Xu Peng
Professor
Functional genomics
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 2017
- Udgivet
Novel thermostable amine transferases from hot spring metagenomes
Ferrandi, E. E., Previdi, A., Bassanini, I., Riva, S., Peng, Xu & Monti, D., jun. 2017, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 101, 12, s. 4963-4979 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic and transcriptomic analyses reveal distinct biological functions for cold shock proteins (VpaCspA and VpaCspD) in Vibrio parahaemolyticus CHN25 during low-temperature survival
Zhu, C., Sun, B., Liu, T., Zheng, H., Gu, W., He, W., Sun, F., Wang, Y., Yang, M., Bei, W., Peng, Xu, She, Q., Xie, L. & Chen, L., 5 jun. 2017, I: BMC Genomics. 18, 19 s., 436.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Formation of a viral replication focus in Sulfolobus cells infected by the rudivirus Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2
Martinez Alvarez, Laura, Deng, Ling & Peng, Xu, jul. 2017, I: Journal of Virology. 91, 13, 12 s., e00486-17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interaction of extremophilic archaeal viruses with human and mouse complement system and viral biodistribution in mice
Wu, L., Uldahl, K. B., Chen, F., Benasutti, H., Logvinski, D., Vu, V., Banda, N. K., Peng, Xu, Simberg, D. & Moghimi, S. M., okt. 2017, I: Molecular Immunology. 90, s. 273-279 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SMV1, an extremely stable thermophilic virus platform for nanoparticle trafficking in the mammalian GI tract
Uldahl, K. B., Walk, S. T., Olshefsky, S. C., Young, M. J. & Peng, Xu, nov. 2017, I: Journal of Applied Microbiology. 123, 5, s. 1286-1297 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sugar metabolism of the first thermophilic Planctomycete Thermogutta terrifontis: comparative genomic and transcriptomic approaches
Elcheninov, A. G., Menzel, P., Gudbergsdottir, S. R., Slesarev, A. I., Kadnikov, V. V., Krogh, Anders, Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu & Kublanov, I. V., 2 nov. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2140.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
A Unified Resource for Tracking Anti-CRISPR Names
Bondy-Denomy, J., Davidson, A. R., Doudna, J. A., Fineran, P. C., Maxwell, K. L., Moineau, S., Peng, Xu, Sontheimer, E. J. & Wiedenheft, B., 2018, I: CRISPR Journal. 1, 5, s. 304-305Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Anti-CRISPR proteins encoded by archaeal lytic viruses inhibit subtype I-D immunity
He, F., Bhoobalan, Yuvaraj, Van, L. B., Kjeldsen, A. L., Dedola, M., Makarova, K. S., Koonin, E. V., Brodersen, D. E. & Peng, Xu, 2018, I: Nature Microbiology. 3, 4, s. 461-469 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Anti-CRISPR-Based and CRISPR-Based Genome Editing of Sulfolobus islandicus Rod-Shaped Virus 2
Mayo-Muñoz, D., He, F., Jørgensen, J. B., Madsen, P. K., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2018, I: Viruses. 10, 12, s. 1-17 695.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Discovering novel hydrolases from hot environments
Wohlgemuth, R., Littlechild, J., Monti, D., Schnorr, K., van Rossum, T., Siebers, B., Menzel, P., Kublanov, I. V., Rike, A. G., Skretas, G., Szabo, Z., Peng, Xu & Young, M. J., 2018, I: Biotechnology Advances. 36, 8, s. 2077-2100Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Erratum: Formation of a viral replication focus in Sulfolobus cells infected by the rudivirus Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2 [Journal of Virology, 91, 13, (2017), (e00486-17)] DOI:10.1128/JVI.00486-17
Martinez Alvarez, Laura, Deng, Ling & Peng, Xu, 1 apr. 2018, I: Journal of Virology. 92, 7, e01991-17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Comparative genomics for non-O1/O139 Vibrio cholerae isolates recovered from the Yangtze River Estuary versus V. cholerae representative isolates from serogroup O1
Gong, L., Yu, P., Zheng, H., Gu, W., He, W., Tang, Y., Wang, Y., Dong, Y., Peng, Xu, She, Q., Xie, L. & Chen, L., 2019, I: Molecular Genetics and Genomics. 294, 2, s. 417-430Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Inhibition of Type III CRISPR-Cas Immunity by an Archaeal Virus-Encoded Anti-CRISPR Protein
Bhoobalan, Yuvaraj, Johansen, T. B., Di Cianni, N. & Peng, Xu, 2019, I: Cell. 179, 2, s. 448-458, e1-e11Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stable maintenance of the rudivirus SIRV3 in a carrier state in Sulfolobus islandicus despite activation of the CRISPR-Cas immune response by a second virus SMV1
Papathanasiou, P., Erdmann, S., Leon-Sobrino, C., Sharma, K., Urlaub, H., Garrett, Roger Antony & Peng, Xu, 2019, I: RNA Biology. 16, 4, s. 557-565Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Anti-CRISPR Proteins in Archaea
Peng, Xu, Mayo-Muñoz, D., Bhoobalan, Yuvaraj & Martinez Alvarez, Laura, 2020, I: Trends in Microbiology. 28, 11, s. 913-921 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Archaeal Viruses and Their Interactions with CRISPR-Cas Systems
Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2020, Biocommunication of Phages. 1 udg. Springer, s. 199-220 22 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Proteomics and Secretomics Revealed Virulence and Antibiotic Resistance-Associated Factors in Vibrio parahaemolyticus Recovered From Commonly Consumed Aquatic Products
Zhu, Z., Yang, L., Yu, P., Wang, Y., Peng, Xu & Chen, L., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 31 s., 1453.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA targeting by subtype I-D CRISPR-Cas shows type I and type III features
Lin, Jinzhong, Fuglsang, Anders, Kjeldsen, A. L., Sun, K., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 18, s. 10470-10478 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Discovery and Characterization of a Novel Thermostable β-Amino Acid Transaminase from a Meiothermus Strain Isolated in an Icelandic Hot Spring
Ferrandi, E. E., Bassanini, I., Sechi, B., Vanoni, M., Tessaro, D., Gudbergsdóttir, S. R., Riva, S., Peng, Xu & Monti, D., 2020, I: Biotechnology Journal. 15, 11, 9 s., 2000125.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prophage-Related Gene VpaChn25_0724 Contributes to Cell Membrane Integrity and Growth of Vibrio parahaemolyticus CHN25
Yang, L., Wang, Y., Yu, P., Ren, S., Zhu, Z., Jin, Y., Yan, J., Peng, Xu & Chen, L., 2020, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 10, 18 s., 595709.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural basis for inhibition of an archaeal CRISPR–Cas type I-D large subunit by an anti-CRISPR protein
Manav, M. C., Van, L. B., Lin, Jinzhong, Fuglsang, Anders, Peng, Xu & Brodersen, D. E., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 5993.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Virulence, Resistance, and Genomic Fingerprint Traits of Vibrio cholerae Isolated from 12 Species of Aquatic Products in Shanghai, China
Fu, H., Yu, P., Liang, W., Kan, B., Peng, Xu & Chen, L., 2020, I: Microbial Drug Resistance. 26, 12, s. 1526-1539 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021
Krupovic, M., Turner, D., Morozova, V., Dyall-Smith, M., Oksanen, H. M., Edwards, R., Dutilh, B. E., Lehman, S. M., Reyes, A., Baquero, D. P., Sullivan, M. B., Uchiyama, J., Nakavuma, J., Barylski, J., Young, M. J., Du, S., Alfenas-Zerbini, P., Kushkina, A., Kropinski, A. M., Kurtböke, I. & 29 flere, , 2021, I: Archives of Virology. 166, 11, s. 3239-3244 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome editing in archaeal viruses and endogenous viral protein purification
Alfastsen, L., Peng, Xu & Bhoobalan, Yuvaraj, 2021, I: STAR Protocols. 2, 4, 27 s., 100791.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
A Comparative Analysis of Weizmannia coagulans Genomes Unravels the Genetic Potential for Biotechnological Applications
Aulitto, M., Martinez Alvarez, Laura, Fiorentino, G., Limauro, D., Peng, Xu & Contursi, P., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences . 23, 6, 23 s., 3135.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative proteomics and secretomics revealed virulence, and coresistance-related factors in non O1/O139 Vibrio cholerae recovered from 16 species of consumable aquatic animals
Shan, X., Fu, J., Li, X., Peng, Xu & Chen, L., 2022, I: Journal of Proteomics. 251, 15 s., 104408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA Motifs and an Accessory CRISPR Factor Determine Cas1 Binding and Integration Activity in Sulfolobus islandicus
Liu, T., Xu, Y., Wang, X., Ye, Q., Liu, Z., Zhang, Z., Liu, J., Yang, Y., Peng, Xu & Peng, N., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences . 23, 17, 15 s., 10178.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diverse Aquatic Animal Matrices Play a Key Role in Survival and Potential Virulence of Non-O1/O139 Vibrio cholerae Isolates
Yan, L., Jin, Y., Zhang, B., Xu, Y., Peng, Xu, Qin, S. & Chen, L., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 21 s., 896767.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomics, Transcriptomics, and Proteomics of SSV1 and Related Fusellovirus: A Minireview
Aulitto, M., Martinez Alvarez, Laura, Fusco, S., She, Q., Bartolucci, S., Peng, Xu & Contursi, P., 2022, I: Viruses. 14, 10, 18 s., 2082.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Survival and Genome Diversity of Vibrio parahaemolyticus Isolated from Edible Aquatic Animals
Xu, D., Peng, Xu, Xie, L. & Chen, L., 2022, I: Diversity. 14, 5, 23 s., 350.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
A clade of RHH proteins ubiquitous in Sulfolobales and their viruses regulates cell cycle progression
Li, X., Lozano-Madueno, C., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2023, I: Nucleic acids symposium series. 51, 4, 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four additional natural 7-deazaguanine derivatives in phages and how to make them
Cui, L., Balamkundu, S., Liu, C. F., Ye, H., Hourihan, J., Rausch, A., Hauß, C., Nilsson, E., Hoetzinger, M., Holmfeldt, K., Zhang, W., Martinez-Alvarez, L., Peng, X., Tremblay, D., Moinau, S., Solonenko, N., Sullivan, M. B., Lee, Y. J., Mulholland, A., Weigele, P. R. & 3 flere, , 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 17, s. 9214-9226 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular basis for inhibition of type III-B CRISPR-Cas by an archaeal viral anti-CRISPR protein
Lin, Jinzhong, Alfastsen, L., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2023, I: Cell Host and Microbe. 31, 11, s. 1837-1849.e5 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Replication Protein Rep Provides Selective Advantage to Viruses in the Presence of CRISPR-Cas Immunity
Zhang, W., Bhoobalan-Chitty, Y., Zhai, Xichuan, Hui, Y., Hansen, Lars Hestbjerg, Deng, Ling & Peng, Xu, 2023, I: CRISPR Journal. 6, 1, s. 32-42Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2024
- Udgivet
Regulatory sequence-based discovery of anti-defense genes in archaeal viruses
Bhoobalan, Yuvaraj, Xu, Shuanshuan, Martinez Alvarez, Laura, Karamycheva, S., Makarova, K. S., Koonin, E. V. & Peng, Xu, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 13 s., 3699.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10365
Flest downloads
-
1256
downloads
Genome Sequence of a Novel Archaeal Fusellovirus Assembled from the Metagenome of a Mexican Hot Spring
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1214
downloads
Genome Sequence of a Novel Archaeal Rudivirus Recovered from a Mexican Hot Spring
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
942
downloads
Metagenomic analyses reveal phylogenetic diversity of carboxypeptidase gene sequences in activated sludge of a wastewater treatment plant in Shanghai, China
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet