Kresten Lindorff-Larsen

Kresten Lindorff-Larsen

Professor


  1. 2015
  2. Udgivet

    Comparing molecular dynamics force fields in the essential subspace

    Martin-García, F., Papaleo, E., Gomez-Puertas, P., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: PLoS ONE. 10, 3, 16 s., e0121114.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    ENCORE: Software for Quantitative Ensemble Comparison

    Tiberti, M., Papaleo, E., Bengtsen, T., Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: PLoS Computational Biology. 11, 10, 16 s., e1004415.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Exploiting hydrophobicity for efficient production of transmembrane helices for structure determination by NMR spectroscopy

    Bugge, K. Ø., Steinocher, H., Brooks, A. J., Lindorff-Larsen, Kresten & Kragelund, Birthe Brandt, 2015, I: Analytical Chemistry. 87, 18, s. 9126–9131 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Interaction networks in protein folding via atomic-resolution experiments and long-time-scale molecular dynamics simulations

    Sborgi, L., Verma, A., Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten, Cerminara, M., Santiveri, C. M., Shaw, D. E., De Alba, E. & Muñoz, V., 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 20, s. 6506-6516 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Structure of a functional amyloid protein subunit computed using sequence variation

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 22–25 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    What does evolution tell us about the structure of a functional amyloid protein?

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D. E., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, Supplement 1, s. 227a 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  8. 2014
  9. Udgivet

    CECAM workshop on intrinsically disordered proteins

    Rösner, Heike Ilona, Papaleo, E., Haxholm, G. W., Best, R. B., Kragelund, Birthe Brandt & Lindorff-Larsen, Kresten, 2014, I: Intrinsically Disordered Proteins. 2, 1, s. 1-5 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  10. Udgivet

    Combining experiments and simulations using the maximum entropy principle

    Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2014, I: PLoS Computational Biology. 10, 2, 9 s., e1003406.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Communication routes in ARID domains between distal residues in Helix 5 and the DNA-binding loops

    Invernizzi, G., Tiberti, M., Lambrughi, M., Lindorff-Larsen, Kresten & Papaleo, E., 2014, I: P L o S Computational Biology (Online). 10, 9, 13 s., e1003744.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Conformational changes and free energies in a Proline isomerase

    Papaleo, E., Sutto, L., Gervasio, F. L. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 9, s. 4169-4174 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Equilibrium simulations of proteins using molecular fragment replacement and NMR chemical shifts

    Boomsma, Wouter, Tian, P., Frellsen, J., Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, Thomas Wim, Lindorff-Larsen, Kresten & Vendruscolo, M., 2014, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 38, s. 13852-13857 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Probabilistic determination of native state ensembles of proteins

    Olsson, S., Vögeli, B. R., Cavalli, A., Boomsma, Wouter, Ferkinghoff-Borg, J., Lindorff-Larsen, Kresten & Hamelryck, Thomas Wim, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 8, s. 3484-3491 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Robust estimation of diffusion-optimized ensembles for enhanced sampling

    Tian, P., Jónsson, S. Æ., Ferkinghoff-Borg, J., Krivov, S. V. .., Lindorff-Larsen, Kresten, Irbäck, A. & Boomsma, Wouter, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 2, s. 543–553 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2013
  17. Udgivet

    A sticky cage can slow down folding

    Boomsma, Wouter & Lindorff-Larsen, Kresten, 2013, I: Biophysical Journal. 104, 5, s. 964-965 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  18. Atomic-level description of ubiquitin folding

    Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten & Shaw, D. E., 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 15, s. 5915-5920 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Atomistic description of the folding of a dimeric protein

    Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten & Shaw, D. E., 2013, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 117, 42, s. 12935-12942 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

    Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics

    Christensen, A. S., Linnet, T. E., Borg, M., Boomsma, Wouter, Lindorff-Larsen, Kresten, Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLoS ONE. 8, 12, 10 s., e84123.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The Structure of the Central Side Chain is Crucial for Anoplin Hemolytic Activity

    Munk, J., Thøgersen, L., Uggerhøj, L. E., Wimmer, R., Frimodt-Møller, N., Lindorff-Larsen, Kresten & Hansen, Paul Robert, 2013, Proceedings of the 23rd American Peptide Symposium. Lebl, M. (red.). American Peptide Society

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Variational optimization of an all-atom implicit solvent force field to match explicit solvent simulation data

    Bottaro, S., Lindorff-Larsen, Kresten & Best, R. B., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 12, s. 5641-5652 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2012
  25. Evaluating the effects of cutoffs and treatment of long-range electrostatics in protein folding simulations

    Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten, Dirks, R. M., Salmon, J. K., Dror, R. O. & Shaw, D. E., 2012, I: P L o S One. 7, 6, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Paths of long-range communication in the E2 enzymes of family 3: a molecular dynamics investigation

    Papaleo, E., Lindorff-Larsen, Kresten & Gioia, L. D., 2012, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 14, s. 12515-12525 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Protein folding kinetics and thermodynamics from atomistic simulation

    Piana, S., Lindorff-Larsen, Kresten & Shaw, D. E., 2012, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 44, s. 17845-17850 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Structure and dynamics of an unfolded protein examined by molecular dynamics simulation

    Lindorff-Larsen, Kresten, Trbovic, N., Maragakis, P., Piana, S. & Shaw, D. E., 2012, I: Journal of the American Chemical Society. 134, 8, s. 3787-3791 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Systematic validation of protein force fields against experimental data

    Lindorff-Larsen, Kresten, Maragakis, P., Piana, S., Eastwood, M. P., Dror, R. O. & Shaw, D. E., 2012, I: P L o S One. 7, 2, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 35228567