Jeppe Vinther

Jeppe Vinther

Lektor

ORCID: 0000-0002-3847-3853

Udgivelsesår:
Alle
1 - 39 ud af 39Pr. side: 50
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2024
  2. Udgivet

    Comment on “DpCoA tagSeq: Barcoding dpCoA-Capped RNA for Direct Nanopore Sequencing via Maleimide-Thiol Reaction”

    Vinther, Jeppe, 2024, I: Analytical Chemistry. 96, 1, s. 606-609 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    CRISPRi screen for enhancing heterologous alpha-amylase yield in Bacillus subtilis

    Geissler, Adrian Sven, Fehler, A. O., Poulsen, L. D., Gonzalez-Tortuero, E., Kallehauge, T. B., Alkan, F., Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, Rasmussen, M. D., Breuener, A., Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2023, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 50, 1, 16 s., kuac028.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Hepatitis C virus RNA is 5'-capped with flavin adenine dinucleotide

    Sherwood, A. V., Rivera-Rangel, L. R., Ryberg, L. A., Larsen, H. S., Anker, K. M., Costa, R., Vågbø, C. B., Jakljevič, E., Pham, L. V., Fernandez-Antunez, C., Indrisiunaite, G., Podolska-Charlery, A., Grothen, J. E. R., Langvad, N. W., Fossat, N., Offersgaard, A., Al-Chaer, A., Nielsen, L., Kuśnierczyk, A., Sølund, C. & 8 flere, Weis, Nina, Gottwein, Judith Margarete, Holmbeck, Kenn, Bottaro, S., Ramirez Almeida, Santseharay, Bukh, Jens, Scheel, Troels Kasper Høyer & Vinther, Jeppe, 2023, I: Nature. 619, s. 811-818

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. 2022
  7. Udgivet

    Flagella disruption in Bacillus subtilis increases amylase production yield

    Fehler, A. O., Kallehauge, T. B., Geissler, Adrian Sven, González-Tortuero, E., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan & Vinther, Jeppe, 2022, I: Microbial Cell Factories. 21, 11 s., 131.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    The impact of PrsA over-expression on the Bacillus subtilis transcriptome during fed-batch fermentation of alpha-amylase production

    Geissler, Adrian Sven, Poulsen, L. D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, González-Tortuero, E., Breüner, A., Jensen, Lars Juhl, Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 17 s., 909493.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. 2021
  10. Udgivet

    Bsgatlas: A unified bacillus subtilis genome and transcriptome annotation atlas with enhanced information access

    Geissler, Adrian Sven, Anthon, Christian, Alkan, F., González-Tortuero, E., Poulsen, L. D., Kallehauge, T. B., Breüner, A., Seemann, Ernst Stefan, Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2021, I: Microbial Genomics. 7, 2, 17 s., 000524.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Light-Dependent Translation Change of Arabidopsis psbA Correlates with RNA Structure Alterations at the Translation Initiation Region

    Gawroński, P., Enroth, Christel Hougård, Kindgren, P., Marquardt, Sebastian, Karpiński, S., Leister, D., Jensen, Poul Erik, Vinther, Jeppe & Scharff, L. B., 2021, I: Cells. 10, 2, 22 s., 322.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. 2020
  13. Udgivet

    No Evidence for N7-Methylation of Guanosine (m7G) in Human let-7e

    Vinther, Jeppe, 2020, I: Molecular Cell. 79, 2, s. 199-200 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  14. 2019
  15. Udgivet

    Detection of internal N7-methylguanosine (m7G) RNA modifications by mutational profiling sequencing

    Enroth, Christel Hougård, Poulsen, L. D., Iversen, S., Kirpekar, F., Albrechtsen, Anders & Vinther, Jeppe, 2019, I: Nucleic Acids Research. 47, 20, 13 s., e126.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Excess primer degradation by Exo I improves the preparation of 3' cDNA ligation-based sequencing libraries

    Enroth, Christel Hougård, Fehler, A. O., Poulsen, L. D. & Vinther, Jeppe, 2019, I: BioTechniques. 67, 3, s. 110-116

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. 2018
  18. Udgivet

    RNA-Seq for Bacterial Gene Expression

    Poulsen, L. D. & Vinther, Jeppe, 2018, I: Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. 73, 1, s. 1-12 e55.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. 2017
  20. Udgivet

    RNase H sequence preferences influence antisense oligonucleotide efficiency

    Kiełpiński, Ł. J., Hagedorn, P. H., Lindow, M. & Vinther, Jeppe, 15 dec. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 22, s. 12932-12944 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. 2016
  22. Udgivet

    Effect of chronic uremia on the transcriptional profile of the calcified aorta analyzed by RNA sequencing

    Rukov, J. L., Gravesen, Eva, Mace, M. L., Hofman-Bang, J., Vinther, Jeppe, Andersen, C. B., Lewin, E. & Ølgaard, Klaus, 2016, I: American Journal of Physiology: Renal Physiology. 310, 6, s. F477-F491 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. 2015
  24. Udgivet

    Dissecting the target specificity of RNase H recruiting oligonucleotides using massively parallel reporter analysis of short RNA motifs

    Rukov, J. L., Hagedorn, P. H., Høy, I. B., Feng, Y., Lindow, M. & Vinther, Jeppe, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8476-8487 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Reproducible analysis of sequencing-based RNA structure probing data with user-friendly tools

    Kielpinski, L. J., Sidiropoulos, N. & Vinther, Jeppe, 2015, Structures of large RNA molecules and their complexes. Woodson, S. A. & Allain, F. H. T. (red.). Elsevier, s. 153-180 28 s. (Methods in Enzymology, Bind 558).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    SHAPE selection (SHAPES) enrich for RNA structure signal in SHAPE sequencing-based probing data

    Poulsen, L. D., Kielpinski, L. J., Salama, S. R., Krogh, Anders & Vinther, Jeppe, 2015, I: R N A. 21, 5, s. 1042-1052 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. 2014
  28. Udgivet

    Massive parallel-sequencing-based hydroxyl radical probing of RNA accessibility

    Kielpinski, L. J. & Vinther, Jeppe, 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 8, 12 s., e70.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Pharmaco-miR: linking microRNAs and drug effects

    Rukov, J. L., Wilentzik, R., Jaffe, I., Vinther, Jeppe & Shomron, N., 2014, I: Briefings in Bioinformatics. 15, 4, s. 648-659 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. 2013
  31. Udgivet

    Body fluid identification of blood, saliva and semen using second generation sequencing of micro-RNA

    Petersen, C. H., Hjort, B. B., Tvedebrink, T., Kielpinski, L. J., Vinther, Jeppe & Morling, Niels, 2013, I: Forensic Science International: Genetics Supplement Series. 4, 1, s. e204-5 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Detection of reverse transcriptase termination sites using cDNA ligation and massive parallel sequencing

    Kielpinski, L. J., Boyd, M., Sandelin, Albin Gustav & Vinther, Jeppe, 2013, I: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1038, s. 213-31 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. 2012
  34. Udgivet

    MicroRNAs and Their Antagonists as Novel Therapeutics

    Vinther, Jeppe, Rukov, J. & Shomron, N., 2012, From Nucleic Acids Sequences to Molecular Medicine. Erdmann, V. A. & Barciszewski, J. (red.). Springer Publishing Company, s. 503-523 21 s. (RNA Technologies).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  35. 2011
  36. Udgivet

    Pharmacogenomics genes show varying perceptibility to microRNA regulation

    Rukov, J. L., Vinther, Jeppe & Shomron, N., 2011, I: Pharmacogenetics and Genomics. 21, 5, s. 251-62 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. 2010
  38. Udgivet

    The early noncoding region of human papillomavirus type 16 is regulated by cytoplasmic polyadenylation factors

    Glahder, J. H., Kristiansen, K., Durand, M., Vinther, Jeppe & Norrild, B., 2010, I: Virus Research. 149, 2, s. 217-223 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. 2009
  40. Udgivet

    Quantitative regulation of alternative splicing in evolution and development

    Irimia, M., Rukov, J. L., Roy, S. W., Vinther, Jeppe & Garcia-Fernandez, J., 2009, I: BioEssays. 31, 1, s. 40-50 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. 2008
  42. Udgivet

    Conserved CPEs in the p53 3' untranslated region influence mRNA stability and protein synthesis

    Rosenstierne, M. W., Vinther, Jeppe, Mittler, G., Larsen, L., Mann, M. & Norrild, B., 2008, I: Anticancer Research. 28, 5A, s. 2553-9 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Identification of let-7-regulated oncofetal genes.

    Boyerinas, B., Park, S., Shomron, N., Hedegaard, M. M., Vinther, Jeppe, Andersen, J. S., Feig, C., Xu, J., Burge, C. B. & Peter, M. E., 2008, I: Cancer Research. 68, 8, s. 2587-91 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Mutation of miRNA target sequences during human evolution.

    Gardner, P. P. & Vinther, Jeppe, 2008, I: Trends in Genetics. 24, 6, s. 262-5 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Origin of introns by 'intronization' of exonic sequences.

    Irimia, M., Rukov, J. L., Penny, D., Vinther, Jeppe, Garcia-Fernandez, J. & Roy, S. W., 2008, I: Trends in Genetics.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. 2007
  47. Udgivet

    High qualitative and quantitative conservation of alternative splicing in Caenorhabditis elegans and Caenorhabditis briggsae.

    Rukov, J. L., Irimia, M., Mørk, S., Lund, Viktor Karlovich, Vinther, Jeppe & Arctander, P., 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 24, 4, s. 909-17 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Use of tiling array data and RNA secondary structure predictions to identify noncoding RNA genes.

    Weile, C., Gardner, P. P., Hedegaard, M. M. & Vinther, Jeppe, 2007, I: BMC Genomics. 8, s. 244

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Widespread evolutionary conservation of alternatively spliced exons in caenorhabditis.

    Irimia, M., Rukov, J. L., Penny, D., Garcia-Fernandez, J., Vinther, Jeppe & Roy, S. W., 2007, I: Molecular Biology and Evolution. 25, 2, s. 375-82 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. 2006
  51. Udgivet

    Identification of miRNA targets with stable isotope labeling by amino acids in cell culture.

    Vinther, Jeppe, Hedegaard, M. M., Gardner, P. P., Andersen, J. S. & Arctander, P., 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 16, s. e107

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. 2005
  53. Udgivet

    The 3' region of human papillomavirus type 16 early mRNAs decrease expression

    Vinther, Jeppe, Rosenstierne, M. W., Kristiansen, K. & Norrild, B., 2005, I: BMC Infectious Diseases. 5, s. 83

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    The 3' region of human papillomavirus type 16 early nRNAs decrease expression

    Vinther, Jeppe, Rosenstierne, M., Kristiansen, K. & Norrild, B., 2005, I: BMC Infect. Dis.. 5, s. 83

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. 2003
  56. Udgivet

    A promoter within the E6 ORF of human papillomavirus type 16 contributes to the expression of the E7 oncoprotein from a monocistronic mRNA

    Glahder, J. H., Hansen, C. N., Vinther, Jeppe, Madsen, B. S. & Norrild, B., 2003, I: Journal of General Virology. 84, Pt 12, s. 3429-41 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    A putative promotor within the E6 ORF of human papillomavirus type 16 controls the expression of the E7 oncoprotein from a monocistronic mRNA

    Glahder, J., Hansen, C. N., Vinther, Jeppe, Madsen, B. S. & Norrild, B., 2003, I: Journal of General Virology. 84, s. 3429-3441

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    Clearance of cervical human papillomavirus infections

    Vinther, Jeppe & Norrild, B., 2003, I: International Journal of Cancer. 104, s. 255-256

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    Identification and characterisation of a cluster of transcription start sites in the E6 ORF of the Human Papillomavirus type 16

    Rosenstierne, M., Vinther, Jeppe, Hansen, C., Fenger-Grøn, M. & Norrild, B., 2003, I: J.Gen.Virol.. 84, s. 2909-2920

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    Identification and characterization of a cluster of transcription start sites located in the E6 ORF of human papillomavirus type 16

    Rosenstierne, M. W., Vinther, Jeppe, Hansen, C. N., Prydsoe, M. & Norrild, B., 2003, I: Journal of General Virology. 84, Pt 11, s. 2909-20 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ID: 10892