Biologisk Institut

 

 
  1. 2019
  2. Udgivet

    Biophysical and Mechanistic Models for Disease-Causing Protein Variants

    Stein, Amelie, Fowler, D. M., Hartmann-Petersen, Rasmus & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Trends in Biochemical Sciences. 44, 7, s. 575-588

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Bornholms desmidiacéer - 130 år efter overlærer Hoff

    Hansen, Gert, Stastny, J., Moestrup, Øjvind & Lundholm, Nina, 2019, I: URT. 2019, 1, s. 8-13

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  4. Udgivet

    Broad North Atlantic distribution of a meiobenthic annelid – against all odds: [Inkl. correction]

    Worsaae, Katrine, Kerbl, A., Vang, Á. & Gonzalez, B. C., 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 15497.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Bronzevejbi: metalskinnet under solens stråler

    Madsen, Henning Bang & Dupont, Y. L., 2019, I: Tidsskrift for Biavl. 153, 9, s. 293

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  6. Udgivet

    CAGEfightR: analysis of 5'-end data using R/Bioconductor

    Thodberg, Malte, Thieffry, A., Vitting-Seerup, K., Andersson, Robin & Sandelin, Albin Gustav, 2019, I: BMC Bioinformatics. 20, 13 s., 487.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    CRP Interacts Specifically With Sxy to Activate Transcription in Escherichia coli

    Søndberg, E., Sinha, A. K., Gerdes, K. & Semsey, S., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 8 s., 2053.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Can interaction specificity in the fungus-farming termite symbiosis be explained by nutritional requirements of the fungal crop?

    da Costa, R. R., Vreeburg, S. M. E., Shik, Jonathan Z., Aanen, D. K. & Poulsen, Michael, 2019, I: Fungal Ecology. 38, s. 54-61

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Can plant traits predict seed dispersal probability via red deer guts, fur, and hooves?

    Petersen, T. K. & Bruun, Hans Henrik, 2019, I: Ecology and Evolution. 9, 17, s. 9768-9781 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Carbon dioxide fluxes of air-exposed sediments and desiccating ponds

    Martinsen, K. T., Kragh, T. & Sand-Jensen, Kaj, 2019, I: Biogeochemistry. 144, 2, s. 165-180

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Catchment properties and the photosynthetic trait composition of freshwater plant communities

    Iversen, L. L., Winkel, A., Baastrup-Spohr, L., Hinke, A. B., Alahuhta, J., Baattrup-Pedersen, A., Birk, S., Brodersen, P., Chambers, P. A., Ecke, F., Feldmann, T., Gebler, D., Heino, J., Jespersen, T. S., Moe, S. J., Riis, T., Sass, L., Vestergaard, O., Maberly, S. C., Sand-jensen, K. & 1 flere, Pedersen, Ole, 2019, I: Science. 366, 6467, s. 878-881 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Cellular functions and molecular mechanisms of non-lysine ubiquitination

    McClellan, A. J., Laugesen, Sophie Heiden & Ellgaard, Lars, 2019, I: Open Biology. 9, 9, 16 s., 190147.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Cellular signalling by primary cilia in development, organ function and disease

    Anvarian, Zeinab, Mykytyn, K., Mukhopadhyay, S., Pedersen, Lotte Bang & Christensen, Søren Tvorup, 2019, I: Nature Reviews Nephrology. 15, s. 199-219

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Changes in host ant communities of Alcon Blue butterflies in abandoned mountain hay meadows

    Tartally, A., Nash, David Richard, Varga, Z. & Lengyel, S., 2019, I: Insect Conservation and Diversity. 12, 6, s. 492-500 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Changes in trophic state and aquatic communities in high Arctic ponds in response to increasing goose populations

    Jensen, T. C., Walseng, B., Hessen, D. O., Dimante-Deimantovica, I., Novichkova, A. A., Chertoprud, E. S., Chertoprud, M. V., Sakharova, E. G., Krylov, A. V., Frisch, D. & Christoffersen, Kirsten Seestern, 2019, I: Freshwater Biology. 64, 7, s. 1241-1254

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Characterization and validation of somatic mutation spectrum to reveal heterogeneity in gastric cancer by single cell sequencing

    Peng, L., Xing, R., Liu, D., Bao, L., Cheng, W., Wang, H., Yu, Y., Liu, X., Jiang, L., Wu, Y., An, Z., Liang, Q., Kim, R. N., Shin, Y. K., Yang, H., Wang, J., Yu, J., Zhang, X., Xu, X., Yang, J. & 3 flere, Wu, K., Zhu, S. & Lu, Y., 2019, I: Science Bulletin. 64, 4, s. 236-244

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Characterization of Extracellular Biosurfactants Expressed by a Pseudomonas putida Strain Isolated from the Interior of Healthy Roots from Sida hermaphrodita Grown in a Heavy Metal Contaminated Soil

    Bernat, P., Nesme, Joseph, Paraszkiewicz, K., Schloter, M. & Płaza, G., 2019, I: Current Microbiology. 76, 11, s. 1320-1329 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Characterization of Hailey-Hailey Disease-mutants in presence and absence of wild type SPCA1 using Saccharomyces cerevisiae as model organism

    Muncanovic, D., Justesen, M. H., Preisler, Sarah Spruce & Pedersen, Per Amstrup, 2019, I: Scientific Reports. 9, 25 s., 12442.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Characterization of a Highly Virulent Edwardsiella anguillarum Strain Isolated From Greek Aquaculture, and a Spontaneously Induced Prophage Therein

    Katharios, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Pavlidis, M. & Wang, Q., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-12 141.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Characterization of host associated microbiota under influencing factors: A case study on human gut and Brachypodium root

    Wei, S., 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  21. Udgivet

    Characterizing Gene Expression and Fragility of the Fragile Site Gene PARK2

    Voutsinos, Vasileios, 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  22. Udgivet

    Chemical ecology of fish-killing microalgae: Toxins, toxin production and the effects on the marine food web

    Binzer, S. B., 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  23. Udgivet

    Cmr3 regulates the suppression on cyclic oligoadenylate synthesis by tag complementarity in a Type III-B CRISPR-Cas system

    Guo, T., Zheng, F., Zeng, Z., Yang, Y., Li, Q., She, Q. & Han, W., 2019, I: RNA Biology. 16, 10, s. 1513-1520

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Combining probiotic Phaeobacter inhibens DSM17395 and broad-host-range vibriophage KVP40 against fish pathogenic vibrios

    Rasmussen, B. B., Kalatzis, Panagiotis, Middelboe, Mathias & Gram, L., 2019, I: Aquaculture. 513, 7 s., 734415.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Community richness of amphibian skin bacteria correlates with bioclimate at the global scale

    Kueneman, J. G., Bletz, M. C., McKenzie, V. J., Becker, C. G., Joseph, M. B., Abarca, J. G., Archer, H., Arellano, A. L., Bataille, A., Becker, M., Belden, L. K., Crottini, A., Geffers, R., Haddad, C. F. B., Harris, R. N., Holden, W. M., Hughey, M., Jarek, M., Kearns, P. J., Kerby, J. L. & 22 flere, Kielgast, J., Kurabayashi, A., Longo, A. V., Loudon, A., Medina, D., Nuñez, J. J., Perl, R. G. B., Pinto-Tomás, A., Rabemananjara, F. C. E., Rebollar, E. A., Rodríguez, A., Rollins-Smith, L., Stevenson, R., Tebbe, C. C., Vargas Asensio, G., Waldman, B., Walke, J. B., Whitfield, S. M., Zamudio, K. R., Zúñiga Chaves, I., Woodhams, D. C. & Vences, M., 2019, I: Nature Ecology and Evolution. 3, 3, s. 381-389 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Comparative Phylogenomics, a Stepping Stone for Bird Biodiversity Studies

    Stiller, Josefin & KU, thw266, 2019, I: Diversity. 11, 7, 19 s., 115.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Comparative activity of ceftriaxone, ciprofloxacin and gentamicin as a function of bacterial growth rate probed by Escherichia coli chromosome replication in the mouse peritonitis model

    Haugan, M. S., Løbner-Olesen, Anders & Frimodt-Møller, N., 2019, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63, 2, 13 s., e-02133-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Comparative analysis of amplicon and metagenomic sequencing methods reveals key features in the evolution of animal metaorganisms

    Rausch, P., Rühlemann, M., Hermes, B. M., Doms, S., Dagan, T., Dierking, K., Domin, H., Fraune, S., von Frieling, J., Henschel, U., Heinsen, F-A., Höppner, M., Jahn, M. T., Jaspers, C., Kissoyan, K. A. B., Langfeldt, D., Rehman, A., Reusch, T. B. H., Roeder, T., Schmitz, R. A. & 9 flere, Schulenburg, H., Soluch, R., Sommer, F., Stukenbrock, E., Weiland-Bräuer, N., Rosenstiel, P., Franke, A., Bosch, T. & Baines, J. F., 2019, I: Microbiome. 7, 19 s., 133.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Comparative genomics for non-O1/O139 Vibrio cholerae isolates recovered from the Yangtze River Estuary versus V. cholerae representative isolates from serogroup O1

    Gong, L., Yu, P., Zheng, H., Gu, W., He, W., Tang, Y., Wang, Y., Dong, Y., Peng, Xu, She, Q., Xie, L. & Chen, L., 2019, I: Molecular Genetics and Genomics. 294, 2, s. 417-430

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Comparative myoanatomy of Tardigrada: new insights from the heterotardigrades Actinarctus doryphorus (Tanarctidae) and Echiniscoides sigismundi (Echiniscoididae)

    Persson, D. K., Halberg, Kenneth Veland, Cardoso Neves, R. A., Jørgensen, Aslak, Kristensen, Reinhardt Møbjerg & Møbjerg, Nadja, 2019, I: B M C Evolutionary Biology. 19, 14 s., 206.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Comparative study on pattern recognition receptors in non-teleost ray-finned fishes and their evolutionary significance in primitive vertebrates

    He, Y., Pan, H., KU, thw266 & He, S., 2019, I: Science China Life Sciences. 62, 4, s. 566-578

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Comparative transcriptomics suggest unique molecular adaptations within tardigrade lineages

    Kamilari, M., Jørgensen, Aslak, Schiøtt, M. & Møbjerg, Nadja, 2019, I: B M C Genomics. 20, 19 s., 607.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Comparison of Twelve Ant Species and Their Susceptibility to Fungal Infection

    Bos, N., Kankaanpää-Kukkonen, V., Freitak, D., Stucki, D. & Sundström, L., 2019, I: Insects. 10, 9, 14 s., 271.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Comparison of cultured human cardiomyocyte clusters obtained from embryos/fetuses or derived from human embryonic stem cells

    Grubb, Søren, Vestergaard, M. L., Andersen, A. S., Rasmussen, K. K., Mamsen, L., Tuckute, G., Grunnet-Lauridsen, K., Møllgård, Kjeld, Ernst, E., Christensen, Søren Tvorup, Callø, Kirstine & tcg964, tcg964, 2019, I: Stem Cells and Development. 28, 9, s. 608-619

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Vibrio anguillarum Nontailed Bacteriophage NO16

    Kalatzis, Panagiotis, Carstens, A. B., Katharios, P., Castillo, D., Hansen, L. H. & Middelboe, Mathias, 2019, I: Microbiology resource announcements. 8, 15, s. 1-2 e00020-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Complete Inactivation of Sebum-Producing Genes Parallels the Loss of Sebaceous Glands in Cetacea

    Lopes-Marques, M., Machado, A. M., Alves, L. Q., Fonseca, M. M., Barbosa, S., Sinding, M. S., Rasmussen, M. H., Iversen, M. R., Bertelsen, Mads Frost, Campos, P. F., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ruivo, R. & Castro, L. F. C., 2019, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 36, 6, s. 1270-1280

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Comprehensive search for accessory proteins encoded with archaeal and bacterial type III CRISPR-cas gene cassettes reveals 39 new cas gene families

    Shah, S. A., Alkhnbashi, O. S., Behler, J., Han, W., She, Q., Hess, W. R., Garrett, Roger Antony & Backofen, R., 2019, I: RNA Biology. 16, 4, s. 530-542 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Computational and cellular studies reveal structural destabilization and degradation of MLH1 variants in Lynch syndrome

    Abildgaard, A. B., Stein, Amelie, Nielsen, S. V., Schultz-Knudsen, Katrine, Papaleo, E., Shrikhande, A., Hoffmann, Eva, Bernstein, I., Gerdes, Anne-Marie Axø, Takahashi, M., Ishioka, C., Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2019, I: eLife. 8, 28 s., e49138 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Consequences of breed formation on patterns of genomic diversity and differentiation: the case of highly diverse peripheral Iberian cattle

    Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Urena, I., Afonso, S., Pires, A. E., Jørsboe, E., Chikhi, L. & Ginja, C., 2019, I: BMC Genomics. 20, s. 1-13 334.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Conservation of Small Regulatory RNAs in Vibrio parahaemolyticus: Possible role of RNA-OUT Encoded by the Pathogenicity Island (VPaI-7) of Pandemic Strains

    Plaza, N., Perez-Reytor, D., Ramirez-Araya, S., Pavon, A., Corsini, G., Loyola, D. E., Jaña, V., Pavez, L., Navarrete, P., Bastías, R., Castillo Bermúdez, D. E. & García, K., 2019, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 20, 11, 15 s., 2827.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Copepod carcasses in the subtropical convergence zone of the Sargasso Sea: implications for microbial community composition, system respiration and carbon flux

    Tang, K. W., Backhaus, L., Riemann, Lasse, Koski, M., Grossart, H., Munk, P. & Nielsen, T. G., 2019, I: Journal of Plankton Research. 41, 4, s. 549-560

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Correlation of bio-optical properties with photosynthetic pigment and microorganism distribution in microbial mats from Hamelin Pool, Australia

    Fisher, A., Wangpraseurt, D., Larkum, A. W. D., Johnson, M., Kühl, Michael, Chen, M., Wong, H. L. & Burns, B. P., 2019, I: F E M S Microbiology Ecology. 95, 1, s. 1-13 fiy219.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Cosmopolitan Metapopulations?

    Fenchel, Tom, Finlay, B. J. & Esteban, G. F., 2019, I: Protist. 170, 3, s. 314-318

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Crustacean-sponge symbiosis: collecting and maintaining sponge-inhabiting barnacles (Cirripedia: Thoracica: Acastinae) for studies on host specificity and larval biology

    Yu, M. C., Kolbasov, G. A., Høeg, Jens Thorvald & Chan, B. K. K., 2019, I: Journal of Crustacean Biology. 39, 4, s. 522-532 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Cryptic diversity of small-sized species of Phalacroma (Dinophysales, Dinophyceae) from Denmark Strait (Eastern Arctic Greenland)

    Daugbjerg, Niels, Hansen, S. A. & Richardson, Katherine, 2019, I: Phycological Research. 67, 3, s. 244-249

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Current View of the Mechanisms Controlling the Transcription of the TOL Plasmid Aromatic Degradation Pathways

    Domínguez-Cuevas, P. & Marqués, S., 2019, Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils, and Lipids. Rojo, F. (red.). Springer, s. 573-594 (Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    DNA-and RNA-SIP Reveal Nitrospira spp. as Key Drivers of Nitrification in Groundwater-Fed Biofilters

    Gülay, A., Fowler, S. J., Tatari, K., Thamdrup, B., Albrechtsen, H., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2019, I: mBio. 10, 6, 14 s., e01870-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    DamMet: ancient methylome mapping accounting for errors, true variants, and post-mortem DNA damage

    Hanghøj, Kristian Ebbesen, Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders & Orlando, L., 2019, I: GigaScience. 8, 4, 6 s., giz025.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Danish plant biodiversity: investigated over more than a century using legacy data

    Nielsen, T. F., 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  50. Udgivet

    Danmarks Svampeatlas – 2018-sæsonen

    Heilmann-Clausen, Jacob, Frøslev, Tobias Guldberg, Læssøe, Thomas, Jeppesen, T. S., Petersen, J. H. & Søchting, Ulrik, 2019, I: Svampe. 79, s. 52-55

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  51. Udgivet

    Dataset on reproductive traits of Scandinavian alpine plants

    Bruun, Hans Henrik, 2019, I: Data in Brief. 25, 12 s., 104149.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt