Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. 2005
  2. Udgivet

    The Prevalence of the OqxAB Multidrug Efflux Pump amongst Olaquindox-Resistant Escherichia coli in Pigs

    Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Jørgensen, H. S. & Jensen, L. B., 2005, I: Microbial Drug Resistance. 11, 4, s. 378-382

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Use of a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry to Detect AHL Production by an Indigenous Soil Community During Decomposition

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: Microbial Ecology. 50, 2, s. 221-229

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. 2006
  5. Udgivet

    A flow cytometry-optimized assay using an SOS-green fluorescent protein (SOS-GFP) whole-cell biosensor for the detection of genotoxins in complex environments

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Mutation Research - Reviews. 603, 2, s. 164-172 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Biodegradation, bioaccessibility and genotoxicity of diffuse polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) pollution at a motorway site

    Johnson, A. R., Lipthay, J. R. D., Reichenberg, F., Sørensen, Søren Johannes, Andersen, O., Christensen, P., Binderup, M. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Science & Technology (Washington). 40, 10, s. 3293-3298

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Biosensors to Monitor Soil Health or Toxicity

    Poulsen, P. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Modern Soil Microbiology. van Elsas, J. D., Jansson, J. K. & Trevors, J. T. (red.). 2nd udg. Boca Raton, FL: CRC Press, s. 435-454

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  8. Udgivet

    Cultivation-independent examination of horizontal transfer and host range of an IncP-1 plasmid among gram-positive and gram-negative bacteria indigenous to the barley rhizosphere

    Musovic, S., Oregaard, G., Kroer, Niels & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Applied and Environmental Microbiology. 72, 10, s. 6687-6692 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Determination of the genetic background for resistance to olaquindox, a Gram-negative growth promoter

    Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Jensen, L. B., 2006, I: DANMAP 2005 - July 2006. s. 100-100 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  10. Udgivet

    Enhanced Biofilm Formation and Increased Resistance to Antimicrobial Agents and Bacterial Invasion Are Caused by Synergistic Interactions in Multispecies Biofilms

    Burmølle, Mette, Webb, J. S., Rao, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Kjelleberg, S., 2006, I: Applied and Environmental Microbiology. 72, 6, s. 3916-3923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Making bio-sense of toxicity: new developments in whole-cell biosencors

    Sørensen, Søren Johannes, Burmølle, Mette & Hansen, Lars Hestbjerg, 2006, I: Current Opinion in Biotechnology. 17, 1, s. 11-16

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Microbial degradation of street dust polycyclic aromatic hydrocarbons in microcosms simulating diffuse pollution of urban soil.

    Johnsen, A. R., de Lipthay, J. R., Sørensen, Søren Johannes, Ekelund, Flemming, Christensen, P., Andersen, O., Karlson, U. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Microbiology. 8, 3, s. 535-45 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Mineralisation of 2,6-dichlorobenzamide (BAM) in dichlobenil-exposed soils and isolation of a BAM-mineralising Aminobacter sp.

    Simonsen, A., Holtze, M. S., Sørensen, S. R., Sørensen, Søren Johannes & Aamund, J., 2006, I: Environmental Pollution. 144, 1, s. 289-295

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Reporter Geneechnology in Soil Ecology; Detection of Bioavailability and Microbial Interactions

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Nucleic Acids and Proteins in Soil. Tyskland: Springer, s. 397-419

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  15. 2007
  16. Udgivet

    Conjugative transfer facilitates stable maintenance of IncP-1 plasmid pKJK5 in Escherichia coli cells colonizing the gastrointestinal tract of the germfree rat

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Applied and Environmental Microbiology. 73, 1, s. 341-343

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Establishment and early succession of a multispecies biofilm composed of soil bacteria

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Microbial Ecology. 54, 2, s. 352-62 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Impact of conjugal transfer on the stability of IncP-1 plasmid pKJK5 in bacterial populations

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: FEMS Microbiology Letters. 266, s. 250-256

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Substrate specificity of the OqxAB multidrug resistance pump in Escherichia coli and selected enteric bacteria

    Hansen, Lars Hestbjerg, Jensen, L. B., Sørensen, H. I. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 60, 1, s. 145-147

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    The cda GenoTox assay: A new sensitive method for detection of environmental genotoxins, including nitroarenes and aromatic amines

    Østergaard, T. G., Hansen, Lars Hestbjerg, Binderup, M., Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Mutation Research - Reviews. 631, 2, s. 77-84

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    The multiple antibiotic resistance IncP-1 plasmid pKJK5 isolated from a soil environment is phylogenetically divergent from members of the previously established a, ß and d sub-groups

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Goesmann, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Plasmid. 58, 1, s. 31-43

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2008
  23. Udgivet

    Acclimation of subsurface microbial communities to mercury

    de Lipthay, J. R., Rasmussen, L. D., Øregaard, G., Simonsen, K., Bahl, M. I., Kroer, Niels & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: FEMS Microbiology Ecology. 65, 1, s. 145-55 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Characterisation, dissemination and persistence of gentamicin resistant Escherichia coli from a Danish university hospital to the waste water environment

    Jakobsen, L., Sandvang, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Bagger-Skjøt, L., Westh, Henrik T., Jørgensen, C., Hansen, D. S., Pedersen, B. M., Monnet, D. L., Frimodt-Møller, N., Sørensen, Søren Johannes & Hammerum, A. M., 2008, I: Environment International. 34, 1, s. 108-15 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Cultivation of hard-to-culture subsurface mercury-resistant bacteria and discovery of new merA gene sequences

    Rasmussen, L. D., Zawadsky, C., Binnerup, S. J., Øregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 12, s. 3795-803 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Nucleotide sequence of pOLA52: a conjugative IncX1 plasmid from Escherichia coli which enables biofilm formation and multidrug efflux

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, She, Q. & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: Plasmid. 60, 1, s. 59-74 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Type 3 fimbriae, encoded by the conjugative plasmid pOLA52, enhance biofilm formation and transfer frequencies in Enterobacteriaceae strains

    Burmølle, Mette, Bahl, M. I., Jensen, L. B., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2008, I: Microbiology. 154, Pt 1, s. 187-95 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. 2009
  29. Udgivet

    All IncP-1 plasmid subgroups, including the novel e subgroup, are prevalent in the influent of a Danish wastewater treatment plant

    Bahl, M. I., Burmølle, Mette, Meisner, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Plasmid. 62, 2, s. 134-139 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Conjugative plasmids: Vessels of the communal gene pool

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 364, 1527, s. 2275-2289 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Construction and Use of Flow Cytometry Optimized Plasmid-Sensor Strains: Genomes in Flux

    Bahl, M. I., Oregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2009, Horizontal Gene Transfer. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 257-268 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  32. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  33. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  34. Udgivet

    Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  35. Udgivet

    The presence of embedded bacterial pure cultures in agar plates stimulate the culturability of soil bacteria.

    Burmølle, Mette, Johnsen, K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Journal of Microbiological Methods. 79, 2, s. 166-173 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. 2010
  37. Udgivet

    All equal, all different?

    Han, S., Lundin, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  38. Udgivet

    Biofilms in chronic infections - a matter of opportunity - monospecies biofilms in multispecies infections

    Burmølle, Mette, Thomsen, T. R., Fazli, M., Dige, I., Christensen, L., Homøe, Preben, Tvede, M., Nyvad, B., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Moser, Claus Ernst, Kirketerp-Møller, K., Johansen, Helle Krogh, Høiby, Niels, Jensen, Peter Østrup, Sørensen, Søren Johannes & Bjarnsholt, Thomas, 2010, I: FEMS Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 324-336 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet
  40. Udgivet

    Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van der Berg, Franciscus Winfried J, Nielsen, Dennis Sandris, Andreasen, Anne Sofie, Pedersen, Bente Klarlund, Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010, I: PLoS ONE. 5, 2, s. e9085 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    New ecological niches and habitats for Chlorophyll d- containing cyanobacteria

    Behrendt, L., Chen, M., Larkum, A. W. D., Ralph, P. J., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, E. & Kühl, Michael, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  42. Udgivet

    The gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Nielsen, Dennis Sandris, Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van den Berg, F. W. J., Andreasen, A. S., Pedersen, B. K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  43. Udgivet
  44. Udgivet

    The nitrogenase gene pool in surface waters of the global ocean is dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Hagström & Riemann, Lasse, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  45. Udgivet

    Probing Barophilic Microbial Communities for Novel Proteolytic Enzymes

    Frank, J. A., Hansen, M. A. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  46. Udgivet
  47. Udgivet

    Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing

    Holmsgaard, P. N., Poulsen, P. H. B., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  48. Udgivet

    Metamobilomics - Expanding the environmental mobilome with high throughput sequencing

    Norman, A., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  49. Udgivet

    The Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Field Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  50. Udgivet

    The effect of L. acidophilus NCFM intake on insulin sensitivity and gut microbiota: a randomized placebo-controlled trial

    Larsen, Nadja, Andreasen, A. S., Pedersen-Skovsgaard, T., Møller, K., van den Berg, F. W. J., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Pedersen, Bente Klarlund & Jakobsen, M., sep. 2010.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  51. Udgivet

    Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing

    Holmsgaard, P. N., Poulsen, P., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  52. Udgivet

    Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Filed Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  53. 2011
  54. Udgivet

    Extrachromosomal replicons:

    Sørensen, Søren Johannes, 2011, Lewin's GENES X. Lewin, B., Krebs, J. E., Goldstein, E. S., Kilpatrick, S. T. & Goldstein, E. S. (red.). 10th ed udg. Sudbury, Mass. : Jones and Bartlett Publishers, s. 282-298 16 s. (Jones and Bartlett books in computer science).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiUndervisning

  55. Udgivet

    An Unexpected Location of the Arginine Catabolic Mobile Element (ACME) in a USA300-Related MRSA Strain

    Bartels, Mette Damkjær, Hansen, Lars Hestbjerg, Boye, K., Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., 2011, I: P L o S One. 6, 1, 5 s., e16193.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Biofilms in soil

    Burmølle, Mette, Kjøller, Annelise Helene & Sørensen, Søren Johannes, 2011, Encyclopedia of agrophysics. Springer, s. 70-75 6 s. (Encyclopedia of Earth Sciences Series).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportEncyclopædiartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Characterization of bacterial populations in Danish raw milk cheeses made with different starter cultures by denaturating gradient gel electrophoresis and pyrosequencing

    Masoud, W. M. H., Takamiya, M. K. W., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2011, I: International Dairy Journal. 21, 3, s. 142-148 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269