Søren Johannes Sørensen

Søren Johannes Sørensen

Professor

ORCID: 0000-0001-6227-9906

Udgivelsesår:
Alle
26 - 50 ud af 411Pr. side: 25
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2022
  2. Udgivet

    Barley Rhizosphere Microbiome Transplantation: A Strategy to Decrease Susceptibility of Barley Grown in Soils With Low Microbial Diversity to Powdery Mildew

    Bziuk, N., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Schikora, A. & Smalla, K., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 14 s., 830905.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Biosolids for safe land application: does wastewater treatment plant size matters when considering antibiotics, pollutants, microbiome, mobile genetic elements and associated resistance genes?

    Wolters, B., Hauschild, K., Blau, K., Mulder, I., Heyde, B. J., Sørensen, Søren Johannes, Siemens, J., Jechalke, S., Smalla, K. & Nesme, Joseph, 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 3, s. 1573-1589 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids

    Pinilla Redondo, Rafael, Russel, J., Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A., Garrett, Roger Antony, Nesme, Joseph, Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 8, s. 4315-4328

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges

    Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. & 83 flere, Darling, A. E., Egan, R., Eskin, E., Georganas, E., Goltsman, E., Gray, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Hofmeyr, S., Huang, P., Irber, L., Jia, H., Jørgensen, T. S., Kieser, S. D., Klemetsen, T., Kola, A., Kolmogorov, M., Korobeynikov, A., Kwan, J., LaPierre, N., Lemaitre, C., Li, C., Limasset, A., Malcher-Miranda, F., Mangul, S., Marcelino, V. R., Marchet, C., Marijon, P., Meleshko, D., Mende, D. R., Milanese, A., Nagarajan, N., Nissen, Jakob Nybo, Nurk, S., Oliker, L., Paoli, L., Peterlongo, P., Piro, V. C., Porter, J. S., Rasmussen, Simon, Rees, E. R., Reinert, K., Renard, B., Robertsen, E. M., Rosen, G. L., Ruscheweyh, H. J., Sarwal, V., Segata, N., Seiler, E., Shi, L., Sun, F., Sunagawa, S., Sørensen, Søren Johannes, Thomas, A., Tong, C., Trajkovski, M., Tremblay, J., Uritskiy, G., Vicedomini, R., Wang, Z., Wang, Z., Wang, Z., Warren, A., Willassen, N. P., Yelick, K., You, R., Zeller, G., Zhao, Z., Zhu, S., Zhu, J., Garrido-Oter, R., Gastmeier, P., Hacquard, S., Häußler, S., Khaledi, A., Maechler, F., Mesny, F., Radutoiu, S., Schulze-Lefert, P., Smit, N., Strowig, T., Bremges, A., Sczyrba, A. & McHardy, A. C., 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 429-440

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Deciphering bacteria associated with a pre-parasitic stage of the root-knot nematode Meloidogyne hapla in nemato-suppressive and nemato-conducive soils

    Topalović, O., Santos, S. S., Heuer, H., Nesme, Joseph, Kanfra, X., Hallmann, J., Sørensen, Søren Johannes & Vestergård, M., 2022, I: Applied Soil Ecology. 172, 9 s., 104344.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Genome binning of viral entities from bulk metagenomics data

    Johansen, Joachim, Plichta, D. R., Nissen, J. N., Jespersen, Marie Louise, Shah, S. A., Deng, Ling, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes & Rasmussen, Simon, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 965.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Horizontal Gene Transfer of an IncP1 Plasmid to Soil Bacterial Community Introduced by Escherichia coli through Manure Amendment in Soil Microcosms

    Macedo, G., Olesen, Asmus Kalckar, Maccario, Lorrie, Leal, L. H., v. d. Maas, P., Heederik, D., Mevius, D., Sørensen, Søren Johannes & Schmitt, H., 2022, I: Environmental Science & Technology. 56, 16, s. 11398-11408 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Impact of intensive lifestyle intervention on gut microbiota composition in type 2 diabetes: a post-hoc analysis of a randomized clinical trial

    Wei, S., Brejnrod, A. D., Trivedi, Urvish, Mortensen, M. S., Johansen, M. Y., Karstoft, Kristian, Vaag, A. A., Ried-Larsen, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Gut Microbes. 14, 1, 15 s., 2005407.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Importance of substrate quality and clay content on microbial extracellular polymeric substances production and aggregate stability in soils

    Olagoke, F. K., Bettermann, A., Nguyen, P. T. B., Redmile-Gordon, M., Babin, D., Smalla, K., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Kalbitz, K. & Vogel, C., 2022, I: Biology and Fertility of Soils. 58, 4, s. 435-457 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    IncHI1A plasmids potentially facilitate horizontal flow of antibiotic resistance genes to pathogens in microbial communities of urban residential sewage

    Olesen, Asmus Kalckar, Pinilla Redondo, Rafael, Hansen, Mads Frederik, Russel, J., Dechesne, A., Smets, B. F., Madsen, Jonas Stenløkke, Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Molecular Ecology. 31, 5, s. 1595-1608

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Influence of sewage sludge stabilization method on microbial community and the abundance of antibiotic resistance genes

    Major, N., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Goreta Ban, S., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D., Grosch, R., Schikora, A. & Schierstaedt, J., 2022, I: Waste Management. 154, s. 126-135 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Long-Range PCR Reveals the Genetic Cargo of IncP-1 Plasmids in the Complex Microbial Community of an On-Farm Biopurification System Treating Pesticide-Contaminated Wastewater

    Dunon, V., Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Lavigne, R., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K., Top, E. M. & Springael, D., 2022, I: Applied and Environmental Microbiology. 88, 3, 17 s., e01648-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Long-Term Fertilization Strategy Impacts Rhizoctonia solani–Microbe Interactions in Soil and Rhizosphere and Defense Responses in Lettuce

    Sommermann, L., Babin, D., Behr, J. H., Chowdhury, S. P., Sandmann, M., Windisch, S., Neumann, G., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Schellenberg, I., Rothballer, M., Geistlinger, J., Smalla, K. & Grosch, R., 2022, I: Microorganisms. 10, 9, 27 s., 1717.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Metabolic Profiling of Interspecies Interactions During Sessile Bacterial Cultivation Reveals Growth and Sporulation Induction in Paenibacillus amylolyticus in Response to Xanthomonas retroflexus

    Herschend, J., Ernst, M., Koren, K., Melnik, A. V., da Silva, R. R., Røder, Henriette Lyng, Damholt, Z. B. V., Hägglund, Per Mårten, Svensson, B., Sørensen, Søren Johannes, Kühl, Michael, Dorrestein, P. C. & Burmølle, Mette, 2022, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 12, 17 s., 805473.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

    Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Neonatal metabolome of caesarean section and risk of childhood asthma

    Gürdeniz, G., Ernst, M., Rago, D., Kim, M., Courraud, J., Stokholm, Jakob, Bønnelykke, Klaus, Björkbom, A., Trivedi, Urvish, Sørensen, Søren Johannes, Brix, Susanne, Hougaard, D., Rasmussen, Morten Arendt, Cohen, A. S., Bisgaard, H. & Chawes, Bo Lund Krogsgaard, 2022, I: The European Respiratory Journal. 59, 6, 11 s., 2102406.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Prophylactic treatment of breast implants with a solution of gentamicin, vancomycin and cefazolin antibiotics for women undergoing breast reconstructive surgery: protocol for a randomised, double-blind, placebo-controlled trial (The BREAST-AB trial)

    Hemmingsen, M. N., Larsen, A., Weltz, T. K., Ørholt, M., Wiberg, S., Bennedsen, A. K., Bille, C., Carstensen, L. F., Jensen, L. T., Bredgaard, R., Koudahl, V., Schmidt, Volker-Jürgen, Vester-Glowinski, Peter Viktor, Hølmich, Lisbet Rosenkrantz, Sørensen, Søren Johannes, Bjarnsholt, Thomas, Damsgaard, Tine M Engberg & Herly, Mikkel, 2022, I: BMJ Open. 12, 9, s. e058697

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Soil texture is a stronger driver of the maize rhizosphere microbiome and extracellular enzyme activities than soil depth or the presence of root hairs

    Yim, B., Ibrahim, Z., Rüger, L., Ganther, M., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Heintz-Buschart, A., Tarkka, M. T., Vetterlein, D., Bonkowski, M., Blagodatskaya, E. & Smalla, K., 2022, I: Plant and Soil. 478, 1-2, s. 229-251 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    The developing airway and gut microbiota in early life is influenced by age of older siblings

    Christensen, E. D., Hjelmsø, M. H., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Shah, S., Redgwell, T., Poulsen, Christina Egeø, Trivedi, Urvish, Russel, J., Gupta, S., Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Sørensen, Søren Johannes, Rasmussen, Morten Arendt, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2022, I: Microbiome. 10, 15 s., 106.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Unexpected diversity among small-scale sample replicates of defined plant root compartments

    Attia, S., Russel, J., Mortensen, M. S., Madsen, Jonas Stenløkke & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: ISME Journal. 16, 4, s. 997-1003 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Vaginal dysbiosis in pregnancy associates with risk of emergency caesarean section: a prospective cohort study

    Haahr, T., Clausen, Tine Dalsgaard, Thorsen, J., Rasmussen, Morten Arendt, Mortensen, M. S., Lehtimäki, J., Shah, S. A., Hjelmsø, M. H., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Vestergaard, G., Jacobsson, B., Larsson, P., Brix, S., Sørensen, Søren Johannes, Bisgaard, H. & Stokholm, Jakob, 2022, I: Clinical Microbiology and Infection. 28, 4, s. Pages 588-595

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. 2021
  24. Udgivet

    A community resource for paired genomic and metabolomic data mining

    Schorn, M. A., Verhoeven, S., Ridder, L., Huber, F., Acharya, D. D., Aksenov, A. A., Aleti, G., Moghaddam, J. A., Aron, A. T., Aziz, S., Bauermeister, A., Bauman, K. D., Baunach, M., Beemelmanns, C., Beman, J. M., Berlanga-Clavero, M. V., Blacutt, A. A., Bode, H. B., Boullie, A., Brejnrod, A. & 90 flere, Bugni, T. S., Calteau, A., Cao, L., Carrión, V. J., Castelo-Branco, R., Chanana, S., Chase, A. B., Chevrette, M. G., Costa-Lotufo, L. V., Crawford, J. M., Currie, C. R., Cuypers, B., Dang, T., de Rond, T., Demko, A. M., Dittmann, E., Du, C., Drozd, C., Dujardin, J., Dutton, R. J., Edlund, A., Fewer, D. P., Garg, N., Gauglitz, J. M., Gentry, E. C., Gerwick, L., Glukhov, E., Gross, H., Gugger, M., Matus, D. G. G., Helfrich, E. J. N., Hempel, B., Hur, J., Iorio, M., Jensen, P. R., Kang, K. B., Kaysser, L., Kelleher, N. L., Kim, C. S., Kim, K. H., Koester, I., König, G. M., Leao, T., Lee, S. R., Lee, Y., Li, Xuan Ji, Little, J. C., Maloney, K. N., Männle, D., Martin H., C., McAvoy, A. C., Metcalf, W. W., Mohimani, H., Molina-Santiago, C., Moore, B. S., Mullowney, M. W., Muskat, M., Nothias, L., O'Neill, E. C., Parkinson, E. I., Petras, D., Piel, J., Pierce, E. C., Pires, K., Reher, R., Romero, D., Roper, M. C., Rust, M., Saad, H., Saenz, C., Sanchez, L. M., Sørensen, Søren Johannes, Sosio, M., Süssmuth, R. D., Sweeney, D., Tahlan, K., Thomson, R. J., Tobias, N. J., Trindade-Silva, A. E., van Wezel, G. P., Wang, M., Weldon, K. C., Zhang, F., Ziemert, N., Duncan, K. R., Crüsemann, M., Rogers, S., Dorrestein, P. C., Medema, M. H. & van der Hooft, J. J. J., 2021, I: Nature Chemical Biology. 17, 4, s. 363-368

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Broad Dissemination of Plasmids across Groundwater-Fed Rapid Sand Filter Microbiomes

    Pinilla Redondo, Rafael, Olesen, Asmus Kalckar, Russel, J., de Vries, L. E., Christensen, L. D., Musovic, S., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: mBio. 12, 6, 13 s., e0306821.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Comparative Genomics Analysis of Keratin-Degrading Chryseobacterium Species Reveals Their Keratinolytic Potential for Secondary Metabolite Production

    Kang, D., Shoaie, S., Jacquiod, S., Sørensen, Søren Johannes & Ledesma-Amaro, R., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 15 s., 1042.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Comparative analysis of the alveolar microbiome in COPD, ECOPD, Sarcoidosis, and ILD patients to identify respiratory illnesses specific microbial signatures

    Gupta, S., Shariff, M., Chaturvedi, G., Sharma, A., Goel, N., Yadav, M., Mortensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Mukerji, M. & Chauhan, N. S., 2021, I: Scientific Reports. 11, 11 s., 3963.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 6 7 8 ...17 Næste

ID: 4269