Xu Peng

Xu Peng

Professor

ORCID: 0000-0003-3926-7514

Udgivelsesår:
Alle
1 - 50 ud af 85Pr. side: 50
Sortering: Titel
  1. Udgivet

    Viruses in acidic geothermal environments of the Kamchatka Peninsula

    Bize, A., Peng, Xu, Prokofeva, M., Maclellan, K., Lucas, S., Forterre, P., Garrett, Roger Antony, Bonch-Osmolovskaya, E. A. & Prangishvili, D., 2008, I: Research in Microbiology. 159, 5, s. 358-66 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    Virulence, Resistance, and Genomic Fingerprint Traits of Vibrio cholerae Isolated from 12 Species of Aquatic Products in Shanghai, China

    Fu, H., Yu, P., Liang, W., Kan, B., Peng, Xu & Chen, L., 2020, I: Microbial Drug Resistance. 26, 12, s. 1526-1539 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Viral Diversity in Hot Springs of Pozzuoli, Italy, and Characterization of a Unique Archaeal Virus, Acidianus Bottle-Shaped Virus, from a New Family, the Ampullaviridae

    Häring, M., Rachel, R., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2005, I: Journal of Virology. 79, 15, s. 9904 - 9911

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Unveiling cell surface and type IV secretion proteins responsible for archaeal rudivirus entry

    Deng, Ling, He, F., Bhoobalan, Yuvaraj, Martinez Alvarez, Laura, Guo, Y. & Peng, Xu, 2014, I: Journal of Virology. 88, 17, s. 10264-10268 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    The complete genome of the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus P2.

    She, Q., Singh, R. K., Confalonieri, F., Zivanovic, Y., Allard, G., Awayez, M. J., Chan-Weiher, CC-Y., Clausen, I. G., Curtis, B. A., De Moors, A., Erauso, G., Fletcher, C., Gordon, P. M., Heikamp-de Jong, I., Jeffries, A. C., Kozera, C. J., Medina, N., Peng, X., Phan, T. N. H., Redder, P. B. & 11 flere, Schenk, M. E., Theriault, C., Tolstrup, N., Charlebois, R. L., Doolittle, W. F., Duguet, M., Gaasterland, T., Garrett, Roger Antony, Ragan, M. A., Sensen, C. W. & Van der Oost, J., 2001, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 98, s. 7835-7840

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    The Scottish Structural Proteomics Facility: targets, methods and outputs

    Oke, M., Carter, L. G., Johnson, K. A., Liu, H., McMahon, S. A., Yan, X., Kerou, M., Weikart, N. D., Kadi, N., Sheikh, M. A., Schmelz, S., Dorward, M., Zawadzki, M., Cozens, C., Falconer, H., Powers, H., Overton, I. M., van Niekerk, C. A. J., Peng, X., Patel, P. & 11 flere, Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Botting, C. H., Coote, P. J., Dryden, D. T. F., Barton, G. J., Schwarz-Linek, U., Challis, G. L., Taylor, G. L., White, M. F. & Naismith, J. H., 1 jun. 2010, I: Journal of Structural and Functional Genomics. 11, 2, s. 167-80 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Survival and Genome Diversity of Vibrio parahaemolyticus Isolated from Edible Aquatic Animals

    Xu, D., Peng, Xu, Xie, L. & Chen, L., 2022, I: Diversity. 14, 5, 23 s., 350.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Sulfolobus genomes: mechanisms of rearrangement and change

    Brügger, K., Peng, Xu & Garrett, Roger Antony, 2006, Archaea: Evolution, physiology and Molecular Biolog.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Sugar metabolism of the first thermophilic Planctomycete Thermogutta terrifontis: comparative genomic and transcriptomic approaches

    Elcheninov, A. G., Menzel, P., Gudbergsdottir, S. R., Slesarev, A. I., Kadnikov, V. V., Krogh, Anders, Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu & Kublanov, I. V., 2 nov. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 11 s., 2140.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Structure of the acidianus filamentous virus 3 and comparative genomics of related archaeal lipothrixviruses

    Vestergaard, G. A., Aramayo, R., Basta, T., Häring, M., Peng, Xu, Brügger, K., Chen, L., Rachel, R., Boisset, N., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2008, I: Journal of Virology. 82, 1, s. 371-381 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Structural basis for inhibition of an archaeal CRISPR–Cas type I-D large subunit by an anti-CRISPR protein

    Manav, M. C., Van, L. B., Lin, Jinzhong, Fuglsang, Anders, Peng, Xu & Brodersen, D. E., 2020, I: Nature Communications. 11, 10 s., 5993.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Stable maintenance of the rudivirus SIRV3 in a carrier state in Sulfolobus islandicus despite activation of the CRISPR-Cas immune response by a second virus SMV1

    Papathanasiou, P., Erdmann, S., Leon-Sobrino, C., Sharma, K., Urlaub, H., Garrett, Roger Antony & Peng, Xu, 2019, I: RNA Biology. 16, 4, s. 557-565

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Sequences and replication of the archaeal rediviruses SIRV1 and SIRV2 relationships to the archaeal lipothrixvirus SIFV and some eukaryal viruses

    Peng, Xu, Blum, H., She, Q., Mallok, H., Brügger, K., Garrett, R. A., Zillig, W. & Prangishvili, D., 2001, I: Virology. 291, s. 226-234

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    SMV1, an extremely stable thermophilic virus platform for nanoparticle trafficking in the mammalian GI tract

    Uldahl, K. B., Walk, S. T., Olshefsky, S. C., Young, M. J. & Peng, Xu, nov. 2017, I: Journal of Applied Microbiology. 123, 5, s. 1286-1297 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Replication Protein Rep Provides Selective Advantage to Viruses in the Presence of CRISPR-Cas Immunity

    Zhang, W., Bhoobalan-Chitty, Y., Zhai, Xichuan, Hui, Y., Hansen, Lars Hestbjerg, Deng, Ling & Peng, Xu, 2023, I: CRISPR Journal. 6, 1, s. 32-42

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Regulatory sequence-based discovery of anti-defense genes in archaeal viruses

    Bhoobalan, Yuvaraj, Xu, Shuanshuan, Martinez Alvarez, Laura, Karamycheva, S., Makarova, K. S., Koonin, E. V. & Peng, Xu, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 13 s., 3699.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Recognition of extremophilic archaeal viruses by eukaryotic cells: a promising nanoplatform from the third domain of life

    Uldahl, K. B., Wu, L., Hall, A., Papathanasiou, P., Peng, Xu & Moghimi, S. M., 2016, I: Scientific Reports. 6, 37966.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Prophage-Related Gene VpaChn25_0724 Contributes to Cell Membrane Integrity and Growth of Vibrio parahaemolyticus CHN25

    Yang, L., Wang, Y., Yu, P., Ren, S., Zhu, Z., Jin, Y., Yan, J., Peng, Xu & Chen, L., 2020, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 10, 18 s., 595709.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Novel viral genomes identified from six metagenomes reveal wide distribution of archaeal viruses and high viral diversity in terrestrial hot springs

    Islin, S. R., Menzel, P., Krogh, Anders, Young, M. & Peng, Xu, 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 3, s. 863-874 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Novel thermostable amine transferases from hot spring metagenomes

    Ferrandi, E. E., Previdi, A., Bassanini, I., Riva, S., Peng, Xu & Monti, D., jun. 2017, I: Applied Microbiology and Biotechnology. 101, 12, s. 4963-4979 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Novel insights into gene regulation of the rudivirus SIRV2 infecting Sulfolobus cells

    Okutan, E., Deng, Ling, Mirlashari, S., Uldahl, K., Halim, M., Liu, C., Garrett, Roger Antony, She, Q. & Peng, Xu, 2013, I: R N A Biology. 10, 5, s. 1-11 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Novel archaeal plasmid pAH1 and its interactions with the lipothrixvirus AFV1

    Basta, T., Smyth, J., Forterre, P., Prangishvili, D. & Peng, Xu, 2009, I: Molecular Microbiology. 71, 1, s. 23-34 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Multiple variants of the archaeal dna rudivirus SIRV1 in a single host and a novel mechanism of genomic variation

    Peng, Xu, Kessler, A., Phan, H., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2004, I: Molecular Microbiology. Vol. 54 (2), s. 366-375

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Multiple consecutive initiation of replication producing novel brush-like intermediates at the termini of linear viral dsDNA genomes with hairpin ends.

    Martinez Alvarez, Laura, Bell, S. D. & Peng, Xu, 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 18, s. 8799-8809 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Morphology and genome organisation of the virus PSV of the hyperthermophilic archaeal genera Pyrobaculum and Thermoproteus: A novel virus family, the Globuloviridae

    Häring , M., Peng, Xu & Brugger K., Rachel R., Stetter K.O., Garrett R.A.,Prangishvili D., B. K. ,. R. R. ,. S. K. O. ,. G. R. A. ,. D., 2004, I: Virology.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Molecular cloning and antimicrobial activity of enterolysin A and helveticin J of bacteriolysins from metagenome of Chinese traditional fermented foods

    Zhang, T., Pan, Y., Li, B., Ou, J., Zhang, J., Chen, Y., Peng, Xu & Chen, L., 2013, I: Food Control. 31, 2, s. 499-507 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Molecular basis for inhibition of type III-B CRISPR-Cas by an archaeal viral anti-CRISPR protein

    Lin, Jinzhong, Alfastsen, L., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2023, I: Cell Host and Microbe. 31, 11, s. 1837-1849.e5 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Modulation of CRISPR locus transcription by the repeat-binding protein Cbp1 in Sulfolobus

    Deng, Ling, Kenchappa, C. S., Peng, Xu, She, Q. & Garrett, Roger Antony, 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 6, s. 2470-2480 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Metagenomic analyses reveal phylogenetic diversity of carboxypeptidase gene sequences in activated sludge of a wastewater treatment plant in Shanghai, China

    Jin, H., Li, B., Peng, Xu & Chen, L., 2014, I: Annals of Microbiology. 64, 2, s. 689-697 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Metagenomic analyses of novel viruses and plasmids from a cultured environmental sample of hyperthermophilic neutrophiles

    Garrett, Roger Antony, Prangishvili, D., Shah, S. A., Reuter, M., Stetter, K. O. & Peng, Xu, 1 nov. 2010, I: Environmental Microbiology. 12, 11, s. 2918-30 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Life cycle characterization of Sulfolobus monocaudavirus 1, an extremophilic spindle-shaped virus with extracellular tail development

    Uldahl, K. B., Jensen, S. B., Bhoobalan, Yuvaraj, Martinez Alvarez, Laura, Papathanasiou, P. & Peng, Xu, jun. 2016, I: Journal of Virology. 90, 12, s. 5693-5699 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    Isolation and characterization of the first Xylanolytic hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus sp strain 2319x1 and its unusual multidomain glycosidase

    Gavrilov, S. N., Stracke, C., Jensen, K., Menzel, P., Kallnik, V., Slesarev, A., Sokolova, T., Zayulina, K., Bräsen, C., Bonch-Osmolovskaya, E. A., Peng, Xu, Kublanov, I. V. & Siebers, B., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 17 s., 552.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Interaction of extremophilic archaeal viruses with human and mouse complement system and viral biodistribution in mice

    Wu, L., Uldahl, K. B., Chen, F., Benasutti, H., Logvinski, D., Vu, V., Banda, N. K., Peng, Xu, Simberg, D. & Moghimi, S. M., okt. 2017, I: Molecular Immunology. 90, s. 273-279 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Insights into Vibrio parahaemolyticus CHN25 response to artificial gastric fluid stress by transcriptomic analysis

    Sun, X., Liu, T., Peng, Xu & Chen, L., 2014, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 15, 12, s. 22539-22562 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Inhibition of Type III CRISPR-Cas Immunity by an Archaeal Virus-Encoded Anti-CRISPR Protein

    Bhoobalan, Yuvaraj, Johansen, T. B., Di Cianni, N. & Peng, Xu, 2019, I: Cell. 179, 2, s. 448-458, e1-e11

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    How to induce non-polarized cells of hepatic origin to express typical hepatocyte polarity: generation of new highly polarized cell models with developed and functional bile canaliculi

    Peng, Xu & Grosse B, Le Tiec B, Nicolas V, Delagebeaudeuf C, Bedda T, Decaens C, Cassio D, G. B. L. T. B. N. V. D. C. B. T. D. C. C. D., 2006, I: Cell and Tissue Research.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Growth factors and gene expression in cultured hepatocytes

    Grunnet, N., Peng, Xu & Tygstrup, N., 1999, I: Jounal of Hepatology. 30, s. 117-122

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Genus-specific protein binding to the large clusters of DNA repeats (short regularly spaced repeats) present in Sulfolobus genomes

    Peng, Xu, Brügger, K., Shen, B., Chen, L., She, Q. & Garrett, Roger Antony, 2003, I: Journal of Bacteriology. 185, 8, s. 2410-7 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Genomics, Transcriptomics, and Proteomics of SSV1 and Related Fusellovirus: A Minireview

    Aulitto, M., Martinez Alvarez, Laura, Fusco, S., She, Q., Bartolucci, S., Peng, Xu & Contursi, P., 2022, I: Viruses. 14, 10, 18 s., 2082.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Genomic and transcriptomic analyses reveal distinct biological functions for cold shock proteins (VpaCspA and VpaCspD) in Vibrio parahaemolyticus CHN25 during low-temperature survival

    Zhu, C., Sun, B., Liu, T., Zheng, H., Gu, W., He, W., Sun, F., Wang, Y., Yang, M., Bei, W., Peng, Xu, She, Q., Xie, L. & Chen, L., 5 jun. 2017, I: BMC Genomics. 18, 19 s., 436.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms

    Peng, Xu, Basta, T., Häring, M., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2007, I: Virology. 364, 1, s. 237-43 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Genome editing in archaeal viruses and endogenous viral protein purification

    Alfastsen, L., Peng, Xu & Bhoobalan, Yuvaraj, 2021, I: STAR Protocols. 2, 4, 27 s., 100791.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Genome Sequence of a Novel Archaeal Rudivirus Recovered from a Mexican Hot Spring

    Servín-Garcidueñas, L., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Martínez-Romero, E., 2013, I: Genome Announcements. 1, 1, s. 1-2 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Genome Sequence of a Novel Archaeal Fusellovirus Assembled from the Metagenome of a Mexican Hot Spring

    Servin-Garciduenas, L. E., Peng, Xu, Garrett, Roger Antony & Martinez-Romero, E., 2013, I: Genome Announcements. 1, s. 1-2 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Gene content and organization of a 281-kbp contig from the genome of the extremely thermophilic archaeon, Sulfolobus solfataricus P2

    Charlebois, R. L., Singh, R. K., Chan-Weiher, CC-Y., Allard, G., Chow, C., Confalonieri, F., Curtis, B., Duguet, M., Erauso, G., Faguy, D., Gaasterland, T., Garrett, R. A., Gordon, P., Jeffries, A. C., Kozera, C., Kushwaha, N., Lafleur, E., Medina, N., Peng, X., Penny, S. L. & 8 flere, She, Q., St. Jean, A., van der Oost, J., Young, F., Zivanovic, Y., Doolittle, W. F., Ragan, M. A. & Sensen, C. W., 2000, I: Genome. 43, s. 116-136

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Gene capture in archaeal chromosomes.

    She, Q., Peng, Xu, Zillig, W. & Garrett, Roger Antony, 2001, I: Nature. 409, s. 478

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Functional characterization of a conserved archaeal viral operon revealing single-stranded DNA binding, annealing and nuclease activities

    Guo, Y., Kragelund, Birthe Brandt, White, M. F. & Peng, Xu, 2015, I: Journal of Molecular Biology. 427, 12, s. 2179-2191 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Four newly isolated fuselloviruses from extreme geothermal environments reveal unusual morphologies and a possible interviral recombination mechanism

    Redder, P., Peng, Xu, Brügger, K., Shah, S. A., Roesch, F., Greve, B., She, Q., Schleper, C., Forterre, P., Garrett, Roger Antony & Prangishvili, D., 2009, I: Environmental Microbiology. 11, 11, s. 2849-62 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Four additional natural 7-deazaguanine derivatives in phages and how to make them

    Cui, L., Balamkundu, S., Liu, C. F., Ye, H., Hourihan, J., Rausch, A., Hauß, C., Nilsson, E., Hoetzinger, M., Holmfeldt, K., Zhang, W., Martinez-Alvarez, L., Peng, X., Tremblay, D., Moinau, S., Solonenko, N., Sullivan, M. B., Lee, Y. J., Mulholland, A., Weigele, P. R. & 3 flere, de Crécy-Lagard, V., Dedon, P. C. & Hutinet, G., 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 17, s. 9214-9226 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Formation of a viral replication focus in Sulfolobus cells infected by the rudivirus Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 2

    Martinez Alvarez, Laura, Deng, Ling & Peng, Xu, jul. 2017, I: Journal of Virology. 91, 13, 12 s., e00486-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 10365