., Guhl, S., Guler, R., Gustincich, S., Ha, T. J., Hamaguchi, M., Hara, M., Harbers, M., Harshbarger, J., Hasegawa, A., Hasegawa, Y., Hashimoto, T., Herlyn, M., Hitchens, K. J., Sui, S. J. H., Hofmann, O. M., Hoof, I., Hori, F., Huminiecki, L., Iida, K., Ikawa, T., Jankovic, B. R., Jia, H., Joshi, A., Jurman, G., Kaczkowski, B., Kai, C., Kaida, K., Kaiho, A., Kajiyama, K., Kanamori-Katayama, M., Kasianov, A. S., Kasukawa, T., Katayama, S., Kato, S., Kawaguchi, S., Kawamoto, H., Kawamura, Y. I., Kawashima, T., Kempfle, J. S., Kenna, T. J., Kere, J., Khachigian, L. M., Kitamura, T., Klinken, S. P., Knox, A. J., Kojima, M., Kojima, S., Kondo, N., Koseki, H., Koyasu, S., Krampitz, S., Kubosaki, A., Kwon, A. T., Laros, J. F. J., Lee, W., Lennartsson, A., Li, K., Lilje, B., Lipovich, L., Mackay-sim, A., Manabe, R. I., Mar, J. C., Marchand, B., Mathelier, A., Mejhert, N., Meynert, A., Mizuno, Y., De Morais, D. A. L., Morikawa, H., Morimoto, M., Moro, K., Motakis, E., Motohashi, H., Mummery, C. L., Murata, M., Nagao-Sato, S., Nakachi, Y., Nakahara, F., Nakamura, T., Nakamura, Y., Nakazato, K., Van Nimwegen, E., Ninomiya, N., Nishiyori, H., Noma, S., Nozaki, T., Ogishima, S., Ohkura, N., Ohmiya, H., Ohno, H., Ohshima, M., Okada-Hatakeyama, M., Okazaki, Y., Orlando, V., Ovchinnikov, D. A., Pain, A., Passier, R., Patrikakis, M., Persson, H., Piazza, S., Prendergast, J. G. D., Rackham, O. J. L., Ramilowski, J. A., Rashid, M., Ravasi, T., Rizzu, P., Roncador, M., Roy, S., Rye, M. B., Saijyo, E., Sajantila, A., Saka, A., Sakaguchi, S., Sakai, M., Sato, H., Satoh, H., Savvi, S., Saxena, A., Schneider, C., Schultes, E. A., Schulze-Tanzil, G. G., Schwegmann, A., Sengstag, T., Sheng, G., Shimoji, H., Shimoni, Y., Shin, J. W., Simon, C., Sugiyama, D., Sugiyama, T., Suzuki, M., Suzuki, N., Swoboda, R. K., 'T Hoen, P. A. C., Tagami, M., Tagami, N. T., Takai, J., Tanaka, H., Tatsukawa, H., Tatum, Z., Thompson, M., Toyoda, H., Toyoda, T., Valen, E., Van De Wetering, M., Van Den Berg, L. M., Verardo, R., Vijayan, D., Vorontsov, I. E., Wasserman, W. W., Watanabe, S., Wells, C. A., Winteringham, L. N., Wolvetang, E., Wood, E. J., Yamaguchi, Y., Yamamoto, M., Yoneda, M., Yonekura, Y., Yoshida, S., Zabierowski, S. E., Zhang, P. G., Zhao, X., Zucchelli, S., Summers, K. M., Suzuki, H., Daub, C. O., Kawai, J., Heutink, P., Hide, W., Freeman, T. C., Lenhard, B., Bajic, L. V. B., Taylor, M. S., Makeev, V. J., Sandelin, Albin Gustav, Hume, D. A., Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2014, I: Nature. 507, 7493, s. 462-470 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    An atlas of active enhancers across human cell types and tissues

    Andersson, R., Gebhard, C., Miguel-Escalada, I., Hoof, I., Lange, J. B., Boyd, M., Chen, Y., Zhao, X., Schmidl, C., Suzuki, T., Ntini, E., Arner, E., Valen, E., Li, K., Schwarzfischer, L., Glatz, D., Raithel, J., Lilje, B., Rapin, N., Bagger, F. O. & 30 flere, Jørgensen, M., Andersen, P. R., Bertin, N., Rackham, O., Burroughs, A. M., Baillie, J. K., Ishizu, Y., Shimizu, Y., Furuhata, E., Maeda, S., Negishi, Y., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Lassmann, T., Itoh, M., Kawaji, H., Kondo, N., Kawai, J., Lennartsson, A., Daub, C. O., Heutink, P., Hume, D. A., Jensen, T. H., Suzuki, H., Hayashizaki, Y., Mueller, F., Forrest, A. R. R., Carninci, P., Rehli, M. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature. 507, 7493, s. 455-461 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Analysis of the DNA methylome and transcriptome in granulopoiesis reveal timed changes and dynamic enhancer methylation

    Rönnerblad, M., Andersson, Robin, Olofsson, T., Douagi, I., Karimi, M., Lehmann, S., Hoof, I., de Hoon, M., Itoh, M., Nagao-Sato, S., Kawaji, H., Lassmann, T., Carninci, P., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Sandelin, Albin Gustav, Ekwall, K., Arner, E. & Lennartsson, A., 2014, I: Blood. 123, 17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    CAGE-defined promoter regions of the genes implicated in Rett Syndrome

    Vitezic, M., Bertin, N., Andersson, Robin, Lipovich, L., Kawaji, H., Lassmann, T., Sandelin, Albin Gustav, Heutink, P., Goldowitz, D., Ha, T., Zhang, P., Patrizi, A., Fagiolini, M., Forrest, A. R., Carninci, P. & Saxena, A., 2014, I: BMC Genomics. 15, 16 s., 1177.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Deep transcriptome profiling of mammalian stem cells supports a regulatory role for retrotransposons in pluripotency maintenance

    Fort, A., Hashimoto, K., Yamada, D., Salimullah, M., Keya, C. A., Saxena, A., Bonetti, A., Voineagu, I., Bertin, N., Kratz, A., Noro, Y., Wong, C-H., de Hoon, M., Andersson, R., Sandelin, A. G., Suzuki, H., Wei, C-L., Koseki, H., Hasegawa, Y., Forrest, A. R. R. & 2 flere, Carninci, P. & FANTOM Consortium, F. C., 2014, I: Nature Genetics. 46, 6, s. 558-566 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome

    Pedersen, J. S., Valen, E., Velazquez, A. M. V., Parker, B. J., Rasmussen, M., Lindgreen, S., Lilje, B., Tobin, D. J., Kelly, T. K., Vang, S., Andersson, R., Jones, P. A., Hoover, C. A., Tikhonov, A., Prokhortchouk, E., Rubin, E. M., Sandelin, A. G., Gilbert, M. T. P., Krogh, A., Willerslev, E. & 1 flere, Orlando, L. A. A., 2014, I: Genome Research. 24, 3, s. 454-466 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Human nonsense-mediated RNA decay initiates widely by endonucleolysis and targets snoRNA host genes

    Lykke-Andersen, S., Chen, Y., Ardal, B., Lilje, B., Waage, J. E., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2014, I: Genes & Development. 28, s. 2498-2517 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2

    Boyd, M., Coskun, M., Lilje, B., Andersson, Robin, Hoof, I., Lange, Jette Bornholdt, Dahlgaard, K., Olsen, Jørgen, Vitezic, M., Bjerrum, Jakob Tveiten , Seidelin, Jakob Benedict, Nielsen, Ole Haagen, Troelsen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: D N A Research. 21, 6, s. 569-583 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    JASPAR 2014: an extensively expanded and updated open-access database of transcription factor binding profiles

    Mathelier, A., Zhao, X., Zhang, A. W., Parcy, F., Worsley-Hunt, R., Arenillas, D. J., Buchman, S., Chen, C., Chou, A., Ienasescu, H., Lim, J., Shyr, C., Tan, G., Zhou, M., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Wasserman, W. W., 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, s. D142-D147 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Molecular architecture of transcription factor hotspots in early adipogenesis

    Siersbæk, R., Baek, S., Rabiee, A., Nielsen, R., Traynor, S., Clarke, N., Sandelin, Albin Gustav, Jensen, O. N., Sung, M., Hager, G. L. & Mandrup, S., 2014, I: Cell Reports. 7, 5, s. 1434-1442 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species

    Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions

    Davis, M. R., Andersson, Robin, Severin, J., de Hoon, M., Bertin, N., Baillie, J. K., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Forrest, A. R. R. & Summers, K. M., 2014, I: Molecular Genetics and Metabolism. 112, 3, s. 73-83 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data

    Vitting-Seerup, K., Porse, Bo Torben, Sandelin, Albin Gustav & Waage, J., 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, s. 1-7 7 s., 81.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    New histone supply regulates replication fork speed and PCNA unloading

    Mejlvang, J., Feng, Y., Alabert, C., Neelsen, K. J., Jasencakova, Zuzana, Zhao, X., Lees, M., Sandelin, Albin Gustav, Pasero, P., Lopes, M. & Groth, Anja, 6 jan. 2014, I: Journal of Cell Biology. 204, 1, s. 29-43 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 5007