Kresten Lindorff-Larsen
Professor
Biomolecular Sciences
Ole Maaløes Vej 5
2200 København N.
- 2019
- Udgivet
Computational and cellular studies reveal structural destabilization and degradation of MLH1 variants in Lynch syndrome
Abildgaard, A. B., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Schultz-Knudsen, Katrine, Papaleo, E., Shrikhande, A., Hoffmann, Eva, Bernstein, I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Takahashi, M., Ishioka, C., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: eLife. 8, 28 s., e49138 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dissecting the statistical properties of the linear extrapolation method of determining protein stability
Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Protein engineering, design & selection : PEDS. 32, 10, s. 471-479 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fitting Corrections to an RNA Force Field Using Experimental Data
Cesari, A., Bottaro, S., Lindorff-Larsen, Kresten, Banás, P., Sponer, J. & Bussi, G., 2019, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 15, 6, s. 3425-3431Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations
Bonomi, M., Bussi, G., Camilloni, C., Tribello, G. A., Banas, P., Barducci, A., Bernetti, M., Bolhuis, P. G., Bottaro, S., Branduardi, D., Capelli, R., Carloni, P., Ceriotti, M., Cesari, A., Chen, H., Chen, W., Colizzi, F., De, S., De La Pierre, M., Donadio, D. & 54 flere, , 2019, I: Nature Methods. 16, 8, s. 670-673Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein stability and degradation in health and disease
Bjørnkjær, Lene, Abildgaard, A. B., Gersing, S. K., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, Molecular Chaperones in Human Disorders. Donev, R. (red.). Academic Press, s. 61-83 (Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, Bind 114).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Side chain to main chain hydrogen bonds stabilize a polyglutamine helix in a transcription factor
Escobedo, A., Topal, B., Kunze, M. B. A., Aranda, J., Chiesa, G., Mungianu, D., Bernardo-Seisdedos, G., Eftekharzadeh, B., Gairí, M., Pierattelli, R., Felli, I. C., Diercks, T., Millet, O., García, J., Orozco, M., Crehuet, R., Lindorff-Larsen, Kresten & Salvatella, X., 2019, I: Nature Communications. 10, 11 s., 2034.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural Basis for Properdin Oligomerization and Convertase Stimulation in the Human Complement System
Pedersen, D. V., Gadeberg, T. A. F., Thomas, C., Wang, Y., Joram, N., Jensen, R. K., Mazarakis, S. M. M., Revel, M., El Sissy, C., Petersen, S. V., Lindorff-Larsen, Kresten, Thiel, S., Laursen, N. S., Fremeaux-Bacchi, V. & Andersen, G. R., 2019, I: Frontiers in Immunology. 10, 19 s., 2007.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substrate-induced conformational dynamics of the dopamine transporter
Nielsen, A. K., Möller, I. R., Wang, Y., Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Lindorff-Larsen, Kresten, Rand, Kasper Dyrberg & Loland, Claus Juul, 2019, I: Nature Communications. 10, 14 s., 2714.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toward mechanistic models for genotype-phenotype correlations in phenylketonuria using protein stability calculations
Scheller, R., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Marin, F. I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Di Marco, M., Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: Human Mutation. 40, 4, s. 444-457Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
On the Calculation of SAXS Profiles of Folded and Intrinsically Disordered Proteins from Computer Simulations
Henriques, J., Arleth, Lise, Lindorff-Larsen, Kresten & Skepo, M., 3 aug. 2018, I: Journal of Molecular Biology. 430, 16, SI, s. 2521-2539Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conformational ensembles of RNA oligonucleotides from integrating NMR and molecular simulations
Bottaro, S., Bussi, G., Kennedy, S. D., Turner, D. H. & Lindorff-Larsen, Kresten, 18 maj 2018, I: Science Advances. 4, 5, 8 s., eaar8521.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic activation and regulation of the mitogen-activated protein kinase p38
Kumar, G. S., Clarkson, M. W., Kunze, M. B. A., Granata, D., Wand, A. J., Lindorff-Larsen, Kresten, Page, R. & Peti, W., 1 maj 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 18, s. 4655-4660 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Combined Simulation and SAXS Study of the Dynamics of Lipid Nanodiscs
Bengtsen, T., Holm-Janas, Viktor, Midtgaard, S. R., Arleth, Lise & Lindorff-Larsen, Kresten, 17 feb. 2018, I: Biophysical Journal. 114, 3, Supp. 1, s. 559A-559A 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Robust Proton Flux (pHlux) Assay for Studying the Function and Inhibition of the Influenza A M2 Proton Channel
Santner, P., Martins, J. M. D. S., Laursen, J. S., Behrendt, L., Riber, Leise, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5949-5956Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biophysical experiments and biomolecular simulations: a perfect match?
Bottaro, S. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Science. 361, 6400, s. 355-360 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cancer Mutations of the Tumor Suppressor SPOP Disrupt the Formation of Active, Phase-Separated Compartments
Bouchard, J. J., Otero, J. H., Scott, D. C., Szulc, E., Martin, E. W., Sabri, N., Granata, D., Marzahn, M. R., Lindorff-Larsen, Kresten, Salvatella, X., Schulman, B. A. & Mittag, T., 2018, I: Molecular Cell. 72, 1, s. 19-36, e1-e8Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Editorial overview: Theory and simulation: Interpreting experimental data at the molecular level
Best, R. B. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 49, s. iv-v 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enhancing coevolution-based contact prediction by imposing structural self-consistency of the contacts
Kassem, M. M., Christoffersen, L. B., Cavalli, A. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Scientific Reports. 8, 11112.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Frequency adaptive metadynamics for the calculation of rare-event kinetics
Wang, Y., Valsson, O., Tiwary, P., Parrinello, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 7, s. 1-7 072309.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gs protein peptidomimetics as allosteric modulators of the β2-adrenergic receptor
Boyhus, L. E., Danielsen, Mia, Bengtson, N. S., Kunze, M. B. A., Kubiak, X., Sminia, T. J., Løper, J. H., Tran, P. T., Lindorff-Larsen, Kresten, Rasmussen, Søren Gøgsig Faarup, Mathiesen, Jesper M. & Pedersen, D. S., 2018, I: RSC Advances. 8, 4, s. 2219-2228 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
How well do force fields capture the strength of salt bridges in proteins?
Ahmed, M. C. H., Papaleo, E. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, 17 s., 4967.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular dynamics ensemble refinement of the heterogeneous native state of NCBD using chemical shifts and NOEs
Papaleo, E., Camilloni, C., Teilum, Kaare, Vendruscolo, M. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, s. 1-24 e5125.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Monte Carlo Sampling of Protein Folding by Combining an All-Atom Physics-Based Model with a Native State Bias
Wang, Y., Tian, P., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Journal of Physical Chemistry B. 122, 49, s. 11174-11185Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Random mutagenesis analysis of the Influenza A M2 proton channel reveals novel resistance mutants
Santner, P., Martins, J. M. D. S., Kampmeyer, Caroline, Hartmann-Petersen, Rasmus, Laursen, J. S., Stein, Amelie, Olsen, Christian Adam, Arkin, I. T., Winther, Jakob R., Willemoës, Martin & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5957-5968Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Role of protein dynamics in transmembrane receptor signalling
Wang, Y., Bugge, K. Ø., Kragelund, Birthe Brandt & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 74-82 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
ID: 35228567
Flest downloads
-
2308
downloads
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
911
downloads
Similarity measures for protein ensembles
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
847
downloads
Evaluating the effects of cutoffs and treatment of long-range electrostatics in protein folding simulations
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt