Albin Gustav Sandelin

Albin Gustav Sandelin

Professor


  1. Udgivet

    spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data

    Vitting-Seerup, K., Porse, Bo Torben, Sandelin, Albin Gustav & Waage, J., 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, s. 1-7 7 s., 81.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Update of the FANTOM web resource: high resolution transcriptome of diverse cell types in mammals

    Lizio, M., Harshbarger, J., Abugessaisa, I., Noguchi, S., Kondo, A., Severin, J., Mungall, C., Arenillas, D., Mathelier, A., Medvedeva, Y. A., Lennartsson, A., Drabløs, F., Ramilowski, J. A., Rackham, O., Gough, J., Andersson, R., Sandelin, A. G., Ienasescu, H-I., Ono, H., Bono, H. & 5 flere, Hayashizaki, Y., Carninci, P., Forrest, A. R. R., Kasukawa, T. & Kawaji, H., 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, D1, s. D737-D743 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Transcriptome analysis of recurrently deregulated genes across multiple cancers identifies new pan-cancer biomarkers

    Kaczkowski, B., Tanaka, Y., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Andersson, Robin, Itoh, M., Lassmann, T., the FANTOM5 consortium, Hayashizaki, Y., Carninci, P. & Forrest, A. R. R., 2016, I: Cancer Research. 76, 2, s. 216-226

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Transcriptional regulation of gene expression clusters in motor neurons following spinal cord injury

    Ryge, J., Winther, Ole, Wienecke, Jacob, Sandelin, Albin Gustav, Westerdahl, A., Hultborn, Hans & Kiehn, O., 2010, I: BMC Genomics. 11, 1, s. 365 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions

    Davis, M. R., Andersson, Robin, Severin, J., de Hoon, M., Bertin, N., Baillie, J. K., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Forrest, A. R. R. & Summers, K. M., 2014, I: Molecular Genetics and Metabolism. 112, 3, s. 73-83 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Transcriptional dynamics during human adipogenesis and its link to adipose morphology and distribution

    Ehrlund, A., Mejhert, N., Björk, C., Andersson, Robin, Kulyté, A., Åström, G., Itoh, M., Kawaji, H., Lassmann, T., Daub, C. O., Carninci, P., Forrest, A. R. R., Hayashizaki, Y., Sandelin, Albin Gustav, Ingelsson, E., FANTOM Consortium, Rydén, M., Laurencikiene, J., Arner, P. & Arner, E., 2017, I: Diabetes. 66, 1, s. 218-230 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet
  8. Udgivet

    Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells

    Arner, E., Daub, C. O., Vitting-Seerup, K., Andersson, R., Lilje, B., Drabløs, F., Lennartsson, A., Rönnerblad, M., Hrydziuszko, O., Vitezic, M., Freeman, T. C., Alhendi, A. M. N., Arner, P., Axton, R., Baillie, J. K., Beckhouse, A., Bodega, B., Briggs, J., Brombacher, F., Davis, M. & 89 flere, Detmar, M., Ehrlund, A., Endoh, M., Eslami, A., Fagiolini, M., Fairbairn, L., Faulkner, G. J., Ferrai, C., Fisher, M. E., Forrester, L., Goldowitz, D., Guler, R., Ha, T., Hara, M., Herlyn, M., Ikawa, T., Kai, C., Kawamoto, H., Khachigian, L. M., Klinken, S. P., Kojima, S., Koseki, H., Klein, S., Mejhert, N., Miyaguchi, K., Mizuno, Y., Morimoto, M., Morris, K. J., Mummery, C., Nakachi, Y., Ogishima, S., Okada-Hatakeyama, M., Okazaki, Y., Orlando, V., Ovchinnikov, D., Passier, R., Patrikakis, M., Pombo, A., Qin, X., Roy, S., Sato, H., Savvi, S., Saxena, A., Schwegmann, A., Sugiyama, D., Swoboda, R., Tanaka, H., Tomoiu, A., Winteringham, L. N., Wolvetang, E., Yanagi-Mizuochi, C., Yoneda, M., Zabierowski, S., Zhang, P., Abugessaisa, I., Bertin, N., Diehl, A. D., Fukuda, S., Furuno, M., Harshbarger, J., Hasegawa, A., Hori, F., Ishikawa-Kato, S., Ishizu, Y., Itoh, M., Kawashima, T., Kojima, M., Kondo, N., Lizio, M., Meehan, T. F., Mungall, C. J., Murata, M., Nishiyori-Sueki, H., Sahin, S., Nagao-Sato, S., Severin, J., de Hoon, M. J. L., Kawai, J., Kasukawa, T., Lassmann, T., Suzuki, H., Kawaji, H., Summers, K. M., Wells, C., Hume, D. A., Forrest, A. R. R., Sandelin, Albin Gustav, Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2015, I: Science (New York, N.Y.). 347, 6225, s. 1010-1014 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    TrancriptomeReconstructoR: data-driven annotation of complex transcriptomes

    Ivanov, M., Sandelin, Albin Gustav & Marquardt, Sebastian, 2021, I: BMC Bioinformatics. 22, 15 s., 290.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line

    Suzuki, H., Forrest, A. R. R., van Nimwegen, E., Daub, C. O., Balwierz, P. J., Irvine, K. M., Lassmann, T., Ravasi, T., Hasegawa, Y., de Hoon, M. J. L., Katayama, S., Schroder, K., Carninci, P., Tomaru, Y., Kanamori-Katayama, M., Kubosaki, A., Akalin, A., Ando, Y., Arner, E., Asada, M. & 31 flere, Asahara, H., Bailey, T., Bajic, V. B., Bauer, D., Beckhouse, A. G., Bertin, N., Björkegren, J., Brombacher, F., Bulger, E., Chalk, A. M., Chiba, J., Cloonan, N., Dawe, A., Dostie, J., Engström, P. G., Essack, M., Faulkner, G. J., Fink, J. L., Fredman, D., Fujimori, K., Furuno, M., Gojobori, T., Gough, J., Grimmond, S. M., Jacobsen, A., Krogh, Anders, Nygaard, S., Sandelin, Albin Gustav, Valen, E., Winther, Ole & Riken Omics Science Center, R. O. S. C., 2009, I: Nature Genetics. 41, 5, s. 553-62 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    The landscape of isoform switches in human cancers

    Vitting-Seerup, K. & Sandelin, Albin Gustav, sep. 2017, I: Molecular Cancer Research. 15, 9, s. 1206-1220 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    The genome landscape of ER{alpha}- and ER{beta}-binding DNA regions.

    Liu, Y., Gao, H., Marstrand, T. T., Ström, A., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav, Gustafsson, J. & Dahlman-Wright, K., 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The frequent evolutionary birth and death of functional promoters in mouse and human

    Young, R. S., Hayashizaki, Y., Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Kawaji, H., Itoh, M., Lassmann, T., Carninci, P., Bickmore, W. A., Forrest, A. R. & Taylor, M. S., 2015, I: Genome Research. 25, s. 1546-1557 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    The constrained maximal expression level owing to haploidy shapes gene content on the mammalian X chromosome

    Hurst, L. D., Ghanbarian, A. T., Forrest, A. R. R., Huminiecki, L., Rehli, M., Kenneth Baillie, J., de Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E. & 243 flere, Schmidl, C., Schaefer, U., Medvedeva, Y. A., Plessy, C., Vitezic, M., Severin, J., Semple, C. A., Ishizu, Y., Young, R. S., Francescatto, M., Alam, I., Albanese, D., Altschuler, G. M., Arakawa, T., Archer, J. A. C., Arner, P., Babina, M., Baker, S., Balwierz, P. J., Beckhouse, A. G., Pradhan, S. B., Blake, J. A., Blumenthal, A., Bodega, B., Bonetti, A., Briggs, J., Brombacher, F., Maxwell Burroughs, A., Califano, A., Cannistraci, C. V., Carbajo, D., Chen, Y., Chierici, M., Ciani, Y., Clevers, H. C., Dalla, E., Davis, C. A., Detmar, M., Diehl, A. D., Dohi, T., Drabløs, F., Edge, A. S. B., Edinger, M., Ekwall, K., Endoh, M., Enomoto, H., Fagiolini, M., Fairbairn, L., Fang, H., Farach-Carson, M. C., Faulkner, G. J., Favorov, A. V., Fisher, M. E., Frith, M. C., Fujita, R., Fukuda, S., Furlanello, C., Furuno, M., Furusawa, J. I., Geijtenbeek, T. B., Gibson, A., Gingeras, T., Goldowitz, D., Gough, J., Guhl, S., Guler, R., Gustincich, S., Ha, T. J., Hamaguchi, M., Hara, M., Harbers, M., Harshbarger, J., Hasegawa, A., Hasegawa, Y., Hashimoto, T., Herlyn, M., Hitchens, K. J., Ho Sui, S. J., Hofmann, O. M., Hoof, I., Hori, F., Huminiecki, L., Iida, K., Ikawa, T., Jankovic, B. R., Jia, H., Joshi, A., Jurman, G., Kaczkowski, B., Kai, C., Kaida, K., Kaiho, A., Kajiyama, K., Kanamori, M. K., Kasianov, A. S., Kasukawa, T., Katayama, S., Kato, S., Kawaguchi, S., Kawamoto, H., Kawamura, Y. I., Kawashima, T., Kempfle, J. S., Kenna, T. J., Kere, J., Khachigian, L. M., Kitamura, T., Peter Klinken, S., Knox, A. J., Kojima, M., Kojima, S., Kondo, N., Koseki, H., Koyasu, S., Krampitz, S., Kubosaki, A., Kwon, A. T., Laros, J. F. J., Lee, W., Lennartsson, A., Li, K., Lilje, B., Lipovich, L., Mackay, A. S., Manabe, R., Mar, J. C., Marchand, B., Mathelier, A., Mejhert, N., Meynert, A., Mizuno, Y., de Lima Morais, D. A., Morikawa, H., Morimoto, M., Moro, K., Motakis, E., Motohashi, H., Mummery, C. L., Murata, M., Nagao, S. S., Nakachi, Y., Nakahara, F., Nakamura, T., Nakamura, Y., Nakazato, K., van Nimwegen, E., Ninomiya, N., Nishiyori, H., Noma, S., Nozaki, T., Ogishima, S., Ohkura, N., Ohmiya, H., Ohno, H., Ohshima, M., Okada, M. H., Okazaki, Y., Orlando, V., Ovchinnikov, D. A., Pain, A., Passier, R., Patrikakis, M., Persson, H., Piazza, S., Prendergast, J. G. D., Rackham, O. J. L., Ramilowski, J. A., Rashid, M., Ravasi, T., Rizzu, P., Roncador, M., Roy, S., Rye, M. B., Saijyo, E., Sajantila, A., Saka, A., Sakaguchi, S., Sakai, M., Sato, H., Satoh, H., Savvi, S., Saxena, A., Schneider, C., Schultes, E. A., Schulze-Tanzil, G. G., Schwegmann, A., Sengstag, T., Sheng, G., Shimoji, H., Shimoni, Y., Shin, J. W., Simon, C., Sugiyama, D., Sugiyama, T., Suzuki, M., Suzuki, N., Swoboda, R. K., 't Hoen, P. A. C., Tagami, M., Takahashi, N., Takai, J., Tanaka, H., Tatsukawa, H., Tatum, Z., Thompson, M., Toyoda, H., Toyoda, T., Valen, E., van de Wetering, M., van den Berg, L. M., Verardo, R., Vijayan, D., Vorontsov, I. E., Wasserman, W. W., Watanabe, S., Wells, C. A., Winteringham, L. N., Wolvetang, E., Wood, E. J., Yamaguchi, Y., Yamamoto, M., Yoneda, M., Yonekura, Y., Yoshida, S., Zabierowski, S. E., Zhang, P. G., Zhao, X., Zucchelli, S., Summers, K. M., Suzuki, H., Daub, C. O., Kawai, J., Heutink, P., Hide, W., Freeman, T. C., Lenhard, B., Bajic, V. B., Taylor, M. S., Makeev, V. J., Sandelin, Albin Gustav, Hume, D. A., Carninci, P. & Hayashizaki, Y., 2015, I: PLoS Biology. 13, 12, 48 s., e1002315.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    The adipose transcriptional response to insulin is determined by obesity, not insulin sensitivity

    Rydén, M., Hrydziuszko, O., Mileti, E., Raman, A., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Toft, E., Qvist, V., Näslund, E., Thorell, A., Andersson, D. P., Dahlman, I., Gao, H., Sandelin, Albin Gustav, Daub, C. O. & Arner, P., 2016, I: Cell Reports. 16, 9, s. 2317-2326 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    The Value of Example Solutions in Pharmacy Education: The role of seniority and gender.

    Sandelin, Albin Gustav, Hansen, H. R., Baldursdóttir, S. G., Kristensen, Anders Skov, Bak, Lasse Kristoffer, Christiansen, Frederik Voetmann & Selhuber-Unkel, C. J. M., 2011, I: Pharmacy Education. 11, 1, s. 32-37 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    The RNA exosome shapes the expression of key protein-coding genes

    Wu, M., Karadoulama, Evdoxia, Lloret-llinares, M., Rouviere, J. O., Vaagensø, C. S., Moravec, M., Li, B., Wang, J., Wu, G., Gockert, M. A. M., Pelechano, V., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 15, s. 8509-8528

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The RNA exosome contributes to gene expression regulation during stem cell differentiation

    Llinares, M. L., Karadoulama, Evdoxia, Chen, Y., Wojenski, L. A., Villafano, G. J., Lange, Jette Bornholdt, Andersson, Robin, Core, L., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 21, s. 11502-11513

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis

    Pauli, A., Valen, E., Lin, M. F., Garber, M., Vastenhouw, N. L., Levin, J. Z., Fan, L., Sandelin, Albin Gustav, Rinn, J. L., Regev, A. & Schier, A. F., 2012, I: Genome Research. 22, s. 577-591 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Systematic clustering of transcription start site landscapes

    Zhao, X., Valen, E., Parker, B. J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: P L o S One. 6, 8, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Spatially resolved analysis of microenvironmental gradient impact on cancer cell phenotypes

    Auxillos, Jamie Yam, Crouigneau, R., Li, Y. F., Dai, Yifan, Stigliani, Arnaud, Tavernaro, I., Resch-Genger, U., Sandelin, Albin Gustav, Marie, R. & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2024, I: Science Advances. 10, 18, 17 s., eadn3448.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Shared activity patterns arising at genetic susceptibility loci reveal underlying genomic and cellular architecture of human disease

    Baillie, J. K., Bretherick, A., Haley, C. S., Clohisey, S., Gray, A., Neyton, L. P. A., Barrett, J., Stahl, E. A., Tenesa, A., Andersson, R., Brown, J. B., Faulkner, G. J., Lizio, M., Schaefer, U., Daub, C., Itoh, M., Kondo, N., Lassmann, T., Kawai, J., Mole, D. & 14 flere, Bajic, V. B., Heutink, P., Rehli, M., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Suzuki, H., Satsangi, J., Wells, C. A., Hacohen, N., Freeman, T. C., Hayashizaki, Y., Carninci, P., Forrest, A. R. R. & Hume, D. A., 2018, I: PLoS Computational Biology. 14, 3, 24 s., e1005934.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Remodeling of retrotransposon elements during epigenetic induction of adult visual cortical plasticity by HDAC inhibitors

    Lennartsson, A., Arner, E., Fagiolini, M., Saxena, A., Andersson, Robin, Takahashi, H., Noro, Y., Sng, J., Sandelin, Albin Gustav, Hensch, T. K. & Carninci, P., 2015, I: Epigenetics & Chromatin. 8, 15 s., 55.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Relation between NOD2 genotype and changes in innate signaling in Crohn's disease on mRNA and miRNA levels

    Chen, Y., Salem, M., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Li, Yuan, Coskun, M., Seidelin, Jakob Benedict, Sandelin, Albin Gustav & Nielsen, Ole Haagen, 2017, I: npj Genomic Medicine. 2, 11 s., 3.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Regulation of laminin γ2 expression by CDX2 in colonic epithelial cells is impaired during active inflammation

    Coskun, M., Soendergaard, C., Joergensen, S., Dahlgaard, K., Riis, Lene Buhl, Nielsen, Ole Haagen, Sandelin, Albin Gustav & Troelsen, J. T., 2017, I: Journal of Cellular Biochemistry. 118, 2, s. 298-307 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Regulating retrotransposon activity through the use of alternative transcription start sites

    Persson, J., Steglich, B., Smialowska, A., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, Andersson, Robin, Schurra, C., Arcangioli, B., Sandelin, Albin Gustav, Nielsen, Olaf & Ekwall, K., 2016, I: E M B O Reports. 17, 5, s. 753-768 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Principles for RNA metabolism and alternative transcription initiation within closely spaced promoters

    Chen, Y., Pai, A. A., Herudek, J., Lubas, M., Meola, N., Järvelin, A. I., Andersson, Robin, Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Nature Genetics. 48, 9, s. 984-994 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Prediction of regulatory elements

    Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Methods in Molecular Biology. 453, s. 233-44 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data

    Chen, Y., Jørgensen, M., Kolde, R., Zhao, X., Parker, B., Valen, E., Wen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2011, I: BMC Genomics. 12, 1, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality

    Ntini, E., Järvelin, A. I., Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Boyd, M., Jørgensen, M., Andersson, Robin, Hoof, I., Schein, A., Andersen, P. R., Andersen, P. K., Preker, P., Valen, E., Zhao, X., Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2013, I: Nature Structural and Molecular Biology. 20, s. 923-928 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Personalized B cell response to the Lactobacillus rhamnosus GG probiotic in healthy human subjects: a randomized trial

    Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Rago, Alfredo, Sloth, S., Hendel, J., Melsæther, C., Müller, C. V., Juul Nielsen, M., Strickertsson, J., Engelholm, Lars Henning, Vitting-Seerup, K., Jensen, Kim Bak, Baker, A. & Sandelin, Albin Gustav, 9 nov. 2020, I: Gut Microbes. 12, 1, s. 1-14 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    PROMoter uPstream Transcripts share characteristics with mRNAs and are produced upstream of all three major types of mammalian promoters

    Preker, P., Almvig, K., Christensen, M. S., Valen, E., Mapendano, C. K., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 19 maj 2011, I: Nucleic Acids Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells

    Agrawal-Singh, S., Lerdrup, Mads, Gomes, A. R., van de Werken, H. J. G., Johansen, Jens Vilstrup, Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Helin, K. & Hansen, K., 2019, I: eLife. 8, s. 1-32 32 s., e40364.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    PAMP-triggered genetic reprogramming involves widespread alternative transcription initiation and an immediate transcription factor wave

    Thieffry, A., López Márquez, Diego, Lange, Jette Bornholdt, Gholami Malekroudi, M., Bressendorff, Simon, Barghetti, A., Sandelin, Albin Gustav & Brodersen, Peter, 2022, I: The Plant Cell. 34, 7, 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Organismal benefits of transcription speed control at gene boundaries

    Leng, Xueyuan, Ivanov, M., Kindgren, P., Malik, I., Thieffry, A., Brodersen, Peter, Sandelin, Albin Gustav, Kaplan, C. D. & Marquardt, Sebastian, 2020, I: EMBO Reports. 21, 4, 16 s., e49315.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase

    Ienasescu, H., Li, K., Andersson, Robin, Vitezic, M., Rennie, Sarah, Chen, Y., Vitting-Seerup, K., Lagoni, E., Boyd, M., Lange, Jette Bornholdt, de Hoon, M. J. L., Kawaji, H., Lassmann, T., FANTOM Consortium, F. C., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Carninci, P. & Sandelin, Albin Gustav, 2016, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2016, 0, 10 s., baw144.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species

    Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    New histone supply regulates replication fork speed and PCNA unloading

    Mejlvang, J., Feng, Y., Alabert, C., Neelsen, K. J., Jasencakova, Zuzana, Zhao, X., Lees, M., Sandelin, Albin Gustav, Pasero, P., Lopes, M. & Groth, Anja, 6 jan. 2014, I: Journal of Cell Biology. 204, 1, s. 29-43 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements

    Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Molecular architecture of transcription factor hotspots in early adipogenesis

    Siersbæk, R., Baek, S., Rabiee, A., Nielsen, R., Traynor, S., Clarke, N., Sandelin, Albin Gustav, Jensen, O. N., Sung, M., Hager, G. L. & Mandrup, S., 2014, I: Cell Reports. 7, 5, s. 1434-1442 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Modeling promoter grammars with evolving hidden Markov models

    Won, K., Sandelin, Albin Gustav, Marstrand, T. T. & Krogh, Anders, 2008, I: Bioinformatics. 24, 15, s. 1669-75 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation

    Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Carninci, P., 2012, I: Nature Reviews. Genetics. 13, 4, s. 233-245 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Mesenchymal-epithelial crosstalk shapes intestinal regionalisation via Wnt and Shh signalling

    Maimets, Martti, Pedersen, M. T., Guiu, J., Dreier, J., Thodberg, Malte, Antoku, Yasuko, Schweiger, P. J., Rib, Leonor, Bardini Bressan, Raul, Miao, Y., Garcia, K. C., Sandelin, Albin Gustav, Serup, Palle & Jensen, Kim Bak, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 715.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Mammalian RNA polymerase II core promoters: insights from genome-wide studies.

    Sandelin, Albin Gustav, Carninci, P., Lenhard, B., Ponjavic, J., Hayashizaki, Y. & Hume, D. A., 2007, I: Nature Reviews. Genetics. 8, 6, s. 424-36 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet
  46. Udgivet

    JASPAR, the open access database of transcription factor-binding profiles: new content and tools in the 2008 update.

    Bryne, J. C., Valen, E., Tang, M. E., Marstrand, T., Winther, Ole, da Piedade, I., Krogh, Anders, Lenhard, B. & Sandelin, Albin Gustav, 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, Database issue, s. D102-6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Rauluseviciute, I., Riudavets-puig, R., Blanc-mathieu, R., Castro-mondragon, J., Ferenc, K., Kumar, V., Lemma, R. B., Lucas, J., Chèneby, J., Baranasic, D., Khan, A., Fornes, O., Gundersen, S., Johansen, M., Hovig, E., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav, Wasserman, W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2024, I: Nucleic Acids Symposium Series. 52, D1, s. D174–D182 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    JASPAR 2022: the 9th release of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Castro-Mondragon, J. A., Riudavets-Puig, R., Rauluseviciute, I., Lemma, R. B., Turchi, L., Blanc-Mathieu, R., Lucas, J., Boddie, P., Khan, A., Perez, N. M., Fornes, O., Leung, T. Y., Aguirre, A., Hammal, F., Schmelter, D., Baranasic, D., Ballester, B., Sandelin, A., Lenhard, B., Vandepoele, K. & 3 flere, Wasserman, W. W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2022, I: Nucleic acids symposium series. 50, D1, s. D165-D173 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor binding profiles

    Fornes, O., Castro-Mondragon, J. A., Khan, A., van der Lee, R., Zhang, X., Richmond, P. A., Modi, B. P., Correard, S., Gheorghe, M., Baranašić, D., Santana-Garcia, W., Tan, G., Chèneby, J., Ballester, B., Parcy, F., Sandelin, Albin Gustav, Lenhard, B., Wasserman, W. W. & Mathelier, A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, D1, s. D87-D92 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    JASPAR 2018: update of the open-access database of transcription factor binding profiles and its web framework

    Khan, A., Fornes, O., Stigliani, A., Gheorghe, M., Castro-Mondragon, J. A., van der Lee, R., Bessy, A., Chèneby, J., Kulkarni, S. R., Tan, G., Baranasic, D., Arenillas, D. J., Sandelin, Albin Gustav, Vandepoele, K., Lenhard, B., Ballester, B., Wasserman, W. W., Parcy, F. & Mathelier, A., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, D1, s. D260-D266 7 s., gkx1126.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 5007