Xu Peng
Professor
Functional genomics
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 1999
- Udgivet
Growth factors and gene expression in cultured hepatocytes
Grunnet, N., Peng, Xu & Tygstrup, N., 1999, I: Jounal of Hepatology. 30, s. 117-122Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2000
- Udgivet
Evolution of the family of pRN plasmids and their integrase-mediated insertion into the chromosome of the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus
Peng, Xu, Holz, I., Zillig, W., Garrett, Roger Antony & She, Q., 2000, I: Journal of Molecular Biology. 303, s. 449-454Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene content and organization of a 281-kbp contig from the genome of the extremely thermophilic archaeon, Sulfolobus solfataricus P2
Charlebois, R. L., Singh, R. K., Chan-Weiher, CC-Y., Allard, G., Chow, C., Confalonieri, F., Curtis, B., Duguet, M., Erauso, G., Faguy, D., Gaasterland, T., Garrett, R. A., Gordon, P., Jeffries, A. C., Kozera, C., Kushwaha, N., Lafleur, E., Medina, N., Peng, X., Penny, S. L. & 8 flere, , 2000, I: Genome. 43, s. 116-136Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2001
- Udgivet
Gene capture in archaeal chromosomes.
She, Q., Peng, Xu, Zillig, W. & Garrett, Roger Antony, 2001, I: Nature. 409, s. 478Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sequences and replication of the archaeal rediviruses SIRV1 and SIRV2 relationships to the archaeal lipothrixvirus SIFV and some eukaryal viruses
Peng, Xu, Blum, H., She, Q., Mallok, H., Brügger, K., Garrett, R. A., Zillig, W. & Prangishvili, D., 2001, I: Virology. 291, s. 226-234Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The complete genome of the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus P2.
She, Q., Singh, R. K., Confalonieri, F., Zivanovic, Y., Allard, G., Awayez, M. J., Chan-Weiher, CC-Y., Clausen, I. G., Curtis, B. A., De Moors, A., Erauso, G., Fletcher, C., Gordon, P. M., Heikamp-de Jong, I., Jeffries, A. C., Kozera, C. J., Medina, N., Peng, X., Phan, T. N. H., Redder, P. B. & 11 flere, , 2001, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 98, s. 7835-7840Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2003
- Udgivet
AFV1 a novel virus infecting hyperthermophilic archaea of the genus Acidianus
Bettstetter, M., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2003, I: Virology. 315, s. 69-79Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
AFV1, a novel virus infecting hyperthermophilic archaea of the genus Acidianus.
Bettstetter, M., Peng, Xu & Garrett RA, Prangishvili D., G. R. P. D., 2003, I: Virology.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genus-specific protein binding to the large clusters of DNA repeats (short regularly spaced repeats) present in Sulfolobus genomes
Peng, Xu, Brügger, K., Shen, B., Chen, L., She, Q. & Garrett, Roger Antony, 2003, I: Journal of Bacteriology. 185, 8, s. 2410-7 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2004
- Udgivet
Morphology and genome organisation of the virus PSV of the hyperthermophilic archaeal genera Pyrobaculum and Thermoproteus: A novel virus family, the Globuloviridae
Häring , M., Peng, Xu & Brugger K., Rachel R., Stetter K.O., Garrett R.A.,Prangishvili D., B. K. ,. R. R. ,. S. K. O. ,. G. R. A. ,. D., 2004, I: Virology.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multiple variants of the archaeal dna rudivirus SIRV1 in a single host and a novel mechanism of genomic variation
Peng, Xu, Kessler, A., Phan, H., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2004, I: Molecular Microbiology. Vol. 54 (2), s. 366-375Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
- Udgivet
A novel rudivirus, ARV1, of the hyperthermophilic archaeal genus Acidianus
Vestergaard, G. A., Häring, M., Peng, Xu, Rachel, R., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2005, I: Virology. 336, 1, s. 83-92 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Viral Diversity in Hot Springs of Pozzuoli, Italy, and Characterization of a Unique Archaeal Virus, Acidianus Bottle-Shaped Virus, from a New Family, the Ampullaviridae
Häring, M., Rachel, R., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2005, I: Journal of Virology. 79, 15, s. 9904 - 9911Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2006
- Udgivet
How to induce non-polarized cells of hepatic origin to express typical hepatocyte polarity: generation of new highly polarized cell models with developed and functional bile canaliculi
Peng, Xu & Grosse B, Le Tiec B, Nicolas V, Delagebeaudeuf C, Bedda T, Decaens C, Cassio D, G. B. L. T. B. N. V. D. C. B. T. D. C. C. D., 2006, I: Cell and Tissue Research.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sulfolobus genomes: mechanisms of rearrangement and change
Brügger, K., Peng, Xu & Garrett, Roger Antony, 2006, Archaea: Evolution, physiology and Molecular Biolog.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- 2007
- Udgivet
Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms
Peng, Xu, Basta, T., Häring, M., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2007, I: Virology. 364, 1, s. 237-43 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
- Udgivet
Evidence for the horizontal transfer of an integrase gene from a fusellovirus to a pRN-like plasmid within a single strain of Sulfolobus and the implications for plasmid survival
Peng, Xu, 2008, I: Microbiology. 154, Pt 2, s. 383-91 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure of the acidianus filamentous virus 3 and comparative genomics of related archaeal lipothrixviruses
Vestergaard, G. A., Aramayo, R., Basta, T., Häring, M., Peng, Xu, Brügger, K., Chen, L., Rachel, R., Boisset, N., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2008, I: Journal of Virology. 82, 1, s. 371-381 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Viruses in acidic geothermal environments of the Kamchatka Peninsula
Bize, A., Peng, Xu, Prokofeva, M., Maclellan, K., Lucas, S., Forterre, P., Garrett, Roger Antony, Bonch-Osmolovskaya, E. A. & Prangishvili, D., 2008, I: Research in Microbiology. 159, 5, s. 358-66 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
- Udgivet
Four newly isolated fuselloviruses from extreme geothermal environments reveal unusual morphologies and a possible interviral recombination mechanism
Redder, P., Peng, Xu, Brügger, K., Shah, S. A., Roesch, F., Greve, B., She, Q., Schleper, C., Forterre, P., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2009, I: Environmental Microbiology. 11, 11, s. 2849-62 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel archaeal plasmid pAH1 and its interactions with the lipothrixvirus AFV1
Basta, T., Smyth, J., Forterre, P., Prangishvili, D. & Peng, Xu, 2009, I: Molecular Microbiology. 71, 1, s. 23-34 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
Familial relationships in hyperthermo- and acidophilic archaeal viruses
Happonen, L. J., Redder, P., Peng, Xu, Reigstad, L. J., Prangishvili, D. & Butcher, S. J., 1 maj 2010, I: Journal of Virology. 84, 9, s. 4747-54 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Scottish Structural Proteomics Facility: targets, methods and outputs
Oke, M., Carter, L. G., Johnson, K. A., Liu, H., McMahon, S. A., Yan, X., Kerou, M., Weikart, N. D., Kadi, N., Sheikh, M. A., Schmelz, S., Dorward, M., Zawadzki, M., Cozens, C., Falconer, H., Powers, H., Overton, I. M., van Niekerk, C. A. J., Peng, X., Patel, P. & 11 flere, , 1 jun. 2010, I: Journal of Structural and Functional Genomics. 11, 2, s. 167-80 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analyses of novel viruses and plasmids from a cultured environmental sample of hyperthermophilic neutrophiles
Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Shah, S. A., Reuter, M., Stetter, K. O. & Peng, Xu, 1 nov. 2010, I: Environmental Microbiology. 12, 11, s. 2918-30 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
- Udgivet
A dimeric Rep protein initiates replication of a linear archaeal virus genome: implications for the Rep mechanism and viral replication
Oke, M., Kerou, M., Liu, H., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Naismith, J. H. & White, M. F., 2011, I: Journal of Virology. 85, 2, s. 925-31 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Archaeal viruses-novel, diverse and enigmatic
Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & She, Q., 2012, I: Science China Life Sciences. 55, 5, s. 422-433 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ekstremernes herrer
Uldahl, K. B. & Peng, Xu, 2012, I: Aktuel Naturvidenskab. 2012, 05, s. 28-29 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Modulation of CRISPR locus transcription by the repeat-binding protein Cbp1 in Sulfolobus
Deng, Ling, Kenchappa, C. S., Peng, Xu, She, Q. & Garrett, Roger Antony, 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 6, s. 2470-2480 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2013
- Udgivet
A novel interference mechanism by a type IIIB CRISPR-Cmr module in Sulfolobus
Deng, Ling, Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Peng, Xu & She, Q., 2013, I: Molecular Microbiology. 87, 5, s. 1088-1099 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biology, biodiversity and application potential of thermophilic viruses
Uldahl, K. B. & Peng, Xu, 2013, Thermophilic Microbes in Environmental and Industrial Biotechnology: Biotechnology of Thermophiles. Satyanarayana, T., Littlechild, J. & Kawarabayasi, Y. (red.). Springer, s. 271-304 34 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome Sequence of a Novel Archaeal Fusellovirus Assembled from the Metagenome of a Mexican Hot Spring
Servin-Garciduenas, L. E., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Martinez-Romero, E., 2013, I: Genome Announcements. 1, s. 1-2 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome Sequence of a Novel Archaeal Rudivirus Recovered from a Mexican Hot Spring
Servín-Garcidueñas, L., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Martínez-Romero, E., 2013, I: Genome Announcements. 1, 1, s. 1-2 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular cloning and antimicrobial activity of enterolysin A and helveticin J of bacteriolysins from metagenome of Chinese traditional fermented foods
Zhang, T., Pan, Y., Li, B., Ou, J., Zhang, J., Chen, Y., Peng, Xu & Chen, L., 2013, I: Food Control. 31, 2, s. 499-507 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel insights into gene regulation of the rudivirus SIRV2 infecting Sulfolobus cells
Okutan, E., Deng, Ling, Mirlashari, S., Uldahl, K., Halim, M., Liu, C., Garrett, Roger Antony, She, Q. & Peng, Xu, 2013, I: R N A Biology. 10, 5, s. 1-11 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2014
- Udgivet
First experimental evidence for the presence of a CRISPR toxin in Sulfolobus
He, F., Chen, L. & Peng, Xu, 2014, I: Journal of Molecular Biology. 426, 22, s. 3683-3688 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Insights into Vibrio parahaemolyticus CHN25 response to artificial gastric fluid stress by transcriptomic analysis
Sun, X., Liu, T., Peng, Xu & Chen, L., 2014, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 15, 12, s. 22539-22562 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analyses reveal phylogenetic diversity of carboxypeptidase gene sequences in activated sludge of a wastewater treatment plant in Shanghai, China
Jin, H., Li, B., Peng, Xu & Chen, L., 2014, I: Annals of Microbiology. 64, 2, s. 689-697 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Unveiling cell surface and type IV secretion proteins responsible for archaeal rudivirus entry
Deng, Ling, He, F., Bhoobalan, Yuvaraj, Martinez Alvarez, Laura, Guo, Y. & Peng, Xu, 2014, I: Journal of Virology. 88, 17, s. 10264-10268 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2015
- Udgivet
CRISPR-Cas adaptive immune systems of the sulfolobales: unravelling their complexity and diversity
Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Erdmann, S., Guannan, L., Mousaei, M., León Sobrino, C., Peng, W., Islin, S. R., Deng, Ling, Vestergaard, G., Peng, Xu & She, Q., 2015, I: Life. 5, 1, s. 783-817 35 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative metagenomics of eight geographically remote terrestrial hot springs
Menzel, P., Islin, S. R., Rike, A. G., Lin, L., Zhang, Q., Contursi, P., Moracci, M., Kristjansson, J. K., Bolduc, B., Gavrilov, S., Ravin, N., Mardanov, A., Bonch-Osmolovskaya, E., Young, M., Krogh, Anders & Peng, Xu, 2015, I: Microbial Ecology. 70, 2, s. 411-424 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Discovery and characterization of thermophilic limonene-1,2-epoxide hydrolases from hot spring metagenomic libraries
Ferrandi, E. E., Sayer, C., Isupov, M. N., Annovazzi, C., Marchesi, C., Iacobone, G., Peng, Xu, Bonch-Osmolovskaya, E., Wohlgemuth, R., Littlechild, J. A. & Monti, D., 2015, I: F E B S Journal. 282, 15, s. 2879-2894 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional characterization of a conserved archaeal viral operon revealing single-stranded DNA binding, annealing and nuclease activities
Guo, Y., Kragelund, Birthe Brandt, White, M. F. & Peng, Xu, 2015, I: Journal of Molecular Biology. 427, 12, s. 2179-2191 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Discovery and characterization of a thermostable and highly halotolerant GH5 cellulase from an Icelandic hot spring isolate
Zarafeta, D., Kissas, D., Sayer, C., Islin, S. R., Ladoukakis, E., Isupov, M. N., Chatziioannou, A., Peng, Xu, Littlechild, J. A., Skretas, G. & Kolisis, F. N., 2016, I: P L o S One. 11, 1, 18 s., e0146454.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
EstDZ3: a new esterolytic enzyme exhibiting remarkable thermostability
Zarafeta, D., Szabo, Z., Moschidi, D., Phan, Safir Hien, Chrysina, E. D., Peng, Xu, Ingham, C. J., Kolisis, F. N. & Skretas, G., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 14 s., 1779.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Isolation and characterization of the first Xylanolytic hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus sp strain 2319x1 and its unusual multidomain glycosidase
Gavrilov, S. N., Stracke, C., Jensen, K., Menzel, P., Kallnik, V., Slesarev, A., Sokolova, T., Zayulina, K., Bräsen, C., Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu, Kublanov, I. V. & Siebers, B., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 17 s., 552.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multiple consecutive initiation of replication producing novel brush-like intermediates at the termini of linear viral dsDNA genomes with hairpin ends.
Martinez Alvarez, Laura, Bell, S. D. & Peng, Xu, 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 18, s. 8799-8809 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel viral genomes identified from six metagenomes reveal wide distribution of archaeal viruses and high viral diversity in terrestrial hot springs
Islin, S. R., Menzel, P., Krogh, Anders, Young, M. & Peng, Xu, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 3, s. 863-874 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Recognition of extremophilic archaeal viruses by eukaryotic cells: a promising nanoplatform from the third domain of life
Uldahl, K. B., Wu, L., Hall, A., Papathanasiou, P., Peng, Xu & Moghimi, S. M., 2016, I: Scientific Reports. 6, 37966.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Life cycle characterization of Sulfolobus monocaudavirus 1, an extremophilic spindle-shaped virus with extracellular tail development
Uldahl, K. B., Jensen, S. B., Bhoobalan, Yuvaraj, Martinez Alvarez, Laura, Papathanasiou, P. & Peng, Xu, jun. 2016, I: Journal of Virology. 90, 12, s. 5693-5699 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
CRISPR-Cas type I-A Cascade complex couples viral infection surveillance to host transcriptional regulation in the dependence of Csa3b
He, F., Vestergaard, G. A., Peng, W., She, Q. & Peng, Xu, 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 4, s. 1902-1913 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10365
Flest downloads
-
1255
downloads
Genome Sequence of a Novel Archaeal Fusellovirus Assembled from the Metagenome of a Mexican Hot Spring
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1208
downloads
Genome Sequence of a Novel Archaeal Rudivirus Recovered from a Mexican Hot Spring
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
932
downloads
Metagenomic analyses reveal phylogenetic diversity of carboxypeptidase gene sequences in activated sludge of a wastewater treatment plant in Shanghai, China
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet