Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor


  1. 2020
  2. Udgivet

    Salmonella persistence in soil depends on reciprocal interactions with indigenous microorganisms

    Schierstaedt, J., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Neuhaus, K., Sørensen, Søren Johannes, Grosch, R., Smalla, K. & Schikora, A., 2020, I: Environmental Microbiology. 22, 7, s. 2639-2652 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    A converging subset of soil bacterial taxa is permissive to the IncP-1 plasmid pKJK5 across a range of soil copper contamination

    Song, J., Klümper, U., Riber, Leise, Dechesne, A., Smets, B. F., Sørensen, Søren Johannes & Brandt, Kristian Koefoed, 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 11, 10 s., fiaa200.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Azo dying of α-keratin material improves microbial keratinase screening and standardization

    Gonzalo, M., Espersen, R., Al-Soud, W. A., Cristiano Falco, F., Hägglund, Per Mårten, Sørensen, Søren Johannes, Svensson, B. & Jacquiod, S., 2020, I: Microbial Biotechnology. 13, 4, s. 984-996

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Biocontrol of Bacterial Wilt Disease Through Complex Interaction Between Tomato Plant, Antagonists, the Indigenous Rhizosphere Microbiota, and Ralstonia solanacearum

    Elsayed, T. R., Jacquiod, S., Nour, E. H., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 15 s., 2835.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    CRISPRCasTyper: Automated Identification, Annotation, and Classification of CRISPR-Cas Loci

    Russel, J., Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: CRISPR Journal. 3, 6, s. 462-469 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Community-intrinsic properties enhance keratin degradation from bacterial consortia

    Nasipuri, P., Herschend, J., Brejnrod, A. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Espersen, R., Svensson, B., Burmølle, Mette, Jacquiod, S. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: PLoS ONE. 15, 1, 26 s., e0228108.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Comparison of antibiotic-resistant bacteria and antibiotic resistance genes abundance in hospital and community wastewater: A systematic review

    Hassoun-Kheir, N., Stabholz, Y., Kreft, J., de la Cruz, R., Romalde, J. L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F., Graham, D. & Paul, M., 2020, I: Science of the Total Environment. 743, 11 s., 140804.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Compatibility of X-ray computed tomography with plant gene expression, rhizosphere bacterial communities and enzyme activities

    Ganther, M., Yim, B., Ibrahim, Z., Bienert, M. D., Lippold, E., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Bienert, G. P., Vetterlein, D., Heintz-Buschart, A., Blagodatskaya, E., Smalla, K. & Tarkka, M. T., 2020, I: Journal of Experimental Botany. 71, 18, s. 5603-5614 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Composted sewage sludge influences the microbiome and persistence of human pathogens in soil

    Major, N., Schierstaedt, J., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Ban, S. G., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D. & Schikora, A., 2020, I: Microorganisms. 8, 7, 14 s., 1020.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Construction of Simplified Microbial Consortia to Degrade Recalcitrant Materials Based on Enrichment and Dilution-to-Extinction Cultures

    Kang, D., Jacquiod, S., Herschend, J., Wei, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 10 s., 3010.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Delivery mode and gut microbial changes correlate with an increased risk of childhood asthma

    Stokholm, Jakob, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Blaser, M. J., Rasmussen, Morten Arendt, Hjelmsø, M., Shah, S., Christensen, E. D., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Brix, S., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Vestergaard, G., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2020, I: Science Translational Medicine. 12, 569, 14 s., eaax9929.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Discovery of multiple anti-CRISPRs highlights anti-defense gene clustering in mobile genetic elements

    Pinilla Redondo, Rafael, Shehreen, S., Marino, N. D., Fagerlund, R. D., Brown, C. M., Sørensen, Søren Johannes, Fineran, P. C. & Bondy-Denomy, J., 2020, I: Nature Communications. 11, 11 s., 5652.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Ecological succession in the vaginal microbiota during pregnancy and birth

    Rasmussen, Morten Arendt, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Dominguez-Bello, M. G., Blaser, M. J., Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Shah, S. A., Hjelmsø, M. H., Lehtimäki, J., Trivedi, Urvish, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2020, I: The ISME Journal. 14, 9, s. 2325-2335 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Environmental shaping of the bacterial and fungal community in infant bed dust and correlations with the airway microbiota

    Gupta, S., Hjelmsø, M. H., Lehtimäki, J., Li, Xuan Ji, Mortensen, M. S., Russel, J., Trivedi, Urvish, Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: Microbiome. 8, 16 s., 115.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Epigenetic landscape links upper airway microbiota in infancy with allergic rhinitis at 6 years of age

    Morin, A., McKennan, C. G., Pedersen, C. T., Stokholm, Jakob, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Schoos, A. M., Naughton, K. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Mortensen, M. S., Vercelli, D., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H., Nicolae, D. L., Bønnelykke, Klaus & Ober, C., 2020, I: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 146, 6, s. 1358-1366

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Exploring microbial determinants of apple replant disease (ARD): a microhabitat approach under split-root design

    Balbín-Suárez, A., Lucas, M., Vetterlein, D., Sørensen, Søren Johannes, Winkelmann, T., Smalla, K. & Jacquiod, S., 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 12, 12 s., fiaa211.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Interspecific interactions in dual-species biofilms of soil bacteria: effects of fertilization practices

    Sun, X., Cai, P., Sørensen, Søren Johannes, Mortimer, M., Gao, C., Huang, Q., Wang, Y., Lin, X., Wu, Y., Zhu, D. & Chen, R., 2020, I: Journal of Soils and Sediments. 20, 3, s. 1494-1501 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Metal-induced bacterial interactions promote diversity in river-sediment microbiomes

    Cyriaque, V., Géron, A., Billon, G., Nesme, Joseph, Werner, J., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: F E M S Microbiology Ecology. 96, 6, 12 s., fiaa076.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Persistence and progression of staphylococcal infection in the presence of public goods

    Trivedi, Urvish, Fell, C., Madsen, Jonas Stenløkke, Everett, J., Burmølle, Mette, Rumbaugh, K. P. & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: npj Biofilms and Microbiomes. 6, 5 s., 55.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Plasmids persist in a microbial community by providing fitness benefit to multiple phylotypes

    Li, L., Dechesne, A., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2020, I: I S M E Journal. 14, 5, s. 1170-1181 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Prenatal dietary supplements influence the infant airway microbiota in a randomized factorial clinical trial

    Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Vestergaard, G., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Brix, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Stokholm, Jakob & Bisgaard, H., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 426.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Prokaryotic Community Composition and Extracellular Polymeric Substances Affect Soil Microaggregation in Carbonate Containing Semiarid Grasslands

    Zethof, J. H. T., Bettermann, A., Vogel, C., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Woche, S. K., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Kalbitz, K., 2020, I: Frontiers in Environmental Science. 8, 19 s., 51.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Rhizosphere microbial communities associated to rose replant disease: links to plant growth and root metabolites

    Yim, B., Baumann, A., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Zühlke, S., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Horticulture Research. 7, 16 s., 144.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Rose replant disease: detailed analyses of plant reactions, root endophytes and rhizosphere microbial communities

    Baumann, A., Yim, B., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Acta Horticulturae. 1283, s. 97-104 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments

    Cyriaque, V., Jacquiod, S. J. A., Riber, Leise, Abu Al-Soud, W., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: Journal of Hazardous Materials. 382, 10 s., 121173.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    The microbiome of captive hamadryas baboons

    Li, Xuan Ji, Trivedi, Urvish, Brejnrod, A. D., Vestergaard, G. A., Mortensen, M. S., Bertelsen, Mads Frost & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: BMC Animal Microbiome. 2, 10 s., 25.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Type IV CRISPR-Cas systems are highly diverse and involved in competition between plasmids

    Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Garrett, Roger Antony, Randau, L., Sørensen, Søren Johannes & Shah, S. A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 4, s. 2000-2012 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Unravelling plasmidome distribution and interaction with its hosting microbiome

    Kav, A. B., Rozov, R., Bogumil, D., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Benhar, I., Halperin, E., Shamir, R. & Mizrahi, I., 2020, I: Environmental Microbiology. 22, 1, s. 32-44

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4269