Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. 2018
  2. Udgivet

    Staphylococcus aureus coagulases are exploitable yet stable public goods in clinically relevant conditions

    Trivedi, Urvish, Madsen, Jonas Stenløkke, Everett, J., Fell, C., Russel, J., Haaber, J., Crosby, H. A., Horswill, A. R., Burmølle, Mette, Rumbaugh, K. P. & Sørensen, Søren Johannes, 11 dec. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 50, s. E11771-E11779

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Enhanced bacterial mutualism through an evolved biofilm phenotype

    Røder, Henriette Lyng, Herschend, J., Russel, J., Andersen, M. F., Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 1 nov. 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 2608-2618 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A culture-independent method for studying transfer of IncI1 plasmids from wild-type Escherichia coli in complex microbial communities

    Anjum, M., Madsen, Jonas Stenløkke, Espinosa-Gongora, C., Jana, B., Wiese, M., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Moodley, Arshnee, Bortolaia, V. & Guardabassi, Luca, sep. 2018, I: Journal of Microbiological Methods. 152, s. 18-26 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Estimating the Transfer Range of Plasmids Encoding Antimicrobial Resistance in a Wastewater Treatment Plant Microbial Community

    Li, L., Dechesne, A., He, Z., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 8 maj 2018, I: Environmental Science & Technology Letters. 5, 5, s. 260-265 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Genetic barcoding of dark-spored myxomycetes (Amoebozoa): identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studies

    Dahl, M. B., Brejnrod, A. D., Unterseher, M., Hoppe, T., Feng, Y., Novozhilov, Y., Sørensen, Søren Johannes & Schnittler, M., mar. 2018, I: Molecular Ecology Resources. 18, 2, s. 306-318 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Long-term industrial metal contamination unexpectedly shaped diversity and activity response of sediment microbiome

    Jacquiod, S. J. A., Cyriaque, V., Riber, Leise, Al-Soud, W. A., Gillan, D. C., Wattiez, R. & Sørensen, Søren Johannes, 15 feb. 2018, I: Journal of Hazardous Materials. 344, s. 299-307 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Soil bacteria show different tolerance ranges to an unprecedented disturbance

    Nunes, I. M., Jurburg, S., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Falcão Salles, J., Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, feb. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 2, s. 189–202 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Microbial indicators for soil quality

    Schloter, M., Nannipieri, P., Sørensen, Søren Johannes & van Elsas, J. D., jan. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 1, s. 1-10 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Rifaximin has minor effects on bacterial composition, inflammation and bacterial translocation in cirrhosis: a randomized trial

    Kimer, N., Pedersen, J. S., Tavenier, J., Christensen, J. E., Busk, T. M., Hobolth, L., Krag, A., Abu Al-Soud, W., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Møller, Søren & Bendtsen, Flemming, jan. 2018, I: Journal of Gastroenterology and Hepatology. 33, 1, s. 307-314 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    In situ metabolomic- and transcriptomic-profiling of the host-associated cyanobacteria Prochloron and Acaryochloris marina

    Behrendt, L., Raina, J., Lutz, A., Kot, W., Albertsen, M., Nielsen, P. H., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 556–567 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    An intriguing relationship between the cyclic diguanylate signaling system and horizontal gene transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Hylling, Ole, Jacquiod, S. J. A., Pécastaings, S., Hansen, L. H., Riber, Leise, Vestergaard, G. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: ISME Journal. 12, 9, s. 2330-2334 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Bacterial social interactions and the emergence of community-intrinsic properties

    Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2018, I: Current Opinion in Microbiology. 42, s. 104-109 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Bulk soil and maize rhizosphere resistance genes, mobile genetic elements and microbial communities are differently impacted by organic and inorganic fertilization

    Wolters, B., Jacquiod, S. J. A., Sørensen, Søren Johannes, Widyasari-Mehta, A., Bech, T. B., Kreuzig, R. & Smalla, K., 2018, I: F E M S Microbiology Ecology. 94, 4, 13 s., fiy027.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Changes in rumen bacterial and archaeal communities over the transition period in primiparous Holstein dairy cows

    Zhu, Z., Kristensen, L., Difford, G. F., Poulsen, M., Noel, S. J., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Lassen, J., Løvendahl, P. & Højberg, O., 2018, I: Journal of Dairy Science. 101, 11, s. 9847-9862

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Enrichment and characterization of an environmental microbial consortium displaying efficient keratinolytic activity

    Kang, D., Herschend, J., Abu Al-Soud, W., Mortensen, M. S., Gonzalo, M., Jacquiod, S. J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Bioresource Technology. 270, s. 303-310

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Fluorescence recovery allows theimplementation of a fluorescence reporter gene platform applicable for the detection and quantification of horizontal gene transfer in anoxic environments

    Pinilla Redondo, Rafael, Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 6, 9 s., e02507-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Free-Living Nematodes Together With Associated Microbes Play an Essential Role in Apple Replant Disease

    Kanfra, X., Liu, B., Beerhues, L., Sørensen, Søren Johannes & Heuer, H., 2018, I: Frontiers in Plant Science. 9, s. 1-13 1666.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    How Microbial Aggregates Protect against Nanoparticle Toxicity

    Tang, J., Wu, Y., Esquivel-Elizondo, S., Sørensen, Søren Johannes & Rittmann, B. E., 2018, I: Trends in Biotechnology. 36, 11, s. 1171-1182

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Investigation of the bacteriophage community in induced lysates of undefined mesophilic mixed-strain DL-cultures using classical and metagenomic approaches

    Muhammed, Musemma Kedir, Olsen, M. L., Kot, Witold, Neve, H., Castro Mejia, J. L., Janzen, T., Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2018, I: International Journal of Food Microbiology. 272, s. 61-72 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Long-term soil metal exposure impaired temporal variation in microbial metatranscriptomes and enriched active phages

    Jacquiod, S., Nunes, I., Brejnrod, A., Hansen, M. A., Holm, Peter Engelund, Johansen, A., Brandt, Kristian Koefoed, Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Microbiome. 6, s. 1-14 223.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Maturation of the gut microbiome and risk of asthma in childhood

    Stokholm, Jakob, Blaser, M. J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Waage, J. E., Vinding, R. K., Schoos, A. M., Kunøe, A., Fink, N. R., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Brejnrod, A. D., Mortensen, M. S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2018, I: Nature Communications. 9, 10 s., 141.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Micro-scale intermixing: a requisite for stable and synergistic co-establishment in a four-species biofilm

    Liu, W., Russel, J., Burmølle, Mette, Sørensen, Søren Johannes & Madsen, Jonas Stenløkke, 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 1940-1951 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Microbial diversity and putative opportunistic pathogens in dishwasher biofilm communities

    Raghupathi, P. K., Zupančič, J., Brejnrod, A. D., Jacquiod, S. J. A., Houf, K., Burmølle, Mette, Gunde-Cimerman, N. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 5, 17 s., e02755-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Monitoring plasmid-mediated horizontal gene transfer in microbiomes: recent advances and future perspectives

    Pinilla Redondo, Rafael, Cyriaque, V., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Riber, Leise, 2018, I: Plasmid. 99, s. 56-67

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Nutrient Fortification of Human Donor Milk Affects Intestinal Function and Protein Metabolism in Preterm Pigs

    Sun, Jing, Li, Y., Nguyen, Duc Ninh, Mortensen, M. S., van den Akker, C. H. P., Skeath, T., Pors, S. E., Pankratova, Stanislava, Rudloff, S., Sørensen, Søren Johannes, Burrin, D. G., Thymann, Thomas & Sangild, Per Torp, 2018, I: Journal of Nutrition. 148, 3, s. 336-347 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Short- and long-term impacts of azithromycin treatment on the gut microbiota in children: a double-blind, randomized, placebo-controlled trial

    Wei, S., Mortensen, M. S., Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Trivedi, Urvish, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: EBioMedicine. 38, s. 265-272

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Stability and resilience of the intestinal microbiota in children in daycare - a 12 month cohort study

    Mortensen, M. S., Jensen, B. H., Williams, J., Brejnrod, A. D., Andersen, L. O., Röser, D., Andreassen, B. U., Petersen, Andreas Munk, Stensvold, C. R., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2018, I: BMC Microbiology. 18, s. 1-11 223.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Synergistic Interactions in Microbial Biofilms Facilitate the Establishment of Opportunistic Pathogenic Fungi in Household Dishwashers

    Zupancic, J., Raghupathi, P. K., Houf, K., Burmølle, Mette, Sørensen, Søren Johannes & Gunde-Cimerman, N., 2018, I: Frontiers in Microbiology. 9, 13 s., 21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Synergistic Interactions within a Multispecies Biofilm Enhance Individual Species Protection against Grazing by a Pelagic Protozoan

    Raghupathi, P. K., Liu, W., Sabbe, K., Houf, K., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2649.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    The bacterial microbiota in first-void urine from men with and without idiopathic urethritis

    Frølund, M., Wikström, A., Lidbrink, P., Abu Al-Soud, W., Larsen, N., Harder, C. B., Sørensen, Søren Johannes, Jensen, J. S. & Ahrens, P., 2018, I: PLoS ONE. 13, 7, s. 1-19 e0201380.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269