Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. Udgivet

    Maize lines with different nitrogen use efficiency select bacterial communities with different β-glucosidase-encoding genes and glucosidase activity in the rhizosphere

    Pathan, S. I., Ceccherini, M. T., Hansen, M. A., Giagnoni, L., Ascher, J., Arenella, M., Sørensen, Søren Johannes, Pietramellara, G., Nannipieri, P. & Renella, G., 2015, I: Biology and Fertility of Soils. 51, 8, s. 995-1004 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Making bio-sense of toxicity: new developments in whole-cell biosencors

    Sørensen, Søren Johannes, Burmølle, Mette & Hansen, Lars Hestbjerg, 2006, I: Current Opinion in Biotechnology. 17, 1, s. 11-16

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Manure and Doxycycline Affect the Bacterial Community and Its Resistome in Lettuce Rhizosphere and Bulk Soil

    Blau, K., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes, Su, J., Zhu, Y., Smalla, K. & Jechalke, S., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-15 725.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Maturation of the gut microbiome and risk of asthma in childhood

    Stokholm, Jakob, Blaser, M. J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Waage, J. E., Vinding, R. K., Schoos, A. M., Kunøe, A., Fink, N. R., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Brejnrod, A. D., Mortensen, M. S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2018, I: Nature Communications. 9, 10 s., 141.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

    Møller, A. K., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Boyd, E. S. & Kroer, Niels, 2014, I: FEMS Microbiology Ecology. 87, 1, s. 52-63 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Metabolic Profiling of Interspecies Interactions During Sessile Bacterial Cultivation Reveals Growth and Sporulation Induction in Paenibacillus amylolyticus in Response to Xanthomonas retroflexus

    Herschend, J., Ernst, M., Koren, K., Melnik, A. V., da Silva, R. R., Røder, Henriette Lyng, Damholt, Z. B. V., Hägglund, Per Mårten, Svensson, B., Sørensen, Søren Johannes, Kühl, Michael, Dorrestein, P. C. & Burmølle, Mette, 2022, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 12, 17 s., 805473.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Metabolic variability in bioprocessing: implications of microbial phenotypic heterogeneity

    Delvigne, F., Zune, Q., Lara, A. R., Abu Al-Soud, W. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Biotechnology. 32, 12, s. 608-616 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Metagenomes provide valuable comparative information on soil microeukaryotes

    Jacquiod, S. J. A., Stenbæk, J., Santos, S. S., Winding, A., Sørensen, Søren Johannes & Priemé, Anders, 2016, I: Research in Microbiology. 167, 5, s. 436-450 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms

    Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures

    Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, Lukasz, Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, Finn Kvist, 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

    Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Metal stressors consistently modulate bacterial conjugal plasmid uptake potential in a phylogenetically conserved manner

    Klümper, U., Dechesne, A., Riber, Leise, Brandt, Kristian Koefoed, Gülay, A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 152-165 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Metal-induced bacterial interactions promote diversity in river-sediment microbiomes

    Cyriaque, V., Géron, A., Billon, G., Nesme, Joseph, Werner, J., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: F E M S Microbiology Ecology. 96, 6, 12 s., fiaa076.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Metamobilomics - Expanding the environmental mobilome with high throughput sequencing

    Norman, A., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  15. Udgivet

    Metamobilomics — expanding our knowledge on the pool of plasmid encoded traits in natural environments using high-throughput sequencing

    Li, L., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: Clinical Microbiology and Infection. 18, Suppl. 4, s. 8-11 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Methanotrophs, methanogens and microbial community structure in livestock slurry surface crusts

    Duan, Y. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2014, I: Journal of Applied Microbiology. 117, 4, s. 1066-1078 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Methods for detection of conjugative plasmid transfer in aquatic environments

    Sengeløv, G. & Sørensen, Søren Johannes, 1998, I: Current Microbiology. 37, s. 274-280

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  18. Udgivet

    Micro-scale intermixing: a requisite for stable and synergistic co-establishment in a four-species biofilm

    Liu, W., Russel, J., Burmølle, Mette, Sørensen, Søren Johannes & Madsen, Jonas Stenløkke, 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 1940-1951 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Microbial community analysis of soils under different soybean cropping regimes in the Argentinean south-eastern Humid Pampas

    Fernandez-Gnecco, G., Smalla, K., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Barbieri, P., Consolo, V. F., Covacevich, F. & Babin, D., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Microbial degradation of street dust polycyclic aromatic hydrocarbons in microcosms simulating diffuse pollution of urban soil.

    Johnsen, A. R., de Lipthay, J. R., Sørensen, Søren Johannes, Ekelund, Flemming, Christensen, P., Andersen, O., Karlson, U. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Microbiology. 8, 3, s. 535-45 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Microbial diversity and PAH catabolic genes tracking spatial heterogeneity of PAH concentrations

    Bengtsson, G., Törneman, N., Lipthay, J. R. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Microbial Ecology. 65, 1, s. 91-100 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Microbial diversity and dynamics throughout manufacturing and ripening of surface ripened semi-hard Danish Danbo cheeses investigated by culture-independent techniques

    Ryssel, M., Johansen, P., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Arneborg, Nils & Jespersen, Lene, 2015, I: International Journal of Food Microbiology. 215, s. 124-30 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Microbial diversity and putative opportunistic pathogens in dishwasher biofilm communities

    Raghupathi, P. K., Zupančič, J., Brejnrod, A. D., Jacquiod, S. J. A., Houf, K., Burmølle, Mette, Gunde-Cimerman, N. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 5, 17 s., e02755-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Microbial diversity in a permanently cold and alkaline environment in Greenland

    Glaring, M. A., Vester, J. K., Lylloff, J. E., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Stougaard, P., 2015, I: PLoS ONE. 10, 4, 22 s., e0124863.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Microbial diversity of biofilm communities in microniches associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella

    Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Trampe, Erik, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Kühl, Michael, 2012, I: I S M E Journal. 6, s. 1222-1237 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Microbial indicators for soil quality

    Schloter, M., Nannipieri, P., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., jan. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 1, s. 1-10 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Microbiomes associated with infective stages of root-knot and lesion nematodes in soil

    Elhadyl, A., Giné, A., Topalovic, O., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Javier Sorribas, F. & Heuer, H., 4 maj 2017, I: PLoS ONE. 12, 5, 17 s., e0177145.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Mineralisation of 2,6-dichlorobenzamide (BAM) in dichlobenil-exposed soils and isolation of a BAM-mineralising Aminobacter sp.

    Simonsen, A., Holtze, M. S., Sørensen, S. R., Sørensen, Søren Johannes & Aamund, J., 2006, I: Environmental Pollution. 144, 1, s. 289-295

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Mining of unexplored habitats for novel chitinases - chiA as a helper gene proxy in metagenomics

    Cretoiu, M. S., Kielak, A. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 94, 5, s. 1347-1358 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet
  31. Udgivet

    Modeling transfer of vaginal microbiota from mother to infant in early life

    Mortensen, M. S., Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Balle, C., Thorsen, J., Krogfelt, K. A., Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: eLife. 10, 19 s., e57051.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Molecular methods for assessing and manipulating the diversity of microbial populations and processes

    Sørensen, Søren Johannes, de Lipthay, J. R., Müller, A. K., Barkay, T., Hansen, Lars Hestbjerg & Rasmussen, L. D., 2002, Enzymes in the Environment: Activity, Ecology, and Applications. Burns, R. G. & Dick, R. P. (red.). Marcel Dekker, 363 s. (Books in soils, plants, and the environment).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Monitoring and evaluating soil quality

    Bloem, J., Schouten, A. J., Sørensen, Søren Johannes, Rutgers, M., van der Werf, A. & Breuer, A. M., 2005, Microbiological methods for assessing soil quality. s. .

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til rapportForskning

  34. Udgivet

    Monitoring plasmid-mediated horizontal gene transfer in microbiomes: recent advances and future perspectives

    Pinilla Redondo, Rafael, Cyriaque, V., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, 2018, I: Plasmid. 99, s. 56-67

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Natural decay process affects the abundance and community structure of Bacteria and Archaea in Picea abies logs

    Rinta-Kanto, J. M., Sinkko, H., Rajala, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Tamminen, M. V. & Timonen, S., 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 7, 10 s., fiw087.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Natural hot spots for gain of multiple resistances: arsenic and antibiotic resistances in heterotrophic, aerobic bacteria from marine hydrothermal vent fields

    Farias, P., Santo, C. E., Branco, R., Francisco, R., Santos, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 7, s. 2534-2543 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Neonatal metabolome of caesarean section and risk of childhood asthma

    Gürdeniz, G., Ernst, M., Rago, D., Kim, M., Courraud, J., Stokholm, Jakob, Bønnelykke, Klaus, Björkbom, A., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Brix, Susanne, Hougaard, D., Rasmussen, Morten Arendt, Cohen, A. S., Bisgaard, H. & Chawes, Bo Lund Krogsgaard, 2022, I: The European Respiratory Journal. 59, 6, 11 s., 2102406.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    New ecological niches and habitats for Chlorophyll d- containing cyanobacteria

    Behrendt, L., Chen, M., Larkum, A. W. D., Ralph, P. J., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, E. & Kühl, Michael, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  39. Udgivet

    Nitrogenase gene amplicons from global marine surface waters are dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A. F., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Steward, G. F., Hagström, Å. & Riemann, Lasse, 2011, I: P L o S One. 6, 4, s. e19223 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet
  41. Udgivet

    Nucleotide sequence of pOLA52: a conjugative IncX1 plasmid from Escherichia coli which enables biofilm formation and multidrug efflux

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, She, Q. & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: Plasmid. 60, 1, s. 59-74 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Nutrient Fortification of Human Donor Milk Affects Intestinal Function and Protein Metabolism in Preterm Pigs

    Sun, Jing, Li, Yanqi, Nguyen, Duc Ninh, Mortensen, M. S., van den Akker, C. H. P., Skeath, T., Pors, S. E., Pankratova, Stanislava, Rudloff, S., Sørensen, Søren Johannes, Burrin, D. G., Thymann, Thomas & Sangild, Per Torp, 2018, I: Journal of Nutrition. 148, 3, s. 336-347 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Oropharyngeal Microbiota Clusters in Children with Asthma or Wheeze Associate with Allergy, Blood Transcriptomic Immune Pathways, and Exacerbation Risk

    U-BIOPRED Study Group, U. S. G., 2023, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 208, 2, s. 142-154 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Permissiveness of soil microbial communities toward receipt of mobile genetic elements

    Musovic, S., Klümper, U., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2012.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  45. Udgivet

    Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  46. Udgivet

    Persistence and progression of staphylococcal infection in the presence of public goods

    Trivedi, Urvish, Fell, C., Madsen, Jonas Stenløkke, Everett, J., Burmølle, Mette, Rumbaugh, K. P. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: npj Biofilms and Microbiomes. 6, 5 s., 55.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Pharmacokinetics of Locally Applied Antibiotic Prophylaxis for Implant-Based Breast Reconstruction

    Hemmingsen, Mathilde Nejrup, Bennedsen, A. K., Kullab, R. B., Norlin, C. B., Ørholt, M., Larsen, A., Bue, M., Lichtenberg, Mads, Hertz, Frederik Boëtius, Damsgaard, T. E., Vester-Glowinski, Peter Viktor, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas & Herly, Mikkel, 2023, I: JAMA network open. 6, 12, 11 s., E2348414.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Phenotypic variability in bioprocessing conditions can be tracked on the basis of on-line flow cytometry and fits to a scaling law

    Baert, J., Kinet, R., Brognaux, A., Delepierre, A., Telek, S., Sørensen, Søren Johannes, Riber, Leise, Fickers, P. & Delvigne, F., 2015, I: Biotechnology Journal. 10, 8, s. 1316-1325 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Physiological heterogeneities in microbial populations and implications for physical stress tolerance

    Carlqvist, M., Lencastre Fernandes, R., Helmark, S., Heins, A., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Gernaey, K. & Eliasson Lantz, A., 2012, I: Microbial Cell Factories. 11, 94, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Plasmid Encoded Multidrug Efflux Pump Conferring Resistance to Olaquindox in Escherichia coli

    Hansen, Lars Hestbjerg, Johannesen, E., Burmølle, Mette, Sørensen, A. H. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 48, 9, s. 3332-3337

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269