Xu Peng

Xu Peng

Professor


  1. Udgivet

    Genome editing in archaeal viruses and endogenous viral protein purification

    Alfastsen, L., Peng, Xu & Bhoobalan, Yuvaraj, 2021, I: STAR Protocols. 2, 4, 27 s., 100791.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Genomics, Transcriptomics, and Proteomics of SSV1 and Related Fusellovirus: A Minireview

    Aulitto, M., Martinez Alvarez, Laura, Fusco, S., She, Q., Bartolucci, S., Peng, Xu & Contursi, P., 2022, I: Viruses. 14, 10, 18 s., 2082.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    A Comparative Analysis of Weizmannia coagulans Genomes Unravels the Genetic Potential for Biotechnological Applications

    Aulitto, M., Martinez Alvarez, Laura, Fiorentino, G., Limauro, D., Peng, Xu & Contursi, P., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences . 23, 6, 23 s., 3135.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Novel archaeal plasmid pAH1 and its interactions with the lipothrixvirus AFV1

    Basta, T., Smyth, J., Forterre, P., Prangishvili, D. & Peng, Xu, 2009, I: Molecular Microbiology. 71, 1, s. 23-34 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    AFV1, a novel virus infecting hyperthermophilic archaea of the genus Acidianus.

    Bettstetter, M., Peng, Xu & Garrett RA, Prangishvili D., G. R. P. D., 2003, I: Virology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    AFV1 a novel virus infecting hyperthermophilic archaea of the genus Acidianus

    Bettstetter, M., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2003, I: Virology. 315, s. 69-79

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Inhibition of Type III CRISPR-Cas Immunity by an Archaeal Virus-Encoded Anti-CRISPR Protein

    Bhoobalan, Yuvaraj, Johansen, T. B., Di Cianni, N. & Peng, Xu, 2019, I: Cell. 179, 2, s. 448-458, e1-e11

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Viruses in acidic geothermal environments of the Kamchatka Peninsula

    Bize, A., Peng, Xu, Prokofeva, M., Maclellan, K., Lucas, S., Forterre, P., Garrett, Roger Antony, Bonch-Osmolovskaya, E. A. & Prangishvili, D., 2008, I: Research in Microbiology. 159, 5, s. 358-66 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    A Unified Resource for Tracking Anti-CRISPR Names

    Bondy-Denomy, J., Davidson, A. R., Doudna, J. A., Fineran, P. C., Maxwell, K. L., Moineau, S., Peng, Xu, Sontheimer, E. J. & Wiedenheft, B., 2018, I: CRISPR Journal. 1, 5, s. 304-305

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Sulfolobus genomes: mechanisms of rearrangement and change

    Brügger, K., Peng, Xu & Garrett, Roger Antony, 2006, Archaea: Evolution, physiology and Molecular Biolog.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Gene content and organization of a 281-kbp contig from the genome of the extremely thermophilic archaeon, Sulfolobus solfataricus P2

    Charlebois, R. L., Singh, R. K., Chan-Weiher, CC-Y., Allard, G., Chow, C., Confalonieri, F., Curtis, B., Duguet, M., Erauso, G., Faguy, D., Gaasterland, T., Garrett, R. A., Gordon, P., Jeffries, A. C., Kozera, C., Kushwaha, N., Lafleur, E., Medina, N., Peng, X., Penny, S. L. & 8 flere, She, Q., St. Jean, A., van der Oost, J., Young, F., Zivanovic, Y., Doolittle, W. F., Ragan, M. A. & Sensen, C. W., 2000, I: Genome. 43, s. 116-136

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Four additional natural 7-deazaguanine derivatives in phages and how to make them

    Cui, L., Balamkundu, S., Liu, C. F., Ye, H., Hourihan, J., Rausch, A., Hauß, C., Nilsson, E., Hoetzinger, M., Holmfeldt, K., Zhang, W., Martinez-Alvarez, L., Peng, X., Tremblay, D., Moinau, S., Solonenko, N., Sullivan, M. B., Lee, Y. J., Mulholland, A., Weigele, P. R. & 3 flere, de Crécy-Lagard, V., Dedon, P. C. & Hutinet, G., 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 17, s. 9214-9226 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    A novel interference mechanism by a type IIIB CRISPR-Cmr module in Sulfolobus

    Deng, Ling, Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Peng, Xu & She, Q., 2013, I: Molecular Microbiology. 87, 5, s. 1088-1099 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Unveiling cell surface and type IV secretion proteins responsible for archaeal rudivirus entry

    Deng, Ling, He, F., Bhoobalan, Yuvaraj, Martinez Alvarez, Laura, Guo, Y. & Peng, Xu, 2014, I: Journal of Virology. 88, 17, s. 10264-10268 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Modulation of CRISPR locus transcription by the repeat-binding protein Cbp1 in Sulfolobus

    Deng, Ling, Kenchappa, C. S., Peng, Xu, She, Q. & Garrett, Roger Antony, 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 6, s. 2470-2480 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Sugar metabolism of the first thermophilic Planctomycete Thermogutta terrifontis: comparative genomic and transcriptomic approaches

    Elcheninov, A. G., Menzel, P., Gudbergsdottir, S. R., Slesarev, A. I., Kadnikov, V. V., Krogh, Anders, Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu & Kublanov, I. V., 2 nov. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2140.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Discovery and Characterization of a Novel Thermostable β-Amino Acid Transaminase from a Meiothermus Strain Isolated in an Icelandic Hot Spring

    Ferrandi, E. E., Bassanini, I., Sechi, B., Vanoni, M., Tessaro, D., Gudbergsdóttir, S. R., Riva, S., Peng, Xu & Monti, D., 2020, I: Biotechnology Journal. 15, 11, 9 s., 2000125.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Discovery and characterization of thermophilic limonene-1,2-epoxide hydrolases from hot spring metagenomic libraries

    Ferrandi, E. E., Sayer, C., Isupov, M. N., Annovazzi, C., Marchesi, C., Iacobone, G., Peng, Xu, Bonch-Osmolovskaya, E., Wohlgemuth, R., Littlechild, J. A. & Monti, D., 2015, I: F E B S Journal. 282, 15, s. 2879-2894 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Novel thermostable amine transferases from hot spring metagenomes

    Ferrandi, E. E., Previdi, A., Bassanini, I., Riva, S., Peng, Xu & Monti, D., jun. 2017, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 101, 12, s. 4963-4979 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Virulence, Resistance, and Genomic Fingerprint Traits of Vibrio cholerae Isolated from 12 Species of Aquatic Products in Shanghai, China

    Fu, H., Yu, P., Liang, W., Kan, B., Peng, Xu & Chen, L., 2020, I: Microbial Drug Resistance. 26, 12, s. 1526-1539 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Archaeal Viruses and Their Interactions with CRISPR-Cas Systems

    Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2020, Biocommunication of Phages. 1 udg. Springer, s. 199-220 22 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Metagenomic analyses of novel viruses and plasmids from a cultured environmental sample of hyperthermophilic neutrophiles

    Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Shah, S. A., Reuter, M., Stetter, K. O. & Peng, Xu, 1 nov. 2010, I: Environmental Microbiology. 12, 11, s. 2918-30 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    CRISPR-Cas adaptive immune systems of the sulfolobales: unravelling their complexity and diversity

    Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Erdmann, S., Guannan, L., Mousaei, M., León Sobrino, C., Peng, W., Islin, S. R., Deng, Ling, Vestergaard, G., Peng, Xu & She, Q., 2015, I: Life. 5, 1, s. 783-817 35 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Isolation and characterization of the first Xylanolytic hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus sp strain 2319x1 and its unusual multidomain glycosidase

    Gavrilov, S. N., Stracke, C., Jensen, K., Menzel, P., Kallnik, V., Slesarev, A., Sokolova, T., Zayulina, K., Bräsen, C., Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu, Kublanov, I. V. & Siebers, B., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 17 s., 552.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Comparative genomics for non-O1/O139 Vibrio cholerae isolates recovered from the Yangtze River Estuary versus V. cholerae representative isolates from serogroup O1

    Gong, L., Yu, P., Zheng, H., Gu, W., He, W., Tang, Y., Wang, Y., Dong, Y., Peng, Xu, She, Q., Xie, L. & Chen, L., 2019, I: Molecular Genetics and Genomics. 294, 2, s. 417-430

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Growth factors and gene expression in cultured hepatocytes

    Grunnet, N., Peng, Xu & Tygstrup, N., 1999, I: Jounal of Hepatology. 30, s. 117-122

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Functional characterization of a conserved archaeal viral operon revealing single-stranded DNA binding, annealing and nuclease activities

    Guo, Y., Kragelund, Birthe Brandt, White, M. F. & Peng, Xu, 2015, I: Journal of Molecular Biology. 427, 12, s. 2179-2191 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Familial relationships in hyperthermo- and acidophilic archaeal viruses

    Happonen, L. J., Redder, P., Peng, Xu, Reigstad, L. J., Prangishvili, D. & Butcher, S. J., 1 maj 2010, I: Journal of Virology. 84, 9, s. 4747-54 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    First experimental evidence for the presence of a CRISPR toxin in Sulfolobus

    He, F., Chen, L. & Peng, Xu, 2014, I: Journal of Molecular Biology. 426, 22, s. 3683-3688 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    CRISPR-Cas type I-A Cascade complex couples viral infection surveillance to host transcriptional regulation in the dependence of Csa3b

    He, F., Vestergaard, G. A., Peng, W., She, Q. & Peng, Xu, 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 4, s. 1902-1913 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Anti-CRISPR proteins encoded by archaeal lytic viruses inhibit subtype I-D immunity

    He, F., Bhoobalan, Yuvaraj, Van, L. B., Kjeldsen, A. L., Dedola, M., Makarova, K. S., Koonin, E. V., Brodersen, D. E. & Peng, Xu, 2018, I: Nature Microbiology. 3, 4, s. 461-469 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Viral Diversity in Hot Springs of Pozzuoli, Italy, and Characterization of a Unique Archaeal Virus, Acidianus Bottle-Shaped Virus, from a New Family, the Ampullaviridae

    Häring, M., Rachel, R., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2005, I: Journal of Virology. 79, 15, s. 9904 - 9911

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Morphology and genome organisation of the virus PSV of the hyperthermophilic archaeal genera Pyrobaculum and Thermoproteus: A novel virus family, the Globuloviridae

    Häring , M., Peng, Xu & Brugger K., Rachel R., Stetter K.O., Garrett R.A.,Prangishvili D., B. K. ,. R. R. ,. S. K. O. ,. G. R. A. ,. D., 2004, I: Virology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Novel viral genomes identified from six metagenomes reveal wide distribution of archaeal viruses and high viral diversity in terrestrial hot springs

    Islin, S. R., Menzel, P., Krogh, Anders, Young, M. & Peng, Xu, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 3, s. 863-874 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Metagenomic analyses reveal phylogenetic diversity of carboxypeptidase gene sequences in activated sludge of a wastewater treatment plant in Shanghai, China

    Jin, H., Li, B., Peng, Xu & Chen, L., 2014, I: Annals of Microbiology. 64, 2, s. 689-697 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021

    Krupovic, M., Turner, D., Morozova, V., Dyall-Smith, M., Oksanen, H. M., Edwards, R., Dutilh, B. E., Lehman, S. M., Reyes, A., Baquero, D. P., Sullivan, M. B., Uchiyama, J., Nakavuma, J., Barylski, J., Young, M. J., Du, S., Alfenas-Zerbini, P., Kushkina, A., Kropinski, A. M., Kurtböke, I. & 29 flere, Brister, J. R., Lood, C., Sarkar, B. L., Yigang, T., Liu, Y., Huang, L., Wittmann, J., Chanishvili, N., van Zyl, L. J., Rumnieks, J., Mochizuki, T., Jalasvuori, M., Aziz, R. K., Łobocka, M., Stedman, K. M., Shkoporov, A. N., Gillis, A., Peng, Xu, Enault, F., Knezevic, P., Lavigne, R., Rhee, S. K., Cvirkaite-Krupovic, V., Moraru, C., Moreno Switt, A. I., Poranen, M. M., Millard, A., Prangishvili, D. & Adriaenssens, E. M., 2021, I: Archives of Virology. 166, 11, s. 3239-3244 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    A clade of RHH proteins ubiquitous in Sulfolobales and their viruses regulates cell cycle progression

    Li, X., Lozano-Madueno, C., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2023, I: Nucleic acids symposium series. 51, 4, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    DNA targeting by subtype I-D CRISPR-Cas shows type I and type III features

    Lin, Jinzhong, Fuglsang, Anders, Kjeldsen, A. L., Sun, K., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 18, s. 10470-10478 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Molecular basis for inhibition of type III-B CRISPR-Cas by an archaeal viral anti-CRISPR protein

    Lin, Jinzhong, Alfastsen, L., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2023, I: Cell Host and Microbe. 31, 11, s. 1837-1849.e5 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    DNA Motifs and an Accessory CRISPR Factor Determine Cas1 Binding and Integration Activity in Sulfolobus islandicus

    Liu, T., Xu, Y., Wang, X., Ye, Q., Liu, Z., Zhang, Z., Liu, J., Yang, Y., Peng, Xu & Peng, N., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences . 23, 17, 15 s., 10178.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Structural basis for inhibition of an archaeal CRISPR–Cas type I-D large subunit by an anti-CRISPR protein

    Manav, M. C., Van, L. B., Lin, Jinzhong, Fuglsang, Anders, Peng, Xu & Brodersen, D. E., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 5993.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Multiple consecutive initiation of replication producing novel brush-like intermediates at the termini of linear viral dsDNA genomes with hairpin ends.

    Martinez Alvarez, Laura, Bell, S. D. & Peng, Xu, 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 18, s. 8799-8809 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Formation of a viral replication focus in Sulfolobus cells infected by the rudivirus Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2

    Martinez Alvarez, Laura, Deng, Ling & Peng, Xu, jul. 2017, I: Journal of Virology. 91, 13, 12 s., e00486-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet
  45. Udgivet

    Anti-CRISPR-Based and CRISPR-Based Genome Editing of Sulfolobus islandicus Rod-Shaped Virus 2

    Mayo-Muñoz, D., He, F., Jørgensen, J. B., Madsen, P. K., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2018, I: Viruses. 10, 12, s. 1-17 695.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Comparative metagenomics of eight geographically remote terrestrial hot springs

    Menzel, P., Islin, S. R., Rike, A. G., Lin, L., Zhang, Q., Contursi, P., Moracci, M., Kristjansson, J. K., Bolduc, B., Gavrilov, S., Ravin, N., Mardanov, A., Bonch-Osmolovskaya, E., Young, M., Krogh, Anders & Peng, Xu, 2015, I: Microbial Ecology. 70, 2, s. 411-424 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    A dimeric Rep protein initiates replication of a linear archaeal virus genome: implications for the Rep mechanism and viral replication

    Oke, M., Kerou, M., Liu, H., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Naismith, J. H. & White, M. F., 2011, I: Journal of Virology. 85, 2, s. 925-31 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    The Scottish Structural Proteomics Facility: targets, methods and outputs

    Oke, M., Carter, L. G., Johnson, K. A., Liu, H., McMahon, S. A., Yan, X., Kerou, M., Weikart, N. D., Kadi, N., Sheikh, M. A., Schmelz, S., Dorward, M., Zawadzki, M., Cozens, C., Falconer, H., Powers, H., Overton, I. M., van Niekerk, C. A. J., Peng, X., Patel, P. & 11 flere, Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Botting, C. H., Coote, P. J., Dryden, D. T. F., Barton, G. J., Schwarz-Linek, U., Challis, G. L., Taylor, G. L., White, M. F. & Naismith, J. H., 1 jun. 2010, I: Journal of Structural and Functional Genomics. 11, 2, s. 167-80 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Novel insights into gene regulation of the rudivirus SIRV2 infecting Sulfolobus cells

    Okutan, E., Deng, Ling, Mirlashari, S., Uldahl, K., Halim, M., Liu, C., Garrett, Roger Antony, She, Q. & Peng, Xu, 2013, I: R N A Biology. 10, 5, s. 1-11 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Stable maintenance of the rudivirus SIRV3 in a carrier state in Sulfolobus islandicus despite activation of the CRISPR-Cas immune response by a second virus SMV1

    Papathanasiou, P., Erdmann, S., Leon-Sobrino, C., Sharma, K., Urlaub, H., Garrett, Roger Antony & Peng, Xu, 2019, I: RNA Biology. 16, 4, s. 557-565

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 10365