Søren Johannes Sørensen
Professor
Microbiology
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- Udgivet
Response of the bacterial community in an on-farm biopurification system, to which diverse pesticides are introduced over an agricultural season
Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Smalla, K., Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, okt. 2017, I: Environmental Pollution. 229, s. 854-862 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing
Holmsgaard, P. N., Poulsen, P., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
The effect of early probiotic exposure on the preterm infant gut microbiome development
Hui, Y., Smith, Birgitte, Mortensen, M. S., Krych, Lukasz, Sørensen, Søren Johannes, Greisen, Gorm, Krogfelt, K. A. & Nielsen, Dennis Sandris, 2021, I: Gut Microbes. 13, 1, 15 s., 1951113.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genomic analysis reveals ecological differentiation in the genus Carnobacterium
Iskandar, C. F., Borges, F., Taminiau, B., Daube, G., Zagorec, M., Remenant, B., Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes, Mangavel, C., Cailliez-Grimal, C. & Revol-Junelles, A., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 14 s., 357.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Artificial selection of stable rhizosphere microbiota leads to heritable plant phenotype changes
Jacquiod, S., Spor, A., Wei, S., Munkager, V., Bru, D., Sørensen, Søren Johannes, Salon, C., Philippot, L. & Blouin, M., 2022, I: Ecology Letters. 25, 1, s. 189-201 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Long-term soil metal exposure impaired temporal variation in microbial metatranscriptomes and enriched active phages
Jacquiod, S., Nunes, I., Brejnrod, A., Hansen, M. A., Holm, Peter Engelund, Johansen, A., Brandt, Kristian Koefoed, Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Microbiome. 6, s. 1-14 223.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deciphering conjugative plasmid permissiveness in wastewater microbiomes
Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Milani, S. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, jul. 2017, I: Molecular Ecology. 26, 13, s. 3556-3571 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Long-term industrial metal contamination unexpectedly shaped diversity and activity response of sediment microbiome
Jacquiod, S. J. A., Cyriaque, V., Riber, Leise, Al-Soud, W. A., Gillan, D. C., Wattiez, R. & Sørensen, Søren Johannes, 15 feb. 2018, I: Journal of Hazardous Materials. 344, s. 299-307 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomes provide valuable comparative information on soil microeukaryotes
Jacquiod, S. J. A., Stenbæk, J., Santos, S. S., Winding, A., Sørensen, Søren Johannes & Priemé, Anders, 2016, I: Research in Microbiology. 167, 5, s. 436-450 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial community analysis for investigating bacterial transfer from tonsils to the pig carcass
Jakobsen, A. M., Bahl, M. I., Buschhardt, T., Hansen, T. B., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Nesbakken, T. & Aabo, S., 2019, I: International Journal of Food Microbiology. 295, s. 8-18 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterisation, dissemination and persistence of gentamicin resistant Escherichia coli from a Danish university hospital to the waste water environment
Jakobsen, L., Sandvang, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Bagger-Skjøt, L., Westh, Henrik T., Jørgensen, C., Hansen, D. S., Pedersen, B. M., Monnet, D. L., Frimodt-Møller, N., Sørensen, Søren Johannes & Hammerum, A. M., 2008, I: Environment International. 34, 1, s. 108-15 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Jakobsen, T. H., Hansen, M. A., Jensen, P. Ø., Hansen, L., Riber, L., Cockburn, A. P. I., Kolpen, M., Hansen, C. R., Ridderberg, W., Eickhardt-Sørensen, S. R., Hansen, M., Kerpedjiev, P., Alhede, M., Qvortrup, K., Burmølle, M., Moser, C. E., Kühl, M., Ciofu, O., Givskov, M., Sørensen, S. J. & 2 flere, , 2013, I: P L o S One. 8, 7, 17 s., e68484.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmid metagenomics reveals multiple antibiotic resistance gene classes among the gut microbiomes of hospitalised patients
Jitwasinkul, T., Suriyaphol, P., Tangphatsornruang, S., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Permpikul, C., Rongrungruang, Y. & Tribuddharat, C., 2016, I: Journal of Global Antimicrobial Resistance. 6, s. 57-66 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan
Johansen, Joachim, Atarashi, K., Arai, Y., Hirose, N., Sørensen, Søren Johannes, Vatanen, T., Knip, M., Honda, K., Xavier, R. J., Rasmussen, Simon & Plichta, D. R., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1064-1078 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome binning of viral entities from bulk metagenomics data
Johansen, Joachim, Plichta, D. R., Nissen, J. N., Jespersen, Marie Louise, Shah, S. A., Deng, Ling, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes & Rasmussen, Simon, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 965.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Microbial degradation of street dust polycyclic aromatic hydrocarbons in microcosms simulating diffuse pollution of urban soil.
Johnsen, A. R., de Lipthay, J. R., Sørensen, Søren Johannes, Ekelund, Flemming, Christensen, P., Andersen, O., Karlson, U. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Microbiology. 8, 3, s. 535-45 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biodegradation, bioaccessibility and genotoxicity of diffuse polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH) pollution at a motorway site
Johnson, A. R., Lipthay, J. R. D., Reichenberg, F., Sørensen, Søren Johannes, Andersen, O., Christensen, P., Binderup, M. & Jacobsen, C. S., 2006, I: Environmental Science & Technology (Washington). 40, 10, s. 3293-3298Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Legacy Effects on the Recovery of Soil Bacterial Communities from Extreme Temperature Perturbation
Jurburg, S. D., Nunes, I. M., Brejnrod, A. D., Jacquiod, S. J. A., Priemé, Anders, Sørensen, Søren Johannes, Van Elsas, J. D. & Salles, J. F., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 13 s., 1832.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Autogenic succession and deterministic recovery following disturbance in soil bacterial communities
Jurburg, S. D., Nunes, I. M., Stegen, J. C., Le Roux, X., Priemé, Anders, Sørensen, Søren Johannes & Salles, J. F., 6 apr. 2017, I: Scientific Reports. 7, 11 s., 45691.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Plasmids, viruses, and other circular elements in rat gut
Jørgensen, T. S., Hansen, M. A., Xu, Z., Tabak, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 30 s.Publikation: Working paper › Forskning
- Udgivet
Current strategies for mobilome research
Jørgensen, T. S., Kiil, A. S., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Frontiers in Microbiology. 5, 6 s., 750.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hundreds of circular novel plasmids and DNA elements identified in a rat cecum metamobilome
Jørgensen, T. S., Xu, Z., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: P L o S One. 9, 2, 9 s., e87924.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Free-Living Nematodes Together With Associated Microbes Play an Essential Role in Apple Replant Disease
Kanfra, X., Liu, B., Beerhues, L., Sørensen, Søren Johannes & Heuer, H., 2018, I: Frontiers in Plant Science. 9, s. 1-13 1666.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production
Kang, D., Shoaie, S., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Ledesma-Amaro, R., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 15 s., 1042.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Construction of Simplified Microbial Consortia to Degrade Recalcitrant Materials Based on Enrichment and Dilution-to-Extinction Cultures
Kang, D., Jacquiod, S., Herschend, J., Wei, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 10 s., 3010.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms
Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enrichment and characterization of an environmental microbial consortium displaying efficient keratinolytic activity
Kang, D., Herschend, J., Abu Al-Soud, W., Mortensen, M. S., Gonzalo, M., Jacquiod, S. J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Bioresource Technology. 270, s. 303-310Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Unravelling plasmidome distribution and interaction with its hosting microbiome
Kav, A. B., Rozov, R., Bogumil, D., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Benhar, I., Halperin, E., Shamir, R. & Mizrahi, I., 2020, I: Environmental Microbiology. 22, 1, s. 32-44Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacterial chitinolytic communities respond to chitin and pH alteration in soil
Kielak, A., Cretoiu, M., Semenov, A., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 1, s. 263-272 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rifaximin has minor effects on bacterial composition, inflammation and bacterial translocation in cirrhosis: a randomized trial
Kimer, N., Pedersen, J. S., Tavenier, J., Christensen, J. E., Busk, T. M., Hobolth, L., Krag, A., Abu Al-Soud, W., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Møller, Søren & Bendtsen, Flemming, jan. 2018, I: Journal of Gastroenterology and Hepatology. 33, 1, s. 307-314 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metal stressors consistently modulate bacterial conjugal plasmid uptake potential in a phylogenetically conserved manner
Klümper, U., Dechesne, A., Riber, Leise, Brandt, Kristian Koefoed, Gülay, A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 152-165 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Broad host range plasmids can invade an unexpectedly diverse fraction of a soil bacterial community
Klümper, U., Riber, Leise, Dechesne, A., Sannazzaro, A. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2015, I: I S M E Journal. 9, s. 934-945 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
- Udgivet
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete genome sequences of four novel Lactococcus lactis phages distantly related to the Rare 1706 Phage Species
Kot, Witold, Neve, H., Vogensen, Finn Kvist, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00265-14.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque
Kot, Witold, Vogensen, Finn Kvist, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of root exudates and bacterial metabolic activity on conjugal gene transfer in the rhizosphere of a marsh plant
Kroer, Niels, Barkay, T., Sørensen, Søren Johannes & Weber, D., 1998, I: FEMS Microbiology Ecology. 25, 4, s. 375-384 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of root exudates and bacterial metabolic activity on conjugal gene transfer in the rhizosphere of a marsch plant
Kroer, Niels, Barkay, T., Sørensen, Søren Johannes & Weber, D., 1998, I: FEMS Microbiology Ecology. 25, s. 375-384Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Novel and conserved bacterial mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine
Kroer, Niels, Møller, A., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
- Udgivet
Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition
Kurilshikov, A., Medina-Gomez, C., Bacigalupe, R., Radjabzadeh, D., Wang, J., Demirkan, A., Le Roy, C. I., Raygoza Garay, J. A., Finnicum, C. T., Liu, X., Zhernakova, D. V., Bonder, M. J., Hansen, T. H., Frost, F., Rühlemann, M. C., Turpin, W., Moon, J. Y., Kim, H. N., Lüll, K., Barkan, E. & 84 flere, , 2021, I: Nature Genetics. 53, s. 156-165 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecology and photobiology of chlorophyll d-containing cyanobacteria
Kühl, Michael, Behrendt, L., Trampe, Erik, Sørensen, Søren Johannes, Chen, M., Qvortrup, K. & Larkum, A., 2012.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
- Udgivet
Predominant genera of fecal microbiota in children with atopic dermatitis are not altered by intake of probiotic bacteria Lactobacillus acidophilus NCFM and Bifidobacterium animalis subsp.lactis Bi-07
Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, Gøbel, R. J., Michaelsen, Kim F., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2011, I: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, s. 482-496 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effect of L. acidophilus NCFM intake on insulin sensitivity and gut microbiota: a randomized placebo-controlled trial
Larsen, Nadja, Andreasen, A. S., Pedersen-Skovsgaard, T., Møller, K., van den Berg, F. W. J., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Pedersen, Bente Klarlund & Jakobsen, M., sep. 2010.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van der Berg, Franciscus Winfried J, Nielsen, Dennis Sandris, Andreasen, Anne Sofie, Pedersen, Bente Klarlund, Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010, I: PLoS ONE. 5, 2, s. e9085 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Urbanized microbiota in infants, immune constitution and later risk of atopic diseases
Lehtimäki, J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Hjelmsø, M., Shah, S., Mortensen, M. S., Trivedi, Urvish, Vestergaard, G., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Brix, S., Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2021, I: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 148, 1, s. 234-243 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fungi and bacteria in the beds of rural and urban infants correlate with later risk of atopic diseases
Lehtimäki, J., Gupta, S., Hjelmsø, M., Shah, S., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Soverini, M., Li, Xuan Ji, Russel, J., Trivedi, Urvish, Brix, S., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Clinical and Experimental Allergy. 53, 12, s. 1268-1278 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome sequence of the lactic acid bacterium, Carnobacterium maltaromaticum ATCC 35586 encodes potential virulence factors
Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Larsen, M. H., Hansen, L., Ingmer, Hanne & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 152, 3, s. 107-115 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The lactic acid bacterium, Carnobacterium maltaromaticum possess a diverse range of potential virulence genes some of which are related to similar genes in Listeria monocytogenes
Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Larsen, M. H., Ingmer, Hanne, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2010.Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
ID: 4269
Flest downloads
-
5133
downloads
Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
3027
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
2838
downloads
Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet