Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- Udgivet
Bacterial communities in termite fungus combs are comprised of consistent gut deposits and contributions from the environment
Otani, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Poulsen, Michael, 2016, I: Microbial Ecology. 71, 1, s. 207-220 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial community analysis for investigating bacterial transfer from tonsils to the pig carcass
Jakobsen, A. M., Bahl, M. I., Buschhardt, T., Hansen, T. B., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Nesbakken, T. & Aabo, S., 2019, I: International Journal of Food Microbiology. 295, s. 8-18 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial community structure in High-Arctic snow and freshwater as revealed by pyrosequencing of 16S rRNA genes and cultivation
Møller, A. K., Søborg, D. A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2013, I: Polar Research. 32, 11 s., 17390.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial social interactions and the emergence of community-intrinsic properties
Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2018, I: Current Opinion in Microbiology. 42, s. 104-109 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial symbiont sharing in Megalomyrmex social parasites and their fungus-growing ant hosts
Liberti, J., Sapountzis, P., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Adams, R. M. M. & Boomsma, Jacobus J., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 12, s. 3151-3169 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacteriophages suppress CRISPR–Cas immunity using RNA-based anti-CRISPRs
Camara, Sarah, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Fagerlund, R. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C., Sørensen, Søren Johannes & Pinilla Redondo, Rafael, 2023, I: Nature. 623, 7987, s. 601-607 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Barley Rhizosphere Microbiome Transplantation: A Strategy to Decrease Susceptibility of Barley Grown in Soils With Low Microbial Diversity to Powdery Mildew
Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 14 s., 830905.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing
Holmsgaard, P. N., Poulsen, P. H. B., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing
Holmsgaard, P. N., Poulsen, P., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Bias in bacterial diversity as a result of Nycodenz extraction from bulk soil
Holmsgaard, P. N., Norman, A., Hede, S. C., Poulsen, P. H. B., Al-Soud, W. A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 14 jul. 2011, I: Soil Biology & Biochemistry. 43, 10, s. 2152-2159 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biocontrol of Bacterial Wilt Disease Through Complex Interaction Between Tomato Plant, Antagonists, the Indigenous Rhizosphere Microbiota, and Ralstonia solanacearum
Elsayed, T. R., Jacquiod, S., Nour, E. H., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 15 s., 2835.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biodegradation, bioaccessibility and genotoxicity of diffuse polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) pollution at a motorway site
Johnson, A. R., Lipthay, J. R. D., Reichenberg, F., Sørensen, Søren Johannes, Andersen, O., Christensen, P., Binderup, M. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Science & Technology (Washington). 40, 10, s. 3293-3298Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biofilm growth and near infrared radiation-driven photosynthesis of the chlorophyll d-containing cyanobacterium Acaryochloris marina
Behrendt, L., Schrameyer, V., Qvortrup, Klaus, Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 11, s. 3896-3904 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biofilms in chronic infections - a matter of opportunity - monospecies biofilms in multispecies infections
Burmølle, Mette, Thomsen, T. R., Fazli, M., Dige, I., Christensen, L., Homøe, Preben, Tvede, M., Nyvad, B., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Moser, Claus Ernst, Kirketerp-Møller, K., Johansen, Helle Krogh, Høiby, Niels, Jensen, Peter Østrup, Sørensen, Søren Johannes & Bjarnsholt, Thomas, 2010, I: FEMS Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 324-336 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biofilms in soil
Burmølle, Mette, Kjøller, Annelise Helene & Sørensen, Søren Johannes, 2011, Encyclopedia of agrophysics. Springer, s. 70-75 6 s. (Encyclopedia of Earth Sciences Series).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Encyclopædiartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bioinformatic approaches reveal metagenomic characterization of soil microbial community
Xu, Z., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Jacquiod, S. J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: P L o S One. 9, 4, 11 s., e93445.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biosensors to Monitor Soil Health or Toxicity
Poulsen, P. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Modern Soil Microbiology. van Elsas, J. D., Jansson, J. K. & Trevors, J. T. (red.). 2nd udg. Boca Raton, FL: CRC Press, s. 435-454Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Biosolids for safe land application: does wastewater treatment plant size matters when considering antibiotics, pollutants, microbiome, mobile genetic elements and associated resistance genes?
Wolters, B., Hauschild, K., Blau, K., Mulder, I., Heyde, B. J., Sørensen, Søren Johannes, Siemens, J., Jechalke, S., Smalla, K. & Nesme, Joseph, 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 3, s. 1573-1589 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Broad Dissemination of Plasmids across Groundwater-Fed Rapid Sand Filter Microbiomes
Pinilla Redondo, Rafael, Olesen, Asmus Kalckar, Russel, J., de Vries, L. E., Christensen, L. D., Musovic, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: mBio. 12, 6, 13 s., e0306821.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Broad host range plasmids can invade an unexpectedly diverse fraction of a soil bacterial community
Klümper, U., Riber, Leise, Dechesne, A., Sannazzaro, A. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2015, I: I S M E Journal. 9, s. 934-945 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bulk soil and maize rhizosphere resistance genes, mobile genetic elements and microbial communities are differently impacted by organic and inorganic fertilization
Wolters, B., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Widyasari-Mehta, A., Bech, T. B., Kreuzig, R. & Smalla, K., 2018, I: F E M S Microbiology Ecology. 94, 4, 13 s., fiy027.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids
Pinilla Redondo, Rafael, Russel, J., Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A., Garrett, Roger Antony, Nesme, Joseph, Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 8, s. 4315-4328Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CRISPRCasTyper: Automated Identification, Annotation, and Classification of CRISPR-Cas Loci
Russel, J., Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: CRISPR Journal. 3, 6, s. 462-469 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cell mass and cell cycle dynamics of an asynchronous budding yeast population: Experimental observations, flow cytometry data analysis, and multi-scale modeling
Lencastre Fernandes, R., Carlquist, M., Neves Lundin, A. L., Heins, A., Dutta, A., Sørensen, Søren Johannes, Jensen, R. A., Nopens, I., Eliasson Lantz, A. & Gernaey, K., 2013, I: Biotechnology and Bioengineering (Print). 110, 3, s. 812-826 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan
Johansen, Joachim, Atarashi, K., Arai, Y., Hirose, N., Sørensen, Søren Johannes, Vatanen, T., Knip, M., Honda, K., Xavier, R. J., Rasmussen, Simon & Plichta, D. R., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1064-1078 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Changes in rumen bacterial and archaeal communities over the transition period in primiparous Holstein dairy cows
Zhu, Z., Kristensen, L., Difford, G. F., Poulsen, M., Noel, S. J., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Lassen, J., Løvendahl, P. & Højberg, O., 2018, I: Journal of Dairy Science. 101, 11, s. 9847-9862Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterisation, dissemination and persistence of gentamicin resistant Escherichia coli from a Danish university hospital to the waste water environment
Jakobsen, L., Sandvang, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Bagger-Skjøt, L., Westh, Henrik T., Jørgensen, C., Hansen, D. S., Pedersen, B. M., Monnet, D. L., Frimodt-Møller, N., Sørensen, Søren Johannes & Hammerum, A. M., 2008, I: Environment International. 34, 1, s. 108-15 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of bacterial populations in Danish raw milk cheeses made with different starter cultures by denaturating gradient gel electrophoresis and pyrosequencing
Masoud, W. M. H., Takamiya, M. K. W., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2011, I: International Dairy Journal. 21, 3, s. 142-148 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Characterization of the gut microbiota in leptin deficient obese mice: correlation to inflammatory and diabetic parameters
Ellekilde, M., Krych, Lukasz, Hansen, Camilla Hartmann Friis, Hufeldt, M. R., Dahl, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Research in Veterinary Science. 96, 2, s. 241-250 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chlorophyll f-driven photosynthesis in a cavernous cyanobacterium
Behrendt, L., Brejnrod, A. D., Schliep, M., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2015, I: The ISME Journal. 9, 9, s. 2108-2111 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chromosomal insertion of the entire Escherichia coli lactose operon, into two strains of Pseudomonas, using a modified mini-Tn5 delivery system
Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Jensen, L. B., 1997, I: Gene. 186, 2, s. 167-173Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Co-localization of antibiotic resistance genes is widespread in the infant gut microbiome and associates with an immature gut microbial composition
Li, Xuan Ji, Brejnrod, A., Trivedi, Urvish, Russel, J., Thorsen, J., Shah, S. A., Vestergaard, G. A., Rasmussen, Morten Arendt, Nesme, Joseph, Bisgaard, H., Stokholm, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Microbiome. 12, 1, 18 s., 87.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coexistence facilitates interspecific biofilm formation in complex microbial communities
Madsen, Jonas Stenløkke, Røder, Henriette Lyng, Russel, J., Sørensen, Helle, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 8, s. 2565–2574Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Community structure of the metabolically active rumen bacterial and archaeal communities of dairy cows over the transition period
Zhu, Z., Noel, S. J., Difford, G. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Lassen, J., Løvendahl, P. & Højberg, O., 8 nov. 2017, I: PLoS ONE. 12, 11, 24 s., e0187858.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Community-intrinsic properties enhance keratin degradation from bacterial consortia
Nasipuri, P., Herschend, J., Brejnrod, A. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Espersen, R., Svensson, B., Burmølle, Mette, Jacquiod, S. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: PLoS ONE. 15, 1, 26 s., e0228108.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production
Kang, D., Shoaie, S., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Ledesma-Amaro, R., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 15 s., 1042.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative analysis of the alveolar microbiome in COPD, ECOPD, Sarcoidosis, and ILD patients to identify respiratory illnesses specific microbial signatures
Gupta, S., Shariff, M., Chaturvedi, G., Sharma, A., Goel, N., Yadav, M., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Mukerji, M. & Chauhan, N. S., 2021, I: Scientific Reports. 11, 11 s., 3963.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomic analysis reveals ecological differentiation in the genus Carnobacterium
Iskandar, C. F., Borges, F., Taminiau, B., Daube, G., Zagorec, M., Remenant, B., Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes, Mangavel, C., Cailliez-Grimal, C. & Revol-Junelles, A., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 14 s., 357.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparison of antibiotic-resistant bacteria and antibiotic resistance genes abundance in hospital and community wastewater: A systematic review
Hassoun-Kheir, N., Stabholz, Y., Kreft, J., de la Cruz, R., Romalde, J. L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F., Graham, D. & Paul, M., 2020, I: Science of the Total Environment. 743, 11 s., 140804.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Compatibility of X-ray computed tomography with plant gene expression, rhizosphere bacterial communities and enzyme activities
Ganther, M., Yim, B., Ibrahim, Z., Bienert, M. D., Lippold, E., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Bienert, G. P., Vetterlein, D., Heintz-Buschart, A., Blagodatskaya, E., Smalla, K. & Tarkka, M. T., 2020, I: Journal of Experimental Botany. 71, 18, s. 5603-5614 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Jakobsen, T. H., Hansen, M. A., Jensen, P. Ø., Hansen, L., Riber, L., Cockburn, A. P. I., Kolpen, M., Hansen, C. R., Ridderberg, W., Eickhardt-Sørensen, S. R., Hansen, M., Kerpedjiev, P., Alhede, M., Qvortrup, K., Burmølle, M., Moser, C. E., Kühl, M., Ciofu, O., Givskov, M., Sørensen, S. J. & 2 flere, , 2013, I: P L o S One. 8, 7, 17 s., e68484.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete genome sequences of four novel Lactococcus lactis phages distantly related to the Rare 1706 Phage Species
Kot, Witold, Neve, H., Vogensen, Finn Kvist, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00265-14.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Composted sewage sludge influences the microbiome and persistence of human pathogens in soil
Major, N., Schierstaedt, J., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Ban, S. G., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D. & Schikora, A., 2020, I: Microorganisms. 8, 7, 14 s., 1020.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conjugative Plasmid Conferring Resistance to Olaquindox
Sørensen, A. H., Hansen, Lars Hestbjerg, Johannesen, E. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Antimicrobial agents and Chemotheraphy. 47, 2, s. 798-799 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conjugative plasmids: Vessels of the communal gene pool
Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 364, 1527, s. 2275-2289 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conjugative transfer facilitates stable maintenance of IncP-1 plasmid pKJK5 in Escherichia coli cells colonizing the gastrointestinal tract of the germfree rat
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Applied and Environmental Microbiology. 73, 1, s. 341-343Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction and Use of Flow Cytometry Optimized Plasmid-Sensor Strains: Genomes in Flux
Bahl, M. I., Oregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2009, Horizontal Gene Transfer. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 257-268 (Methods in Molecular Biology).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Construction of Simplified Microbial Consortia to Degrade Recalcitrant Materials Based on Enrichment and Dilution-to-Extinction Cultures
Kang, D., Jacquiod, S., Herschend, J., Wei, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 10 s., 3010.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4269
Flest downloads
-
5136
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3027
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2838
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet