Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor

ORCID: 0000-0001-6227-9906

Udgivelsesår:
Alle
301 - 350 ud af 412Pr. side: 50
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    Plasmid metagenomics reveals multiple antibiotic resistance gene classes among the gut microbiomes of hospitalised patients

    Jitwasinkul, T., Suriyaphol, P., Tangphatsornruang, S., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Permpikul, C., Rongrungruang, Y. & Tribuddharat, C., 2016, I: Journal of Global Antimicrobial Resistance. 6, s. 57-66 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    Plasmid permissiveness of wastewater microbiomes can be predicted from 16S rRNA sequences by machine learning

    Moradigaravand, D., Li, L., Dechesne, A., Nesme, Joseph, de la Cruz, R., Ahmad, H., Banzhaf, M., Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F. & Kreft, J. U., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 7, 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Plasmid transfer in aquatic environments. Molecular Microbial Ecology Manual

    Sørensen, Søren Johannes (red.), Øregaard, G. (red.), De Lipthay, J. R. (red.) & Kroer, Niels (red.), 2004, The Netherlands: Kluwer Academic Publishers.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning

  4. Udgivet

    Plasmid transfer of pBR322 derivatives from reeA E.coli K12 donor strain to various natural gram-negative isolates

    Sørensen, Søren Johannes, 1992, The Release of Genetically Modified Microorganisms. New York: Plenum Publishing Corporation, s. 197-198

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

  5. Udgivet

    Plasmids persist in a microbial community by providing fitness benefit to multiple phylotypes

    Li, L., Dechesne, A., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2020, I: I S M E Journal. 14, 5, s. 1170-1181 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Plasmids, viruses, and other circular elements in rat gut

    Jørgensen, T. S., Hansen, M. A., Xu, Z., Tabak, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 30 s.

    Publikation: Working paper › Forskning

  7. Udgivet

    Predation by protozoa on Escherichia coli K12 in soil and transfer of resistance plasmid RP4 to indigenous bacteria in soil

    Sørensen, Søren Johannes, Schyberg, T. & Rønn, Regin, 1999, I: Appl. Soil Ecol.. 11, s. 79-90

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Predominant genera of fecal microbiota in children with atopic dermatitis are not altered by intake of probiotic bacteria Lactobacillus acidophilus NCFM and Bifidobacterium animalis subsp.lactis Bi-07

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, Gøbel, R. J., Michaelsen, Kim F., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2011, I: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, s. 482-496 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Prenatal dietary supplements influence the infant airway microbiota in a randomized factorial clinical trial

    Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Vestergaard, G., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Brix, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Stokholm, Jakob & Bisgaard, H., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 426.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Presence of N-acyl Homoserine Lactones in Soil Detected by a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg, Oregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Microbial Ecology. 45, 3, s. 226-236 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Priority of Early Colonizers but No Effect on Cohabitants in a Synergistic Biofilm Community

    Olsen, N. M. C., Røder, Henriette Lyng, Russel, J., Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 8 s., 1949.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Probing Barophilic Microbial Communities for Novel Proteolytic Enzymes

    Frank, J. A., Hansen, M. A. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  13. Udgivet

    Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing

    Zakrzewski, M., Goesmann, A., Jaenicke, S., Jünemann, S., Eikmeyer, F., Szczepanowski, R., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Pühler, A. & Schlüter, A., 2012, I: Journal of Biotechnology. 158, 4, s. 248-258 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Prokaryotic Community Composition and Extracellular Polymeric Substances Affect Soil Microaggregation in Carbonate Containing Semiarid Grasslands

    Zethof, J. H. T., Bettermann, A., Vogel, C., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Woche, S. K., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Kalbitz, K., 2020, I: Frontiers in Environmental Science. 8, 19 s., 51.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Prophylactic treatment of breast implants with a solution of gentamicin, vancomycin and cefazolin antibiotics for women undergoing breast reconstructive surgery: protocol for a randomised, double-blind, placebo-controlled trial (The BREAST-AB trial)

    Hemmingsen, M. N., Larsen, A., Weltz, T. K., Ørholt, M., Wiberg, S., Bennedsen, A. K., Bille, C., Carstensen, L. F., Jensen, L. T., Bredgaard, R., Koudahl, V., Schmidt, Volker-Jürgen, Vester-Glowinski, Peter Viktor, Hølmich, Lisbet Rosenkrantz, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas, Damsgaard, Tine M Engberg & Herly, Mikkel, 2022, I: BMJ Open. 12, 9, s. e058697

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Quantification of bioavailable chlortetracycline in pig feces using a bacterial whole-cell biosensor

    Hansen, Lars Hestbjerg, Aarestrup, F. & Sørensen, Søren Johannes, 2002, I: Veterinary Microbiology. 87, 1, s. 51-57

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Quantification of plasmid loss in Escherichia coli cells by use of flow cytometry

    Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2004, I: FEMS Microbiology Letters. 232, 1, s. 45-49

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Quantitative Flow Cytometry to Understand Population Heterogeneity in Response to Changes in Substrate Availability in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae Chemostats

    Heins, A., Johanson, T., Han, S., Lundin, L., Carlquist, M., Gernaey, K. V., Sørensen, Søren Johannes & Lantz, A. E., 2019, I: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 7, 15 s., 187.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Quantitative metagenomic analyses based on average genome size normalization

    Frank, J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2011, I: Applied and Environmental Microbiology. 77, 7, s. 2513-2521 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris

    Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D., Winther, Jakob R. & Kühl, Michael, 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Recovery of GFP-labeled bacteria for culturing and molecular analysis after cell sorting using a benchtop flow cytometer

    Ferrari, B. C., Øregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Microbial Ecology. 48, s. 239-245

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Reduced tillage, cover crops and organic amendments affect soil microbiota and improve soil health in Uruguayan vegetable farming systems

    Cerecetto, V., Smalla, K., Nesme, Joseph, Garaycochea, S., Fresia, P., Sørensen, Søren Johannes, Babin, D. & Leoni, C., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab023.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Reporter Geneechnology in Soil Ecology; Detection of Bioavailability and Microbial Interactions

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Nucleic Acids and Proteins in Soil. Tyskland: Springer, s. 397-419

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

  24. Udgivet

    Response of the bacterial community in an on-farm biopurification system, to which diverse pesticides are introduced over an agricultural season

    Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Smalla, K., Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, okt. 2017, I: Environmental Pollution. 229, s. 854-862 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Rhizosphere microbial communities associated to rose replant disease: links to plant growth and root metabolites

    Yim, B., Baumann, A., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Zühlke, S., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Horticulture Research. 7, 16 s., 144.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Rifaximin has minor effects on bacterial composition, inflammation and bacterial translocation in cirrhosis: a randomized trial

    Kimer, N., Pedersen, J. S., Tavenier, J., Christensen, J. E., Busk, T. M., Hobolth, L., Krag, A., Abu Al-Soud, W., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Møller, Søren & Bendtsen, Flemming, jan. 2018, I: Journal of Gastroenterology and Hepatology. 33, 1, s. 307-314 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Root exposure to apple replant disease soil triggers local defense response and rhizoplane microbiome dysbiosis

    Balbín-Suárez, A., Jacquiod, S., Rohr, A. D., Liu, B., Flachowsky, H., Winkelmann, T., Beerhues, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Vetterlein, D. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 14 s., fiab031.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Rose replant disease: detailed analyses of plant reactions, root endophytes and rhizosphere microbial communities

    Baumann, A., Yim, B., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Acta Horticulturae. 1283, s. 97-104 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments

    Cyriaque, V., Jacquiod, S. J. A., Riber, Leise, Abu Al-Soud, W., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: Journal of Hazardous Materials. 382, 10 s., 121173.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Selection for Cu-tolerant bacterial communities with altered composition, but unaltered richness, via long-term Cu exposure

    Berg, J., Brandt, Kristian Koefoed, Abu Al-Soud, W., Holm, Peter Engelund, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Nybroe, O., 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, s. 7438-7446 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  32. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  33. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Lactococcus lactis c2 dairy bacteriphages with different thermal inactivation

    Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, C. L. M., Bashir, A., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Knoechel, Susanne, aug. 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  35. Udgivet

    Sequence of a SCCmec type VII (former VT) found in Danish ST8-t024-PVLneg CA-MRSA

    Boye, K., Pulis, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., apr. 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  36. Udgivet

    Sequencing of IncX-plasmids suggests ubiquity of mobile forms of a biofilm-promoting gene cassette recruited from Klebsiella pneumoniae

    Burmølle, Mette, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2012, I: PLOS ONE. 7, 7, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Sequentially aerated membrane biofilm reactors for autotrophic nitrogen removal: microbial community composition and dynamics

    Pellicer i Nàcher, C., Franck, S., Gülay, A., Ruscalleda, M., Terada, A., Abu Al-Soud, W., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2014, I: Microbial Biotechnology. 7, 1, s. 32-43 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Shifts in abundance and diversity of mobile genetic elements after the introduction of diverse pesticides into an on-farm biopurification system over the course of a year

    Dealtry, S., Holmsgaard, P. N., Dunon, V., Jechalke, S., Ding, G., Kroegerrecklenfort, E., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Zuehlke, S., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 13, s. 4012-4020 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Shifts in the microbial community structure explain the response of soil respiration to land-use change but not to climate warming

    Nazaries, L., Tottey, W., Robinson, L., Khachane, A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Singh, B. K., 2015, I: Soil Biology & Biochemistry. 89, s. 123-134 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Short- and long-term impacts of azithromycin treatment on the gut microbiota in children: a double-blind, randomized, placebo-controlled trial

    Wei, S., Mortensen, M. S., Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Trivedi, Urvish, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: EBioMedicine. 38, s. 265-272

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Similar sponge-associated bacteria can be acquired via both vertical and horizontal transmission

    Sipkema, D., de Caralt, S., Morillo, J. A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Smidt, H. & Uriz, M. J., 2015, I: Environmental Microbiology. 17, 10, s. 3807-3821 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Simultaneous pyrosequencing of the 16S rRNA, IncP-1 trfA, and merA genes

    Holmsgaard, P. N., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2013, I: Journal of Microbiological Methods. 95, 2, s. 280-284 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Single cell flow cytometry analysis of gene transfer from E. coli to indigenous freshwater bacteria reveals an up to 100 fold higher transfer, than determined by selective culturing

    Øregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2004

    Publikation: Andet › Andet bidrag › Formidling

  44. Udgivet

    Soil amendment with sewage sludge affects soil prokaryotic community composition, mobilome and resistome

    Wolters, B., Fornefeld, E., Jechalke, S., Su, J., Zhu, Y., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Jacquiod, S., 2019, I: F E M S Microbiology Reviews. 95, 1, s. 1-14 fiy193.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Soil bacteria show different tolerance ranges to an unprecedented disturbance

    Nunes, I. M., Jurburg, S., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Falcão Salles, J., Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, feb. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 2, s. 189–202 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Soil texture is a stronger driver of the maize rhizosphere microbiome and extracellular enzyme activities than soil depth or the presence of root hairs

    Yim, B., Ibrahim, Z., Rüger, L., Ganther, M., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Heintz-Buschart, A., Tarkka, M. T., Vetterlein, D., Bonkowski, M., Blagodatskaya, E. & Smalla, K., 2022, I: Plant and Soil. 478, 1-2, s. 229-251 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Spatial analysis of the root system coupled to microbial community inoculation shed light on rhizosphere bacterial community assembly

    Wei, S., Jacquiod, S., Philippot, L., Blouin, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Biology and Fertility of Soils. 57, 7, s. 973-989 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Specificity and stability of the Acromyrmex–Pseudonocardia symbiosis

    Andersen, Sandra Breum, Hansen, Lars Hestbjerg, Sapountzis, P., Sørensen, Søren Johannes & Boomsma, Jacobus J., 2013, I: Molecular Ecology. 22, 16, s. 4307-4321 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Stability and resilience of the intestinal microbiota in children in daycare - a 12 month cohort study

    Mortensen, M. S., Jensen, Betina Hebbelstrup, Williams, J., Brejnrod, A. D., Andersen, L. O., Röser, D., Andreassen, B. U., Petersen, Andreas Munk, Stensvold, C. R., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2018, I: BMC Microbiology. 18, 11 s., 223.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Studying bacterial multispecies biofilms: where to start?

    Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Trends in Microbiology. 24, 6, s. 503-513 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1...3 4 5 6 7 8 9 Næste

ID: 4269