Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor

ORCID: 0000-0001-6227-9906

Udgivelsesår:
Alle
101 - 200 ud af 411Pr. side: 100
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2011
  2. Udgivet

    Characterization of pIC13_78, a biofilm enabling plasmid

    Madsen, Jonas Stenløkke, Norman, A., Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  3. Udgivet

    Construction of biosensors to investigate physiological diversity in fermentation processes

    Han, S., Lundin, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  4. Udgivet

    Endolithic chlorophyll d-containing phototrophs

    Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Norman, A., Qvortrup, Klaus, Chen, M., Ralph, P., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, Erik & Kühl, Michael, 2011, I: I S M E Journal. 5, 6, s. 1072-6 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Experimental methods and modeling techniques for description of cell population heterogeneity

    Lencastre Fernandes, R., Nierychlo, M., Lundin, L., Pedersen, A. E., Tellez, P. E. P., Dutta, A., Carlquist, M., Bolic, A., Schäpper, D., Brunetti, A. C., Helmark, S., Heins, A-L., Jensen, A. D., Nopens, I., Rottwitt, K., Szita, N., Elsas, J. D. V., Nielsen, P. H., Martinussen, J., Sørensen, S. J. & 2 flere, Eliasson Lantz, A. & Gernaey, K., 2011, I: Biotechnology Advances. 29, 6, s. 575-599 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Green fluorescent protein (GFP) leakage from microbial biosensors provides useful information for the evaluation of the scale-down effect

    Delvigne, F., Brognaux, A., Francis, F., Twizere, J., Gorret, N., Sørensen, Søren Johannes & Thonart, P., 2011, I: Biotechnology Journal. 6, 8, s. 968-978 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Investigation of diversity of plasmids carrying the blaTEM-52 gene

    Bielak, E. M., Bergenholtz, R. D., Jørgensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Hasman, H., 2011, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 66, 11, s. 2465-74 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Limiting the occurrence of antimicrobial resistance through targeted interventions directed at plasmid transfer and stability

    Riber, Leise, Charbon, G., Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Nitrogenase gene amplicons from global marine surface waters are dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A. F., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Steward, G. F., Hagström, Å. & Riemann, Lasse, 2011, I: P L o S One. 6, 4, s. e19223 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Predominant genera of fecal microbiota in children with atopic dermatitis are not altered by intake of probiotic bacteria Lactobacillus acidophilus NCFM and Bifidobacterium animalis subsp.lactis Bi-07

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, Gøbel, R. J., Michaelsen, Kim F., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2011, I: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, s. 482-496 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Quantitative metagenomic analyses based on average genome size normalization

    Frank, J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2011, I: Applied and Environmental Microbiology. 77, 7, s. 2513-2521 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  13. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  14. Udgivet

    Diversity and characterization of mercury-resistant bacteria in snow, freshwater and sea-ice brine from the High Arctic

    Møller, A., Barkay, T., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Skov, H. & Kroer, Niels, 1 mar. 2011, I: F E M S Microbiology Ecology. 75, 3, s. 390-401 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Sequence of a SCCmec type VII (former VT) found in Danish ST8-t024-PVLneg CA-MRSA

    Boye, K., Pulis, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., apr. 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  16. Udgivet

    Design and Synthesis of a Quintessential Self-Transmissible IncX1 Plasmid, pX1.0

    Hansen, Lars Hestbjerg, Bentzon-Tilia, M., Bentzon-Tilia, S., Norman, A., Rafty, L. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2011, I: P L o S One. 6, 5, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Applicability of GFP microbial whole cell biosensors to bioreactor operations: mathematical modeling and related experimental tools

    Delvigne, F., Brognaux, A., Gorret, N., Sørensen, Søren Johannes, Michel, C. & Thonart, P., jul. 2011, Biosensors - Emerging Materials and Applications. Serra, P. A. (red.). Rijeka, Croatia: InTech, s. 601-630 30 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Bias in bacterial diversity as a result of Nycodenz extraction from bulk soil

    Holmsgaard, P. N., Norman, A., Hede, S. C., Poulsen, P. H. B., Al-Soud, W. A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 14 jul. 2011, I: Soil Biology & Biochemistry. 43, 10, s. 2152-2159 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Lactococcus lactis c2 dairy bacteriphages with different thermal inactivation

    Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, C. L. M., Bashir, A., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Knoechel, Susanne, aug. 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  20. 2012
  21. Udgivet

    454-sequencing reveals stochastic local reassembly and high disturbance tolerance within arbuscular mycorrhizal fungal communities

    Lekberg, K. Y. M., Schnoor, T., Kjøller, Rasmus, Gibbons, S. M., Hansen, Lars Hestbjerg, Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Rosendahl, Søren, 2012, I: Journal of Ecology. 100, 1, s. 151-160 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    An invisible workforce: biofilms in the soil

    Burmølle, Mette, Kjøller, Annelise Helene & Sørensen, Søren Johannes, 2012, Microbial biofilms: current research and applications. Lear, G. & Lewis, G. D. (red.). Caister Academic Press, s. 61-71 11 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Assessment of the specificity of Burkholderia and Pseudomonas qPCR assays for detection of these genera in soil using 454 pyrosequencing

    Bergmark, L., Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Microbiology Letters. 333, 1, s. 77-84 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Bacteria in the first void urine of urethritis patients and healthy controls analysed by 454 high throughput senquencing

    Ahrens, P., Frølund, M., Abu Al-Soud, W., Wikström, A., Lidbrink, P., Cullberg, M., Sørensen, Søren Johannes & Jensen, J. S., 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  25. Udgivet

    Biofilm growth and near infrared radiation-driven photosynthesis of the chlorophyll d-containing cyanobacterium Acaryochloris marina

    Behrendt, L., Schrameyer, V., Qvortrup, Klaus, Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 11, s. 3896-3904 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Culture-dependent and -independent investigations of microbial diversity on urinary catheters

    Xu, Y., Moser, Claus Ernst, Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Høiby, Niels, Nielsen, P. H. & Thomsen, T. R., 2012, I: Journal of Clinical Microbiology. 50, 12, s. 3901-3908 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    DGGE and Pyrosequencing characterization of microbial community and methane-metabolizing microorganisms in livestock slurry surface crusts

    Duan, Y. (., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  28. Udgivet

    Design and synthesis of a functional self-replicating, broad host range cloning vector from bits and bytes

    Riber, Leise, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  29. Udgivet

    Draft Genome Sequence of the Soil Bacterium Burkholderia terrae Strain BS001, Which Interacts with Fungal Surface Structures

    Nazir, R., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Journal of Bacteriology. 194, 16, s. 4480-4481 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Early life treatment with vancomycin propagates Akkermansia muciniphila and reduces diabetes incidence in the NOD mouse

    Hansen, Camilla Hartmann Friis, Krych, Lukasz, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Buschard, K. & Hansen, Axel Kornerup, 2012, I: Diabetologia. 55, 8, s. 2285-2294 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Ecology and photobiology of chlorophyll d-containing cyanobacteria

    Kühl, Michael, Behrendt, L., Trampe, Erik, Sørensen, Søren Johannes, Chen, M., Qvortrup, K. & Larkum, A., 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  32. Udgivet

    Ecology and photobiology of chlorophyll d-containing cyanobacteria

    Kühl, Michael, Behrendt, L., Trampe, Erik, Sørensen, Søren Johannes, Chen, M., Qvortrup, Klaus & Larkum, A. W. D., 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  33. Udgivet

    Gut microbiota composition is correlated to grid floor induced stress and behavior in the BALB/c mouse

    Bendtsen, K. M. B., Krych, Lukasz, Sørensen, Dorte Bratbo, Pang, W., Nielsen, Dennis Sandris, Josefsen, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Axel Kornerup, 2012, I: P L o S One. 7, 10, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Heterogeneity in recombinant protein production

    Schalén, M., Johanson, T., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes & Lantz, A. E., 2012, I: New Biotechnology. 29, Supplement, 0, s. S78 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    High robustness of soil bacteria and funghi to multifactorial climate change manipulations

    Bergmark, L., Haugwitz-Hardenberg-Reventlow, M. S., Sørensen, Søren Johannes & Priemé, Anders, 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  36. Udgivet

    Insight from the draft genome of Dietzia cinnamea P4 reveals mechanisms of survival in complex tropical soil habitats and biotechnology potential

    Procópio, L., Alvarez, V. M., Jurelevicius, D. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Cardoso, J. S., Pádula, M., Leitao, Á. C., Seldin, L. & van Elsas, J. D., 2012, I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology. 101, 2, s. 289-302 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Limiting the occurrence of antimicrobial resistance through targeted interventions directed at plasmid stability

    Riber, Leise, Burmølle, Mette, Milani, S. M., Alm, M., Thomsen, P., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  38. Udgivet

    Metamobilomics — expanding our knowledge on the pool of plasmid encoded traits in natural environments using high-throughput sequencing

    Li, L., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: Clinical Microbiology and Infection. 18, Suppl. 4, s. 8-11 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Microbial diversity of biofilm communities in microniches associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella

    Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Trampe, Erik, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Kühl, Michael, 2012, I: I S M E Journal. 6, s. 1222-1237 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Mining of unexplored habitats for novel chitinases - chiA as a helper gene proxy in metagenomics

    Cretoiu, M. S., Kielak, A. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., 2012, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 94, 5, s. 1347-1358 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Novel and conserved bacterial mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

    Kroer, Niels, Møller, A., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  42. Udgivet

    Permissiveness of soil microbial communities toward receipt of mobile genetic elements

    Musovic, S., Klümper, U., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  43. Udgivet

    Physiological heterogeneities in microbial populations and implications for physical stress tolerance

    Carlqvist, M., Lencastre Fernandes, R., Helmark, S., Heins, A., Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Gernaey, K. & Eliasson Lantz, A., 2012, I: Microbial Cell Factories. 11, 94, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing

    Zakrzewski, M., Goesmann, A., Jaenicke, S., Jünemann, S., Eikmeyer, F., Szczepanowski, R., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Pühler, A. & Schlüter, A., 2012, I: Journal of Biotechnology. 158, 4, s. 248-258 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Selection for Cu-tolerant bacterial communities with altered composition, but unaltered richness, via long-term Cu exposure

    Berg, J., Brandt, Kristian Koefoed, Abu Al-Soud, W., Holm, Peter Engelund, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Nybroe, O., 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, s. 7438-7446 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Sequencing of IncX-plasmids suggests ubiquity of mobile forms of a biofilm-promoting gene cassette recruited from Klebsiella pneumoniae

    Burmølle, Mette, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2012, I: PLOS ONE. 7, 7, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    The fate of indigenous microbiota, starter cultures, Escherichia coli, Listeria innocua and Staphylococcus aureus in Danish raw milk and cheeses determined by pyrosequencing and quantitative real time (qRT)-PCR

    Masoud, W. M. H., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 153, 1-2, s. 192-202 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    The fate of mercury in Arctic terrestrial and aquatic ecosystems, a review

    Douglas, T. A., Loseto, L. L., Macdonald, R. W., Outridge, P., Dommergue, A., Poulain, A., Amyot, M., Barkay, T., Berg, T., Chételat, J., Constant, P., Evans, M., Ferrari, C., Gantner, N., Johnson, M. S., Kirk, J., Kroer, N., Larose, C., Lean, D., Nielsen, T. G. & 7 flere, Poissant, L., Rognerud, S., Skov, H., Sørensen, Søren Johannes, Wang, F., Wilson, S. & Zdanowicz, C. M., 2012, I: Environmental Chemistry (Online). 9, 4, s. 321-355 35 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    The genome sequence of the lactic acid bacterium, Carnobacterium maltaromaticum ATCC 35586 encodes potential virulence factors

    Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Larsen, M. H., Hansen, L., Ingmer, Hanne & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 152, 3, s. 107-115 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 183-195 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  51. Udgivet

    When it makes sense to socialize whilst being on the move: A small EAL-domain containing protein, encoded on natural biofilm-promoting plasmids, triggers motility

    Madsen, Jonas Stenløkke, Riber, Leise, Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  52. 2013
  53. Udgivet

    454 pyrosequencing analyses of bacterial and archaeal richness in 21 full-scale biogas digesters

    Sundberg, C., Abu Al-Soud, W., Larsson, M., Alm, E., Yekta, S. S., Svensson, B. H., Sørensen, Søren Johannes & Karlsson, A., 2013, I: FEMS Microbiology Ecology. 85, 3, s. 612-626 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    A low-cost, multiplexable, automated flow cytometry procedure for the characterization of microbial stress dynamics in bioreactors

    Brognaux, A., Han, S., Sørensen, Søren Johannes, Lebeau, F., Thonart, P. & Delvigne, F., 2013, I: Microbial Cell Factories. 12, 100, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    A spatiotemporal view of plasmid loss in biofilms and planktonic cultures: [plus] Erratum

    Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Biotechnology and Bioengineering (Print). 110, 12, s. 3071-3074 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  56. Udgivet

    Adaptation and heterogeneity of Escherichia coli MC1000 growing in complex environments

    Puentes-Téllez, P., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 3, s. 1008-1017 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    Bacterial chitinolytic communities respond to chitin and pH alteration in soil

    Kielak, A., Cretoiu, M., Semenov, A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 1, s. 263-272 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    Bacterial community structure in High-Arctic snow and freshwater as revealed by pyrosequencing of 16S rRNA genes and cultivation

    Møller, A. K., Søborg, D. A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2013, I: Polar Research. 32, 11 s., 17390.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    Cell mass and cell cycle dynamics of an asynchronous budding yeast population: Experimental observations, flow cytometry data analysis, and multi-scale modeling

    Lencastre Fernandes, R., Carlquist, M., Neves Lundin, A. L., Heins, A., Dutta, A., Sørensen, Søren Johannes, Jensen, R. A., Nopens, I., Eliasson Lantz, A. & Gernaey, K., 2013, I: Biotechnology and Bioengineering (Print). 110, 3, s. 812-826 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes

    Jakobsen, T. H., Hansen, M. A., Jensen, P. Ø., Hansen, L., Riber, L., Cockburn, A. P. I., Kolpen, M., Hansen, C. R., Ridderberg, W., Eickhardt-Sørensen, S. R., Hansen, M., Kerpedjiev, P., Alhede, M., Qvortrup, K., Burmølle, M., Moser, C. E., Kühl, M., Ciofu, O., Givskov, M., Sørensen, S. J. & 2 flere, Høiby, Niels & Bjarnsholt, Thomas, 2013, I: P L o S One. 8, 7, 17 s., e68484.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  61. Udgivet

    Design of growth-dependent biosensors based on destabilized GFP for the detection of physiological behavior of Escherichia coli in heterogeneous bioreactors

    Han, S., Delvigne, F., Brognaux, A., Charbon, G. E. & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Biotechnology Progress. 29, 2, s. 553-563 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  62. Udgivet

    Effects of fertilization with urban and agricultural organic wastes in a field trial – Prokaryotic diversity investigated by pyrosequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Bergmark, L., Magid, Jakob, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Soil Biology & Biochemistry. 57, s. 784-893 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  63. Udgivet

    Investigating the diversity of Pseudomonas spp. in soil using culture dependent and independent techniques

    Li, L., Abu Al-Soud, W., Bergmark, L., Riber, Leise, Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Current Microbiology. 67, 4, s. 423-430 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    Investigation of the relationship between lactococcal host cell wall polysaccharide genotype and 936 phage receptor binding protein phylogeny

    Mahony, J., Kot, Witold, Murphy, J., Ainsworth, S., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes, Hammer, K., Cambillau, C., Vogensen, Finn Kvist & Sinderen, D. V., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 14, s. 4385-4392 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  65. Udgivet

    Microbial diversity and PAH catabolic genes tracking spatial heterogeneity of PAH concentrations

    Bengtsson, G., Törneman, N., Lipthay, J. R. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Microbial Ecology. 65, 1, s. 91-100 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  66. Udgivet

    Simultaneous pyrosequencing of the 16S rRNA, IncP-1 trfA, and merA genes

    Holmsgaard, P. N., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2013, I: Journal of Microbiological Methods. 95, 2, s. 280-284 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  67. Udgivet

    Specificity and stability of the Acromyrmex–Pseudonocardia symbiosis

    Andersen, Sandra Breum, Hansen, Lars Hestbjerg, Sapountzis, P., Sørensen, Søren Johannes & Boomsma, Jacobus J., 2013, I: Molecular Ecology. 22, 16, s. 4307-4321 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  68. Udgivet

    The ability of soil bacteria to receive the conjugative IncP1 plasmid, pKJK10, is different in a mixed community compared to single strains

    de la Cruz Perera, C. I., Ren, D., Blanchet, M., Dendooven, L., Marsch, R., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2013, I: F E M S Microbiology Letters. 338, 1, s. 95-100 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  69. Udgivet

    The impact of the conjugative IncP-1 plasmid pKJK5 on multispecies biofilm formation is dependent on the plasmid host

    Røder, Henriette Lyng, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2013, I: F E M S Microbiology Letters. 344, 2, s. 186-192 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  70. Udgivet

    The murine lung microbiome in relation to the intestinal and vaginal bacterial communities

    Barfod, K. K., Roggenbuck, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Schjørring, S., Larsen, S. T., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2013, I: B M C Microbiology. 13, 12 s., 303.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  71. 2014
  72. Udgivet

    An improved method for including upper size range plasmids in metamobilomes

    Norman, A., Riber, Leise, Luo, W., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, 12 s., e104405.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  73. Udgivet

    Bioinformatic approaches reveal metagenomic characterization of soil microbial community

    Xu, Z., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Jacquiod, S. J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: P L o S One. 9, 4, 11 s., e93445.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  74. Udgivet

    Characterization of the gut microbiota in leptin deficient obese mice: correlation to inflammatory and diabetic parameters

    Ellekilde, M., Krych, Lukasz, Hansen, Camilla Hartmann Friis, Hufeldt, M. R., Dahl, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Research in Veterinary Science. 96, 2, s. 241-250 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  75. Udgivet

    Complete genome sequences of four novel Lactococcus lactis phages distantly related to the Rare 1706 Phage Species

    Kot, Witold, Neve, H., Vogensen, Finn Kvist, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00265-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  76. Udgivet

    DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque

    Kot, Witold, Vogensen, Finn Kvist, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  77. Udgivet

    Draft genome sequence of Burkholderia sordidicola S170, a potential plant growth promoter isolated from coniferous forest soil in the Czech Republic

    Lladó, S., Xu, Z., Sørensen, Søren Johannes & Baldrian, P., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00810-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  78. Udgivet

    Exploring the immediate and long-term impact on bacterial communities in soil amended with animal and urban organic waste fertilizers using pyrosequencing and screening for horizontal transfer of antibiotic resistance

    Riber, Leise, Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. B. S., Bergmark, L., Brejnrod, A. D., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 206-224 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  79. Udgivet

    Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    Genome sequences of two Leuconostoc pseudomesenteroides strains isolated from Danish dairy starter cultures

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, s. 2 e00484-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    High-throughput screening of multispecies biofilm formation and quantitative PCR-based assessment of individual species proportions, useful for exploring interspecific bacterial interactions

    Ren, D., Madsen, Jonas Stenløkke, de la Cruz Perera, C. I., Bergmark, L., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2014, I: Microbial Ecology. 68, 1, s. 146-154 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  82. Udgivet

    Host-specific microbial communities in three sympatric North Sea sponges

    Naim, M. A., Morillo, J. A., Sørensen, Søren Johannes, Abu Al-Soud, W., Smidt, H. & Sipkema, D., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 2, s. 390-403 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  83. Udgivet

    Hundreds of circular novel plasmids and DNA elements identified in a rat cecum metamobilome

    Jørgensen, T. S., Xu, Z., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: P L o S One. 9, 2, 9 s., e87924.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  84. Udgivet

    Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

    Nielsen, H. B., Almeida, M., Juncker, A., Rasmussen, S., Li, J., Sunagawa, S., Plichta, D. R., Gautier, L., Pedersen, A. G., Le Chatelier, E., Pelletier, E., Bonde, I., Nielsen, T., Manichanh, C., Arumugam, M., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Blom, N., Borruel, N., Burgdorf, K. S. & 31 flere, Boumezbeur, F., Casellas, F., Doré, J., Dworzynski, P., Guarner, F., Hansen, Torben, Hildebrand, F., Kaas, R. S., Kennedy, S., Kristiansen, Karsten, Kultima, J. R., Léonard, P., Levenez, F., Lund, O., Moumen, B., Le Paslier, D., Pons, N., Pedersen, Oluf Borbye, Prifti, E., Qin, J., Raes, J., Sørensen, Søren Johannes, Tap, J., Tims, S., Ussery, D., Yamada, T., Renault, P., Sicheritz-Pontén, T., Bork, P., Wang, J. & MetaHIT Consortium, M. C., 2014, I: Nature Biotechnology. 32, 8, s. 822–828 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  85. Udgivet

    Identifying the core microbial community in the gut of fungus-growing termites

    Otani, S., Mikaelyan, A., Nobre, T., Hansen, Lars Hestbjerg, Koné, N. A., Sørensen, Søren Johannes, Aanen, D. K., Boomsma, Jacobus J., Brune, A. & Poulsen, Michael, 2014, I: Molecular Ecology. 23, 18, s. 4631–4644 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  86. Udgivet

    Interactions in multispecies biofilms: do they actually matter?

    Burmølle, Mette, Ren, D., Bjarnsholt, Thomas & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Microbiology. 22, 2, s. 84-91 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  87. Udgivet

    Loss of microbial diversity in soils is coincident with reductions in some specialized functions

    Singh, B. K., Quince, C., Macdonald, C. A., Khachane, A., Thomas, N., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, He, Z., White, D., Sinclair, A., Crooks, B., Zhou, J. & Campbell, C. D., 2014, I: Environmental Microbiology. 16, 8, s. 2408-2420 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  88. Udgivet

    Mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

    Møller, A. K., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Boyd, E. S. & Kroer, Niels, 2014, I: FEMS Microbiology Ecology. 87, 1, s. 52-63 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  89. Udgivet

    Metabolic variability in bioprocessing: implications of microbial phenotypic heterogeneity

    Delvigne, F., Zune, Q., Lara, A. R., Abu Al-Soud, W. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Biotechnology. 32, 12, s. 608-616 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  90. Udgivet

    Methanotrophs, methanogens and microbial community structure in livestock slurry surface crusts

    Duan, Y. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2014, I: Journal of Applied Microbiology. 117, 4, s. 1066-1078 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  91. Udgivet

    Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris

    Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D., Winther, Jakob R. & Kühl, Michael, 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  92. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  93. Udgivet

    Sequentially aerated membrane biofilm reactors for autotrophic nitrogen removal: microbial community composition and dynamics

    Pellicer i Nàcher, C., Franck, S., Gülay, A., Ruscalleda, M., Terada, A., Abu Al-Soud, W., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2014, I: Microbial Biotechnology. 7, 1, s. 32-43 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  94. Udgivet

    Shifts in abundance and diversity of mobile genetic elements after the introduction of diverse pesticides into an on-farm biopurification system over the course of a year

    Dealtry, S., Holmsgaard, P. N., Dunon, V., Jechalke, S., Ding, G., Kroegerrecklenfort, E., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Zuehlke, S., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 13, s. 4012-4020 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  95. Udgivet

    Synbiotic Lactobacillus acidophilus NCFM and cellobiose does not affect human gut bacterial diversity but increases abundance of lactobacilli, bifidobacteria and branched-chain fatty acids: a randomized, double-blinded cross-over trial

    van Zanten, G. C., Krych, Lukasz, Röytiö, H., Forssten, S., Lahtinen, S. J., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Svensson, B., Jespersen, Lene & Jakobsen, M., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 225-236 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  96. Udgivet

    The giraffe (Giraffa camelopardalis) rumen microbiome

    Roggenbuck, M., Sauer, C., Poulsen, M., Bertelsen, M. F. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 237-246 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  97. Udgivet

    The microbiome of New World vultures

    Roggenbuck, M., Schnell, I. B., Blom, N., Bælum, J., Bertelsen, M. F., Sicheritz-Pontén, T., Sørensen, Søren Johannes, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R. & Hansen, L. H., 2014, I: Nature Communications. 5, 7 s., 5498.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  98. 2015
  99. Udgivet

    Acromyrmex leaf-cutting ants have simple gut microbiota with nitrogen-fixing potential

    Sapountzis, P., Zhukova, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Schiøtt, M. & Boomsma, Jacobus J., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 16, s. 5527-5537 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  100. Udgivet

    Bacterial symbiont sharing in Megalomyrmex social parasites and their fungus-growing ant hosts

    Liberti, J., Sapountzis, P., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Adams, R. M. M. & Boomsma, Jacobus J., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 12, s. 3151-3169 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  101. Udgivet

    Broad host range plasmids can invade an unexpectedly diverse fraction of a soil bacterial community

    Klümper, U., Riber, Leise, Dechesne, A., Sannazzaro, A. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2015, I: I S M E Journal. 9, s. 934-945 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  102. Udgivet

    Chlorophyll f-driven photosynthesis in a cavernous cyanobacterium

    Behrendt, L., Brejnrod, A. D., Schliep, M., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2015, I: The ISME Journal. 9, 9, s. 2108-2111 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  103. Udgivet

    Current strategies for mobilome research

    Jørgensen, T. S., Kiil, A. S., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Frontiers in Microbiology. 5, 6 s., 750.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  104. Udgivet

    Draft genome sequences of two protease-producing strains of Arsukibacterium, isolated from two cold and alkaline environments

    Lylloff, J. E., Hansen, L. B. S., Jepsen, M., Hallin, P. F., Sørensen, Søren Johannes, Stougaard, P. & Glaring, M. A., 2015, I: Genome Announcements. 3, 3, 2 s., e00585-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  105. Udgivet

    Facultative control of matrix production optimizes competitive fitness in Pseudomonas aeruginosa PA14 biofilm models

    Madsen, Jonas Stenløkke, Lin, Y. C., Squyres, G. R., Price-Whelan, A., Torio, A. D. S., Song, A., Cornell, W. C., Sørensen, Søren Johannes, Xavier, J. B. & Dietrich, L. E. P., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 24, s. 8414-8426 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 Næste

ID: 4269