Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor

ORCID: 0000-0001-6227-9906

Udgivelsesår:
Alle
101 - 200 ud af 412Pr. side: 100
Sortering: 1. forfatter
  1. Udgivet

    Exploring the immediate and long-term impact on bacterial communities in soil amended with animal and urban organic waste fertilizers using pyrosequencing and screening for horizontal transfer of antibiotic resistance

    Riber, Leise, Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. B. S., Bergmark, L., Brejnrod, A. D., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 206-224 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    High prevalence of biofilm synergy among bacterial soil isolates in cocultures indicates bacterial interspecific cooperation

    Ren, D., Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 11 jan. 2015, I: ISME Journal. 9, s. 81-89 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    High-throughput screening of multispecies biofilm formation and quantitative PCR-based assessment of individual species proportions, useful for exploring interspecific bacterial interactions

    Ren, D., Madsen, Jonas Stenløkke, de la Cruz Perera, C. I., Bergmark, L., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2014, I: Microbial Ecology. 68, 1, s. 146-154 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Ecological succession in the vaginal microbiota during pregnancy and birth

    Rasmussen, Morten Arendt, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Dominguez-Bello, M. G., Blaser, M. J., Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Shah, S. A., Hjelmsø, M. H., Lehtimäki, J., Trivedi, Urvish, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2020, I: The ISME Journal. 14, 9, s. 2325-2335 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    The effect of longterm exposure to mercury on the bacterial community in marine sediment

    Rasmussen, L. D. & Sørensen, Søren Johannes, 1998, I: Current Microbiology. 36, s. 291-297

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  6. Udgivet

    Effects of mercury contimanation on the culturable heterotrophic, functional and genetic diversity of the bacterial community in soil

    Rasmussen, L. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: FEMS Microbiology Ecology. 36, s. 1-9

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Application of a mer-lux biosensor for estimating bioavailable mercury in soil

    Rasmussen, L. D., Sørensen, Søren Johannes, Turner, R. R. & Barkay, T., 2000, I: Soil Biology & Biochemistry. 32, 5, s. 639-646

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Group-specific PCR primers to amplify 24S α-subunit rRNA genes from Kinetoplastida (Protozoa) used in denaturing gradient gel electrophoresis

    Rasmussen, L. D., Ekelund, Flemming, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Johnsen, K., 2001, I: Microbial Ecology. 42, 2, s. 109-115

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Cultivation of hard-to-culture subsurface mercury-resistant bacteria and discovery of new merA gene sequences

    Rasmussen, L. D., Zawadsky, C., Binnerup, S. J., Øregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 12, s. 3795-803 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Synergistic Interactions within a Multispecies Biofilm Enhance Individual Species Protection against Grazing by a Pelagic Protozoan

    Raghupathi, P. K., Liu, W., Sabbe, K., Houf, K., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2649.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Microbial diversity and putative opportunistic pathogens in dishwasher biofilm communities

    Raghupathi, P. K., Zupančič, J., Brejnrod, A. D., Jacquiod, S. J. A., Houf, K., Burmølle, Mette, Gunde-Cimerman, N. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 5, 17 s., e02755-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Genome sequence of Psychrobacter cibarius strain W1

    Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 3, 1 s., e00078-16.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Genome sequence of Kocuria varians G6 ssolated from a slaughterhouse in Denmark

    Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 2 s., e00076-16.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Draft genome assembly of two Pseudoclavibacter helvolus strains, G8 and W3, isolated from slaughterhouse environments

    Raghupathi, P. K., Herschend, J., Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Genome Announcements. 4, 2, 1 s., e00077-16.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Adaptation and heterogeneity of Escherichia coli MC1000 growing in complex environments

    Puentes-Téllez, P., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 3, s. 1008-1017 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Insight from the draft genome of Dietzia cinnamea P4 reveals mechanisms of survival in complex tropical soil habitats and biotechnology potential

    Procópio, L., Alvarez, V. M., Jurelevicius, D. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Cardoso, J. S., Pádula, M., Leitao, Á. C., Seldin, L. & van Elsas, J. D., 2012, I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology. 101, 2, s. 289-302 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Effects of fertilization with urban and agricultural organic wastes in a field trial – Prokaryotic diversity investigated by pyrosequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Bergmark, L., Magid, Jakob, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Soil Biology & Biochemistry. 57, s. 784-893 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  19. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  20. Udgivet

    Biosensors to Monitor Soil Health or Toxicity

    Poulsen, P. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Modern Soil Microbiology. van Elsas, J. D., Jansson, J. K. & Trevors, J. T. (red.). 2nd udg. Boca Raton, FL: CRC Press, s. 435-454

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

  21. Udgivet

    Fluorescence recovery allows theimplementation of a fluorescence reporter gene platform applicable for the detection and quantification of horizontal gene transfer in anoxic environments

    Pinilla Redondo, Rafael, Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 6, 9 s., e02507-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Discovery of multiple anti-CRISPRs highlights anti-defense gene clustering in mobile genetic elements

    Pinilla Redondo, Rafael, Shehreen, S., Marino, N. D., Fagerlund, R. D., Brown, C. M., Sørensen, Søren Johannes, Fineran, P. C. & Bondy-Denomy, J., 2020, I: Nature Communications. 11, 11 s., 5652.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids

    Pinilla Redondo, Rafael, Russel, J., Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A., Garrett, Roger Antony, Nesme, Joseph, Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 8, s. 4315-4328

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Type IV CRISPR-Cas systems are highly diverse and involved in competition between plasmids

    Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Garrett, Roger Antony, Randau, L., Sørensen, Søren Johannes & Shah, S. A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 4, s. 2000-2012 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Broad Dissemination of Plasmids across Groundwater-Fed Rapid Sand Filter Microbiomes

    Pinilla Redondo, Rafael, Olesen, Asmus Kalckar, Russel, J., de Vries, L. E., Christensen, L. D., Musovic, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: mBio. 12, 6, 13 s., e0306821.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Monitoring plasmid-mediated horizontal gene transfer in microbiomes: recent advances and future perspectives

    Pinilla Redondo, Rafael, Cyriaque, V., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, 2018, I: Plasmid. 99, s. 56-67

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Sequentially aerated membrane biofilm reactors for autotrophic nitrogen removal: microbial community composition and dynamics

    Pellicer i Nàcher, C., Franck, S., Gülay, A., Ruscalleda, M., Terada, A., Abu Al-Soud, W., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2014, I: Microbial Biotechnology. 7, 1, s. 32-43 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Genome sequences of two Leuconostoc pseudomesenteroides strains isolated from Danish dairy starter cultures

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, s. 2 e00484-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Effect of long-term organic and mineral fertilization strategies on rhizosphere microbiota assemblage and performance of lettuce

    Paul Chowdhury, S., Babin, D., Sandmann, M., Jacquiod, S., Sommermann, L., Sørensen, Søren Johannes, Fliessbach, A., Mäder, P., Geistlinger, J., Smalla, K., Rothballer, M. & Grosch, R., 2019, I: Environmental Microbiology. 21, 7, s. 2426-2439

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Maize lines with different nitrogen use efficiency select bacterial communities with different β-glucosidase-encoding genes and glucosidase activity in the rhizosphere

    Pathan, S. I., Ceccherini, M. T., Hansen, M. A., Giagnoni, L., Ascher, J., Arenella, M., Sørensen, Søren Johannes, Pietramellara, G., Nannipieri, P. & Renella, G., 2015, I: Biology and Fertility of Soils. 51, 8, s. 995-1004 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Identifying the core microbial community in the gut of fungus-growing termites

    Otani, S., Mikaelyan, A., Nobre, T., Hansen, Lars Hestbjerg, Koné, N. A., Sørensen, Søren Johannes, Aanen, D. K., Boomsma, Jacobus J., Brune, A. & Poulsen, Michael, 2014, I: Molecular Ecology. 23, 18, s. 4631–4644 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Bacterial communities in termite fungus combs are comprised of consistent gut deposits and contributions from the environment

    Otani, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Poulsen, Michael, 2016, I: Microbial Ecology. 71, 1, s. 207-220 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Priority of Early Colonizers but No Effect on Cohabitants in a Synergistic Biofilm Community

    Olsen, N. M. C., Røder, Henriette Lyng, Russel, J., Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 8 s., 1949.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    IncHI1A plasmids potentially facilitate horizontal flow of antibiotic resistance genes to pathogens in microbial communities of urban residential sewage

    Olesen, Asmus Kalckar, Pinilla Redondo, Rafael, Hansen, Mads Frederik, Russel, J., Dechesne, A., Smets, B. F., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Molecular Ecology. 31, 5, s. 1595-1608

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Importance of substrate quality and clay content on microbial extracellular polymeric substances production and aggregate stability in soils

    Olagoke, F. K., Bettermann, A., Nguyen, P. T. B., Redmile-Gordon, M., Babin, D., Smalla, K., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Kalbitz, K. & Vogel, C., 2022, I: Biology and Fertility of Soils. 58, 4, s. 435-457 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Soil bacteria show different tolerance ranges to an unprecedented disturbance

    Nunes, I. M., Jurburg, S., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Falcão Salles, J., Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, feb. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 2, s. 189–202 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Coping with copper: legacy effect of copper on potential activity of soil bacteria following a century of exposure

    Nunes, I. M., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Holm, Peter Engelund, Johansen, A., Brandt, Kristian Koefoed, Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 11, 12 s., fiw175.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    A flow cytometry-optimized assay using an SOS-green fluorescent protein (SOS-GFP) whole-cell biosensor for the detection of genotoxins in complex environments

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Mutation Research - Reviews. 603, 2, s. 164-172 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Construction of a ColD cda Promoter-Based SOS-Green Fluorescent Protein Whole-Cell Biosensor with Higher Sensitivity toward Genotoxic Compounds than Constructs Based on recA, umuDC, or sulA Promoters

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: Applied and Environmental Microbiology. 71, 5, s. 2338-2346

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    An improved method for including upper size range plasmids in metamobilomes

    Norman, A., Riber, Leise, Luo, W., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, 12 s., e104405.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Metamobilomics - Expanding the environmental mobilome with high throughput sequencing

    Norman, A., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  43. Udgivet

    Nucleotide sequence of pOLA52: a conjugative IncX1 plasmid from Escherichia coli which enables biofilm formation and multidrug efflux

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, She, Q. & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: Plasmid. 60, 1, s. 59-74 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Conjugative plasmids: Vessels of the communal gene pool

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 364, 1527, s. 2275-2289 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

    Nielsen, H. B., Almeida, M., Juncker, A., Rasmussen, S., Li, J., Sunagawa, S., Plichta, D. R., Gautier, L., Pedersen, A. G., Le Chatelier, E., Pelletier, E., Bonde, I., Nielsen, T., Manichanh, C., Arumugam, M., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Blom, N., Borruel, N., Burgdorf, K. S. & 31 flere, Boumezbeur, F., Casellas, F., Doré, J., Dworzynski, P., Guarner, F., Hansen, Torben, Hildebrand, F., Kaas, R. S., Kennedy, S., Kristiansen, Karsten, Kultima, J. R., Léonard, P., Levenez, F., Lund, O., Moumen, B., Le Paslier, D., Pons, N., Pedersen, Oluf Borbye, Prifti, E., Qin, J., Raes, J., Sørensen, Søren Johannes, Tap, J., Tims, S., Ussery, D., Yamada, T., Renault, P., Sicheritz-Pontén, T., Bork, P., Wang, J. & MetaHIT Consortium, M. C., 2014, I: Nature Biotechnology. 32, 8, s. 822–828 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    The gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Nielsen, Dennis Sandris, Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van den Berg, F. W. J., Andreasen, A. S., Pedersen, B. K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  47. Udgivet

    Intra- and inter-field diversity of 2,4-dichlorophenoxyacetic acid-degradative plasmids and their tfd catabolic genes in rice fields of the Mekong delta in Vietnam

    Nguyen, T. P. O., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Horemans, B., Sørensen, Søren Johannes, De Mot, R. & Springael, D., 2019, I: FEMS Microbiology Ecology. 95, 1, s. 1-11 fiy214.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Back to the future of soil metagenomics

    Nesme, J., Achouak, W., Agathos, S. N., Bailey, M., Baldrian, P., Brunel, D., Frostegard, A., Heulin, T., Jansson, J. K., Jurkevitch, E., Kruus, K. L., Kowalchuk, G. A., Lagares, A., Lappin-Scott, H. M., Lemanceau, P., Le Paslier, D., Mandic-Mulec, I., Murrell, J. C., Myrold, D. D., Nalin, R. & 28 flere, Nannipieri, P., Neufeld, J. D., O'Gara, F., Parnell, J. J., Puehler, A., Pylro, V., Ramos, J. L., Roesch, L. F. W., Schloter, M., Schleper, C., Sczyrba, A., Sessitsch, A., Sjoeling, S., Sørensen, Jan, Sørensen, Søren Johannes, Tebbe, C. C., Topp, E., Tsiamis, G., van Elsas, J. D., van Keulen, G., Widmer, F., Wagner, M., Zhang, T., Zhang, X., Zhao, L., Zhu, Y., Vogel, T. M. & Simonet, P., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 5 s., 73.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Draft Genome Sequence of the Soil Bacterium Burkholderia terrae Strain BS001, Which Interacts with Fungal Surface Structures

    Nazir, R., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Journal of Bacteriology. 194, 16, s. 4480-4481 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Shifts in the microbial community structure explain the response of soil respiration to land-use change but not to climate warming

    Nazaries, L., Tottey, W., Robinson, L., Khachane, A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Singh, B. K., 2015, I: Soil Biology & Biochemistry. 89, s. 123-134 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  51. Udgivet

    Community-intrinsic properties enhance keratin degradation from bacterial consortia

    Nasipuri, P., Herschend, J., Brejnrod, A. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Espersen, R., Svensson, B., Burmølle, Mette, Jacquiod, S. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: PLoS ONE. 15, 1, 26 s., e0228108.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. Udgivet

    Host-specific microbial communities in three sympatric North Sea sponges

    Naim, M. A., Morillo, J. A., Sørensen, Søren Johannes, Abu Al-Soud, W., Smidt, H. & Sipkema, D., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 2, s. 390-403 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  53. Udgivet

    Adaptation of the bacterial community to heavy metal contamination

    Müller, A. K., Rasmussen, L. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: FEMS Microbiology Letters. 205, s. 49-53

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  54. Udgivet

    The Effect of Long Term Mercury Pollution on the Soil Microbial Community

    Müller, A. K., Westergaard, K., Christensen, Søren & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: FEMS Microbiology Ecology. 36, 1, s. 11-19

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    The diversity, structure and function of soil microbial communities exposed to different disturbances

    Müller, A. K., Westergaard, K., Christensen, S. & Sørensen, Søren Johannes, 2002, I: Microbial Ecology. 44, s. 49-58

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  56. Udgivet

    Mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

    Møller, A. K., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Boyd, E. S. & Kroer, Niels, 2014, I: FEMS Microbiology Ecology. 87, 1, s. 52-63 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    Bacterial community structure in High-Arctic snow and freshwater as revealed by pyrosequencing of 16S rRNA genes and cultivation

    Møller, A. K., Søborg, D. A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2013, I: Polar Research. 32, 11 s., 17390.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    Diversity and characterization of mercury-resistant bacteria in snow, freshwater and sea-ice brine from the High Arctic

    Møller, A., Barkay, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Skov, H. & Kroer, Niels, 1 mar. 2011, I: F E M S Microbiology Ecology. 75, 3, s. 390-401 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    Cultivation-independent examination of horizontal transfer and host range of an IncP-1 plasmid among gram-positive and gram-negative bacteria indigenous to the barley rhizosphere

    Musovic, S., Oregaard, G., Kroer, Niels & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Applied and Environmental Microbiology. 72, 10, s. 6687-6692 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    Permissiveness of soil microbial communities toward receipt of mobile genetic elements

    Musovic, S., Klümper, U., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  61. Udgivet

    Investigation of the bacteriophage community in induced lysates of undefined mesophilic mixed-strain DL-cultures using classical and metagenomic approaches

    Muhammed, Musemma Kedir, Olsen, M. L., Kot, Witold, Neve, H., Castro Mejia, J. L., Janzen, T., Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2018, I: International Journal of Food Microbiology. 272, s. 61-72 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  62. Udgivet

    Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures

    Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, Lukasz, Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, Finn Kvist, 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  63. Udgivet

    Stability and resilience of the intestinal microbiota in children in daycare - a 12 month cohort study

    Mortensen, M. S., Jensen, Betina Hebbelstrup, Williams, J., Brejnrod, A. D., Andersen, L. O., Röser, D., Andreassen, B. U., Petersen, Andreas Munk, Stensvold, C. R., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2018, I: BMC Microbiology. 18, 11 s., 223.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    The developing hypopharyngeal microbiota in early life

    Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Roggenbuck, M., Abu Al-Soud, W., Balle, C., Krogfelt, K. A., Stokholm, Jakob, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Waage, J. E., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Microbiome. 4, 12 s., 70.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  65. Udgivet

    Modeling transfer of vaginal microbiota from mother to infant in early life

    Mortensen, M. S., Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Balle, C., Thorsen, J., Krogfelt, K. A., Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: eLife. 10, 19 s., e57051.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  66. Udgivet

    Epigenetic landscape links upper airway microbiota in infancy with allergic rhinitis at 6 years of age

    Morin, A., McKennan, C. G., Pedersen, C. T., Stokholm, Jakob, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Schoos, A. M., Naughton, K. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Mortensen, M. S., Vercelli, D., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H., Nicolae, D. L., Bønnelykke, Klaus & Ober, C., 2020, I: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 146, 6, s. 1358-1366

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  67. Udgivet

    Plasmid permissiveness of wastewater microbiomes can be predicted from 16S rRNA sequences by machine learning

    Moradigaravand, D., Li, L., Dechesne, A., Nesme, Joseph, de la Cruz, R., Ahmad, H., Banzhaf, M., Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F. & Kreft, J. U., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 7, 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  68. Udgivet

    Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges

    Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. & 83 flere, Darling, A. E., Egan, R., Eskin, E., Georganas, E., Goltsman, E., Gray, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Hofmeyr, S., Huang, P., Irber, L., Jia, H., Jørgensen, T. S., Kieser, S. D., Klemetsen, T., Kola, A., Kolmogorov, M., Korobeynikov, A., Kwan, J., LaPierre, N., Lemaitre, C., Li, C., Limasset, A., Malcher-Miranda, F., Mangul, S., Marcelino, V. R., Marchet, C., Marijon, P., Meleshko, D., Mende, D. R., Milanese, A., Nagarajan, N., Nissen, Jakob Nybo, Nurk, S., Oliker, L., Paoli, L., Peterlongo, P., Piro, V. C., Porter, J. S., Rasmussen, Simon, Rees, E. R., Reinert, K., Renard, B., Robertsen, E. M., Rosen, G. L., Ruscheweyh, H. J., Sarwal, V., Segata, N., Seiler, E., Shi, L., Sun, F., Sunagawa, S., Sørensen, Søren Johannes, Thomas, A., Tong, C., Trajkovski, M., Tremblay, J., Uritskiy, G., Vicedomini, R., Wang, Z., Wang, Z., Wang, Z., Warren, A., Willassen, N. P., Yelick, K., You, R., Zeller, G., Zhao, Z., Zhu, S., Zhu, J., Garrido-Oter, R., Gastmeier, P., Hacquard, S., Häußler, S., Khaledi, A., Maechler, F., Mesny, F., Radutoiu, S., Schulze-Lefert, P., Smit, N., Strowig, T., Bremges, A., Sczyrba, A. & McHardy, A. C., 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 429-440

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  69. Udgivet

    Characterization of bacterial populations in Danish raw milk cheeses made with different starter cultures by denaturating gradient gel electrophoresis and pyrosequencing

    Masoud, W. M. H., Takamiya, M. K. W., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2011, I: International Dairy Journal. 21, 3, s. 142-148 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  70. Udgivet

    The fate of indigenous microbiota, starter cultures, Escherichia coli, Listeria innocua and Staphylococcus aureus in Danish raw milk and cheeses determined by pyrosequencing and quantitative real time (qRT)-PCR

    Masoud, W. M. H., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 153, 1-2, s. 192-202 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  71. Udgivet

    Influence of sewage sludge stabilization method on microbial community and the abundance of antibiotic resistance genes

    Major, N., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Goreta Ban, S., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D., Grosch, R., Schikora, A. & Schierstaedt, J., 2022, I: Waste Management. 154, s. 126-135 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  72. Udgivet

    Composted sewage sludge influences the microbiome and persistence of human pathogens in soil

    Major, N., Schierstaedt, J., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Ban, S. G., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D. & Schikora, A., 2020, I: Microorganisms. 8, 7, 14 s., 1020.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  73. Udgivet

    Investigation of the relationship between lactococcal host cell wall polysaccharide genotype and 936 phage receptor binding protein phylogeny

    Mahony, J., Kot, Witold, Murphy, J., Ainsworth, S., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes, Hammer, K., Cambillau, C., Vogensen, Finn Kvist & Sinderen, D. V., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 14, s. 4385-4392 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  74. Udgivet

    Facultative control of matrix production optimizes competitive fitness in Pseudomonas aeruginosa PA14 biofilm models

    Madsen, Jonas Stenløkke, Lin, Y. C., Squyres, G. R., Price-Whelan, A., Torio, A. D. S., Song, A., Cornell, W. C., Sørensen, Søren Johannes, Xavier, J. B. & Dietrich, L. E. P., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 24, s. 8414-8426 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  75. Udgivet

    A spatiotemporal view of plasmid loss in biofilms and planktonic cultures: [plus] Erratum

    Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Biotechnology and Bioengineering (Print). 110, 12, s. 3071-3074 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  76. Udgivet

    An intriguing relationship between the cyclic diguanylate signaling system and horizontal gene transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Hylling, Ole, Jacquiod, S. J. A., Pécastaings, S., Hansen, L. H., Riber, Leise, Vestergaard, G. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: ISME Journal. 12, 9, s. 2330-2334 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  77. Udgivet

    Coexistence facilitates interspecific biofilm formation in complex microbial communities

    Madsen, Jonas Stenløkke, Røder, Henriette Lyng, Russel, J., Sørensen, Helle, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 8, s. 2565–2574

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  78. Udgivet

    When it makes sense to socialize whilst being on the move: A small EAL-domain containing protein, encoded on natural biofilm-promoting plasmids, triggers motility

    Madsen, Jonas Stenløkke, Riber, Leise, Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  79. Udgivet

    Bacterial social interactions and the emergence of community-intrinsic properties

    Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2018, I: Current Opinion in Microbiology. 42, s. 104-109 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 183-195 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    Type 3 fimbriae encoded on plasmids are expressed from a unique promoter without affecting host motility, facilitating an exceptional phenotype that enhances conjugal plasmid transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Riber, Leise, Kot, Witold, Basfeld, A., Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: P L o S One. 11, 9, 19 s., e0162390.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  82. Udgivet

    Characterization of pIC13_78, a biofilm enabling plasmid

    Madsen, Jonas Stenløkke, Norman, A., Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  83. Udgivet

    Horizontal Gene Transfer of an IncP1 Plasmid to Soil Bacterial Community Introduced by Escherichia coli through Manure Amendment in Soil Microcosms

    Macedo, G., Olesen, Asmus Kalckar, Maccario, Lorrie, Leal, L. H., v. d. Maas, P., Heederik, D., Mevius, D., Sørensen, Søren Johannes & Schmitt, H., 2022, I: Environmental Science & Technology. 56, 16, s. 11398-11408 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  84. Udgivet

    Identifying qualitative effects of different grazing types on below-ground communities and function in a long-term field experiment

    Macdonald, C. A., Crawley, M. J., Wright, D. J., Kuczynski, J., Robinson, L., Knight, R., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Deng, Y., Zhou, J. & Singh, B. K., 2015, I: Environmental Microbiology. 17, 3, s. 841-854 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  85. Udgivet

    Draft genomes of seven isolates from Danish wastewater facilities belonging to Pseudomonas, Bacillus, Pseudochrobactrum, Brevundimonas, and Pandoraea

    Maccario, Lorrie, Silva, A. F., Nesme, Joseph, Amador Hierro, Cristina Isabel, Sørensen, Søren Johannes, Cooper, V. S. & Røder, Henriette Lyng, 2023, I: Microbiology resource announcements. 12, 12, 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  86. Udgivet

    Genomic and exoproteomic analyses of cold- and alkaline-adapted bacteria reveal an abundance of secreted subtilisin-like proteases

    Lylloff, J. E., Hansen, L. B. S., Jepsen, M., Sanggaard, K. W., Vester, J. K., Enghild, J. J., Sørensen, Søren Johannes, Stougaard, P. & Glaring, M. A., 2016, I: Microbial Biotechnology. 9, 2, s. 245-256 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  87. Udgivet

    Draft genome sequences of two protease-producing strains of Arsukibacterium, isolated from two cold and alkaline environments

    Lylloff, J. E., Hansen, L. B. S., Jepsen, M., Hallin, P. F., Sørensen, Søren Johannes, Stougaard, P. & Glaring, M. A., 2015, I: Genome Announcements. 3, 3, 2 s., e00585-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  88. Udgivet

    Diverse gene functions in a soil mobilome

    Luo, W., Xu, Z., Riber, Leise, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Soil Biology & Biochemistry. 101, s. 175-183 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  89. Udgivet

    Draft genome sequence of Burkholderia sordidicola S170, a potential plant growth promoter isolated from coniferous forest soil in the Czech Republic

    Lladó, S., Xu, Z., Sørensen, Søren Johannes & Baldrian, P., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00810-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  90. Udgivet

    Low-abundant species facilitates specific spatial organization that promotes multispecies biofilm formation

    Liu, W., Russel, J., Røder, Henriette Lyng, Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2017, I: Environmental Microbiology. 19, 7, s. 2893-2905 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  91. Udgivet

    Deciphering links between bacterial interactions and spatial organization in multispecies biofilms

    Liu, W., Jacquiod, S., Brejnrod, A., Russel, J., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2019, I: ISME Journal. 13, 12, s. 3054-3066 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  92. Udgivet

    Micro-scale intermixing: a requisite for stable and synergistic co-establishment in a four-species biofilm

    Liu, W., Russel, J., Burmølle, Mette, Sørensen, Søren Johannes & Madsen, Jonas Stenløkke, 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 1940-1951 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  93. Udgivet

    Interspecific bacterial interactions are reflected in multispecies biofilm spatial organization

    Liu, W., Røder, Henriette Lyng, Madsen, Jonas Stenløkke, Bjarnsholt, Thomas, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 8 s., 1366.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  94. Udgivet

    Impact of dna extraction method on bacterial community composition measured by denaturing gradient gel electrophoresis

    Lipthay, J. R. D., Enzinger, C., Johnsen, K., Aamand, J. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Soil Biology & Biochemistry. 36, s. 1607-1614

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  95. Udgivet

    Enhanced degradation of phenoxyacetic acid in soil by horizontal transfer of the tfdA gene encoding a 2,4-dichlorophenoxyacetic acid dioxygenase

    Lipthay, J. R. D., Barkay, T. & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: FEMS Microbiology Ecology. 35, s. 75-84

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  96. Udgivet

    Bacterial symbiont sharing in Megalomyrmex social parasites and their fungus-growing ant hosts

    Liberti, J., Sapountzis, P., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Adams, R. M. M. & Boomsma, Jacobus J., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 12, s. 3151-3169 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  97. Udgivet

    The infant gut resistome associates with E. coli, environmental exposures, gut microbiome maturity, and asthma-associated bacterial composition

    Li, Xuan Ji, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A., Vestergaard, G. A., Russel, J., Trivedi, Urvish, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Gupta, S., Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Cell Host & Microbe. 29, 6, s. 975–987.e4 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  98. Udgivet

    Differential responses of the gut microbiome and resistome to antibiotic exposures in infants and adults

    Li, Xuan Ji, Brejnrod, A., Thorsen, J., Zachariasen, Trine, Trivedi, Urvish, Russel, J., Vestergaard, G. A., Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt & Sørensen, Søren Johannes, 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 16 s., 8526.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  99. Udgivet

    Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

    Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  100. Udgivet

    Co-localization of antibiotic resistance genes is widespread in the infant gut microbiome and associates with an immature gut microbial composition

    Li, Xuan Ji, Brejnrod, A., Trivedi, Urvish, Russel, J., Thorsen, J., Shah, S. A., Vestergaard, G. A., Rasmussen, Morten Arendt, Nesme, Joseph, Bisgaard, H., Stokholm, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Microbiome. 12, 1, 18 s., 87.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 Næste

ID: 4269