Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. 2014
  2. Udgivet

    An improved method for including upper size range plasmids in metamobilomes

    Norman, A., Riber, Leise, Luo, W., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, 12 s., e104405.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Bioinformatic approaches reveal metagenomic characterization of soil microbial community

    Xu, Z., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Jacquiod, S. J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: P L o S One. 9, 4, 11 s., e93445.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Characterization of the gut microbiota in leptin deficient obese mice: correlation to inflammatory and diabetic parameters

    Ellekilde, M., Krych, Lukasz, Hansen, Camilla Hartmann Friis, Hufeldt, M. R., Dahl, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Research in Veterinary Science. 96, 2, s. 241-250 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Complete genome sequences of four novel Lactococcus lactis phages distantly related to the Rare 1706 Phage Species

    Kot, Witold, Neve, H., Vogensen, Finn Kvist, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00265-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque

    Kot, Witold, Vogensen, Finn Kvist, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Draft genome sequence of Burkholderia sordidicola S170, a potential plant growth promoter isolated from coniferous forest soil in the Czech Republic

    Lladó, S., Xu, Z., Sørensen, Søren Johannes & Baldrian, P., 2014, I: Genome Announcements. 2, 4, 2 s., e00810-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Exploring the immediate and long-term impact on bacterial communities in soil amended with animal and urban organic waste fertilizers using pyrosequencing and screening for horizontal transfer of antibiotic resistance

    Riber, Leise, Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. B. S., Bergmark, L., Brejnrod, A. D., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 206-224 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Genome sequences of two Leuconostoc pseudomesenteroides strains isolated from Danish dairy starter cultures

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, s. 2 e00484-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    High-throughput screening of multispecies biofilm formation and quantitative PCR-based assessment of individual species proportions, useful for exploring interspecific bacterial interactions

    Ren, D., Madsen, Jonas Stenløkke, de la Cruz Perera, C. I., Bergmark, L., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2014, I: Microbial Ecology. 68, 1, s. 146-154 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Host-specific microbial communities in three sympatric North Sea sponges

    Naim, M. A., Morillo, J. A., Sørensen, Søren Johannes, Abu Al-Soud, W., Smidt, H. & Sipkema, D., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 2, s. 390-403 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Hundreds of circular novel plasmids and DNA elements identified in a rat cecum metamobilome

    Jørgensen, T. S., Xu, Z., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, L. H., 2014, I: P L o S One. 9, 2, 9 s., e87924.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

    Nielsen, H. B., Almeida, M., Juncker, A., Rasmussen, S., Li, J., Sunagawa, S., Plichta, D. R., Gautier, L., Pedersen, A. G., Le Chatelier, E., Pelletier, E., Bonde, I., Nielsen, T., Manichanh, C., Arumugam, M., Batto, J-M., dos Santos, M. B. Q., Blom, N., Borruel, N., Burgdorf, K. S. & 31 flere, Boumezbeur, F., Casellas, F., Doré, J., Dworzynski, P., Guarner, F., Hansen, Torben, Hildebrand, F., Kaas, R. S., Kennedy, S., Kristiansen, Karsten, Kultima, J. R., Léonard, P., Levenez, F., Lund, O., Moumen, B., Le Paslier, D., Pons, N., Pedersen, Oluf Borbye, Prifti, E., Qin, J., Raes, J., Sørensen, Søren Johannes, Tap, J., Tims, S., Ussery, D., Yamada, T., Renault, P., Sicheritz-Pontén, T., Bork, P., Wang, J. & MetaHIT Consortium, M. C., 2014, I: Nature Biotechnology. 32, 8, s. 822–828 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Identifying the core microbial community in the gut of fungus-growing termites

    Otani, S., Mikaelyan, A., Nobre, T., Hansen, Lars Hestbjerg, Koné, N. A., Sørensen, Søren Johannes, Aanen, D. K., Boomsma, Jacobus J., Brune, A. & Poulsen, Michael, 2014, I: Molecular Ecology. 23, 18, s. 4631–4644 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Interactions in multispecies biofilms: do they actually matter?

    Burmølle, Mette, Ren, D., Bjarnsholt, Thomas & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Microbiology. 22, 2, s. 84-91 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Loss of microbial diversity in soils is coincident with reductions in some specialized functions

    Singh, B. K., Quince, C., Macdonald, C. A., Khachane, A., Thomas, N., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, He, Z., White, D., Sinclair, A., Crooks, B., Zhou, J. & Campbell, C. D., 2014, I: Environmental Microbiology. 16, 8, s. 2408-2420 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

    Møller, A. K., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Boyd, E. S. & Kroer, Niels, 2014, I: FEMS Microbiology Ecology. 87, 1, s. 52-63 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Metabolic variability in bioprocessing: implications of microbial phenotypic heterogeneity

    Delvigne, F., Zune, Q., Lara, A. R., Abu Al-Soud, W. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: Trends in Biotechnology. 32, 12, s. 608-616 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Methanotrophs, methanogens and microbial community structure in livestock slurry surface crusts

    Duan, Y. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Elsgaard, L., Petersen, S. O. & Boon, N., 2014, I: Journal of Applied Microbiology. 117, 4, s. 1066-1078 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris

    Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D., Winther, Jakob R. & Kühl, Michael, 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Sequentially aerated membrane biofilm reactors for autotrophic nitrogen removal: microbial community composition and dynamics

    Pellicer i Nàcher, C., Franck, S., Gülay, A., Ruscalleda, M., Terada, A., Abu Al-Soud, W., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2014, I: Microbial Biotechnology. 7, 1, s. 32-43 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Shifts in abundance and diversity of mobile genetic elements after the introduction of diverse pesticides into an on-farm biopurification system over the course of a year

    Dealtry, S., Holmsgaard, P. N., Dunon, V., Jechalke, S., Ding, G., Kroegerrecklenfort, E., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Zuehlke, S., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 13, s. 4012-4020 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Synbiotic Lactobacillus acidophilus NCFM and cellobiose does not affect human gut bacterial diversity but increases abundance of lactobacilli, bifidobacteria and branched-chain fatty acids: a randomized, double-blinded cross-over trial

    van Zanten, G. C., Krych, Lukasz, Röytiö, H., Forssten, S., Lahtinen, S. J., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Svensson, B., Jespersen, Lene & Jakobsen, M., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 225-236 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    The giraffe (Giraffa camelopardalis) rumen microbiome

    Roggenbuck, M., Sauer, C., Poulsen, M., Bertelsen, M. F. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 237-246 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    The microbiome of New World vultures

    Roggenbuck, M., Schnell, I. B., Blom, N., Bælum, J., Bertelsen, M. F., Sicheritz-Pontén, T., Sørensen, Søren Johannes, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R. & Hansen, L. H., 2014, I: Nature Communications. 5, 7 s., 5498.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269