Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- Udgivet
Construction of a ColD cda Promoter-Based SOS-Green Fluorescent Protein Whole-Cell Biosensor with Higher Sensitivity toward Genotoxic Compounds than Constructs Based on recA, umuDC, or sulA Promoters
Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: Applied and Environmental Microbiology. 71, 5, s. 2338-2346Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction of an extended range whole-cell tetracycline biosensor by use of the tet(M) resistance gene
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: FEMS Microbiology Letters. 253, 2, s. 201-205Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction of biosensors to investigate physiological diversity in fermentation processes
Han, S., Lundin, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2011.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Cooperative microbial interactions drive spatial segregation in porous environments
Wu, Y., Fu, C., Peacock, C. L., Sørensen, Søren Johannes, Redmile-Gordon, M. A., Xiao, K. Q., Gao, C., Liu, J., Huang, Q., Li, Z., Song, P., Zhu, Y., Zhou, J. & Cai, P., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 14 s., 4226.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coping with copper: legacy effect of copper on potential activity of soil bacteria following a century of exposure
Nunes, I. M., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Holm, Peter Engelund, Johansen, A., Brandt, Kristian Koefoed, Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 11, 12 s., fiw175.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: a benchmark of metagenomics software
Sczyrba, A., Hofmann, P., Belmann, P., Koslicki, D., Janssen, S., Dröge, J., Gregor, I., Majda, S., Fiedler, J., Dahms, E., Bremges, A., Fritz, A., Garrido-Oter, R., Jørgensen, T. S., Shapiro, N., Blood, P. D., Gurevich, A., Bai, Y., Turaev, D., DeMaere, M. Z. & 47 flere, , 2017, I: Nature Methods. 14, 11, s. 1063-1071 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges
Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. & 83 flere, , 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 429-440Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cultivation of hard-to-culture subsurface mercury-resistant bacteria and discovery of new merA gene sequences
Rasmussen, L. D., Zawadsky, C., Binnerup, S. J., Øregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 12, s. 3795-803 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cultivation-independent examination of horizontal transfer and host range of an IncP-1 plasmid among gram-positive and gram-negative bacteria indigenous to the barley rhizosphere
Musovic, S., Oregaard, G., Kroer, Niels & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Applied and Environmental Microbiology. 72, 10, s. 6687-6692 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Culture-dependent and -independent investigations of microbial diversity on urinary catheters
Xu, Y., Moser, Claus Ernst, Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Høiby, Niels, Nielsen, P. H. & Thomsen, T. R., 2012, I: Journal of Clinical Microbiology. 50, 12, s. 3901-3908 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Current strategies for mobilome research
Jørgensen, T. S., Kiil, A. S., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Frontiers in Microbiology. 5, 6 s., 750.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DGGE and Pyrosequencing characterization of microbial community and methane-metabolizing microorganisms in livestock slurry surface crusts
Duan, Y. (., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2012.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
DNA-and RNA-SIP Reveal Nitrospira spp. as Key Drivers of Nitrification in Groundwater-Fed Biofilters
Gülay, A., Fowler, S. J., Tatari, K., Thamdrup, B., Albrechtsen, H., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2019, I: mBio. 10, 6, 14 s., e01870-19.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque
Kot, Witold, Vogensen, Finn Kvist, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deciphering bacteria associated with a pre-parasitic stage of the root-knot nematode Meloidogyne hapla in nemato-suppressive and nemato-conducive soils
Topalović, O., Santos, S. S., Heuer, H., Nesme, Joseph, Kanfra, X., Hallmann, J., Sørensen, Søren Johannes & Vestergård, M., 2022, I: Applied Soil Ecology. 172, 9 s., 104344.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deciphering conjugative plasmid permissiveness in wastewater microbiomes
Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Milani, S. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, jul. 2017, I: Molecular Ecology. 26, 13, s. 3556-3571 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deciphering links between bacterial interactions and spatial organization in multispecies biofilms
Liu, W., Jacquiod, S., Brejnrod, A., Russel, J., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2019, I: ISME Journal. 13, 12, s. 3054-3066 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Delivery mode and gut microbial changes correlate with an increased risk of childhood asthma
Stokholm, Jakob, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Blaser, M. J., Rasmussen, Morten Arendt, Hjelmsø, M., Shah, S., Christensen, E. D., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Brix, S., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Vestergaard, G., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2020, I: Science Translational Medicine. 12, 569, 14 s., eaax9929.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Design and Synthesis of a Quintessential Self-Transmissible IncX1 Plasmid, pX1.0
Hansen, Lars Hestbjerg, Bentzon-Tilia, M., Bentzon-Tilia, S., Norman, A., Rafty, L. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2011, I: P L o S One. 6, 5, 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Design of growth-dependent biosensors based on destabilized GFP for the detection of physiological behavior of Escherichia coli in heterogeneous bioreactors
Han, S., Delvigne, F., Brognaux, A., Charbon, G. E. & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Biotechnology Progress. 29, 2, s. 553-563 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection and quantification of tetracyclines by whole cell biosensors
Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2000, I: FEMS Microbiology Letters. 190, 2, s. 273-278Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection of Oxytetracycline production by Streptomyces rimosus in soil microcosms by combining whole-cell biosensors and flow cytometry
Hansen, Lars Hestbjerg, Ferrari, B., Sørensen, A. H., Veal, D. & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: Applied and Environmental Microbiology. 67, 1, s. 239-244Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Determination of the genetic background for resistance to olaquindox, a Gram-negative growth promoter
Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Jensen, L. B., 2006, I: DANMAP 2005 - July 2006. s. 100-100 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Different Degrees of Niche Differentiation for Bacteria, Fungi, and Myxomycetes Within an Elevational Transect in the German Alps
Dahl, M. B., Brejnrod, A. D., Russel, J., Sørensen, Søren Johannes & Schnittler, M., 2019, I: Microbial Ecology. 78, 3, s. 764-780Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differential responses of the gut microbiome and resistome to antibiotic exposures in infants and adults
Li, Xuan Ji, Brejnrod, A., Thorsen, J., Zachariasen, Trine, Trivedi, Urvish, Russel, J., Vestergaard, G. A., Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt & Sørensen, Søren Johannes, 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 16 s., 8526.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Direct Detection and Quantification of Horizontal Gene Transfer Using Flow Cytometry and gfp as a Reporter Gene
Sørensen, Søren Johannes, Sørensen, A. H., Hansen, Lars Hestbjerg, Oregaard, G. & Veal, D., 2003, I: Current Microbiology. 47, 2, s. 129-133 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Discovery of multiple anti-CRISPRs highlights anti-defense gene clustering in mobile genetic elements
Pinilla Redondo, Rafael, Shehreen, S., Marino, N. D., Fagerlund, R. D., Brown, C. M., Sørensen, Søren Johannes, Fineran, P. C. & Bondy-Denomy, J., 2020, I: Nature Communications. 11, 11 s., 5652.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Distinct gene expression profile of Xanthomonas retroflexus engaged in synergistic multispecies biofilm formation
Hansen, L. B. S., Ren, D., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 300-303 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Distinct rhizomicrobiota assemblages and plant performance in lettuce grown in soils with different agricultural management histories
Babin, D., Sommermann, L., Chowdhury, S. P., Behr, J. H., Sandmann, M., Neumann, G., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K. & Grosch, R., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 21 s., fiab027.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diverse gene functions in a soil mobilome
Luo, W., Xu, Z., Riber, Leise, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Soil Biology & Biochemistry. 101, s. 175-183 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity and characterization of mercury-resistant bacteria in snow, freshwater and sea-ice brine from the High Arctic
Møller, A., Barkay, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Skov, H. & Kroer, Niels, 1 mar. 2011, I: F E M S Microbiology Ecology. 75, 3, s. 390-401 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Filed Trial
Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Draft Genome Sequence of the Soil Bacterium Burkholderia terrae Strain BS001, Which Interacts with Fungal Surface Structures
Nazir, R., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Journal of Bacteriology. 194, 16, s. 4480-4481 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome assembly of two Pseudoclavibacter helvolus strains, G8 and W3, isolated from slaughterhouse environments
Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 1 s., e00077-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome sequence of Burkholderia sordidicola S170, a potential plant growth promoter isolated from coniferous forest soil in the Czech Republic
Lladó, S., Xu, Z., Sørensen, Søren Johannes & Baldrian, P., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00810-14.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome sequences of two Kocuria isolates, K. salsicia G1 and K. rhizophila G2, isolated from a slaughterhouse in Denmark
Herschend, J., Raghupathi, P. K., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 2 s., e00075-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome sequences of two protease-producing strains of Arsukibacterium, isolated from two cold and alkaline environments
Lylloff, J. E., Hansen, L. B. S., Jepsen, M., Hallin, P. F., Sørensen, Søren Johannes, Stougaard, P. & Glaring, M. A., 2015, I: Genome Announcements. 3, 3, 2 s., e00585-15.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genomes of seven isolates from Danish wastewater facilities belonging to Pseudomonas, Bacillus, Pseudochrobactrum, Brevundimonas, and Pandoraea
Maccario, Lorrie, Silva, A. F., Nesme, Joseph, Amador Hierro, Cristina Isabel, Sørensen, Søren Johannes, Cooper, V. S. & Røder, Henriette Lyng, 2023, I: Microbiology resource announcements. 12, 12, 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
EMBRACE-WATERS statement: Recommendations for reporting of studies on antimicrobial resistance in wastewater and related aquatic environments
Hassoun-Kheir, N., Stabholz, Y., Kreft, J-U., de la Cruz, R., Dechesne, A., Smets, B. F., Romalde, J. L., Lema, A., Balboa, S., García-Riestra, C., Torres-Sangiao, E., Neuberger, A., Graham, D., Quintela-Baluja, M., Stekel, D. J., Graham, J., Pruden, A., Nesme, J., Sørensen, S. J., Hough, R. & 1 flere, , 2021, I: One Health. 13, 9 s., 100339.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Early life treatment with vancomycin propagates Akkermansia muciniphila and reduces diabetes incidence in the NOD mouse
Hansen, Camilla Hartmann Friis, Krych, Lukasz, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Buschard, K. & Hansen, Axel Kornerup, 2012, I: Diabetologia. 55, 8, s. 2285-2294 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecological patterns, diversity and core taxa of microbial communities in groundwater-fed rapid gravity filters
Gülay, A., Musovic, S., Albrechtsen, H., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2016, I: The ISME Journal. 10, 9, s. 2209-2222 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecological succession in the vaginal microbiota during pregnancy and birth
Rasmussen, Morten Arendt, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Dominguez-Bello, M. G., Blaser, M. J., Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Shah, S. A., Hjelmsø, M. H., Lehtimäki, J., Trivedi, Urvish, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2020, I: The ISME Journal. 14, 9, s. 2325-2335 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Ecology and photobiology of chlorophyll d-containing cyanobacteria
Kühl, Michael, Behrendt, L., Trampe, Erik, Sørensen, Søren Johannes, Chen, M., Qvortrup, K. & Larkum, A., 2012.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Ecosystem response of pasture soil communities to fumigation-induced microbial diversity reductions: an examination of the biodiversity-ecosystem function relationship
Griffiths, B. S., Ritz, K., Bardgett, R. D., Cook, R., Christensen, Søren, Ekelund, Flemming, Sørensen, Søren Johannes, Bååth, E., Bloem, J., De Ruiter, P. C., Dolfing, J. & Nicolardot, B., 2000, I: Oikos. 90, 2, s. 279-294Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of Tetracycline on Transfer and Establishment of the Tetracycline-Inducible Conjugative Transposon Tn916 in the Guts of Gnotobiotic Rats
Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Licht, T. R., 2004, I: Applied and Environmental Microbiology. 70, 2, s. 758-764Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of genomic location on horizontal transfer of a recombinant gene cassette between Pseudomonas strains in the rhizosphere and spermosphere of barley seedlings
Sengeløv, G., Kristensen, K. J., Sørensen, A. M. H., Kroer, Niels & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: Current Microbiology. 42, s. 160-167Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of long-term organic and mineral fertilization strategies on rhizosphere microbiota assemblage and performance of lettuce
Paul Chowdhury, S., Babin, D., Sandmann, M., Jacquiod, S., Sommermann, L., Sørensen, Søren Johannes, Fliessbach, A., Mäder, P., Geistlinger, J., Smalla, K., Rothballer, M. & Grosch, R., 2019, I: Environmental Microbiology. 21, 7, s. 2426-2439Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of root exudates and bacterial metabolic activity on conjugal gene transfer in the rhizosphere of a marsch plant
Kroer, Niels, Barkay, T., Sørensen, Søren Johannes & Weber, D., 1998, I: FEMS Microbiology Ecology. 25, s. 375-384Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
ID: 4269
Flest downloads
-
5145
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3030
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2840
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet