Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor

ORCID: 0000-0001-6227-9906

Udgivelsesår:
Alle
1 - 29 ud af 29Pr. side: 100
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2021
  2. Udgivet

    A community resource for paired genomic and metabolomic data mining

    Schorn, M. A., Verhoeven, S., Ridder, L., Huber, F., Acharya, D. D., Aksenov, A. A., Aleti, G., Moghaddam, J. A., Aron, A. T., Aziz, S., Bauermeister, A., Bauman, K. D., Baunach, M., Beemelmanns, C., Beman, J. M., Berlanga-Clavero, M. V., Blacutt, A. A., Bode, H. B., Boullie, A., Brejnrod, A. & 90 flere, Bugni, T. S., Calteau, A., Cao, L., Carrión, V. J., Castelo-Branco, R., Chanana, S., Chase, A. B., Chevrette, M. G., Costa-Lotufo, L. V., Crawford, J. M., Currie, C. R., Cuypers, B., Dang, T., de Rond, T., Demko, A. M., Dittmann, E., Du, C., Drozd, C., Dujardin, J., Dutton, R. J., Edlund, A., Fewer, D. P., Garg, N., Gauglitz, J. M., Gentry, E. C., Gerwick, L., Glukhov, E., Gross, H., Gugger, M., Matus, D. G. G., Helfrich, E. J. N., Hempel, B., Hur, J., Iorio, M., Jensen, P. R., Kang, K. B., Kaysser, L., Kelleher, N. L., Kim, C. S., Kim, K. H., Koester, I., König, G. M., Leao, T., Lee, S. R., Lee, Y., Li, Xuan Ji, Little, J. C., Maloney, K. N., Männle, D., Martin H., C., McAvoy, A. C., Metcalf, W. W., Mohimani, H., Molina-Santiago, C., Moore, B. S., Mullowney, M. W., Muskat, M., Nothias, L., O'Neill, E. C., Parkinson, E. I., Petras, D., Piel, J., Pierce, E. C., Pires, K., Reher, R., Romero, D., Roper, M. C., Rust, M., Saad, H., Saenz, C., Sanchez, L. M., Sørensen, Søren Johannes, Sosio, M., Süssmuth, R. D., Sweeney, D., Tahlan, K., Thomson, R. J., Tobias, N. J., Trindade-Silva, A. E., van Wezel, G. P., Wang, M., Weldon, K. C., Zhang, F., Ziemert, N., Duncan, K. R., Crüsemann, M., Rogers, S., Dorrestein, P. C., Medema, M. H. & van der Hooft, J. J. J., 2021, I: Nature Chemical Biology. 17, 4, s. 363-368

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Broad Dissemination of Plasmids across Groundwater-Fed Rapid Sand Filter Microbiomes

    Pinilla Redondo, Rafael, Olesen, Asmus Kalckar, Russel, J., de Vries, L. E., Christensen, L. D., Musovic, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: mBio. 12, 6, 13 s., e0306821.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production

    Kang, D., Shoaie, S., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Ledesma-Amaro, R., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 15 s., 1042.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Comparative analysis of the alveolar microbiome in COPD, ECOPD, Sarcoidosis, and ILD patients to identify respiratory illnesses specific microbial signatures

    Gupta, S., Shariff, M., Chaturvedi, G., Sharma, A., Goel, N., Yadav, M., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Mukerji, M. & Chauhan, N. S., 2021, I: Scientific Reports. 11, 11 s., 3963.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Distinct rhizomicrobiota assemblages and plant performance in lettuce grown in soils with different agricultural management histories

    Babin, D., Sommermann, L., Chowdhury, S. P., Behr, J. H., Sandmann, M., Neumann, G., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K. & Grosch, R., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 21 s., fiab027.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    EMBRACE-WATERS statement: Recommendations for reporting of studies on antimicrobial resistance in wastewater and related aquatic environments

    Hassoun-Kheir, N., Stabholz, Y., Kreft, J-U., de la Cruz, R., Dechesne, A., Smets, B. F., Romalde, J. L., Lema, A., Balboa, S., García-Riestra, C., Torres-Sangiao, E., Neuberger, A., Graham, D., Quintela-Baluja, M., Stekel, D. J., Graham, J., Pruden, A., Nesme, J., Sørensen, S. J., Hough, R. & 1 flere, Paul, M., 2021, I: One Health. 13, 9 s., 100339.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Emergent bacterial community properties induce enhanced drought tolerance in Arabidopsis

    Yang, Nan, Nesme, Joseph, Røder, Henriette Lyng, Li, Xuan Ji, Zuo, Zhangli Thomsen, Petersen, Morten, Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: npj Biofilms and Microbiomes. 7, 11 s., 82.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Extended-Spectrum β-Lactamase and Carbapenemase Genes are Substantially and Sequentially Reduced during Conveyance and Treatment of Urban Sewage

    Li, L., Nesme, Joseph, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Hashsham, S., Williams, M. R., Yu, Z., Sørensen, Søren Johannes, Graham, D. W., Romalde, J. L., Dechesne, A. & Smets, B. F., 2021, I: Environmental Science & Technology. 55, 9, s. 5939-5949 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Identification of Beneficial Microbial Consortia and Bioactive Compounds with Potential as Plant Biostimulants for a Sustainable Agriculture

    Tabacchioni, S., Passato, S., Ambrosino, P., Huang, L., Caldara, M., Cantale, C., Hett, J., Del Fiore, A., Fiore, A., Schlüter, A., Sczyrba, A., Maestri, E., Marmiroli, N., Neuhoff, D., Nesme, J., Sørensen, S. J., Aprea, G., Nobili, C., Presenti, O., Giovannetti, G. & 4 flere, Giovannetti, C., Pihlanto, A., Brunori, A. & Bevivino, A., 2021, I: Microorganisms. 9, 2, 23 s., 426.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Impact of Long-Term Organic and Mineral Fertilization on Rhizosphere Metabolites, Root–Microbial Interactions and Plant Health of Lettuce

    Windisch, S., Sommermann, L., Babin, D., Chowdhury, S. P., Grosch, R., Moradtalab, N., Walker, F., Höglinger, B., El-Hasan, A., Armbruster, W., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Geistlinger, J., Smalla, K., Rothballer, M., Ludewig, U. & Neumann, G., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 11, 26 s., 597745.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Impact of Tellurite on the Metabolism of Paenibacillus pabuli AL109b With Flagellin Production Explaining High Reduction Capacity

    Farias, P., Francisco, R., Maccario, Lorrie, Herschend, J., Piedade, A. P., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 15 s., 718963.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Importance of microbial communities at the root-soil interface for extracellular polymeric substances and soil aggregation in semiarid grasslands

    Bettermann, A., Zethof, J. H. T., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Kalbitz, K., Smalla, K. & Vogel, C., 2021, I: Soil Biology & Biochemistry. 159, 14 s., 108301.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Kin discrimination promotes horizontal gene transfer between unrelated strains in Bacillus subtilis

    Stefanic, P., Belcijan, K., Kraigher, B., Kostanjšek, R., Nesme, Joseph, Madsen, Jonas Stenløkke, Kovac, J., Sørensen, Søren Johannes, Vos, M. & Mandic-Mulec, I., 2021, I: Nature Communications. 12, 11 s., 3457.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition

    Kurilshikov, A., Medina-Gomez, C., Bacigalupe, R., Radjabzadeh, D., Wang, J., Demirkan, A., Le Roy, C. I., Raygoza Garay, J. A., Finnicum, C. T., Liu, X., Zhernakova, D. V., Bonder, M. J., Hansen, T. H., Frost, F., Rühlemann, M. C., Turpin, W., Moon, J. Y., Kim, H. N., Lüll, K., Barkan, E. & 84 flere, Shah, S. A., Fornage, M., Szopinska-Tokov, J., Wallen, Z. D., Borisevich, D., Agreus, L., Andreasson, A., Bang, C., Bedrani, L., Bell, J. T., Bisgaard, H., Boehnke, M., Boomsma, D. I., Burk, R. D., Claringbould, A., Croitoru, K., Davies, G. E., van Duijn, C. M., Duijts, L., Falony, G., Fu, J., van der Graaf, A., Hansen, Torben, Homuth, G., Hughes, D. A., Ijzerman, R. G., Jackson, M. A., Jaddoe, V. W. V., Joossens, M., Jørgensen, T., Keszthelyi, D., Knight, R., Laakso, M., Laudes, M., Launer, L. J., Lieb, W., Lusis, A. J., Masclee, A. A. M., Moll, H. A., Mujagic, Z., Qibin, Q., Rothschild, D., Shin, H., Sørensen, Søren Johannes, Steves, C. J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Timpson, N. J., Tito, R. Y., Vieira-Silva, S., Völker, U., Völzke, H., Võsa, U., Wade, K. H., Walter, S., Watanabe, K., Weiss, S., Weiss, F. U., Weissbrod, O., Westra, H. J., Willemsen, G., Payami, H., Jonkers, D. M. A. E., Arias Vasquez, A., de Geus, E. J. C., Meyer, K. A., Stokholm, Jakob, Segal, E., Org, E., Wijmenga, C., Kim, H. L., Kaplan, R. C., Spector, T. D., Uitterlinden, A. G., Rivadeneira, F., Franke, A., Lerch, M. M., Franke, L., Sanna, S., D’Amato, M., Pedersen, Oluf Borbye, Paterson, A. D., Kraaij, R., Raes, J. & Zhernakova, A., 2021, I: Nature Genetics. 53, s. 156-165 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Lead Drives Complex Dynamics of a Conjugative Plasmid in a Bacterial Community

    Cyriaque, V., Madsen, Jonas Stenløkke, Fievez, L., Leroy, B., Hansen, Lars Hestbjerg, Bureau, F., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 655903.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms

    Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Microbial community analysis of soils under different soybean cropping regimes in the Argentinean south-eastern Humid Pampas

    Fernandez-Gnecco, G., Smalla, K., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Barbieri, P., Consolo, V. F., Covacevich, F. & Babin, D., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab007.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Modeling transfer of vaginal microbiota from mother to infant in early life

    Mortensen, M. S., Rasmussen, Morten Arendt, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Balle, C., Thorsen, J., Krogfelt, K. A., Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: eLife. 10, 19 s., e57051.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Reduced tillage, cover crops and organic amendments affect soil microbiota and improve soil health in Uruguayan vegetable farming systems

    Cerecetto, V., Smalla, K., Nesme, Joseph, Garaycochea, S., Fresia, P., Sørensen, Søren Johannes, Babin, D. & Leoni, C., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab023.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Root exposure to apple replant disease soil triggers local defense response and rhizoplane microbiome dysbiosis

    Balbín-Suárez, A., Jacquiod, S., Rohr, A. D., Liu, B., Flachowsky, H., Winkelmann, T., Beerhues, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Vetterlein, D. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 14 s., fiab031.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Spatial analysis of the root system coupled to microbial community inoculation shed light on rhizosphere bacterial community assembly

    Wei, S., Jacquiod, S., Philippot, L., Blouin, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Biology and Fertility of Soils. 57, 7, s. 973-989 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Temporal oral microbiome changes with brushing in children with cleft lip and palate

    Rodrigues, R., Chung, A. P., Mortensen, M. S., Fernandes, M. H., Monteiro, A. B., Furfuro, R., Silva, C. C., Manso, M. C., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2021, I: Heliyon. 7, 9 s., e06513.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    The Airway Microbiota Modulates Effect of Azithromycin Treatment for Episodes of Recurrent Asthma-like Symptoms in Preschool Children: A Randomized Clinical Trial

    Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt, Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Hjelmsø, M., Shah, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2021, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 204, 2, s. 149-158

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    The effect of early probiotic exposure on the preterm infant gut microbiome development

    Hui, Y., Smith, Birgitte, Mortensen, M. S., Krych, Lukasz, Sørensen, Søren Johannes, Greisen, Gorm, Krogfelt, K. A. & Nielsen, Dennis Sandris, 2021, I: Gut Microbes. 13, 1, 15 s., 1951113.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    The infant gut resistome associates with E. coli, environmental exposures, gut microbiome maturity, and asthma-associated bacterial composition

    Li, Xuan Ji, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A., Vestergaard, G. A., Russel, J., Trivedi, Urvish, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Gupta, S., Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Cell Host & Microbe. 29, 6, s. 975–987.e4 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    The initial inoculation ratio regulates bacterial coculture interactions and metabolic capacity

    Gao, C., Cao, H., Cai, P. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: ISME Journal. 15, s. 29-40 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    The treasure inside barley seeds: microbial diversity and plant beneficial bacteria

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Straube, B., Wehner, G., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: Environmental Microbiomes. 16, 21 s., 20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Tillage shapes the soil and rhizosphere microbiome of barley - but not its susceptibility towards Blumeria graminis f. sp. hordei

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Douchkov, D., Lueck, S., Babin, D., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Urbanized microbiota in infants, immune constitution and later risk of atopic diseases

    Lehtimäki, J., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Hjelmsø, M., Shah, S., Mortensen, M. S., Trivedi, Urvish, Vestergaard, G., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Brix, S., Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2021, I: Journal of Allergy and Clinical Immunology. 148, 1, s. 234-243 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ID: 4269