Albin Gustav Sandelin

Albin Gustav Sandelin

Professor


  1. Udgivet

    Identification of gene transcription start sites and enhancers responding to pulmonary carbon nanotube exposure in Vivo

    Lange, Jette Bornholdt, Saber, A. T., Lilje, B., Boyd, M., Jørgensen, M., Chen, Y., Vitezic, M., Jacobsen, N. R., Poulsen, S. S., Berthing, T., Bressendorff, Simon, Vitting-Seerup, K., Andersson, Robin, Hougaard, K. S., Yauk, C. L., Halappanavar, S., Wallin, E. H. R., Vogel, U. & Sandelin, Albin Gustav, 2017, I: A C S Nano. 11, 4, s. 3597-3613 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Interaction of antidepressants with the serotonin and norepinephrine transporters: mutational studies of the S1 substrate binding pocket

    Sørensen, L., Andersen, J., Thomsen, M., Hansen, S. M. R., Zhao, X., Sandelin, Albin Gustav, Strømgaard, Kristian & Kristensen, Anders Skov, 2012, I: The Journal of Biological Chemistry. 287, 52, s. 43694-43707 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Interaction of antidepressants with the serotonin and norepinephrine transporters: mutational studies of the S1 substrate binding pocket

    Sørensen, L., Andersen, J., Thomsen, M., Hansen, S. M. R., Zhao, X., Sandelin, Albin Gustav, Strømgaard, Kristian & Kristensen, Anders Skov, 2012, I: Journal of Biological Chemistry. 287, s. 43694-43707 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    IsoformSwitchAnalyzeR: analysis of changes in genome-wide patterns of alternative splicing and its functional consequences

    Vitting-Seerup, K. & Sandelin, Albin Gustav, 2019, I: Bioinformatics. 35, 21, s. 4469-4471

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    JASPAR 2010: the greatly expanded open-access database of transcription factor binding profiles

    Portales-Casamar, E., Thongjuea, S., Kwon, A. T., Arenillas, D., Zhao, X., Valen, E., Yusuf, D., Lenhard, B., Wasserman, W. W. & Sandelin, Albin Gustav, 2009, I: Nucleic Acids Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    JASPAR 2014: an extensively expanded and updated open-access database of transcription factor binding profiles

    Mathelier, A., Zhao, X., Zhang, A. W., Parcy, F., Worsley-Hunt, R., Arenillas, D. J., Buchman, S., Chen, C., Chou, A., Ienasescu, H., Lim, J., Shyr, C., Tan, G., Zhou, M., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Wasserman, W. W., 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, s. D142-D147 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    JASPAR 2016: a major expansion and update of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Mathelier, A., Fornes, O., Arenillas, D. J., Chen, C., Denay, G., Lee, J., Shi, W., Shyr, C., Tan, G., Worsley-Hunt, R., Zhang, A. W., Parcy, F., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Wasserman, W. W., 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, D1, s. D110-D115 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    JASPAR 2018: update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework

    Khan, A., Fornes, O., Stigliani, A., Gheorghe, M., Castro-Mondragon, J. A., van der Lee, R., Bessy, A., Chèneby, J., Kulkarni, S. R., Tan, G., Baranasic, D., Arenillas, D. J., Sandelin, Albin Gustav, Vandepoele, K., Lenhard, B., Ballester, B., Wasserman, W. W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, D1, s. D260-D266 7 s., gkx1126.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Fornes, O., Castro-Mondragon, J. A., Khan, A., van der Lee, R., Zhang, X., Richmond, P. A., Modi, B. P., Correard, S., Gheorghe, M., Baranašić, D., Santana-Garcia, W., Tan, G., Chèneby, J., Ballester, B., Parcy, F., Sandelin, Albin Gustav, Lenhard, B., Wasserman, W. W. & Mathelier, A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, D1, s. D87-D92 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    JASPAR 2022: the 9th release of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Castro-Mondragon, J. A., Riudavets-Puig, R., Rauluseviciute, I., Lemma, R. B., Turchi, L., Blanc-Mathieu, R., Lucas, J., Boddie, P., Khan, A., Perez, N. M., Fornes, O., Leung, T. Y., Aguirre, A., Hammal, F., Schmelter, D., Baranasic, D., Ballester, B., Sandelin, A., Lenhard, B., Vandepoele, K. & 3 flere, Wasserman, W. W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2022, I: Nucleic acids symposium series. 50, D1, s. D165-D173 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Rauluseviciute, I., Riudavets-puig, R., Blanc-mathieu, R., Castro-mondragon, J., Ferenc, K., Kumar, V., Lemma, R. B., Lucas, J., Chèneby, J., Baranasic, D., Khan, A., Fornes, O., Gundersen, S., Johansen, M., Hovig, E., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav, Wasserman, W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2024, I: Nucleic Acids Symposium Series. 52, D1, s. D174–D182 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.

    Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet
  14. Udgivet

    Mammalian RNA polymerase II core promoters: insights from genome-wide studies.

    Sandelin, Albin Gustav, Carninci, P., Lenhard, B., Ponjavic, J., Hayashizaki, Y. & Hume, D. A., 2007, I: Nature Reviews. Genetics. 8, 6, s. 424-36 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Mesenchymal-epithelial crosstalk shapes intestinal regionalisation via Wnt and Shh signalling

    Maimets, Martti, Pedersen, M. T., Guiu, J., Dreier, J., Thodberg, Malte, Antoku, Yasuko, Schweiger, P. J., Rib, Leonor, Bardini Bressan, Raul, Miao, Y., Garcia, K. C., Sandelin, Albin Gustav, Serup, Palle & Jensen, Kim Bak, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 715.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation

    Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Carninci, P., 2012, I: Nature Reviews. Genetics. 13, 4, s. 233-245 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Modeling promoter grammars with evolving hidden Markov models

    Won, K., Sandelin, Albin Gustav, Marstrand, T. T. & Krogh, Anders, 2008, I: Bioinformatics. 24, 15, s. 1669-75 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Molecular architecture of transcription factor hotspots in early adipogenesis

    Siersbæk, R., Baek, S., Rabiee, A., Nielsen, R., Traynor, S., Clarke, N., Sandelin, Albin Gustav, Jensen, O. N., Sung, M., Hager, G. L. & Mandrup, S., 2014, I: Cell Reports. 7, 5, s. 1434-1442 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements

    Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    New histone supply regulates replication fork speed and PCNA unloading

    Mejlvang, J., Feng, Y., Alabert, C., Neelsen, K. J., Jasencakova, Zuzana, Zhao, X., Lees, M., Sandelin, Albin Gustav, Pasero, P., Lopes, M. & Groth, Anja, 6 jan. 2014, I: Journal of Cell Biology. 204, 1, s. 29-43 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species

    Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase

    Ienasescu, H., Li, K., Andersson, Robin, Vitezic, M., Rennie, Sarah, Chen, Y., Vitting-Seerup, K., Lagoni, E., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, de Hoon, M. J. L., Kawaji, H., Lassmann, T., FANTOM Consortium, F. C., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2016, 0, 10 s., baw144.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Organismal benefits of transcription speed control at gene boundaries

    Leng, Xueyuan, Ivanov, M., Kindgren, P., Malik, I., Thieffry, A., Brodersen, Peter, Sandelin, Albin Gustav, Kaplan, C. D. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: EMBO Reports. 21, 4, 16 s., e49315.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    PAMP-triggered genetic reprogramming involves widespread alternative transcription initiation and an immediate transcription factor wave

    Thieffry, A., López Márquez, Diego, Lange, Jette Bornholdt, Gholami Malekroudi, M., Bressendorff, Simon, Barghetti, A., Sandelin, Albin Gustav & Brodersen, Peter, 2022, I: The Plant Cell. 34, 7, 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells

    Agrawal-Singh, S., Lerdrup, Mads, Gomes, A. R., van de Werken, H. J. G., Johansen, Jens Vilstrup, Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Helin, K. & Hansen, K., 2019, I: eLife. 8, s. 1-32 32 s., e40364.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 5007