Birgitte Regenberg
Professor
Ecology and Evolution
Universitetsparken 15
2100 København Ø
- 2023
- Udgivet
Circular and Circulating DNA in Inflammatory Bowel Disease: From Pathogenesis to Potential Molecular Therapies
Di Vincenzo, F., Yadid, Y., Petito, V., Emoli, V., Masi, L., Gerovska, D., Araúzo-Bravo, M. J., Gasbarrini, A., Regenberg, Birgitte & Scaldaferri, F., 2023, I: Cells. 12, 15, 29 s., 1953.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Did circular DNA shape the evolution of mammalian genomes?
Holt, Sylvester, Arrey Tané, Gerard & Regenberg, Birgitte, 2023, I: Trends in Biochemical Sciences. 48, 4, 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Methods for the purification and detection of single nucleotide KRAS mutations on extrachromosomal circular DNA in human plasma
Hansen, Lasse Bøllehuus, Jakobsen, S. F., Zole, Egija, Noer, Julie Boertmann, Fang, L. T., Alizadeh, S., Johansen, Julia Sidenius, Mohiyuddin, M. & Regenberg, Birgitte, 2023, I: Cancer Medicine. 12, 17, s. 17679-17691 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variation of extrachromosomal circular DNA in cancer cell lines
dos Santos, Carl Henrik Rung, Hansen, Lasse Bøllehuus, Rojas Triana, Monica, Johansen, A. Z., Perez-Moreno, Mirna & Regenberg, Birgitte, 2023, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 21, s. 4207-4214 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
A unifying model for extrachromosomal circular DNA load in eukaryotic cells
Arrey Tané, Gerard, Keating, S. T. & Regenberg, Birgitte, 2022, I: Seminars in Cell and Developmental Biology. 128, s. 40-50 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CReSIL: accurate identification of extrachromosomal circular DNA from long-read sequences
Wanchai, V., Jenjaroenpun, P., Leangapichart, T., Arrey Tané, Gerard, Burnham, C. M., Tümmler, M. C., Delgado-Calle, J., Regenberg, Birgitte & Nookaew, I., 2022, I: Briefings in Bioinformatics. 23, 6, 11 s., bbac422.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Circle-Seq reveals genomic and disease-specific hallmarks in urinary cell-free extrachromosomal circular DNAs
Lv, W., Pan, X., Han, P., Wang, Z., Feng, W., Xing, X., Wang, Q., Qu, K., Zeng, Y., Zhang, C., Xu, Z., Li, Y., Zheng, T., Lin, L., Liu, C., Liu, X., Li, H., Henriksen, R. A., Bolund, L., Lin, L. & 7 flere, , 2022, I: Clinical and Translational Medicine. 12, 4, 16 s., e817.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Circular DNA in the human germline and its association with recombination
Henriksen, Rasmus Henrik Amund, Jenjaroenpun, P., Sjøstrøm, I. B., Jensen, Kristian HR, Prada Luengo, Inigo, Wongsurawat, T., Nookaew, I. & Regenberg, Birgitte, 2022, I: Molecular Cell. 82, 1, s. 209-217.e7Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Extrachromosomal circular DNA in cancer: history, current knowledge, and methods
Noer, Julie Boertmann, Hørsdal, O. K., Xiang, X., Luo, Y. & Regenberg, Birgitte, 2022, I: Trends in Genetics. 38, 7, s. 766-781 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Targeted removal of mitochondrial DNA from mouse and human extrachromosomal circular DNA with CRISPR-Cas9
Feng, Weijia, Arrey Tané, Gerard, Zole, Egija, Iv, W., Liang, Xue, Han, Peng, Mohiyuddin, M., Pilegaard, Henriette & Regenberg, Birgitte, 2022, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 20, s. 3059-3067 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
Isolation, characterization, and genome assembly of Barnettozyma botsteinii sp. nov. and novel strains of Kurtzmaniella quercitrusa isolated from the intestinal tract of the termite Macrotermes bellicosus
Arrey Tané, Gerard, Li, G., Murphy, Rob, Guimaraes, L., Alizadeh, S., Poulsen, Michael & Regenberg, Birgitte, 2021, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 11, 12, 13 s., jkab342.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
- Udgivet
Near-Random Distribution of Chromosome-Derived Circular DNA in the Condensed Genome of Pigeons and the Larger, More Repeat-Rich Human Genome
Møller, H. D., Ramos Madrigal, Jazmin, Prada Luengo, Inigo, Gilbert, M Thomas P & Regenberg, Birgitte, 2020, I: Genome Biology and Evolution. 12, 2, s. 3762-3777 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Replicative aging is associated with loss of genetic heterogeneity from extrachromosomal circular DNA in Saccharomyces cerevisiae
Prada Luengo, Inigo, Møller, H. D., Henriksen, Rasmus Henrik Amund, Gao, Q., Larsen, C. E., Alizadeh, S., Maretty, L., Houseley, J. & Regenberg, Birgitte, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 14, s. 7883-7898 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
What Is Extrachromosomal Circular DNA and What Does It Do?
Chiu, R. W. K., Dutta, A., Hensson, A. G., Lo, Y. M. D., Mischel, P. & Regenberg, Birgitte, 2020, I: Clinical Chemistry. 66, 6, s. 754-759Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
- Udgivet
Lifelong physical activity is associated with promoter hypomethylation of genes involved in metabolism, myogenesis, contractile properties and oxidative stress resistance in aged human skeletal muscle
Sailani, M. R., Halling, Jens Frey, Møller, H. D., Lee, H., Plomgaard, Peter Stendahl, Pilegaard, Henriette, Snyder, M. P. & Regenberg, Birgitte, 2019, I: Scientific Reports. 9, s. 1-11 3272.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multicellular group formation in Saccharomyces cerevisiae
Fisher, Roberta May & Regenberg, Birgitte, 2019, I: Proceedings. Biological sciences. 286, 1910, 7 s., 20191098.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RNAi as a Tool to Study Virulence in the Pathogenic Yeast Candida glabrata
Ishchuku, O. P., Ahmad, K. M., Koruza, K., Bojanovic, K., Sprenger, M., Kasper, L., Brunke, S., Hube, B., Säll, T., Hellmark, T., Gullstrand, B., Brion, C., Freel, K., Schacherer, J., Regenberg, Birgitte, Knechtts, W. & Piskur, J., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 17 s., 1679.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sensitive detection of circular DNAs at single-nucleotide resolution using guided realignment of partially aligned reads
Prada Luengo, Inigo, Krogh, Anders, Sørensen, L. M. & Regenberg, Birgitte, 2019, I: BMC Bioinformatics. 20, 9 s., 663.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
To Be or Not to Be: Circular RNAs or mRNAs From Circular DNAs?
Iparraguirre, L., Prada Luengo, Inigo, Regenberg, Birgitte & Otaegui, D., 2019, I: Frontiers in Genetics. 10, 6 s., 940.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2018
- Udgivet
Circular DNA elements of chromosomal origin are common in healthy human somatic tissue
Møller, H. D., Mohiyuddin, M., Prada Luengo, Inigo, Sailani, M. R., Halling, Jens Frey, Plomgaard, Peter Stendahl, Maretty, L., Hansen, Anders Johannes, Snyder, M. P., Pilegaard, Henriette, Lam, H. Y. K. & Regenberg, Birgitte, 1 dec. 2018, I: Nature Communications. 9, 12 s., 1069.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CRISPR-C: circularization of genes and chromosome by CRISPR in human cells
Møller, H. D., Lin, L., Xiang, X., Petersen, T. S., Huang, J., Yang, L., Kjeldsen, E., Jensen, U. B., Zhang, X., Liu, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Church, G. M., Bolund, L., Regenberg, Birgitte & Luo, Y., 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 22, s. 1-13 e131.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regulation of apoptosis and autophagy in mouse and human skeletal muscle with aging and lifelong exercise training
Dethlefsen, M. M., Halling, Jens Frey, Møller, H. D., Plomgaard, Peter Stendahl, Regenberg, Birgitte, Jørgensen, Stine Ringholm & Pilegaard, Henriette, 2018, I: Experimental Gerontology. 111, s. 141-153Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2017
- Udgivet
Division of labour in the yeast: Saccharomyces cerevisiae
Wloch-Salamon, D. M., Fisher, Roberta May & Regenberg, Birgitte, okt. 2017, I: Yeast. 34, 10, s. 399-406 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Persistence and drug tolerance in pathogenic yeast
Bojsen, R. K., Regenberg, Birgitte & Folkesson, A., feb. 2017, I: Current Genetics. 63, 1, s. 19-22 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2016
- Udgivet
A common mechanism involving the TORC1 pathway can lead to amphotericin B-persistence in biofilm and planktonic Saccharomyces cerevisiae populations populations
Bojsen, R. K., Regenberg, Birgitte, Gresham, D. & Folkesson, A., 2016, I: Scientific Reports. 6, 10 s., 21874 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 546549
Flest downloads
-
1592
downloads
Genetic basis for Saccharomyces cerevisiae biofilm in liquid medium
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
776
downloads
Amino acid transporter genes are essential for FLO11-dependent and FLO11-independent biofilm formation and invasive growth in Saccharomyces cerevisiae
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
706
downloads
The synthetic amphipathic peptidomimetic LTX109 is a potent fungicide that disturbs plasma membrane integrity in a sphingolipid dependent manner
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet