Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- Udgivet
Oropharyngeal Microbiota Clusters in Children with Asthma or Wheeze Associate with Allergy, Blood Transcriptomic Immune Pathways, and Exacerbation Risk
U-BIOPRED Study Group, U. S. G., 2023, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 208, 2, s. 142-154 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A novel and affordable bioaugmentation strategy with microbial extracts to accelerate the biodegradation of emerging contaminants in different media
Aguilar-Romero, I., van Dillewijn, P., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Nogales, R., Delgado-Moreno, L. & Romero, E., 2022, I: Science of the Total Environment. 834, 10 s., 155234.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacteria in the first void urine of urethritis patients and healthy controls analysed by 454 high throughput senquencing
Ahrens, P., Frølund, M., Abu Al-Soud, W., Wikström, A., Lidbrink, P., Cullberg, M., Sørensen, Søren Johannes & Jensen, J. S., 2012.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Specificity and stability of the Acromyrmex–Pseudonocardia symbiosis
Andersen, Sandra Breum, Hansen, Lars Hestbjerg, Sapountzis, P., Sørensen, Søren Johannes & Boomsma, Jacobus J., 2013, I: Molecular Ecology. 22, 16, s. 4307-4321 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fate of CMY-2-Encoding Plasmids Introduced into the Human Fecal Microbiota by Exogenous Escherichia coli
Anjum, M., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph, Jana, B., Wiese, M., Jasinskyte, D., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Dalsgaard, Anders, Moodley, Arshnee, Bortolaia, V. & Guardabassi, Luca, 2019, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63, 5, 13 s., e02528-18.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A culture-independent method for studying transfer of IncI1 plasmids from wild-type Escherichia coli in complex microbial communities
Anjum, M., Madsen, Jonas Stenløkke, Espinosa-Gongora, C., Jana, B., Wiese, M., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Moodley, Arshnee, Bortolaia, V. & Guardabassi, Luca, sep. 2018, I: Journal of Microbiological Methods. 152, s. 18-26 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Unexpected diversity among small-scale sample replicates of defined plant root compartments
Attia, S., Russel, J., Mortensen, M. S., Madsen, Jonas Stenløkke & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: ISME Journal. 16, 4, s. 997-1003 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of long-term agricultural management practices on soil prokaryotic communities
Babin, D., Deubel, A., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Geistlinger, J., Grosch, R. & Smalla, K., 2019, I: Soil Biology & Biochemistry. 129, s. 17-28Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Distinct rhizomicrobiota assemblages and plant performance in lettuce grown in soils with different agricultural management histories
Babin, D., Sommermann, L., Chowdhury, S. P., Behr, J. H., Sandmann, M., Neumann, G., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K. & Grosch, R., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 21 s., fiab027.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phenotypic variability in bioprocessing conditions can be tracked on the basis of on-line flow cytometry and fits to a scaling law
Baert, J., Kinet, R., Brognaux, A., Delepierre, A., Telek, S., Sørensen, Søren Johannes, Riber, Leise, Fickers, P. & Delvigne, F., 2015, I: Biotechnology Journal. 10, 8, s. 1316-1325 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of tetracycline on transfer and establishment of the tetracycline-inducible conjugative transposon Tn916 in the gut of gnotobiotic rats
Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, L. H. & Licht, T. R., 2003, I: Applied and Environmental Microbiology. ., s. .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
In vivo detection and quantification of tetracycline by use of a whole-cell biosensor in the intestine of rats
Bahl, M. I., Hansen, L. H., Licht, T. R. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. ., s. .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conjugative transfer facilitates stable maintenance of IncP-1 plasmid pKJK5 in Escherichia coli cells colonizing the gastrointestinal tract of the germfree rat
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Applied and Environmental Microbiology. 73, 1, s. 341-343Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction and Use of Flow Cytometry Optimized Plasmid-Sensor Strains: Genomes in Flux
Bahl, M. I., Oregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2009, Horizontal Gene Transfer. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 257-268 (Methods in Molecular Biology).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
In Vivo Detection and Quantification of Tetracycline by Use of a Whole-Cell Biosensor in the Rat Intestine
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. R. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 48, 4, s. 1112-1117Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantification of plasmid loss in Escherichia coli cells by use of flow cytometry
Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2004, I: FEMS Microbiology Letters. 232, 1, s. 45-49Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction of an extended range whole-cell tetracycline biosensor by use of the tet(M) resistance gene
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: FEMS Microbiology Letters. 253, 2, s. 201-205Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
All IncP-1 plasmid subgroups, including the novel e subgroup, are prevalent in the influent of a Danish wastewater treatment plant
Bahl, M. I., Burmølle, Mette, Meisner, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Plasmid. 62, 2, s. 134-139 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of conjugal transfer on the stability of IncP-1 plasmid pKJK5 in bacterial populations
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: FEMS Microbiology Letters. 266, s. 250-256Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The multiple antibiotic resistance IncP-1 plasmid pKJK5 isolated from a soil environment is phylogenetically divergent from members of the previously established a, ß and d sub-groups
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Goesmann, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Plasmid. 58, 1, s. 31-43Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of Tetracycline on Transfer and Establishment of the Tetracycline-Inducible Conjugative Transposon Tn916 in the Guts of Gnotobiotic Rats
Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Licht, T. R., 2004, I: Applied and Environmental Microbiology. 70, 2, s. 758-764Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids
Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Root exposure to apple replant disease soil triggers local defense response and rhizoplane microbiome dysbiosis
Balbín-Suárez, A., Jacquiod, S., Rohr, A. D., Liu, B., Flachowsky, H., Winkelmann, T., Beerhues, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Vetterlein, D. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 14 s., fiab031.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring microbial determinants of apple replant disease (ARD): a microhabitat approach under split-root design
Balbín-Suárez, A., Lucas, M., Vetterlein, D., Sørensen, Søren Johannes, Winkelmann, T., Smalla, K. & Jacquiod, S., 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 12, 12 s., fiaa211.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The murine lung microbiome in relation to the intestinal and vaginal bacterial communities
Barfod, K. K., Roggenbuck, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Schjørring, S., Larsen, S. T., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2013, I: B M C Microbiology. 13, 12 s., 303.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Alterations of the murine gut microbiome in allergic airway disease are independent of surfactant protein D
Barfod, K. K., Roggenbuck, M., Al-Shuweli, S., Fakih, D., Sørensen, Søren Johannes & Sørensen, G. L., mar. 2017, I: Heliyon. 3, 3, 19 s., e00262.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An Unexpected Location of the Arginine Catabolic Mobile Element (ACME) in a USA300-Related MRSA Strain
Bartels, Mette Damkjær, Hansen, Lars Hestbjerg, Boye, K., Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., 2011, I: P L o S One. 6, 1, 5 s., e16193.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rose replant disease: detailed analyses of plant reactions, root endophytes and rhizosphere microbial communities
Baumann, A., Yim, B., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Acta Horticulturae. 1283, s. 97-104 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Long-term conservation tillage with reduced nitrogen fertilization intensity can improve winter wheat health via positive plant–microorganism feedback in the rhizosphere
Behr, J. H., Kuhl-Nagel, T., Sommermann, L., Moradtalab, N., Chowdhury, S. P., Schloter, M., Windisch, S., Schellenberg, I., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K., Ludewig, U., Neumann, G., Grosch, R. & Babin, D., 2024, I: FEMS Microbiology Ecology. 100, 2, 18 s., fiae003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chlorophyll f-driven photosynthesis in a cavernous cyanobacterium
Behrendt, L., Brejnrod, A. D., Schliep, M., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2015, I: The ISME Journal. 9, 9, s. 2108-2111 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
New ecological niches and habitats for Chlorophyll d- containing cyanobacteria
Behrendt, L., Chen, M., Larkum, A. W. D., Ralph, P. J., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, E. & Kühl, Michael, 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Endolithic chlorophyll d-containing phototrophs
Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Norman, A., Qvortrup, Klaus, Chen, M., Ralph, P., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, Erik & Kühl, Michael, 2011, I: I S M E Journal. 5, 6, s. 1072-6 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
In situ metabolomic- and transcriptomic-profiling of the host-associated cyanobacteria Prochloron and Acaryochloris marina
Behrendt, L., Raina, J., Lutz, A., Kot, W., Albertsen, M., Nielsen, P. H., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 556–567 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity of biofilm communities in microniches associated with the didemnid ascidian Lissoclinum patella
Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Trampe, Erik, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Kühl, Michael, 2012, I: I S M E Journal. 6, s. 1222-1237 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biofilm growth and near infrared radiation-driven photosynthesis of the chlorophyll d-containing cyanobacterium Acaryochloris marina
Behrendt, L., Schrameyer, V., Qvortrup, Klaus, Neves Lundin, A. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 11, s. 3896-3904 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris
Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D., Winther, Jakob R. & Kühl, Michael, 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gut microbiota composition is correlated to grid floor induced stress and behavior in the BALB/c mouse
Bendtsen, K. M. B., Krych, Lukasz, Sørensen, Dorte Bratbo, Pang, W., Nielsen, Dennis Sandris, Josefsen, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Axel Kornerup, 2012, I: P L o S One. 7, 10, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial diversity and PAH catabolic genes tracking spatial heterogeneity of PAH concentrations
Bengtsson, G., Törneman, N., Lipthay, J. R. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Microbial Ecology. 65, 1, s. 91-100 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Selection for Cu-tolerant bacterial communities with altered composition, but unaltered richness, via long-term Cu exposure
Berg, J., Brandt, Kristian Koefoed, Abu Al-Soud, W., Holm, Peter Engelund, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Nybroe, O., 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, s. 7438-7446 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High robustness of soil bacteria and funghi to multifactorial climate change manipulations
Bergmark, L., Haugwitz-Hardenberg-Reventlow, M. S., Sørensen, Søren Johannes & Priemé, Anders, 2012.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
- Udgivet
Assessment of the specificity of Burkholderia and Pseudomonas qPCR assays for detection of these genera in soil using 454 pyrosequencing
Bergmark, L., Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Microbiology Letters. 333, 1, s. 77-84 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Importance of microbial communities at the root-soil interface for extracellular polymeric substances and soil aggregation in semiarid grasslands
Bettermann, A., Zethof, J. H. T., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Kalbitz, K., Smalla, K. & Vogel, C., 2021, I: Soil Biology & Biochemistry. 159, 14 s., 108301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Investigation of diversity of plasmids carrying the blaTEM-52 gene
Bielak, E. M., Bergenholtz, R. D., Jørgensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Hasman, H., 2011, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 66, 11, s. 2465-74 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Manure and Doxycycline Affect the Bacterial Community and Its Resistome in Lettuce Rhizosphere and Bulk Soil
Blau, K., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes, Su, J., Zhu, Y., Smalla, K. & Jechalke, S., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-15 725.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Monitoring and evaluating soil quality
Bloem, J., Schouten, A. J., Sørensen, Søren Johannes, Rutgers, M., van der Werf, A. & Breuer, A. M., 2005, Microbiological methods for assessing soil quality. s. .Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til rapport › Forskning
- Udgivet
- Udgivet
A low-cost, multiplexable, automated flow cytometry procedure for the characterization of microbial stress dynamics in bioreactors
Brognaux, A., Han, S., Sørensen, Søren Johannes, Lebeau, F., Thonart, P. & Delvigne, F., 2013, I: Microbial Cell Factories. 12, 100, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Presence of N-acyl Homoserine Lactones in Soil Detected by a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry
Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg, Oregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Microbial Ecology. 45, 3, s. 226-236 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The presence of embedded bacterial pure cultures in agar plates stimulate the culturability of soil bacteria.
Burmølle, Mette, Johnsen, K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Journal of Microbiological Methods. 79, 2, s. 166-173 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4269
Flest downloads
-
5129
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3026
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2836
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet