Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. 2011
  2. Udgivet

    An Unexpected Location of the Arginine Catabolic Mobile Element (ACME) in a USA300-Related MRSA Strain

    Bartels, Mette Damkjær, Hansen, Lars Hestbjerg, Boye, K., Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., 2011, I: P L o S One. 6, 1, 5 s., e16193.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Biofilms in soil

    Burmølle, Mette, Kjøller, Annelise Helene & Sørensen, Søren Johannes, 2011, Encyclopedia of agrophysics. Springer, s. 70-75 6 s. (Encyclopedia of Earth Sciences Series).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportEncyclopædiartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Characterization of bacterial populations in Danish raw milk cheeses made with different starter cultures by denaturating gradient gel electrophoresis and pyrosequencing

    Masoud, W. M. H., Takamiya, M. K. W., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2011, I: International Dairy Journal. 21, 3, s. 142-148 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet
  6. Udgivet

    Construction of biosensors to investigate physiological diversity in fermentation processes

    Han, S., Lundin, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2011.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  7. Udgivet

    Endolithic chlorophyll d-containing phototrophs

    Behrendt, L., Larkum, A. W. D., Norman, A., Qvortrup, Klaus, Chen, M., Ralph, P., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, Erik & Kühl, Michael, 2011, I: I S M E Journal. 5, 6, s. 1072-6 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Experimental methods and modeling techniques for description of cell population heterogeneity

    Lencastre Fernandes, R., Nierychlo, M., Lundin, L., Pedersen, A. E., Tellez, P. E. P., Dutta, A., Carlquist, M., Bolic, A., Schäpper, D., Brunetti, A. C., Helmark, S., Heins, A-L., Jensen, A. D., Nopens, I., Rottwitt, K., Szita, N., Elsas, J. D. V., Nielsen, P. H., Martinussen, J., Sørensen, S. J. & 2 flere, Eliasson Lantz, A. & Gernaey, K., 2011, I: Biotechnology Advances. 29, 6, s. 575-599 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Green fluorescent protein (GFP) leakage from microbial biosensors provides useful information for the evaluation of the scale-down effect

    Delvigne, F., Brognaux, A., Francis, F., Twizere, J., Gorret, N., Sørensen, Søren Johannes & Thonart, P., 2011, I: Biotechnology Journal. 6, 8, s. 968-978 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Investigation of diversity of plasmids carrying the blaTEM-52 gene

    Bielak, E. M., Bergenholtz, R. D., Jørgensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Hasman, H., 2011, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 66, 11, s. 2465-74 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet
  12. Udgivet

    Nitrogenase gene amplicons from global marine surface waters are dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A. F., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Steward, G. F., Hagström, Å. & Riemann, Lasse, 2011, I: P L o S One. 6, 4, s. e19223 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Predominant genera of fecal microbiota in children with atopic dermatitis are not altered by intake of probiotic bacteria Lactobacillus acidophilus NCFM and Bifidobacterium animalis subsp.lactis Bi-07

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, Gøbel, R. J., Michaelsen, Kim F., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2011, I: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, s. 482-496 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Quantitative metagenomic analyses based on average genome size normalization

    Frank, J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2011, I: Applied and Environmental Microbiology. 77, 7, s. 2513-2521 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  16. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  17. 2010
  18. Udgivet

    Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing

    Holmsgaard, P. N., Poulsen, P., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  19. Udgivet

    Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Filed Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  20. Udgivet

    The effect of L. acidophilus NCFM intake on insulin sensitivity and gut microbiota: a randomized placebo-controlled trial

    Larsen, Nadja, Andreasen, A. S., Pedersen-Skovsgaard, T., Møller, K., van den Berg, F. W. J., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Pedersen, Bente Klarlund & Jakobsen, M., sep. 2010.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  21. Udgivet
  22. Udgivet

    Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing

    Holmsgaard, P. N., Poulsen, P. H. B., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  23. Udgivet

    Metamobilomics - Expanding the environmental mobilome with high throughput sequencing

    Norman, A., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  24. Udgivet

    The Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Field Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  25. Udgivet

    Probing Barophilic Microbial Communities for Novel Proteolytic Enzymes

    Frank, J. A., Hansen, M. A. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  26. Udgivet

    All equal, all different?

    Han, S., Lundin, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  27. Udgivet

    Biofilms in chronic infections - a matter of opportunity - monospecies biofilms in multispecies infections

    Burmølle, Mette, Thomsen, T. R., Fazli, M., Dige, I., Christensen, L., Homøe, Preben, Tvede, M., Nyvad, B., Tolker-Nielsen, Tim, Givskov, Michael, Moser, Claus Ernst, Kirketerp-Møller, K., Johansen, Helle Krogh, Høiby, Niels, Jensen, Peter Østrup, Sørensen, Søren Johannes & Bjarnsholt, Thomas, 2010, I: FEMS Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 324-336 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet
  29. Udgivet

    Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van der Berg, Franciscus Winfried J, Nielsen, Dennis Sandris, Andreasen, Anne Sofie, Pedersen, Bente Klarlund, Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010, I: PLoS ONE. 5, 2, s. e9085 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    New ecological niches and habitats for Chlorophyll d- containing cyanobacteria

    Behrendt, L., Chen, M., Larkum, A. W. D., Ralph, P. J., Sørensen, Søren Johannes, Trampe, E. & Kühl, Michael, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  31. Udgivet

    The gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Nielsen, Dennis Sandris, Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van den Berg, F. W. J., Andreasen, A. S., Pedersen, B. K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  32. Udgivet
  33. Udgivet

    The nitrogenase gene pool in surface waters of the global ocean is dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Hagström & Riemann, Lasse, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  34. 2009
  35. Udgivet

    All IncP-1 plasmid subgroups, including the novel e subgroup, are prevalent in the influent of a Danish wastewater treatment plant

    Bahl, M. I., Burmølle, Mette, Meisner, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Plasmid. 62, 2, s. 134-139 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Conjugative plasmids: Vessels of the communal gene pool

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 364, 1527, s. 2275-2289 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Construction and Use of Flow Cytometry Optimized Plasmid-Sensor Strains: Genomes in Flux

    Bahl, M. I., Oregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2009, Horizontal Gene Transfer. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 257-268 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  38. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  39. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  40. Udgivet

    Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  41. Udgivet

    The presence of embedded bacterial pure cultures in agar plates stimulate the culturability of soil bacteria.

    Burmølle, Mette, Johnsen, K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Journal of Microbiological Methods. 79, 2, s. 166-173 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. 2008
  43. Udgivet

    Acclimation of subsurface microbial communities to mercury

    de Lipthay, J. R., Rasmussen, L. D., Øregaard, G., Simonsen, K., Bahl, M. I., Kroer, Niels & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: FEMS Microbiology Ecology. 65, 1, s. 145-55 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Characterisation, dissemination and persistence of gentamicin resistant Escherichia coli from a Danish university hospital to the waste water environment

    Jakobsen, L., Sandvang, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Bagger-Skjøt, L., Westh, Henrik T., Jørgensen, C., Hansen, D. S., Pedersen, B. M., Monnet, D. L., Frimodt-Møller, N., Sørensen, Søren Johannes & Hammerum, A. M., 2008, I: Environment International. 34, 1, s. 108-15 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Cultivation of hard-to-culture subsurface mercury-resistant bacteria and discovery of new merA gene sequences

    Rasmussen, L. D., Zawadsky, C., Binnerup, S. J., Øregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Kroer, Niels, 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 12, s. 3795-803 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Nucleotide sequence of pOLA52: a conjugative IncX1 plasmid from Escherichia coli which enables biofilm formation and multidrug efflux

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, She, Q. & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: Plasmid. 60, 1, s. 59-74 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Type 3 fimbriae, encoded by the conjugative plasmid pOLA52, enhance biofilm formation and transfer frequencies in Enterobacteriaceae strains

    Burmølle, Mette, Bahl, M. I., Jensen, L. B., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2008, I: Microbiology. 154, Pt 1, s. 187-95 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. 2007
  49. Udgivet

    Conjugative transfer facilitates stable maintenance of IncP-1 plasmid pKJK5 in Escherichia coli cells colonizing the gastrointestinal tract of the germfree rat

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Applied and Environmental Microbiology. 73, 1, s. 341-343

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Establishment and early succession of a multispecies biofilm composed of soil bacteria

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Microbial Ecology. 54, 2, s. 352-62 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Impact of conjugal transfer on the stability of IncP-1 plasmid pKJK5 in bacterial populations

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: FEMS Microbiology Letters. 266, s. 250-256

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Substrate specificity of the OqxAB multidrug resistance pump in Escherichia coli and selected enteric bacteria

    Hansen, Lars Hestbjerg, Jensen, L. B., Sørensen, H. I. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 60, 1, s. 145-147

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    The cda GenoTox assay: A new sensitive method for detection of environmental genotoxins, including nitroarenes and aromatic amines

    Østergaard, T. G., Hansen, Lars Hestbjerg, Binderup, M., Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Mutation Research - Reviews. 631, 2, s. 77-84

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    The multiple antibiotic resistance IncP-1 plasmid pKJK5 isolated from a soil environment is phylogenetically divergent from members of the previously established a, ß and d sub-groups

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Goesmann, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Plasmid. 58, 1, s. 31-43

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. 2006
  56. Udgivet

    A flow cytometry-optimized assay using an SOS-green fluorescent protein (SOS-GFP) whole-cell biosensor for the detection of genotoxins in complex environments

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Mutation Research - Reviews. 603, 2, s. 164-172 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269