Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. Udgivet

    Reporter Geneechnology in Soil Ecology; Detection of Bioavailability and Microbial Interactions

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Nucleic Acids and Proteins in Soil. Tyskland: Springer, s. 397-419

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  2. Udgivet

    Interactions in multispecies biofilms: do they actually matter?

    Burmølle, Mette, Ren, D., Bjarnsholt, Thomas & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Microbiology. 22, 2, s. 84-91 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Biofilms in chronic infections - a matter of opportunity - monospecies biofilms in multispecies infections

    Burmølle, Mette, Thomsen, T. R., Fazli, M., Dige, I., Christensen, L., Homøe, Preben, Tvede, M., Nyvad, B., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Moser, Claus Ernst, Kirketerp-Møller, K., Johansen, Helle Krogh, Høiby, Niels, Jensen, Peter Østrup, Sørensen, Søren Johannes & Bjarnsholt, Thomas, 2010, I: FEMS Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 324-336 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Establishment and early succession of a multispecies biofilm composed of soil bacteria

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Microbial Ecology. 54, 2, s. 352-62 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    An invisible workforce: biofilms in the soil

    Burmølle, Mette, Kjøller, Annelise Helene & Sørensen, Søren Johannes, 2012, Microbial biofilms: current research and applications. Lear, G. & Lewis, G. D. (red.). Caister Academic Press, s. 61-71 11 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Enhanced Biofilm Formation and Increased Resistance to Antimicrobial Agents and Bacterial Invasion Are Caused by Synergistic Interactions in Multispecies Biofilms

    Burmølle, Mette, Webb, J. S., Rao, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Kjelleberg, S., 2006, I: Applied and Environmental Microbiology. 72, 6, s. 3916-3923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Type 3 fimbriae, encoded by the conjugative plasmid pOLA52, enhance biofilm formation and transfer frequencies in Enterobacteriaceae strains

    Burmølle, Mette, Bahl, M. I., Jensen, L. B., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2008, I: Microbiology. 154, Pt 1, s. 187-95 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Biofilms in soil

    Burmølle, Mette, Kjøller, Annelise Helene & Sørensen, Søren Johannes, 2011, Encyclopedia of agrophysics. Springer, s. 70-75 6 s. (Encyclopedia of Earth Sciences Series).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportEncyclopædiartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Sequencing of IncX-plasmids suggests ubiquity of mobile forms of a biofilm-promoting gene cassette recruited from Klebsiella pneumoniae

    Burmølle, Mette, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2012, I: PLOS ONE. 7, 7, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Use of a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry to Detect AHL Production by an Indigenous Soil Community During Decomposition

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: Microbial Ecology. 50, 2, s. 221-229

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Barley Rhizosphere Microbiome Transplantation: A Strategy to Decrease Susceptibility of Barley Grown in Soils With Low Microbial Diversity to Powdery Mildew

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 14 s., 830905.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Tillage shapes the soil and rhizosphere microbiome of barley - but not its susceptibility towards Blumeria graminis f. sp. hordei

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Douchkov, D., Lueck, S., Babin, D., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The treasure inside barley seeds: microbial diversity and plant beneficial bacteria

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Straube, B., Wehner, G., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: Environmental Microbiomes. 16, 21 s., 20.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Bacteriophages suppress CRISPR–Cas immunity using RNA-based anti-CRISPRs

    Camara, Sarah, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Fagerlund, R. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C., Sørensen, Søren Johannes & Pinilla Redondo, Rafael, 2023, I: Nature. 623, 7987, s. 601-607 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Physiological heterogeneities in microbial populations and implications for physical stress tolerance

    Carlqvist, M., Lencastre Fernandes, R., Helmark, S., Heins, A., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Gernaey, K. & Eliasson Lantz, A., 2012, I: Microbial Cell Factories. 11, 94, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Reduced tillage, cover crops and organic amendments affect soil microbiota and improve soil health in Uruguayan vegetable farming systems

    Cerecetto, V., Smalla, K., Nesme, Joseph, Garaycochea, S., Fresia, P., Sørensen, Søren Johannes, Babin, D. & Leoni, C., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab023.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    The developing airway and gut microbiota in early life is influenced by age of older siblings

    Christensen, E. D., Hjelmsø, M. H., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Shah, S., Redgwell, T., Poulsen, Christina Egeø, Trivedi, Urvish, Russel, J., Gupta, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2022, I: Microbiome. 10, 15 s., 106.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Tailings microbial community profile and prediction of its functionality in basins of tungsten mine

    Chung, A. P., Coimbra, C., Farias, P., Francisco, R., Branco, R., Simão, F. V., Gomes, E., Pereira, A., Vila, M. C., Fiúza, A., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 19596.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Mining of unexplored habitats for novel chitinases - chiA as a helper gene proxy in metagenomics

    Cretoiu, M. S., Kielak, A. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 94, 5, s. 1347-1358 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Lead Drives Complex Dynamics of a Conjugative Plasmid in a Bacterial Community

    Cyriaque, V., Madsen, Jonas Stenløkke, Fievez, L., Leroy, B., Hansen, Lars Hestbjerg, Bureau, F., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 655903.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments

    Cyriaque, V., Jacquiod, S. J. A., Riber, Leise, Abu Al-Soud, W., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: Journal of Hazardous Materials. 382, 10 s., 121173.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Metal-induced bacterial interactions promote diversity in river-sediment microbiomes

    Cyriaque, V., Géron, A., Billon, G., Nesme, Joseph, Werner, J., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: F E M S Microbiology Ecology. 96, 6, 12 s., fiaa076.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Genetic barcoding of dark-spored myxomycetes (Amoebozoa): identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studies

    Dahl, M. B., Brejnrod, A. D., Unterseher, M., Hoppe, T., Feng, Y., Novozhilov, Y., Sørensen, Søren Johannes & Schnittler, M., mar. 2018, I: Molecular Ecology Resources. 18, 2, s. 306-318 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Warmer winters result in reshaping of the European beech forest soil microbiome (bacteria, archaea and fungi) - With potential implications for ecosystem functioning

    Dahl, M. B., Kreyling, J., Petters, S., Wang, H., Mortensen, M. S., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Urich, T. & Weigel, R., 2023, I: Environmental Microbiology. 25, 6, 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Different Degrees of Niche Differentiation for Bacteria, Fungi, and Myxomycetes Within an Elevational Transect in the German Alps

    Dahl, M. B., Brejnrod, A. D., Russel, J., Sørensen, Søren Johannes & Schnittler, M., 2019, I: Microbial Ecology. 78, 3, s. 764-780

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Exploring the complex response to linuron of bacterial communities from biopurification systems by means of cultivation-independent methods

    Dealtry, S., Nour, E. H., Holmsgaard, P. N., Ding, G. C., Weichelt, V., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Springael, D. & Smalla, K., 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 2, 12 s., fiv157.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Shifts in abundance and diversity of mobile genetic elements after the introduction of diverse pesticides into an on-farm biopurification system over the course of a year

    Dealtry, S., Holmsgaard, P. N., Dunon, V., Jechalke, S., Ding, G., Kroegerrecklenfort, E., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Zuehlke, S., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 13, s. 4012-4020 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    It is elemental: soil nutrient stoichiometry drives bacterial diversity

    Delgado-Baquerizo, M., Reich, P. B., Khachane, A. N., Campbell, C. D., Thomas, N., Freitag, T. E., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Bardgett, R. D. & Singh, B. K., 2017, I: Environmental Microbiology. 19, 3, s. 1176-1188 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Green fluorescent protein (GFP) leakage from microbial biosensors provides useful information for the evaluation of the scale-down effect

    Delvigne, F., Brognaux, A., Francis, F., Twizere, J., Gorret, N., Sørensen, Søren Johannes & Thonart, P., 2011, I: Biotechnology Journal. 6, 8, s. 968-978 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Metabolic variability in bioprocessing: implications of microbial phenotypic heterogeneity

    Delvigne, F., Zune, Q., Lara, A. R., Abu Al-Soud, W. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Biotechnology. 32, 12, s. 608-616 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Applicability of GFP microbial whole cell biosensors to bioreactor operations: mathematical modeling and related experimental tools

    Delvigne, F., Brognaux, A., Gorret, N., Sørensen, Søren Johannes, Michel, C. & Thonart, P., jul. 2011, Biosensors - Emerging Materials and Applications. Serra, P. A. (red.). Rijeka, Croatia: InTech, s. 601-630 30 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    The fate of mercury in Arctic terrestrial and aquatic ecosystems, a review

    Douglas, T. A., Loseto, L. L., Macdonald, R. W., Outridge, P., Dommergue, A., Poulain, A., Amyot, M., Barkay, T., Berg, T., Chételat, J., Constant, P., Evans, M., Ferrari, C., Gantner, N., Johnson, M. S., Kirk, J., Kroer, N., Larose, C., Lean, D., Nielsen, T. G. & 7 flere, Poissant, L., Rognerud, S., Skov, H., Sørensen, Søren Johannes, Wang, F., Wilson, S. & Zdanowicz, C. M., 2012, I: Environmental Chemistry (Online). 9, 4, s. 321-355 35 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Methanotrophs, methanogens and microbial community structure in livestock slurry surface crusts

    Duan, Y. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2014, I: Journal of Applied Microbiology. 117, 4, s. 1066-1078 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Hordeum vulgare differentiates its response to beneficial bacteria

    Duan, Y., Han, M., Grimm, M., Schierstaedt, J., Imani, J., Cardinale, M., Le Jean, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Schikora, A., 2023, I: BMC Plant Biology. 23, 1, 16 s., 460.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    DGGE and Pyrosequencing characterization of microbial community and methane-metabolizing microorganisms in livestock slurry surface crusts

    Duan, Y. (., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2012.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  36. Udgivet

    Long-Range PCR Reveals the Genetic Cargo of IncP-1 Plasmids in the Complex Microbial Community of an On-Farm Biopurification System Treating Pesticide-Contaminated Wastewater

    Dunon, V., Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Lavigne, R., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K., Top, E. M. & Springael, D., 2022, I: Applied and Environmental Microbiology. 88, 3, 17 s., e01648-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    A comparison of short-read, HiFi long-read, and hybrid strategies for genome-resolved metagenomics

    Eisenhofer Philipona, Raphael A, Nesme, J., Santos-Bay, Luisa, Koziol, Adam Leslie, Sørensen, Søren Johannes, Alberdi, Antton & Aizpurua Arrieta, Ostaizka, 2024, I: Microbiology Spectrum. 12, 4, 14 s., e03590-23.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Microbiomes associated with infective stages of root-knot and lesion nematodes in soil

    Elhadyl, A., Giné, A., Topalovic, O., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Javier Sorribas, F. & Heuer, H., 4 maj 2017, I: PLoS ONE. 12, 5, 17 s., e0177145.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Characterization of the gut microbiota in leptin deficient obese mice: correlation to inflammatory and diabetic parameters

    Ellekilde, M., Krych, Lukasz, Hansen, Camilla Hartmann Friis, Hufeldt, M. R., Dahl, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Research in Veterinary Science. 96, 2, s. 241-250 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Biocontrol of Bacterial Wilt Disease Through Complex Interaction Between Tomato Plant, Antagonists, the Indigenous Rhizosphere Microbiota, and Ralstonia solanacearum

    Elsayed, T. R., Jacquiod, S., Nour, E. H., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 15 s., 2835.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Natural hot spots for gain of multiple resistances: arsenic and antibiotic resistances in heterotrophic, aerobic bacteria from marine hydrothermal vent fields

    Farias, P., Santo, C. E., Branco, R., Francisco, R., Santos, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 7, s. 2534-2543 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Impact of Tellurite on the Metabolism of Paenibacillus pabuli AL109b With Flagellin Production Explaining High Reduction Capacity

    Farias, P., Francisco, R., Maccario, Lorrie, Herschend, J., Piedade, A. P., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 15 s., 718963.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    The nitrogenase gene pool in surface waters of the global ocean is dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Hagström & Riemann, Lasse, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  44. Udgivet

    Nitrogenase gene amplicons from global marine surface waters are dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A. F., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Steward, G. F., Hagström, Å. & Riemann, Lasse, 2011, I: P L o S One. 6, 4, s. e19223 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Microbial community analysis of soils under different soybean cropping regimes in the Argentinean south-eastern Humid Pampas

    Fernandez-Gnecco, G., Smalla, K., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Barbieri, P., Consolo, V. F., Covacevich, F. & Babin, D., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Recovery of GFP-labeled bacteria for culturing and molecular analysis after cell sorting using a benchtop flow cytometer

    Ferrari, B. C., Øregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Microbial Ecology. 48, s. 239-245

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Quantitative metagenomic analyses based on average genome size normalization

    Frank, J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2011, I: Applied and Environmental Microbiology. 77, 7, s. 2513-2521 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Probing Barophilic Microbial Communities for Novel Proteolytic Enzymes

    Frank, J. A., Hansen, M. A. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  49. Udgivet

    The bacterial microbiota in first-void urine from men with and without idiopathic urethritis

    Frølund, M., Wikström, A., Lidbrink, P., Abu Al-Soud, W., Larsen, N., Harder, C. B., Sørensen, Søren Johannes, Jensen, J. S. & Ahrens, P., 2018, I: PLoS ONE. 13, 7, s. 1-19 e0201380.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Compatibility of X-ray computed tomography with plant gene expression, rhizosphere bacterial communities and enzyme activities

    Ganther, M., Yim, B., Ibrahim, Z., Bienert, M. D., Lippold, E., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Bienert, G. P., Vetterlein, D., Heintz-Buschart, A., Blagodatskaya, E., Smalla, K. & Tarkka, M. T., 2020, I: Journal of Experimental Botany. 71, 18, s. 5603-5614 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269