Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. 2017
  2. Udgivet

    A meta-proteomics approach to study the interspecies interactions affecting microbial biofilm development in a model community

    Herschend, J., Damholt, Z. B. V., Marquard, A. M., Svensson, B., Sørensen, Søren Johannes, Hägglund, Per Mårten & Burmølle, Mette, 28 nov. 2017, I: Scientific Reports. 7, 13 s., 16483.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Community structure of the metabolically active rumen bacterial and archaeal communities of dairy cows over the transition period

    Zhu, Z., Noel, S. J., Difford, G. F., Abu Al-Soud, W., Brejnrod, A. D., Sørensen, Søren Johannes, Lassen, J., Løvendahl, P. & Højberg, O., 8 nov. 2017, I: PLoS ONE. 12, 11, 24 s., e0187858.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A novel baiting microcosm approach used to identify the bacterial community associated with Penicillium bilaii hyphae in soil

    Ghodsalavi, B., Svenningsen, N. B., Hao, X., Olsson, S., Nicolaisen, Mette Haubjerg, Al-Soud, W. A., Sørensen, Søren Johannes & Nybroe, O., 27 okt. 2017, I: PLOS ONE. 12, 10, 14 s., e0187116.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Antagonism correlates with metabolic similarity in diverse bacteria

    Russel, J., Røder, Henriette Lyng, Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 3 okt. 2017, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 114, 40, s. 10684-10688 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Response of the bacterial community in an on-farm biopurification system, to which diverse pesticides are introduced over an agricultural season

    Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Smalla, K., Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, okt. 2017, I: Environmental Pollution. 229, s. 854-862 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Effects of soil pre-treatment with Basamid© granules, Brassica juncea, Raphanus sativus, and Tagetes patula on bacterial and fungal communities at two apple replant disease sites

    Yim, B., Nitt, H., Wrede, A., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Winkelmann, T. & Smalla, K., 1 sep. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 15 s., 1604.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Deciphering conjugative plasmid permissiveness in wastewater microbiomes

    Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Milani, S. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, jul. 2017, I: Molecular Ecology. 26, 13, s. 3556-3571 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Microbiomes associated with infective stages of root-knot and lesion nematodes in soil

    Elhadyl, A., Giné, A., Topalovic, O., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Javier Sorribas, F. & Heuer, H., 4 maj 2017, I: PLoS ONE. 12, 5, 17 s., e0177145.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Autogenic succession and deterministic recovery following disturbance in soil bacterial communities

    Jurburg, S. D., Nunes, I. M., Stegen, J. C., Le Roux, X., Priemé, Anders, Sørensen, Søren Johannes & Salles, J. F., 6 apr. 2017, I: Scientific Reports. 7, 11 s., 45691.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Alterations of the murine gut microbiome in allergic airway disease are independent of surfactant protein D

    Barfod, K. K., Roggenbuck, M., Al-Shuweli, S., Fakih, D., Sørensen, Søren Johannes & Sørensen, G. L., mar. 2017, I: Heliyon. 3, 3, 19 s., e00262.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    A post-planktonic era of in vitro infectious models: issues and changes addressed by a clinically relevant wound like media

    Trivedi, Urvish, Madsen, Jonas Stenløkke, Rumbaugh, K. P., Wolcott, R. D., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2017, I: Critical Reviews in Microbiology. 43, 4, s. 453-465 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Comparative genomic analysis reveals ecological differentiation in the genus Carnobacterium

    Iskandar, C. F., Borges, F., Taminiau, B., Daube, G., Zagorec, M., Remenant, B., Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes, Mangavel, C., Cailliez-Grimal, C. & Revol-Junelles, A., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 14 s., 357.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Critical Assessment of Metagenome Interpretation: a benchmark of metagenomics software

    Sczyrba, A., Hofmann, P., Belmann, P., Koslicki, D., Janssen, S., Dröge, J., Gregor, I., Majda, S., Fiedler, J., Dahms, E., Bremges, A., Fritz, A., Garrido-Oter, R., Jørgensen, T. S., Shapiro, N., Blood, P. D., Gurevich, A., Bai, Y., Turaev, D., DeMaere, M. Z. & 47 flere, Chikhi, R., Nagarajan, N., Quince, C., Meyer, F., Balvociute, M., Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Chia, B. K. H., Denis, B., Froula, J. L., Wang, Z., Egan, R., Kang, D. D., Cook, J. J., Deltel, C., Beckstette, M., Lemaitre, C., Peterlongo, P., Rizk, G., Lavenier, D., Wu, Y., Singer, S. W., Jain, C., Strous, M., Klingenberg, H., Meinicke, P., Barton, M. D., Lingner, T., Lin, H., Liao, Y., Silva, G. G. Z., Cuevas, D. A., Edwards, R. A., Saha, S., Piro, V. C., Renard, B. Y., Pop, M., Klenk, H., Göker, M., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Vorholt, J. A., Schulze-Lefert, P., Rubin, E. M., Darling, A. E., Rattei, T. & McHardy, A. C., 2017, I: Nature Methods. 14, 11, s. 1063-1071 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Distinct gene expression profile of Xanthomonas retroflexus engaged in synergistic multispecies biofilm formation

    Hansen, L. B. S., Ren, D., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 300-303 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    It is elemental: soil nutrient stoichiometry drives bacterial diversity

    Delgado-Baquerizo, M., Reich, P. B., Khachane, A. N., Campbell, C. D., Thomas, N., Freitag, T. E., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Bardgett, R. D. & Singh, B. K., 2017, I: Environmental Microbiology. 19, 3, s. 1176-1188 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Legacy Effects on the Recovery of Soil Bacterial Communities from Extreme Temperature Perturbation

    Jurburg, S. D., Nunes, I. M., Brejnrod, A. D., Jacquiod, S. J. A., Priemé, Anders, Sørensen, Søren Johannes, Van Elsas, J. D. & Salles, J. F., 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 13 s., 1832.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Low-abundant species facilitates specific spatial organization that promotes multispecies biofilm formation

    Liu, W., Russel, J., Røder, Henriette Lyng, Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2017, I: Environmental Microbiology. 19, 7, s. 2893-2905 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures

    Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, Lukasz, Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, Finn Kvist, 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Metal stressors consistently modulate bacterial conjugal plasmid uptake potential in a phylogenetically conserved manner

    Klümper, U., Dechesne, A., Riber, Leise, Brandt, Kristian Koefoed, Gülay, A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 152-165 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Plasmids, viruses, and other circular elements in rat gut

    Jørgensen, T. S., Hansen, M. A., Xu, Z., Tabak, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 30 s.

    Publikation: Working paperForskning

  22. Udgivet

    Whole-genome sequence of Pseudomonas fluorescens EK007-RG4, a promising biocontrol agent against a broad range of bacteria, including the fire blight bacterium Erwinia amylovora

    Habibi, R., Tarighi, S., Behravan, J., Taheri, P., Kjøller, Annelise Helene, Brejnrod, A. D., Madsen, Jonas Stenløkke & Sørensen, Søren Johannes, 2017, I: Genome Announcements. 5, 13, 2 s., e00026-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269