Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- Udgivet
Maize lines with different nitrogen use efficiency select bacterial communities with different β-glucosidase-encoding genes and glucosidase activity in the rhizosphere
Pathan, S. I., Ceccherini, M. T., Hansen, M. A., Giagnoni, L., Ascher, J., Arenella, M., Sørensen, Søren Johannes, Pietramellara, G., Nannipieri, P. & Renella, G., 2015, I: Biology and Fertility of Soils. 51, 8, s. 995-1004 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Making bio-sense of toxicity: new developments in whole-cell biosencors
Sørensen, Søren Johannes, Burmølle, Mette & Hansen, Lars Hestbjerg, 2006, I: Current Opinion in Biotechnology. 17, 1, s. 11-16Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Manure and Doxycycline Affect the Bacterial Community and Its Resistome in Lettuce Rhizosphere and Bulk Soil
Blau, K., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes, Su, J., Zhu, Y., Smalla, K. & Jechalke, S., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-15 725.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Maturation of the gut microbiome and risk of asthma in childhood
Stokholm, Jakob, Blaser, M. J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Waage, J. E., Vinding, R. K., Schoos, A. M., Kunøe, A., Fink, N. R., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Brejnrod, A. D., Mortensen, M. S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2018, I: Nature Communications. 9, 10 s., 141.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine
Møller, A. K., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Boyd, E. S. & Kroer, Niels, 2014, I: FEMS Microbiology Ecology. 87, 1, s. 52-63 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metabolic Profiling of Interspecies Interactions During Sessile Bacterial Cultivation Reveals Growth and Sporulation Induction in Paenibacillus amylolyticus in Response to Xanthomonas retroflexus
Herschend, J., Ernst, M., Koren, K., Melnik, A. V., da Silva, R. R., Røder, Henriette Lyng, Damholt, Z. B. V., Hägglund, Per Mårten, Svensson, B., Sørensen, Søren Johannes, Kühl, Michael, Dorrestein, P. C. & Burmølle, Mette, 2022, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 12, 17 s., 805473.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metabolic variability in bioprocessing: implications of microbial phenotypic heterogeneity
Delvigne, F., Zune, Q., Lara, A. R., Abu Al-Soud, W. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Biotechnology. 32, 12, s. 608-616 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomes provide valuable comparative information on soil microeukaryotes
Jacquiod, S. J. A., Stenbæk, J., Santos, S. S., Winding, A., Sørensen, Søren Johannes & Priemé, Anders, 2016, I: Research in Microbiology. 167, 5, s. 436-450 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms
Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures
Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, Lukasz, Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, Finn Kvist, 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs
Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metal stressors consistently modulate bacterial conjugal plasmid uptake potential in a phylogenetically conserved manner
Klümper, U., Dechesne, A., Riber, Leise, Brandt, Kristian Koefoed, Gülay, A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 152-165 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metal-induced bacterial interactions promote diversity in river-sediment microbiomes
Cyriaque, V., Géron, A., Billon, G., Nesme, Joseph, Werner, J., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: F E M S Microbiology Ecology. 96, 6, 12 s., fiaa076.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Metamobilomics — expanding our knowledge on the pool of plasmid encoded traits in natural environments using high-throughput sequencing
Li, L., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: Clinical Microbiology and Infection. 18, Suppl. 4, s. 8-11 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Methanotrophs, methanogens and microbial community structure in livestock slurry surface crusts
Duan, Y. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2014, I: Journal of Applied Microbiology. 117, 4, s. 1066-1078 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Methods for detection of conjugative plasmid transfer in aquatic environments
Sengeløv, G. & Sørensen, Søren Johannes, 1998, I: Current Microbiology. 37, s. 274-280Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Micro-scale intermixing: a requisite for stable and synergistic co-establishment in a four-species biofilm
Liu, W., Russel, J., Burmølle, Mette, Sørensen, Søren Johannes & Madsen, Jonas Stenløkke, 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 1940-1951 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial community analysis of soils under different soybean cropping regimes in the Argentinean south-eastern Humid Pampas
Fernandez-Gnecco, G., Smalla, K., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Barbieri, P., Consolo, V. F., Covacevich, F. & Babin, D., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab007.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial degradation of street dust polycyclic aromatic hydrocarbons in microcosms simulating diffuse pollution of urban soil.
Johnsen, A. R., de Lipthay, J. R., Sørensen, Søren Johannes, Ekelund, Flemming, Christensen, P., Andersen, O., Karlson, U. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Microbiology. 8, 3, s. 535-45 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity and PAH catabolic genes tracking spatial heterogeneity of PAH concentrations
Bengtsson, G., Törneman, N., Lipthay, J. R. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Microbial Ecology. 65, 1, s. 91-100 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity and dynamics throughout manufacturing and ripening of surface ripened semi-hard Danish Danbo cheeses investigated by culture-independent techniques
Ryssel, M., Johansen, P., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Arneborg, Nils & Jespersen, Lene, 2015, I: International Journal of Food Microbiology. 215, s. 124-30 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity and putative opportunistic pathogens in dishwasher biofilm communities
Raghupathi, P. K., Zupančič, J., Brejnrod, A. D., Jacquiod, S. J. A., Houf, K., Burmølle, Mette, Gunde-Cimerman, N. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 5, 17 s., e02755-17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity in a permanently cold and alkaline environment in Greenland
Glaring, M. A., Vester, J. K., Lylloff, J. E., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Stougaard, P., 2015, I: PLoS ONE. 10, 4, 22 s., e0124863.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity of biofilm communities in microniches associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella
Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Trampe, Erik, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Kühl, Michael, 2012, I: I S M E Journal. 6, s. 1222-1237 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial indicators for soil quality
Schloter, M., Nannipieri, P., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., jan. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 1, s. 1-10 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbiomes associated with infective stages of root-knot and lesion nematodes in soil
Elhadyl, A., Giné, A., Topalovic, O., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Javier Sorribas, F. & Heuer, H., 4 maj 2017, I: PLoS ONE. 12, 5, 17 s., e0177145.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mineralisation of 2,6-dichlorobenzamide (BAM) in dichlobenil-exposed soils and isolation of a BAM-mineralising Aminobacter sp.
Simonsen, A., Holtze, M. S., Sørensen, S. R., Sørensen, Søren Johannes & Aamund, J., 2006, I: Environmental Pollution. 144, 1, s. 289-295Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mining of unexplored habitats for novel chitinases - chiA as a helper gene proxy in metagenomics
Cretoiu, M. S., Kielak, A. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 94, 5, s. 1347-1358 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mobilization of non-conjugative plasmids, pBR322-derivatives from laboratory strains of escherichia coli to indigenous bacteria isolated from seawater
Sørensen, Søren Johannes, 1992, I: Microbial Releases. 1, s. 17-22Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Modeling transfer of vaginal microbiota from mother to infant in early life
Mortensen, M. S., Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Balle, C., Thorsen, J., Krogfelt, K. A., Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: eLife. 10, 19 s., e57051.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular methods for assessing and manipulating the diversity of microbial populations and processes
Sørensen, Søren Johannes, de Lipthay, J. R., Müller, A. K., Barkay, T., Hansen, Lars Hestbjerg & Rasmussen, L. D., 2002, Enzymes in the Environment: Activity, Ecology, and Applications. Burns, R. G. & Dick, R. P. (red.). Marcel Dekker, 363 s. (Books in soils, plants, and the environment).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Monitoring and evaluating soil quality
Bloem, J., Schouten, A. J., Sørensen, Søren Johannes, Rutgers, M., van der Werf, A. & Breuer, A. M., 2005, Microbiological methods for assessing soil quality. s. .Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til rapport › Forskning
- Udgivet
Monitoring plasmid-mediated horizontal gene transfer in microbiomes: recent advances and future perspectives
Pinilla Redondo, Rafael, Cyriaque, V., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, 2018, I: Plasmid. 99, s. 56-67Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Natural decay process affects the abundance and community structure of Bacteria and Archaea in Picea abies logs
Rinta-Kanto, J. M., Sinkko, H., Rajala, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Tamminen, M. V. & Timonen, S., 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 7, 10 s., fiw087.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Natural hot spots for gain of multiple resistances: arsenic and antibiotic resistances in heterotrophic, aerobic bacteria from marine hydrothermal vent fields
Farias, P., Santo, C. E., Branco, R., Francisco, R., Santos, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 7, s. 2534-2543 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Neonatal metabolome of caesarean section and risk of childhood asthma
Gürdeniz, G., Ernst, M., Rago, D., Kim, M., Courraud, J., Stokholm, Jakob, Bønnelykke, Klaus, Björkbom, A., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Brix, Susanne, Hougaard, D., Rasmussen, Morten Arendt, Cohen, A. S., Bisgaard, H. & Chawes, Bo Lund Krogsgaard, 2022, I: The European Respiratory Journal. 59, 6, 11 s., 2102406.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
New ecological niches and habitats for Chlorophyll d- containing cyanobacteria
Behrendt, L., Chen, M., Larkum, A. W. D., Ralph, P. J., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, E. & Kühl, Michael, 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Nitrogenase gene amplicons from global marine surface waters are dominated by genes of non-cyanobacteria
Farnelid, H., Andersson, A. F., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Steward, G. F., Hagström, Å. & Riemann, Lasse, 2011, I: P L o S One. 6, 4, s. e19223 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel and conserved bacterial mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine
Kroer, Niels, Møller, A., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Nucleotide sequence of pOLA52: a conjugative IncX1 plasmid from Escherichia coli which enables biofilm formation and multidrug efflux
Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, She, Q. & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: Plasmid. 60, 1, s. 59-74 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nutrient Fortification of Human Donor Milk Affects Intestinal Function and Protein Metabolism in Preterm Pigs
Sun, Jing, Li, Yanqi, Nguyen, Duc Ninh, Mortensen, M. S., van den Akker, C. H. P., Skeath, T., Pors, S. E., Pankratova, Stanislava, Rudloff, S., Sørensen, Søren Johannes, Burrin, D. G., Thymann, Thomas & Sangild, Per Torp, 2018, I: Journal of Nutrition. 148, 3, s. 336-347 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oropharyngeal Microbiota Clusters in Children with Asthma or Wheeze Associate with Allergy, Blood Transcriptomic Immune Pathways, and Exacerbation Risk
U-BIOPRED Study Group, U. S. G., 2023, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 208, 2, s. 142-154 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Permissiveness of soil microbial communities toward receipt of mobile genetic elements
Musovic, S., Klümper, U., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2012.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Persistence and progression of staphylococcal infection in the presence of public goods
Trivedi, Urvish, Fell, C., Madsen, Jonas Stenløkke, Everett, J., Burmølle, Mette, Rumbaugh, K. P. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: npj Biofilms and Microbiomes. 6, 5 s., 55.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pharmacokinetics of Locally Applied Antibiotic Prophylaxis for Implant-Based Breast Reconstruction
Hemmingsen, Mathilde Nejrup, Bennedsen, A. K., Kullab, R. B., Norlin, C. B., Ørholt, M., Larsen, A., Bue, M., Lichtenberg, Mads, Hertz, Frederik Boëtius, Damsgaard, T. E., Vester-Glowinski, Peter Viktor, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas & Herly, Mikkel, 2023, I: JAMA network open. 6, 12, 11 s., E2348414.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phenotypic variability in bioprocessing conditions can be tracked on the basis of on-line flow cytometry and fits to a scaling law
Baert, J., Kinet, R., Brognaux, A., Delepierre, A., Telek, S., Sørensen, Søren Johannes, Riber, Leise, Fickers, P. & Delvigne, F., 2015, I: Biotechnology Journal. 10, 8, s. 1316-1325 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physiological heterogeneities in microbial populations and implications for physical stress tolerance
Carlqvist, M., Lencastre Fernandes, R., Helmark, S., Heins, A., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Gernaey, K. & Eliasson Lantz, A., 2012, I: Microbial Cell Factories. 11, 94, 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmid Encoded Multidrug Efflux Pump Conferring Resistance to Olaquindox in Escherichia coli
Hansen, Lars Hestbjerg, Johannesen, E., Burmølle, Mette, Sørensen, A. H. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 48, 9, s. 3332-3337Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4269
Flest downloads
-
5145
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3030
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2840
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet