Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor

ORCID: 0000-0001-6227-9906

Udgivelsesår:
Alle
301 - 400 ud af 411Pr. side: 100
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    Plasmid permissiveness of wastewater microbiomes can be predicted from 16S rRNA sequences by machine learning

    Moradigaravand, D., Li, L., Dechesne, A., Nesme, Joseph, de la Cruz, R., Ahmad, H., Banzhaf, M., Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F. & Kreft, J. U., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 7, 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    Plasmid transfer in aquatic environments. Molecular Microbial Ecology Manual

    Sørensen, Søren Johannes (red.), Øregaard, G. (red.), De Lipthay, J. R. (red.) & Kroer, Niels (red.), 2004, The Netherlands: Kluwer Academic Publishers.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning

  3. Udgivet

    Plasmid transfer of pBR322 derivatives from reeA E.coli K12 donor strain to various natural gram-negative isolates

    Sørensen, Søren Johannes, 1992, The Release of Genetically Modified Microorganisms. New York: Plenum Publishing Corporation, s. 197-198

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

  4. Udgivet

    Plasmids persist in a microbial community by providing fitness benefit to multiple phylotypes

    Li, L., Dechesne, A., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2020, I: I S M E Journal. 14, 5, s. 1170-1181 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Plasmids, viruses, and other circular elements in rat gut

    Jørgensen, T. S., Hansen, M. A., Xu, Z., Tabak, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 30 s.

    Publikation: Working paper › Forskning

  6. Udgivet

    Predation by protozoa on Escherichia coli K12 in soil and transfer of resistance plasmid RP4 to indigenous bacteria in soil

    Sørensen, Søren Johannes, Schyberg, T. & Rønn, Regin, 1999, I: Appl. Soil Ecol.. 11, s. 79-90

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Predominant genera of fecal microbiota in children with atopic dermatitis are not altered by intake of probiotic bacteria Lactobacillus acidophilus NCFM and Bifidobacterium animalis subsp.lactis Bi-07

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, Gøbel, R. J., Michaelsen, Kim F., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2011, I: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, s. 482-496 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Prenatal dietary supplements influence the infant airway microbiota in a randomized factorial clinical trial

    Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Vestergaard, G., Mortensen, M. S., Brejnrod, A., Brix, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Stokholm, Jakob & Bisgaard, H., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 426.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Presence of N-acyl Homoserine Lactones in Soil Detected by a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg, Oregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Microbial Ecology. 45, 3, s. 226-236 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Priority of Early Colonizers but No Effect on Cohabitants in a Synergistic Biofilm Community

    Olsen, N. M. C., Røder, Henriette Lyng, Russel, J., Madsen, Jonas Stenløkke, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 8 s., 1949.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Probing Barophilic Microbial Communities for Novel Proteolytic Enzymes

    Frank, J. A., Hansen, M. A. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  12. Udgivet

    Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing

    Zakrzewski, M., Goesmann, A., Jaenicke, S., Jünemann, S., Eikmeyer, F., Szczepanowski, R., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Pühler, A. & Schlüter, A., 2012, I: Journal of Biotechnology. 158, 4, s. 248-258 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Prokaryotic Community Composition and Extracellular Polymeric Substances Affect Soil Microaggregation in Carbonate Containing Semiarid Grasslands

    Zethof, J. H. T., Bettermann, A., Vogel, C., Babin, D., Cammeraat, E. L. H., Solé-Benet, A., Lázaro, R., Luna, L., Nesme, Joseph, Woche, S. K., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Kalbitz, K., 2020, I: Frontiers in Environmental Science. 8, 19 s., 51.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Prophylactic treatment of breast implants with a solution of gentamicin, vancomycin and cefazolin antibiotics for women undergoing breast reconstructive surgery: protocol for a randomised, double-blind, placebo-controlled trial (The BREAST-AB trial)

    Hemmingsen, M. N., Larsen, A., Weltz, T. K., Ørholt, M., Wiberg, S., Bennedsen, A. K., Bille, C., Carstensen, L. F., Jensen, L. T., Bredgaard, R., Koudahl, V., Schmidt, Volker-Jürgen, Vester-Glowinski, Peter Viktor, Hølmich, Lisbet Rosenkrantz, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas, Damsgaard, Tine M Engberg & Herly, Mikkel, 2022, I: BMJ Open. 12, 9, s. e058697

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Quantification of bioavailable chlortetracycline in pig feces using a bacterial whole-cell biosensor

    Hansen, Lars Hestbjerg, Aarestrup, F. & Sørensen, Søren Johannes, 2002, I: Veterinary Microbiology. 87, 1, s. 51-57

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Quantification of plasmid loss in Escherichia coli cells by use of flow cytometry

    Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2004, I: FEMS Microbiology Letters. 232, 1, s. 45-49

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Quantitative Flow Cytometry to Understand Population Heterogeneity in Response to Changes in Substrate Availability in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae Chemostats

    Heins, A., Johanson, T., Han, S., Lundin, L., Carlquist, M., Gernaey, K. V., Sørensen, Søren Johannes & Lantz, A. E., 2019, I: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 7, 15 s., 187.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Quantitative metagenomic analyses based on average genome size normalization

    Frank, J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2011, I: Applied and Environmental Microbiology. 77, 7, s. 2513-2521 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris

    Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, Søren Johannes, Larkum, A. W. D., Winther, Jakob R. & Kühl, Michael, 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Recovery of GFP-labeled bacteria for culturing and molecular analysis after cell sorting using a benchtop flow cytometer

    Ferrari, B. C., Øregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Microbial Ecology. 48, s. 239-245

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Reduced tillage, cover crops and organic amendments affect soil microbiota and improve soil health in Uruguayan vegetable farming systems

    Cerecetto, V., Smalla, K., Nesme, Joseph, Garaycochea, S., Fresia, P., Sørensen, Søren Johannes, Babin, D. & Leoni, C., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s., fiab023.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Reporter Geneechnology in Soil Ecology; Detection of Bioavailability and Microbial Interactions

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Nucleic Acids and Proteins in Soil. Tyskland: Springer, s. 397-419

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

  23. Udgivet

    Response of the bacterial community in an on-farm biopurification system, to which diverse pesticides are introduced over an agricultural season

    Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Smalla, K., Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, okt. 2017, I: Environmental Pollution. 229, s. 854-862 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Rhizosphere microbial communities associated to rose replant disease: links to plant growth and root metabolites

    Yim, B., Baumann, A., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Zühlke, S., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Horticulture Research. 7, 16 s., 144.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Rifaximin has minor effects on bacterial composition, inflammation and bacterial translocation in cirrhosis: a randomized trial

    Kimer, N., Pedersen, J. S., Tavenier, J., Christensen, J. E., Busk, T. M., Hobolth, L., Krag, A., Abu Al-Soud, W., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Møller, Søren & Bendtsen, Flemming, jan. 2018, I: Journal of Gastroenterology and Hepatology. 33, 1, s. 307-314 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Root exposure to apple replant disease soil triggers local defense response and rhizoplane microbiome dysbiosis

    Balbín-Suárez, A., Jacquiod, S., Rohr, A. D., Liu, B., Flachowsky, H., Winkelmann, T., Beerhues, L., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Vetterlein, D. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 4, 14 s., fiab031.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Rose replant disease: detailed analyses of plant reactions, root endophytes and rhizosphere microbial communities

    Baumann, A., Yim, B., Grunewaldt-Stöcker, G., Liu, B., Beerhues, L., Sapp, M., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Winkelmann, T., 2020, I: Acta Horticulturae. 1283, s. 97-104 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments

    Cyriaque, V., Jacquiod, S. J. A., Riber, Leise, Abu Al-Soud, W., Gillan, D. C., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2020, I: Journal of Hazardous Materials. 382, 10 s., 121173.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Selection for Cu-tolerant bacterial communities with altered composition, but unaltered richness, via long-term Cu exposure

    Berg, J., Brandt, Kristian Koefoed, Abu Al-Soud, W., Holm, Peter Engelund, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Nybroe, O., 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, s. 7438-7446 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  31. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  32. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Lactococcus lactis c2 dairy bacteriphages with different thermal inactivation

    Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, C. L. M., Bashir, A., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes & Knoechel, Susanne, aug. 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  34. Udgivet

    Sequence of a SCCmec type VII (former VT) found in Danish ST8-t024-PVLneg CA-MRSA

    Boye, K., Pulis, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., apr. 2011.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  35. Udgivet

    Sequencing of IncX-plasmids suggests ubiquity of mobile forms of a biofilm-promoting gene cassette recruited from Klebsiella pneumoniae

    Burmølle, Mette, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2012, I: PLOS ONE. 7, 7, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Sequentially aerated membrane biofilm reactors for autotrophic nitrogen removal: microbial community composition and dynamics

    Pellicer i Nàcher, C., Franck, S., Gülay, A., Ruscalleda, M., Terada, A., Abu Al-Soud, W., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2014, I: Microbial Biotechnology. 7, 1, s. 32-43 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Shifts in abundance and diversity of mobile genetic elements after the introduction of diverse pesticides into an on-farm biopurification system over the course of a year

    Dealtry, S., Holmsgaard, P. N., Dunon, V., Jechalke, S., Ding, G., Kroegerrecklenfort, E., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Zuehlke, S., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 13, s. 4012-4020 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Shifts in the microbial community structure explain the response of soil respiration to land-use change but not to climate warming

    Nazaries, L., Tottey, W., Robinson, L., Khachane, A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Singh, B. K., 2015, I: Soil Biology & Biochemistry. 89, s. 123-134 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Short- and long-term impacts of azithromycin treatment on the gut microbiota in children: a double-blind, randomized, placebo-controlled trial

    Wei, S., Mortensen, M. S., Stokholm, Jakob, Brejnrod, A. D., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Trivedi, Urvish, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: EBioMedicine. 38, s. 265-272

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Similar sponge-associated bacteria can be acquired via both vertical and horizontal transmission

    Sipkema, D., de Caralt, S., Morillo, J. A., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Smidt, H. & Uriz, M. J., 2015, I: Environmental Microbiology. 17, 10, s. 3807-3821 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Simultaneous pyrosequencing of the 16S rRNA, IncP-1 trfA, and merA genes

    Holmsgaard, P. N., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2013, I: Journal of Microbiological Methods. 95, 2, s. 280-284 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Single cell flow cytometry analysis of gene transfer from E. coli to indigenous freshwater bacteria reveals an up to 100 fold higher transfer, than determined by selective culturing

    Øregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2004

    Publikation: Andet › Andet bidrag › Formidling

  43. Udgivet

    Soil amendment with sewage sludge affects soil prokaryotic community composition, mobilome and resistome

    Wolters, B., Fornefeld, E., Jechalke, S., Su, J., Zhu, Y., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Jacquiod, S., 2019, I: F E M S Microbiology Reviews. 95, 1, s. 1-14 fiy193.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Soil bacteria show different tolerance ranges to an unprecedented disturbance

    Nunes, I. M., Jurburg, S., Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Falcão Salles, J., Priemé, Anders & Sørensen, Søren Johannes, feb. 2018, I: Biology and Fertility of Soils. 54, 2, s. 189–202 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Soil texture is a stronger driver of the maize rhizosphere microbiome and extracellular enzyme activities than soil depth or the presence of root hairs

    Yim, B., Ibrahim, Z., Rüger, L., Ganther, M., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Heintz-Buschart, A., Tarkka, M. T., Vetterlein, D., Bonkowski, M., Blagodatskaya, E. & Smalla, K., 2022, I: Plant and Soil. 478, 1-2, s. 229-251 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Spatial analysis of the root system coupled to microbial community inoculation shed light on rhizosphere bacterial community assembly

    Wei, S., Jacquiod, S., Philippot, L., Blouin, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Biology and Fertility of Soils. 57, 7, s. 973-989 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Specificity and stability of the Acromyrmex–Pseudonocardia symbiosis

    Andersen, Sandra Breum, Hansen, Lars Hestbjerg, Sapountzis, P., Sørensen, Søren Johannes & Boomsma, Jacobus J., 2013, I: Molecular Ecology. 22, 16, s. 4307-4321 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Stability and resilience of the intestinal microbiota in children in daycare - a 12 month cohort study

    Mortensen, M. S., Jensen, Betina Hebbelstrup, Williams, J., Brejnrod, A. D., Andersen, L. O., Röser, D., Andreassen, B. U., Petersen, Andreas Munk, Stensvold, C. R., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2018, I: BMC Microbiology. 18, 11 s., 223.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Studying bacterial multispecies biofilms: where to start?

    Røder, Henriette Lyng, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2016, I: Trends in Microbiology. 24, 6, s. 503-513 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Studying plasmid horizontal transfer in situ: a critical review

    Sørensen, Søren Johannes, Bailey, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Kroer, Niels & Wuertz, S., 2005, I: Nature Reviews. Microbiology. 3, 9, s. 700-710

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning

  51. Udgivet

    Substrate specificity of the OqxAB multidrug resistance pump in Escherichia coli and selected enteric bacteria

    Hansen, Lars Hestbjerg, Jensen, L. B., Sørensen, H. I. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 60, 1, s. 145-147

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. Udgivet

    Survival of Escherichia coli K12 in seawater

    Sørensen, Søren Johannes, 1991, I: FEMS Microbiology Ecology. 85, s. 161-168

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  53. Udgivet

    Synbiotic Lactobacillus acidophilus NCFM and cellobiose does not affect human gut bacterial diversity but increases abundance of lactobacilli, bifidobacteria and branched-chain fatty acids: a randomized, double-blinded cross-over trial

    van Zanten, G. C., Krych, Lukasz, Röytiö, H., Forssten, S., Lahtinen, S. J., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Svensson, B., Jespersen, Lene & Jakobsen, M., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 225-236 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    Synergistic Interactions in Microbial Biofilms Facilitate the Establishment of Opportunistic Pathogenic Fungi in Household Dishwashers

    Zupancic, J., Raghupathi, P. K., Houf, K., Burmølle, Mette, Sørensen, Søren Johannes & Gunde-Cimerman, N., 2018, I: Frontiers in Microbiology. 9, 13 s., 21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    Synergistic Interactions within a Multispecies Biofilm Enhance Individual Species Protection against Grazing by a Pelagic Protozoan

    Raghupathi, P. K., Liu, W., Sabbe, K., Houf, K., Burmølle, Mette & Sørensen, Søren Johannes, 2018, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2649.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  56. Udgivet

    Tailings microbial community profile and prediction of its functionality in basins of tungsten mine

    Chung, A. P., Coimbra, C., Farias, P., Francisco, R., Branco, R., Simão, F. V., Gomes, E., Pereira, A., Vila, M. C., Fiúza, A., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 19596.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  57. Udgivet

    Temporal oral microbiome changes with brushing in children with cleft lip and palate

    Rodrigues, R., Chung, A. P., Mortensen, M. S., Fernandes, M. H., Monteiro, A. B., Furfuro, R., Silva, C. C., Manso, M. C., Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2021, I: Heliyon. 7, 9 s., e06513.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    The cda GenoTox assay: A new sensitive method for detection of environmental genotoxins, including nitroarenes and aromatic amines

    Østergaard, T. G., Hansen, Lars Hestbjerg, Binderup, M., Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Mutation Research - Reviews. 631, 2, s. 77-84

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    The Airway Microbiota Modulates Effect of Azithromycin Treatment for Episodes of Recurrent Asthma-like Symptoms in Preschool Children: A Randomized Clinical Trial

    Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt, Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Hjelmsø, M., Shah, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes & Bisgaard, H., 2021, I: American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 204, 2, s. 149-158

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    The Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Field Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  61. Udgivet

    The Effect of Long Term Mercury Pollution on the Soil Microbial Community

    Müller, A. K., Westergaard, K., Christensen, Søren & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: FEMS Microbiology Ecology. 36, 1, s. 11-19

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  62. Udgivet

    The Prevalence of the OqxAB Multidrug Efflux Pump amongst Olaquindox-Resistant Escherichia coli in Pigs

    Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Jørgensen, H. S. & Jensen, L. B., 2005, I: Microbial Drug Resistance. 11, 4, s. 378-382

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  63. Udgivet

    The ability of soil bacteria to receive the conjugative IncP1 plasmid, pKJK10, is different in a mixed community compared to single strains

    de la Cruz Perera, C. I., Ren, D., Blanchet, M., Dendooven, L., Marsch, R., Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2013, I: F E M S Microbiology Letters. 338, 1, s. 95-100 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    The airway microbiota of neonates colonized with asthma-associated pathogenic bacteria

    Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Li, Xuan Ji, Peng, Shuang, Sunde, R. B., Shah, S. A., Bhattacharyya, M., Poulsen, C. S., Poulsen, Christina Egeø, Leal Rodriguez, C., Widdowson, Michael Lawrence, Neumann, A. U., Trivedi, Urvish, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Nature Communications. 14, 12 s., 6668.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  65. Udgivet

    The bacterial microbiota in first-void urine from men with and without idiopathic urethritis

    Frølund, M., Wikström, A., Lidbrink, P., Abu Al-Soud, W., Larsen, N., Harder, C. B., Sørensen, Søren Johannes, Jensen, J. S. & Ahrens, P., 2018, I: PLoS ONE. 13, 7, s. 1-19 e0201380.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  66. Udgivet

    The developing airway and gut microbiota in early life is influenced by age of older siblings

    Christensen, E. D., Hjelmsø, M. H., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Shah, S., Redgwell, T., Poulsen, Christina Egeø, Trivedi, Urvish, Russel, J., Gupta, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2022, I: Microbiome. 10, 15 s., 106.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  67. Udgivet

    The developing hypopharyngeal microbiota in early life

    Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Roggenbuck, M., Abu Al-Soud, W., Balle, C., Krogfelt, K. A., Stokholm, Jakob, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Waage, J. E., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Microbiome. 4, 12 s., 70.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  68. Udgivet

    The diversity, structure and function of soil microbial communities exposed to different disturbances

    Müller, A. K., Westergaard, K., Christensen, S. & Sørensen, Søren Johannes, 2002, I: Microbial Ecology. 44, s. 49-58

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  69. Udgivet

    The effect of acetate on population heterogeneity in different cellular characteristics of Escherichia coli in aerobic batch cultures

    Heins, A., Lundin, L., Nunes, I., Gernaey, K. V., Sørensen, Søren Johannes & Eliasson Lantz, A., 2019, I: Biotechnology Progress. 35, 3, e2796.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  70. Udgivet

    The effect of early probiotic exposure on the preterm infant gut microbiome development

    Hui, Y., Smith, Birgitte, Mortensen, M. S., Krych, Lukasz, Sørensen, Søren Johannes, Greisen, Gorm, Krogfelt, K. A. & Nielsen, Dennis Sandris, 2021, I: Gut Microbes. 13, 1, 15 s., 1951113.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  71. Udgivet

    The effect of longterm exposure to mercury on the bacterial community in marine sediment

    Rasmussen, L. D. & Sørensen, Søren Johannes, 1998, I: Current Microbiology. 36, s. 291-297

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  72. Udgivet

    The effect of the lacY gene on the induction of IPTG inducible promoters, studied in Escherichia coli and Pseudomonas fluorescens

    Hansen, Lars Hestbjerg, Knudsen, S. & Sørensen, Søren Johannes, 1998, I: Current Microbiology. 36, 6, s. 341-347

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  73. Udgivet

    The effect of L. acidophilus NCFM intake on insulin sensitivity and gut microbiota: a randomized placebo-controlled trial

    Larsen, Nadja, Andreasen, A. S., Pedersen-Skovsgaard, T., Møller, K., van den Berg, F. W. J., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Pedersen, Bente Klarlund & Jakobsen, M., sep. 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  74. Udgivet

    The fate of indigenous microbiota, starter cultures, Escherichia coli, Listeria innocua and Staphylococcus aureus in Danish raw milk and cheeses determined by pyrosequencing and quantitative real time (qRT)-PCR

    Masoud, W. M. H., Vogensen, Finn Kvist, Lillevang, S., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Jakobsen, M., 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 153, 1-2, s. 192-202 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  75. Udgivet

    The fate of mercury in Arctic terrestrial and aquatic ecosystems, a review

    Douglas, T. A., Loseto, L. L., Macdonald, R. W., Outridge, P., Dommergue, A., Poulain, A., Amyot, M., Barkay, T., Berg, T., Chételat, J., Constant, P., Evans, M., Ferrari, C., Gantner, N., Johnson, M. S., Kirk, J., Kroer, N., Larose, C., Lean, D., Nielsen, T. G. & 7 flere, Poissant, L., Rognerud, S., Skov, H., Sørensen, Søren Johannes, Wang, F., Wilson, S. & Zdanowicz, C. M., 2012, I: Environmental Chemistry (Online). 9, 4, s. 321-355 35 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  76. Udgivet

    The genome sequence of the lactic acid bacterium, Carnobacterium maltaromaticum ATCC 35586 encodes potential virulence factors

    Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Larsen, M. H., Hansen, L., Ingmer, Hanne & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: International Journal of Food Microbiology. 152, 3, s. 107-115 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  77. Udgivet

    The giraffe (Giraffa camelopardalis) rumen microbiome

    Roggenbuck, M., Sauer, C., Poulsen, M., Bertelsen, M. F. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 237-246 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  78. Udgivet

    The gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Nielsen, Dennis Sandris, Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van den Berg, F. W. J., Andreasen, A. S., Pedersen, B. K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010. 1 s.

    Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  79. Udgivet

    The impact of the conjugative IncP-1 plasmid pKJK5 on multispecies biofilm formation is dependent on the plasmid host

    Røder, Henriette Lyng, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2013, I: F E M S Microbiology Letters. 344, 2, s. 186-192 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    The infant gut resistome associates with E. coli, environmental exposures, gut microbiome maturity, and asthma-associated bacterial composition

    Li, Xuan Ji, Stokholm, Jakob, Brejnrod, A., Vestergaard, G. A., Russel, J., Trivedi, Urvish, Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Gupta, S., Hjelmsø, M. H., Shah, S. A., Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Cell Host & Microbe. 29, 6, s. 975–987.e4 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    The infant gut virome is associated with preschool asthma risk independently of bacteria

    Rodríguez, C. L., Shah, S. A., Rasmussen, Morten Arendt, Thorsen, J., Boulund, U., Pedersen, C. T., Castro-Mejía, J. L., Poulsen, Christina Egeø, Poulsen, C. S., Deng, Ling, Larsen, Frej Andreas Nøhr, Widdowson, Michael Lawrence, Zhang, Yichang, Sørensen, Søren Johannes, Moineau, S., Petit, M. A., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Nielsen, Dennis Sandris & Stokholm, Jakob, 2023, I: Nature Medicine. 30, s. 138-148 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  82. Udgivet

    The initial inoculation ratio regulates bacterial coculture interactions and metabolic capacity

    Gao, C., Cao, H., Cai, P. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: ISME Journal. 15, s. 29-40 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  83. Udgivet

    The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 183-195 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  84. Udgivet

    The lactic acid bacterium, Carnobacterium maltaromaticum possess a diverse range of potential virulence genes some of which are related to similar genes in Listeria monocytogenes

    Leisner, Jørgen, Hansen, M. A., Larsen, M. H., Ingmer, Hanne, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  85. Udgivet

    The microbiome of New World vultures

    Roggenbuck, M., Schnell, I. B., Blom, N., Bælum, J., Bertelsen, M. F., Sicheritz-Pontén, T., Sørensen, Søren Johannes, Gilbert, M Thomas P, Graves, G. R. & Hansen, L. H., 2014, I: Nature Communications. 5, 7 s., 5498.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  86. Udgivet

    The microbiome of captive hamadryas baboons

    Li, Xuan Ji, Trivedi, Urvish, Brejnrod, A. D., Vestergaard, G. A., Mortensen, M. S., Bertelsen, Mads Frost & Sørensen, Søren Johannes, 2020, I: BMC Animal Microbiome. 2, 10 s., 25.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  87. Udgivet

    The multiple antibiotic resistance IncP-1 plasmid pKJK5 isolated from a soil environment is phylogenetically divergent from members of the previously established a, ß and d sub-groups

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Goesmann, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Plasmid. 58, 1, s. 31-43

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  88. Udgivet

    The murine lung microbiome in relation to the intestinal and vaginal bacterial communities

    Barfod, K. K., Roggenbuck, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Schjørring, S., Larsen, S. T., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2013, I: B M C Microbiology. 13, 12 s., 303.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  89. Udgivet

    The mycorrhizal fungus (Glomus intraradices) affects microbial activity in the rhizosphere of pea plants (Pisum sativum)

    Wamberg, C., Christensen, Søren, Jakobsen, I., Müller, A. K. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Soil Biology & Biochemistry. Vol. 35, issue 10, s. 1349-1357

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  90. Udgivet

    The needle mycobiome of Picea glauca – A dynamic system reflecting surrounding environment and tree phenological traits

    Würth, D. G., Dahl, M. B., Trouillier, M., Wilmking, M., Unterseher, M., Scholler, M., Sørensen, Søren Johannes, Mortensen, M. & Schnittler, M., 2019, I: Fungal Ecology. 41, s. 177-186 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  91. Udgivet

    The nitrogenase gene pool in surface waters of the global ocean is dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Hagström & Riemann, Lasse, 2010.

    Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

  92. Udgivet

    The presence of embedded bacterial pure cultures in agar plates stimulate the culturability of soil bacteria.

    Burmølle, Mette, Johnsen, K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Journal of Microbiological Methods. 79, 2, s. 166-173 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  93. Udgivet

    The scent of symbiosis: gut bacteria may affect social interactions in leaf-cutting ants

    Teseo, S., van Zweden, J. S., Pontieri, L., Kooij, P. W., Sørensen, Søren Johannes, Wenseleers, T., Poulsen, Michael, Boomsma, Jacobus J. & Sapountzis, P., 2019, I: Animal Behaviour. 150, s. 239-254

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  94. Udgivet

    The treasure inside barley seeds: microbial diversity and plant beneficial bacteria

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Straube, B., Wehner, G., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: Environmental Microbiomes. 16, 21 s., 20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  95. Udgivet

    The use of whole-cell biosensors to detect and quantify compounds or conditions affecting biological systems

    Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: Microbial Ecology. 42, 4, s. 483-494

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  96. Udgivet

    Tillage shapes the soil and rhizosphere microbiome of barley - but not its susceptibility towards Blumeria graminis f. sp. hordei

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Douchkov, D., Lueck, S., Babin, D., Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 3, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  97. Udgivet

    Transfer of plasmid RP4 in the spermosphere and rhizosphere of barley seedling

    Sørensen, Søren Johannes & Jensen, L., 1998, I: Antonie van Leeuwenhoek. International Journal of General and Molecular Microbiology. 73, s. 69-77

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  98. Udgivet

    Type 3 fimbriae encoded on plasmids are expressed from a unique promoter without affecting host motility, facilitating an exceptional phenotype that enhances conjugal plasmid transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Riber, Leise, Kot, Witold, Basfeld, A., Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: P L o S One. 11, 9, 19 s., e0162390.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  99. Udgivet

    Type 3 fimbriae, encoded by the conjugative plasmid pOLA52, enhance biofilm formation and transfer frequencies in Enterobacteriaceae strains

    Burmølle, Mette, Bahl, M. I., Jensen, L. B., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2008, I: Microbiology. 154, Pt 1, s. 187-95 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  100. Udgivet

    Type IV CRISPR-Cas systems are highly diverse and involved in competition between plasmids

    Pinilla Redondo, Rafael, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Garrett, Roger Antony, Randau, L., Sørensen, Søren Johannes & Shah, S. A., 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 4, s. 2000-2012 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 Næste

ID: 4269