Mathias Middelboe
Professor
Marine Biological Section
Strandpromenaden 5
3000 Helsingør
- 2023
- Udgivet
Hydrostatic pressure induces transformations in the organic matter and microbial community composition of marine snow particles
Stief, P., Schauberger, C., Becker, K. W., Elvert, M., Balmonte, J. P., Franco-Cisterna, B., Middelboe, Mathias & Glud, R. N., 2023, I: Communications Earth and Environment. 4, 1, 14 s., 377.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Staying below the Radar: Unraveling a New Family of Ubiquitous “Cryptic” Non-Tailed Temperate Vibriophages and Implications for Their Bacterial Hosts
Kalatzis, P. G., Mauritzen, Jesper Juel, Winther-Have, Caroline Sophie W, Michniewski, S., Millard, A., Tsertou, M. I., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 2023, I: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 23 s., 3937.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Strain-specific quorum-sensing responses determine virulence properties in Vibrio anguillarum
Mauritzen, Jesper Juel, Søndberg, E., Kalatzis, Panagiotis, Roager, L., Gram, L., Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2023, I: Environmental Microbiology. 25, 7, 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
In Vitro Evolution of Specific Phages Infecting the Fish Pathogen Flavobacterium psychrophilum
Castillo, D., Højsting, A. R., Roosvall, A., Smyrlis, G., Jørgensen, J. & Middelboe, Mathias, 2022, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 3, 1, s. 28-37 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On Single-Cell Enzyme Assays in Marine Microbial Ecology and Biogeochemistry
Traving, Sachia Jo, Balmonte, J. P., Seale, D., Arnosti, C., Glud, R. N., Hallam, S. J. & Middelboe, Mathias, 2022, I: Frontiers in Marine Science. 9, 9 s., 846656.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prevalence of genetically similar Flavobacterium columnare phages across aquaculture environments reveals a strong potential for pathogen control
Runtuvuori-Salmela, A., Kunttu, H. M. T., Laanto, E., Almeida, G. M. F., Mäkelä, K., Middelboe, Mathias & Sundberg, L., 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 5, s. 2404-2420 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reversible mutations in gliding motility and virulence genes: A flexible and efficient phage defence mechanism in Flavobacterium psychrophilum
Jørgensen, J., Sundell, K., Castillo, D., Dramshøj, L. S., Jørgensen, N. B., Madsen, S. B., Landor, L., Wiklund, T., Donati, V. L., Madsen, L., Dalsgaard, I. & Middelboe, Mathias, 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 10, s. 4915-4930Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Gut Microbiota of Healthy and Flavobacterium psychrophilum-Infected Rainbow Trout Fry Is Shaped by Antibiotics and Phage Therapies
Donati, V. L., Madsen, L., Middelboe, Mathias, Strube, M. L. & Dalsgaard, I., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 21 s., 771296.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Bacteriophage Resistance Affects Flavobacterium columnare Virulence Partly via Mutations in Genes Related to Gliding Motility and the Type IX Secretion System
Kunttu, H. M. T., Runtuvuori-Salmela, A., Sundell, K., Wiklund, T., Middelboe, Mathias, Landor, L., Ashrafi, R., Hoikkala, V. & Sundberg, L., 2021, I: Applied and Environmental Microbiology. 87, 16, 19 s., e00812-21 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Genomic Analyses of Flavobacterium psychrophilum Isolates Reveals New Putative Genetic Determinants of Virulence Traits
Castillo, D., Donati, V. L., Jørgensen, J., Sundell, K., Dalsgaard, I., Madsen, L., Wiklund, T. & Middelboe, Mathias, 2021, I: Microorganisms. 9, 8, 15 s., 1658.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparison of Delivery Methods in Phage Therapy against Flavobacterium columnare Infections in Rainbow Trout
Kunttu, H. M. T., Runtuvuori-Salmela, A., Middelboe, Mathias, Clark, J. & Sundberg, L. R., 2021, I: Antibiotics. 10, 8, 19 s., 914.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of Baltic Sea phages driven by environmental changes
Hoetzinger, M., Nilsson, E., Arabi, R., Osbeck, C. M. G., Pontiller, B., Hutinet, G., Bayfield, O. W., Traving, S., Kisand, V., Lundin, D., Pinhassi, J., Middelboe, Mathias & Holmfeldt, K., 2021, I: Environmental Microbiology. 23, 8, s. 4576-4594 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genome-informed approach to identify genetic determinants of Flavobacterium psychrophilum phage susceptibility
Castillo, D., Jørgensen, J., Sundell, K., Madsen, L., Dalsgaard, I., Wiklund, T. & Middelboe, Mathias, 2021, I: Environmental Microbiology. 23, 8, s. 4185-4199 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic Analysis of Pasteurella atlantica Provides Insight on Its Virulence Factors and Phylogeny and Highlights the Potential of Reverse Vaccinology in Aquaculture
Ellul, R. M., Kalatzis, Panagiotis, Frantzen, C., Haugland, G. T., Gulla, S., Colquhoun, D. J., Middelboe, Mathias, Wergeland, H. I. & Rønneseth, A., 2021, I: Microorganisms. 9, 6, 22 s., 1215.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interactions between Rainbow Trout Eyed Eggs and Flavobacterium spp. Using a Bath Challenge Model: Preliminary Evaluation of Bacteriophages as Pathogen Control Agents
Donati, V. L., Dalsgaard, I., Runtuvuori-Salmela, A., Kunttu, H., Jørgensen, J., Castillo, D., Sundberg, L., Middelboe, Mathias & Madsen, L., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 31 s., 971.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interactions between the Prophage 919TP and Its Vibrio cholerae Host: Implications of gmd Mutation for Phage Resistance, Cell Auto-Aggregation, and Motility
Li, N., Zeng, Y., Hu, B., Zhu, T., Svenningsen, Sine Lo, Middelboe, Mathias & Tan, D., 2021, I: Viruses. 13, 12, 15 s., 2342.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phage-Mediated Control of Flavobacterium psychrophilum in Aquaculture: In vivo Experiments to Compare Delivery Methods
Donati, V. L., Dalsgaard, I., Sundell, K., Castillo, D., Er-Rafik, M., Clark, J., Wiklund, T., Middelboe, Mathias & Madsen, L., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 16 s., 628309.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatial variability of prokaryotic and viral abundances in the Kermadec and Atacama Trench regions
Schauberger, C., Middelboe, Mathias, Larsen, M., Peoples, L. M., Bartlett, D. H., Kirpekar, F., Rowden, A. A., Wenzhöfer, F., Thamdrup, B. & Glud, R. N., 2021, I: Limnology and Oceanography. 66, 6, s. 2095-2109 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Bacteriophages: Emerging Applications in Medicine, Food, and Biotechnology
Sohail, H. A., Coffey, A., Debrowska, K., Meyer, I. M., Middelboe, Mathias, Sohail, M. & Clokie, M. R. J., 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 2, s. 75-82 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bacteriophages as Biocontrol Agents for Flavobacterium psychrophilum Biofilms and Rainbow Trout Infections
Sundell, K., Landor, L., Castillo, D., Middelboe, Mathias & Wiklund, T., 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 198-204 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Beyond Cholera: Characterization of zot-Encoding Filamentous Phages in the Marine Fish Pathogen Vibrio anguillarum
Mauritzen, Jesper Juel, Castillo, D., Tan, D., Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2020, I: Viruses. 12, 7, 17 s., 730.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High cell densities favor lysogeny: induction of an H20 prophage is repressed by quorum sensing and enhances biofilm formation in Vibrio anguillarum
Tan, D., Hansen, Mads Frederik, de Carvalho, L. N., Røder, Henriette Lyng, Burmølle, Mette, Middelboe, Mathias & Svenningsen, Sine Lo, 2020, I: The ISME Journal. 14, 7, s. 1731-1742 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sharp contrasts between freshwater and marine microbial enzymatic capabilities, community composition, and DOM pools in a NE Greenland fjord
Balmonte, J. P., Hasler-Sheetal, H., Glud, R. N., Andersen, Thorbjørn Joest, Sejr, M. K., Middelboe, Mathias, Teske, A. & Arnosti, C., 2020, I: Limnology and Oceanography. 65, 1, s. 77-95 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
P. aeruginosa flow-cell biofilms are enhanced by repeated phage treatments but can be eradicated by phage-ciprofloxacin combination: —monitoring the phage–P. aeruginosa biofilms interactions
Henriksen, K., Rørbo, N., Rybtke, Morten Levin, Martinet, M. G., Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels, Middelboe, Mathias & Ciofu, Oana, 2019, I: Pathogens and Disease. 77, 2, 11 s., ftz011.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Big Impact of the Tiny: Bacteriophage–Bacteria Interactions in Biofilms
Hansen, Mads Frederik, Svenningsen, Sine Lo, Røder, Henriette Lyng, Middelboe, Mathias & Burmølle, Mette, 2019, I: Trends in Microbiology. 27, 9, s. 739-752 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Biological transformation of Arctic dissolved organic matter in a NE Greenland fjord
Paulsen, M. L., Müller, O., Larsen, A., Møller, E. F., Middelboe, Mathias, Sejr, M. K. & Stedmon, C., 2019, I: Limnology and Oceanography. 64, 3, s. 1014-1033Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combining probiotic Phaeobacter inhibens DSM17395 and broad-host-range vibriophage KVP40 against fish pathogenic vibrios
Rasmussen, B. B., Kalatzis, Panagiotis, Middelboe, Mathias & Gram, L., 2019, I: Aquaculture. 513, 7 s., 734415.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete Genome Sequence of Vibrio anguillarum Nontailed Bacteriophage NO16
Kalatzis, Panagiotis, Carstens, A. B., Katharios, P., Castillo, D., Hansen, L. H. & Middelboe, Mathias, 2019, I: Microbiology resource announcements. 8, 15, s. 1-2 e00020-19.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effects of allochthonous dissolved organic matter input on microbial composition and nitrogen-cycling genes at two contrasting estuarine sites
Happel, E. M., Markussen, T. M., Teikari, J. E., Huchaiah, V., Alneberg, J., Andersson, A. F., Sivonen, K., Middelboe, Mathias, Kisand, V. & Riemann, Lasse, 2019, I: F E M S Microbiology Ecology. 95, 9, 10 s., fiz123.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Large Phenotypic and Genetic Diversity of Prophages Induced from the Fish Pathogen Vibrio anguillarum
Castillo, D., Andersen, N., Kalatzis, Panagiotis & Middelboe, Mathias, 2019, I: Viruses. 11, 11, 15 s., 983.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phage defense mechanisms and their genomic and phenotypic implications in the fish pathogen Vibrio anguillarum
Castillo, D., Rørbo, N., Jørgensen, J., Lange, J., Tan, D., Kalatzis, Panagiotis, Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2019, I: FEMS Microbiology Ecology. 95, 3, fiz004.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phenotypic and Genetic Predictors of Pathogenicity and Virulence in Flavobacterium psychrophilum
Sundell, K., Landor, L., Nicolas, P., Jørgensen, J., Castillo, D., Middelboe, Mathias, Dalsgaard, I., Donati, V. L., Madsen, L. & Wiklund, T., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 14 s., 1711.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Bacteriophage Interactions with Marine Pathogenic Vibrios: Implications for Phage Therapy
Kalatzis, Panagiotis, Castillo Bermúdez, D. E., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 2018, I: Antibiotics. 7, 1, 23 s., 15.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coupling biogeochemical process rates and metagenomic blueprints of coastal bacterial assemblages in the context of environmental change
Markussen, T. M., Happel, E. M., Teikari, J. E., Huchaiah, V., Alneberg, J., Andersson, A. F., Sivonen, K., Riemann, Lasse, Middelboe, Mathias & Kisand, V., 2018, I: Environmental Microbiology. 20, 8, s. 3083-3099Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Draft Genome Sequences of Six Vibrio diazotrophicus Strains Isolated from Deep Subsurface Sediments of the Baltic Sea
Castillo, D., Vandieken, V., Engelen, B., Engelhardt, T. & Middelboe, Mathias, 2018, I: Genome Announcements. 6, 10, s. 1-2 e00081-18.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the Effect of Phage Therapy in Preventing Vibrio anguillarum Infections in Cod and Turbot Larvae
Rørbo, N. I., Rønneseth, A., Kalatzis, Panagiotis, Rasmussen, B. B., Engell-Sørensen, K., Kleppen, H. P., Wergeland, H. I., Gram, L. & Middelboe, Mathias, 2018, I: Antibiotics. 7, 2, 15 s., 42.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Widespread distribution of prophage-encoded virulence factors in marine Vibrio communities
Castillo, D., Kauffman, K., Hussain, F., Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N., Polz, M. F. & Middelboe, Mathias, 2018, I: Scientific Reports. 8, s. 1-9 9973.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Isolation and characterization of a N4-like lytic bacteriophage infecting Vibrio splendidus, a pathogen of fish and bivalves
Katharios, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Sarropoulou, E. & Middelboe, Mathias, 28 dec. 2017, I: PLoS ONE. 12, 12, 14 s., e0190083.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Marine viruses: key players in marine ecosystems
Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., okt. 2017, I: Viruses. 9, 10, 6 s., 302.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning
- Udgivet
Stumbling across the same phage: comparative genomics of widespread temperate phages infecting the fish pathogen Vibrio anguillarum
Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N. I., Castillo Bermúdez, D. E., Mauritzen, Jesper Juel, Jørgensen, J., Kokkari, C., Zhang, F., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 20 maj 2017, I: Viruses. 9, 5, 19 s., 122.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genome analyses of Vibrio anguillarum strains reveal a link with pathogenicity traits
Castillo Bermúdez, D. E., Alvise, P. D., Xu, R., Zhang, F., Middelboe, Mathias & Gram, L., 28 feb. 2017, I: mSystems. 2, 1, 14 s., e00001-17.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Carbon bioavailability in a high arctic fjord influenced by glacial meltwater, NE Greenland
Paulsen, M. L., Nielsen, S. E. B., Müller, O., Møller, E. F., Stedmon, C. A., Juul-Pedersen, T., Markager, S., Sejr, M. K., Delgado Huertas, A., Larsen, A. & Middelboe, Mathias, 2017, I: Frontiers in Marine Science. 4, 19 s., 176.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Global occurrence and heterogeneity of the Roseobacter-clade species Ruegeria mobilis
Sonnenschein, E. C., Nielsen, K. F., D'Alvise, P., Porsby, C. H., Melchiorsen, J., Heilmann, J., Kalatzis, Panagiotis, López-Pérez, M., Bunk, B., Spröer, C., Middelboe, Mathias & Gram, L., 2017, I: The ISME Journal. 11, s. 569-583 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
Benthic carbon mineralization in hadal trenches: assessment by in situ O2 microprofile measurements
Wenzhöfer, F., Oguri, K., Middelboe, Mathias, Turnewitsch, R., Toyofuku, T., Kitazato, H. & Glud, R. N., 2016, I: Deep-Sea Research. Part 1: Oceanographic Research Papers. 116, s. 276-286 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative genome analysis provides Insights into the pathogenicity of Flavobacterium psychrophilum
Castillo Bermúdez, D. E., Christiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2016, I: P L o S One. 11, 4, 18 s., e0152515.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of bacteriophages on the growth of Favobacterium psychrophilum and development of phage-resistant strains
Christiansen, R. H., Madsen, L., Dalsgaard, I., Castillo Bermúdez, D. E., Kalatzis, P. G. & Middelboe, Mathias, 2016, I: Microbial Ecology. 71, 4, s. 845-859 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic diversity of bacteriophages infecting the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum
Castillo Bermúdez, D. E. & Middelboe, Mathias, 2016, I: F E M S Microbiology Letters. 363, 24, 6 s., fnw272.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Predation and selection for antibiotic resistance in natural environments
Leisner, Jørgen, Jørgensen, Niels O. G. & Middelboe, Mathias, 2016, I: Evolutionary Applications (Online). 9, 3, s. 427-434 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantification of viral and prokaryotic production rates in benthic ecosystems: a methods comparison
Rastelli, E., Dell'Anno, A., Corinaldesi, C., Middelboe, Mathias, Noble, R. T. & Danovaro, R., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 11 s., 1501.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Re-examination of the relationship between marine virus and microbial cell abundances
Wigington, C. H., Sonderegger, D., Brussaard, C. P. D., Buchan, A., Finke, J. F., Fuhrman, J. A., Lennon, J. T., Middelboe, Mathias, Suttle, C. A., Wilson, W. H., Wommack, K. E., Wilhelm, S. W. & Weitz, J. S., 2016, I: Nature Microbiology. 1, 8 s., 15024 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 8392
Flest downloads
-
1744
downloads
Viral lysis of bacteria: an important source of dissolved amino acids and cell wall compounds
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1360
downloads
Seasonal dynamics of autotrophic and heterotrophic plankton metabolism and PCO2 in a subarctic Greenland fjord
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1043
downloads
Virus-driven nitrogen cycling enhances phytoplankton growth
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet