Albin Gustav Sandelin
Professor
Bioinformatik og RNA Biologi
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 2015
- Udgivet
Gateways to the FANTOM5 promoter level mammalian expression atlas
Lizio, M., Harshbarger, J., Shimoji, H., Severin, J., Kasukawa, T., Sahin, S., Abugessaisa, I., Fukuda, S., Hori, F., Ishikawa-Kato, S., Mungall, C. J., Arner, E., Baillie, J. K., Bertin, N., Bono, H., de Hoon, M., Diehl, A. D., Dimont, E., Freeman, T. C., Fujieda, K. & 21 flere, , 2015, I: Genome Biology (Online Edition). 16, 14 s., 22.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Human gene promoters are intrinsically bidirectional
Andersson, Robin, Chen, Y., Core, L., Lis, J. T., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2015, I: Molecular Cell. 60, 3, s. 346-347 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Remodeling of retrotransposon elements during epigenetic induction of adult visual cortical plasticity by HDAC inhibitors
Lennartsson, A., Arner, E., Fagiolini, M., Saxena, A., Andersson, Robin, Takahashi, H., Noro, Y., Sng, J., Sandelin, Albin Gustav, Hensch, T. K. & Carninci, P., 2015, I: Epigenetics & Chromatin. 8, 15 s., 55.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The constrained maximal expression level owing to haploidy shapes gene content on the mammalian X chromosome
Hurst, L. D., Ghanbarian, A. T., Forrest, A. R. R., Huminiecki, L., Rehli, M., Kenneth Baillie, J., de Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E. & 243 flere, , 2015, I: PLoS Biology. 13, 12, 48 s., e1002315.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The frequent evolutionary birth and death of functional promoters in mouse and human
Young, R. S., Hayashizaki, Y., Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Kawaji, H., Itoh, M., Lassmann, T., Carninci, P., Bickmore, W. A., Forrest, A. R. & Taylor, M. S., 2015, I: Genome Research. 25, s. 1546-1557 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells
Arner, E., Daub, C. O., Vitting-Seerup, K., Andersson, R., Lilje, B., Drabløs, F., Lennartsson, A., Rönnerblad, M., Hrydziuszko, O., Vitezic, M., Freeman, T. C., Alhendi, A. M. N., Arner, P., Axton, R., Baillie, J. K., Beckhouse, A., Bodega, B., Briggs, J., Brombacher, F., Davis, M. & 89 flere, , 2015, I: Science (New York, N.Y.). 347, 6225, s. 1010-1014 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
New histone supply regulates replication fork speed and PCNA unloading
Mejlvang, J., Feng, Y., Alabert, C., Neelsen, K. J., Jasencakova, Zuzana, Zhao, X., Lees, M., Sandelin, Albin Gustav, Pasero, P., Lopes, M. & Groth, Anja, 6 jan. 2014, I: Journal of Cell Biology. 204, 1, s. 29-43 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A promoter-level mammalian expression atlas
Forest, A. R. R., Kawaji, H., Rehli, M., Baillie, J. K., De Hoon, M. J. L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I. V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J., Meehan, T. F., Schmeier, S., Bertin, N., Jørgensen, M., Dimont, E., Arner, E., Schmidl, C., Schaefer, U. & 241 flere, , 2014, I: Nature. 507, 7493, s. 462-470 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An atlas of active enhancers across human cell types and tissues
Andersson, R., Gebhard, C., Miguel-Escalada, I., Hoof, I., Lange, J. B., Boyd, M., Chen, Y., Zhao, X., Schmidl, C., Suzuki, T., Ntini, E., Arner, E., Valen, E., Li, K., Schwarzfischer, L., Glatz, D., Raithel, J., Lilje, B., Rapin, N., Bagger, F. O. & 30 flere, , 2014, I: Nature. 507, 7493, s. 455-461 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Analysis of the DNA methylome and transcriptome in granulopoiesis reveal timed changes and dynamic enhancer methylation
Rönnerblad, M., Andersson, Robin, Olofsson, T., Douagi, I., Karimi, M., Lehmann, S., Hoof, I., de Hoon, M., Itoh, M., Nagao-Sato, S., Kawaji, H., Lassmann, T., Carninci, P., Hayashizaki, Y., Forrest, A. R. R., Sandelin, Albin Gustav, Ekwall, K., Arner, E. & Lennartsson, A., 2014, I: Blood. 123, 17Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CAGE-defined promoter regions of the genes implicated in Rett Syndrome
Vitezic, M., Bertin, N., Andersson, Robin, Lipovich, L., Kawaji, H., Lassmann, T., Sandelin, Albin Gustav, Heutink, P., Goldowitz, D., Ha, T., Zhang, P., Patrizi, A., Fagiolini, M., Forrest, A. R., Carninci, P. & Saxena, A., 2014, I: BMC Genomics. 15, 16 s., 1177.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deep transcriptome profiling of mammalian stem cells supports a regulatory role for retrotransposons in pluripotency maintenance
Fort, A., Hashimoto, K., Yamada, D., Salimullah, M., Keya, C. A., Saxena, A., Bonetti, A., Voineagu, I., Bertin, N., Kratz, A., Noro, Y., Wong, C-H., de Hoon, M., Andersson, R., Sandelin, A. G., Suzuki, H., Wei, C-L., Koseki, H., Hasegawa, Y., Forrest, A. R. R. & 2 flere, , 2014, I: Nature Genetics. 46, 6, s. 558-566 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-wide nucleosome map and cytosine methylation levels of an ancient human genome
Pedersen, J. S., Valen, E., Velazquez, A. M. V., Parker, B. J., Rasmussen, M., Lindgreen, S., Lilje, B., Tobin, D. J., Kelly, T. K., Vang, S., Andersson, R., Jones, P. A., Hoover, C. A., Tikhonov, A., Prokhortchouk, E., Rubin, E. M., Sandelin, A. G., Gilbert, M. T. P., Krogh, A., Willerslev, E. & 1 flere, , 2014, I: Genome Research. 24, 3, s. 454-466 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Human nonsense-mediated RNA decay initiates widely by endonucleolysis and targets snoRNA host genes
Lykke-Andersen, S., Chen, Y., Ardal, B., Lilje, B., Waage, J. E., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2014, I: Genes & Development. 28, s. 2498-2517 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of TNF-α-responsive promoters and enhancers in the intestinal epithelial cell model Caco-2
Boyd, M., Coskun, M., Lilje, B., Andersson, Robin, Hoof, I., Lange, Jette Bornholdt, Dahlgaard, K., Olsen, Jørgen, Vitezic, M., Bjerrum, Jakob Tveiten , Seidelin, Jakob Benedict, Nielsen, Ole Haagen, Troelsen, J. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: D N A Research. 21, 6, s. 569-583 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
JASPAR 2014: an extensively expanded and updated open-access database of transcription factor binding profiles
Mathelier, A., Zhao, X., Zhang, A. W., Parcy, F., Worsley-Hunt, R., Arenillas, D. J., Buchman, S., Chen, C., Chou, A., Ienasescu, H., Lim, J., Shyr, C., Tan, G., Zhou, M., Lenhard, B., Sandelin, Albin Gustav & Wasserman, W. W., 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, s. D142-D147 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular architecture of transcription factor hotspots in early adipogenesis
Siersbæk, R., Baek, S., Rabiee, A., Nielsen, R., Traynor, S., Clarke, N., Sandelin, Albin Gustav, Jensen, O. N., Sung, M., Hager, G. L. & Mandrup, S., 2014, I: Cell Reports. 7, 5, s. 1434-1442 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nuclear stability and transcriptional directionality separate functionally distinct RNA species
Andersson, Robin, Refsing Andersen, P., Valen, E., Core, L. J., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2014, I: Nature Communications. 5, 10 s., 5336.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptional profiling of the human fibrillin/LTBP gene family, key regulators of mesenchymal cell functions
Davis, M. R., Andersson, Robin, Severin, J., de Hoon, M., Bertin, N., Baillie, J. K., Kawaji, H., Sandelin, Albin Gustav, Forrest, A. R. R. & Summers, K. M., 2014, I: Molecular Genetics and Metabolism. 112, 3, s. 73-83 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data
Vitting-Seerup, K., Porse, Bo Torben, Sandelin, Albin Gustav & Waage, J., 2014, I: B M C Bioinformatics. 15, s. 1-7 7 s., 81.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
Acute Genome-wide effects of Rosiglitazone on PPARγ transcriptional networks in Adipocytes
Haakonsson, A. K., Madsen, M. S., Nielsen, R., Sandelin, Albin Gustav & Mandrup, S., 2013, I: Molecular Endocrinology. 27, 9, s. 1536-1549 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection of reverse transcriptase termination sites using cDNA ligation and massive parallel sequencing
Kielpinski, L. J., Boyd, M., Sandelin, Albin Gustav & Vinther, Jeppe, 2013, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1038, s. 213-31 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Polyadenylation site-induced decay of upstream transcripts enforces promoter directionality
Ntini, E., Järvelin, A. I., Lange, Jette Bornholdt, Chen, Y., Boyd, M., Jørgensen, M., Andersson, Robin, Hoof, I., Schein, A., Andersen, P. R., Andersen, P. K., Preker, P., Valen, E., Zhao, X., Pelechano, V., Steinmetz, L. M., Sandelin, Albin Gustav & Jensen, T. H., 2013, I: Nature Structural and Molecular Biology. 20, s. 923-928 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Cross-species ChIP-seq studies provide insights into regulatory strategies of PPAR¿ in adipocytes
Schmidt, S. F., Jørgensen, M., Sandelin, Albin Gustav & Mandrup, S., 2012, I: Transcription. 3, 1, s. 19-24 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GMD: measuring the distance between histograms with applications on high-throughput sequencing reads
Zhao, X. & Sandelin, Albin Gustav, 2012, I: Bioinformatics. 28, 8, s. 1164-1165 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 5007
Flest downloads
-
3482
downloads
spliceR: an R package for classification of alternative splicing and prediction of coding potential from RNA-seq data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3337
downloads
Prediction of RNA Polymerase II recruitment, elongation and stalling from histone modification data
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2986
downloads
Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet