Ole Winther

Ole Winther

Professor MSO, Gæsteprofessor


  1. 2022
  2. Udgivet

    Calibrated uncertainty for molecular property prediction using ensembles of message passing neural networks

    Busk, J., Jørgensen, P. B., Bhowmik, A., Schmidt, M. N., Winther, Ole & Vegge, T., 2022, I: Machine Learning: Science and Technology. 3, 1, 12 s., 015012.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models

    Thumuluri, V., Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Nielsen, H. & Winther, Ole, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W228-W234

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues

    Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, Ole, Nielsen, Finn Cilius & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    NetSurfP-3.0: accurate and fast prediction of protein structural features by protein language models and deep learning

    Høie, M. H., Kiehl, E. N., Petersen, Bent, Nielsen, M., Winther, Ole, Nielsen, H., Hallgren, J. & Marcatili, P., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W510-W515 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    SignalP 6.0 predicts all five types of signal peptides using protein language models

    Teufel, Felix Georg, Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Gíslason, M. H., Pihl, S. I., Tsirigos, Konstantinos, Winther, Ole, Brunak, Søren, von Heijne, G. & Nielsen, H., 2022, I: Nature Biotechnology. 40, s. 1023-1025

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  7. Udgivet

    Transfer learning reveals sequence determinants of regulatory element accessibility

    Salvatore, Marco, Horlacher, M., Winther, Ole & Andersson, Robin, 2022, bioRxiv, 24 s.

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  8. Udgivet

    Transition1x: a dataset for building generalizable reactive machine learning potentials

    Schreiner, M., Bhowmik, A., Vegge, T., Busk, J. & Winther, Ole, 2022, I: Scientific Data. 9, 1, 9 s., 779.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 171145930