Kresten Lindorff-Larsen

Kresten Lindorff-Larsen

Professor


  1. 2019
  2. Udgivet

    Computational and cellular studies reveal structural destabilization and degradation of MLH1 variants in Lynch syndrome

    Abildgaard, A. B., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Schultz-Knudsen, Katrine, Papaleo, E., Shrikhande, A., Hoffmann, Eva, Bernstein, I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Takahashi, M., Ishioka, C., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: eLife. 8, 28 s., e49138 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Dissecting the statistical properties of the linear extrapolation method of determining protein stability

    Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Protein engineering, design & selection : PEDS. 32, 10, s. 471-479 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Fitting Corrections to an RNA Force Field Using Experimental Data

    Cesari, A., Bottaro, S., Lindorff-Larsen, Kresten, Banás, P., Sponer, J. & Bussi, G., 2019, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 15, 6, s. 3425-3431

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations

    Bonomi, M., Bussi, G., Camilloni, C., Tribello, G. A., Banas, P., Barducci, A., Bernetti, M., Bolhuis, P. G., Bottaro, S., Branduardi, D., Capelli, R., Carloni, P., Ceriotti, M., Cesari, A., Chen, H., Chen, W., Colizzi, F., De, S., De La Pierre, M., Donadio, D. & 54 flere, Drobot, V., Ensing, B., Ferguson, A. L., Filizola, M., Fraser, J. S., Fu, H., Gasparotto, P., Gervasio, F. L., Giberti, F., Gil-Ley, A., Giorgino, T., Heller, G. T., Hocky, G. M., Iannuzzi, M., Invernizzi, M., Jelfs, K. E., Jussupow, A., Kirilin, E., Laio, A., Limongelli, V., Lindorff-Larsen, Kresten, Lohr, T., Marinelli, F., Martin-Samos, L., Masetti, M., Meyer, R., Michaelides, A., Molteni, C., Morishita, T., Nava, M., Paissoni, C., Papaleo, E., Parrinello, M., Pfaendtner, J., Piaggi, P., Piccini, G., Pietropaolo, A., Pietrucci, F., Pipolo, S., Provasi, D., Quigley, D., Raiteri, P., Raniolo, S., Rydzewski, J., Salvalaglio, M., Sosso, G. C., Spiwok, V., Sponer, J., Swenson, D. W. H., Tiwary, P., Valsson, O., Vendruscolo, M., Voth, G. A. & White, A., 2019, I: Nature Methods. 16, 8, s. 670-673

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Protein stability and degradation in health and disease

    Bjørnkjær, Lene, Abildgaard, A. B., Gersing, S. K., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, Molecular Chaperones in Human Disorders. Donev, R. (red.). Academic Press, s. 61-83 (Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, Bind 114).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Side chain to main chain hydrogen bonds stabilize a polyglutamine helix in a transcription factor

    Escobedo, A., Topal, B., Kunze, M. B. A., Aranda, J., Chiesa, G., Mungianu, D., Bernardo-Seisdedos, G., Eftekharzadeh, B., Gairí, M., Pierattelli, R., Felli, I. C., Diercks, T., Millet, O., García, J., Orozco, M., Crehuet, R., Lindorff-Larsen, Kresten & Salvatella, X., 2019, I: Nature Communications. 10, 11 s., 2034.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Structural Basis for Properdin Oligomerization and Convertase Stimulation in the Human Complement System

    Pedersen, D. V., Gadeberg, T. A. F., Thomas, C., Wang, Y., Joram, N., Jensen, R. K., Mazarakis, S. M. M., Revel, M., El Sissy, C., Petersen, S. V., Lindorff-Larsen, Kresten, Thiel, S., Laursen, N. S., Fremeaux-Bacchi, V. & Andersen, G. R., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 19 s., 2007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Substrate-induced conformational dynamics of the dopamine transporter

    Nielsen, A. K., Möller, I. R., Wang, Y., Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Lindorff-Larsen, Kresten, Rand, Kasper Dyrberg & Loland, Claus Juul, 2019, I: Nature Communications. 10, 14 s., 2714.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Toward mechanistic models for genotype-phenotype correlations in phenylketonuria using protein stability calculations

    Scheller, R., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Marin, F. I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Di Marco, M., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: Human Mutation. 40, 4, s. 444-457

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. 2018
  12. Udgivet

    On the Calculation of SAXS Profiles of Folded and Intrinsically Disordered Proteins from Computer Simulations

    Henriques, J., Arleth, Lise, Lindorff-Larsen, Kresten & Skepo, M., 3 aug. 2018, I: Journal of Molecular Biology. 430, 16, SI, s. 2521-2539

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Conformational ensembles of RNA oligonucleotides from integrating NMR and molecular simulations

    Bottaro, S., Bussi, G., Kennedy, S. D., Turner, D. H. & Lindorff-Larsen, Kresten, 18 maj 2018, I: Science Advances. 4, 5, 8 s., eaar8521.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Dynamic activation and regulation of the mitogen-activated protein kinase p38

    Kumar, G. S., Clarkson, M. W., Kunze, M. B. A., Granata, D., Wand, A. J., Lindorff-Larsen, Kresten, Page, R. & Peti, W., 1 maj 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 18, s. 4655-4660 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    A Combined Simulation and SAXS Study of the Dynamics of Lipid Nanodiscs

    Bengtsen, T., Holm-Janas, Viktor, Midtgaard, S. R., Arleth, Lise & Lindorff-Larsen, Kresten, 17 feb. 2018, I: Biophysical Journal. 114, 3, Supp. 1, s. 559A-559A 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    A Robust Proton Flux (pHlux) Assay for Studying the Function and Inhibition of the Influenza A M2 Proton Channel

    Santner, P., Martins, J. M. D. S., Laursen, J. S., Behrendt, L., Riber, Leise, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5949-5956

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Biophysical experiments and biomolecular simulations: a perfect match?

    Bottaro, S. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Science. 361, 6400, s. 355-360 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Cancer Mutations of the Tumor Suppressor SPOP Disrupt the Formation of Active, Phase-Separated Compartments

    Bouchard, J. J., Otero, J. H., Scott, D. C., Szulc, E., Martin, E. W., Sabri, N., Granata, D., Marzahn, M. R., Lindorff-Larsen, Kresten, Salvatella, X., Schulman, B. A. & Mittag, T., 2018, I: Molecular Cell. 72, 1, s. 19-36, e1-e8

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Editorial overview: Theory and simulation: Interpreting experimental data at the molecular level

    Best, R. B. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 49, s. iv-v 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Enhancing coevolution-based contact prediction by imposing structural self-consistency of the contacts

    Kassem, M. M., Christoffersen, L. B., Cavalli, A. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Scientific Reports. 8, 11112.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Frequency adaptive metadynamics for the calculation of rare-event kinetics

    Wang, Y., Valsson, O., Tiwary, P., Parrinello, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 7, s. 1-7 072309.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Gs protein peptidomimetics as allosteric modulators of the β2-adrenergic receptor

    Boyhus, L. E., Danielsen, Mia, Bengtson, N. S., Kunze, M. B. A., Kubiak, X., Sminia, T. J., Løper, J. H., Tran, P. T., Lindorff-Larsen, Kresten, Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Mathiesen, Jesper M. & Pedersen, D. S., 2018, I: RSC Advances. 8, 4, s. 2219-2228 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    How well do force fields capture the strength of salt bridges in proteins?

    Ahmed, M. C. H., Papaleo, E. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, 17 s., 4967.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Molecular dynamics ensemble refinement of the heterogeneous native state of NCBD using chemical shifts and NOEs

    Papaleo, E., Camilloni, C., Teilum, Kaare, Vendruscolo, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, s. 1-24 e5125.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Monte Carlo Sampling of Protein Folding by Combining an All-Atom Physics-Based Model with a Native State Bias

    Wang, Y., Tian, P., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Physical Chemistry B. 122, 49, s. 11174-11185

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Random mutagenesis analysis of the Influenza A M2 proton channel reveals novel resistance mutants

    Santner, P., Martins, J. M. D. S., Kampmeyer, Caroline, Hartmann-Petersen, Rasmus, Laursen, J. S., Stein, Amelie, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5957-5968

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Role of protein dynamics in transmembrane receptor signalling

    Wang, Y., Bugge, K. Ø., Kragelund, Birthe Brandt & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 74-82 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

ID: 35228567