Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- 2016
- Udgivet
Exploring the complex response to linuron of bacterial communities from biopurification systems by means of cultivation-independent methods
Dealtry, S., Nour, E. H., Holmsgaard, P. N., Ding, G. C., Weichelt, V., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Springael, D. & Smalla, K., 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 2, 12 s., fiv157.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High frequencies of antibiotic resistance genes in infants' meconium and early fecal samples
Gosalbes, M. J., Vallès, Y., Jiménez-Hernández, N., Balle, C., Riva, P., Miravet-Verde, S., de Vries, Lisbeth Elvira, Llop, S., Agersø, Y., Sørensen, Søren Johannes, Ballester, F. & Francino, M. P., 2016, I: Journal of Developmental Origins of Health and Disease. 7, 01, s. 35-44 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecological patterns, diversity and core taxa of microbial communities in groundwater-fed rapid gravity filters
Gülay, A., Musovic, S., Albrechtsen, H., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2016, I: The ISME Journal. 10, 9, s. 2209-2222 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome sequences of two Kocuria isolates, K. salsicia G1 and K. rhizophila G2, isolated from a slaughterhouse in Denmark
Herschend, J., Raghupathi, P. K., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 2 s., e00075-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence of Arthrobacter antarcticus strain W2, isolated from a slaughterhouse
Herschend, J., Raghupathi, P. K., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 2 s., e00073-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence of Kocuria palustris strain W4
Herschend, J., Raghupathi, P. K., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 1 s., e00074-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomes provide valuable comparative information on soil microeukaryotes
Jacquiod, S. J. A., Stenbæk, J., Santos, S. S., Winding, A., Sørensen, Søren Johannes & Priemé, Anders, 2016, I: Research in Microbiology. 167, 5, s. 436-450 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmid metagenomics reveals multiple antibiotic resistance gene classes among the gut microbiomes of hospitalised patients
Jitwasinkul, T., Suriyaphol, P., Tangphatsornruang, S., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Permpikul, C., Rongrungruang, Y. & Tribuddharat, C., 2016, I: Journal of Global Antimicrobial Resistance. 6, s. 57-66 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interspecific bacterial interactions are reflected in multispecies biofilm spatial organization
Liu, W., Røder, Henriette Lyng, Madsen, Jonas Stenløkke, Bjarnsholt, Thomas, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 8 s., 1366.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diverse gene functions in a soil mobilome
Luo, W., Xu, Z., Riber, Leise, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Soil Biology & Biochemistry. 101, s. 175-183 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic and exoproteomic analyses of cold- and alkaline-adapted bacteria reveal an abundance of secreted subtilisin-like proteases
Lylloff, J. E., Hansen, L. B. S., Jepsen, M., Sanggaard, K. W., Vester, J. K., Enghild, J. J., Sørensen, Søren Johannes, Stougaard, P. & Glaring, M. A., 2016, I: Microbial Biotechnology. 9, 2, s. 245-256 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coexistence facilitates interspecific biofilm formation in complex microbial communities
Madsen, Jonas Stenløkke, Røder, Henriette Lyng, Russel, J., Sørensen, Helle, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 8, s. 2565–2574Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Type 3 fimbriae encoded on plasmids are expressed from a unique promoter without affecting host motility, facilitating an exceptional phenotype that enhances conjugal plasmid transfer
Madsen, Jonas Stenløkke, Riber, Leise, Kot, Witold, Basfeld, A., Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: P L o S One. 11, 9, 19 s., e0162390.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The developing hypopharyngeal microbiota in early life
Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Roggenbuck, M., Abu Al-Soud, W., Balle, C., Krogfelt, K. A., Stokholm, Jakob, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Waage, J. E., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Microbiome. 4, 12 s., 70.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Back to the future of soil metagenomics
Nesme, J., Achouak, W., Agathos, S. N., Bailey, M., Baldrian, P., Brunel, D., Frostegard, A., Heulin, T., Jansson, J. K., Jurkevitch, E., Kruus, K. L., Kowalchuk, G. A., Lagares, A., Lappin-Scott, H. M., Lemanceau, P., Le Paslier, D., Mandic-Mulec, I., Murrell, J. C., Myrold, D. D., Nalin, R. & 28 flere, , 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 5 s., 73.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coping with copper: legacy effect of copper on potential activity of soil bacteria following a century of exposure
Nunes, I. M., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Holm, Peter Engelund, Johansen, A., Brandt, Kristian Koefoed, Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 11, 12 s., fiw175.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial communities in termite fungus combs are comprised of consistent gut deposits and contributions from the environment
Otani, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Poulsen, Michael, 2016, I: Microbial Ecology. 71, 1, s. 207-220 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft genome assembly of two Pseudoclavibacter helvolus strains, G8 and W3, isolated from slaughterhouse environments
Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 1 s., e00077-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence of Kocuria varians G6 ssolated from a slaughterhouse in Denmark
Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 2 s., e00076-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome sequence of Psychrobacter cibarius strain W1
Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 3, 1 s., e00078-16.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enhanced plasmid loss in bacterial populations exposed to the antimicrobial compound irgasan delivered from interpenetrating polymer network silicone hydrogels
Riber, Leise, Burmølle, Mette, Alm, M., Milani, S. M., Thomsen, P., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Plasmid. 87-88, s. 72-78 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Natural decay process affects the abundance and community structure of Bacteria and Archaea in Picea abies logs
Rinta-Kanto, J. M., Sinkko, H., Rajala, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Tamminen, M. V. & Timonen, S., 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 7, 10 s., fiw087.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Vitamin D and allergic airway disease shape the murine lung microbiome in a sex-specific manner
Roggenbuck, M., Anderson, D., Barfod, K. K., Feelisch, M., Geldenhuys, S., Sørensen, Søren Johannes, Weeden, C. E., Hart, P. H. & Gorman, S., 2016, I: Respiratory Research. 17, 18 s., 116.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Studying bacterial multispecies biofilms: where to start?
Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Trends in Microbiology. 24, 6, s. 503-513 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large-scale benchmarking reveals false discoveries and count transformation sensitivity in 16S rRNA gene amplicon data analysis methods used in microbiome studies
Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Brejnrod, A. D., Mortensen, M. S., Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H. & Waage, J. E., 2016, I: Microbiome. 4, 14 s., 62.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4269
Flest downloads
-
5143
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3030
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2839
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet