Biologisk Institut

 

 
  1. 2023
  2. Udgivet

    Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in the macaque cortex

    Chen, A., Sun, Y., Lei, Y., Li, C., Liao, S., Meng, J., Bai, Y., Liu, Z., Liang, Z., Zhu, Z., Yuan, N., Yang, H., Wu, Z., Lin, F., Wang, K., Li, M., Zhang, S., Yang, M., Fei, T., Zhuang, Z. & 85 flere, Huang, Y., Zhang, Y., Xu, Y., Cui, L., Zhang, R., Han, L., Sun, X., Chen, B., Li, W., Huangfu, B., Ma, K., Ma, J., Li, Z., Lin, Y., Wang, H., Zhong, Y., Zhang, H., Yu, Q., Wang, Y., Liu, X., Peng, J., Liu, C., Chen, W., Pan, W., An, Y., Xia, S., Lu, Y., Wang, M., Song, X., Liu, S., Wang, Z., Gong, C., Huang, X., Yuan, Y., Zhao, Y., Chai, Q., Tan, X., Liu, J., Zheng, M., Li, S., Huang, Y., Hong, Y., Huang, Z., Li, M., Jin, M., Li, Y., Zhang, H., Sun, S., Gao, L., Bai, Y., Cheng, M., Hu, G., Liu, S., Wang, B., Xiang, B., Li, S., Li, H., Chen, M., Wang, S., Li, M., Liu, W., Liu, X., Zhao, Q., Lisby, Michael, Wang, J., Fang, J., Lin, Y., Xie, Q., He, J., Xu, H., Huang, W., Mulder, J., Yang, H., Sun, Y., Uhlen, M., Poo, M., Wang, J., Yao, J., Wei, W., Li, Y., Shen, Z., Liu, L., Liu, Z., Xu, X. & Li, C., 2023, I: Cell. 186, 17, s. 3726-3743.e24 43 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Evidence for early domestic yak, taurine cattle, and their hybrids on the Tibetan Plateau

    Chen, N., Zhang, Z., Hou, J., Chen, J., Gao, X., Tang, L., Wangdue, S., Zhang, X., Sinding, Mikkel Holger Strander, Liu, X., Han, J., Lü, H., Lei, C., Marshall, F. & Liu, X., 2023, I: Science Advances. 9, 50, 13 s., eadi6857.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Global genetic diversity, introgression, and evolutionary adaptation of indicine cattle revealed by whole genome sequencing

    Chen, N., Xia, X., Hanif, Q., Zhang, F., Dang, R., Huang, B., Lyu, Y., Luo, X., Zhang, H., Yan, H., Wang, S., Wang, F., Chen, J., Guan, X., Liu, Y., Li, S., Jin, L., Wang, P., Sun, L., Zhang, J. & 37 flere, Liu, J., Qu, K., Cao, Y., Sun, J., Liao, Y., Xiao, Z., Cai, M., Mu, L., Siddiki, A. Z., Asif, M., Mansoor, S., Babar, M. E., Hussain, T., Silva, G. L. L. P., Gorkhali, N. A., Terefe, E., Belay, G., Tijjani, A., Zegeye, T., Gebre, M. G., Ma, Y., Wang, Y., Huang, Y., Lan, X., Chen, H., Migliore, N. R., Colombo, G., Semino, O., Achilli, A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Lenstra, J. A., Cheng, H., Lu, W., Hanotte, O., Han, J., Jiang, Y. & Lei, C., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 13 s., 7803.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Informing the SWAT model with remote sensing detected vegetation phenology for improved modeling of ecohydrological processes

    Chen, S., Fu, Y. H., Wu, Z., Hao, F., Hao, Z., Guo, Y., Geng, X., Li, X., Zhang, X., Tang, Jing, Singh, V. P. & Zhang, X., 2023, I: Journal of Hydrology. 616, 13 s., 128817.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Long divergent haplotypes introgressed from wild sheep are associated with distinct morphological and adaptive characteristics in domestic sheep

    Cheng, H., Zhang, Z., Wen, J., Lenstra, J. A., Heller, Rasmus, Cai, Y., Guo, Y., Li, M., Li, R., Li, W., He, S., Wang, J., Shao, J., Song, Y., Zhang, L., Billah, M., Wang, X., Liu, M. & Jiang, Y., 2023, I: PLOS Genetics. 19, 2, 27 s., e1010615.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Vocal interactivity in-and-between humans, animals and robots

    Chetouani, M., Briefer, Elodie, Dassow, A., Marxer, R., Moore, R. K., Obin, N. & Stowell, D., 2023, I: Interaction Studies. 24, 1, s. 1-4 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Tyrosine kinases compete for growth hormone receptor binding and regulate receptor mobility and degradation

    Chhabra, Y., Seiffert, P., Gormal, R. S., Vullings, M., Lee, C. M. M., Wallis, T. P., Dehkhoda, F., Indrakumar, S., Jacobsen, Nina Louise, Lindorff-Larsen, Kresten, Durisic, N., Waters, M. J., Meunier, F. A., Kragelund, Birthe Brandt & Brooks, A. J., 2023, I: Cell Reports. 42, 5, 26 s., 112490.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Muscle PGC-1α modulates hepatic mitophagy regulation during aging

    Christensen, N. M., Jørgensen, Stine Ringholm, Buch, B. T., Gudiksen, Anders, Halling, Jens Frey & Pilegaard, Henriette, 2023, I: Experimental Gerontology. 172, 9 s., 112046.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    The extinct Sicilian wolf shows a complex history of isolation and admixture with ancient dogs

    Ciucani, M. M., Ramos-Madrigal, J., Hernández-Alonso, G., Carmagnini, A., Aninta, S. G., Sun, X., Scharff-Olsen, C. H., Lanigan, L. T., Fracasso, I., Clausen, C. G., Aspi, J., Kojola, I., Baltrūnaitė, L., Balčiauskas, L., Moore, J., Åkesson, M., Saarma, U., Hindrikson, M., Hulva, P., Bolfíková, B. Č. & 19 flere, Nowak, C., Godinho, R., Smith, S., Paule, L., Nowak, S., Mysłajek, R. W., Lo Brutto, S., Ciucci, P., Boitani, L., Vernesi, C., Stenøien, H. K., Smith, O., Frantz, L., Rossi, L., Angelici, F. M., Cilli, E., Sinding, Mikkel Holger Strander, Gilbert, M Thomas P & Gopalakrishnan, Shyam, 2023, I: iScience. 26, 8, 22 s., 107307.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Drosophila TNF/TNFRs: At the crossroad between metabolism, immunity, and tissue homeostasis

    Colombani, Julien & Andersen, Ditte Skovaa, 2023, I: FEBS Letters. 597, 19, s. 2416-2432 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Legionella maioricensis sp. nov., a new species isolated from the hot water distribution systems of a hospital and a shopping center during routine sampling

    Crespi, S., Drašar, V., Salvà-Serra, F., Jaén-Luchoro, D., Piñeiro-Iglesias, B., Lindemann, P. C., Aliaga-Lozano, F., Fernandez Juarez, Victor, Coll-García, G., Moore, E. R. B. & Bennasar-Figueras, A., 2023, I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 73, 1, 12 s., 005686.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Four additional natural 7-deazaguanine derivatives in phages and how to make them

    Cui, L., Balamkundu, S., Liu, C. F., Ye, H., Hourihan, J., Rausch, A., Hauß, C., Nilsson, E., Hoetzinger, M., Holmfeldt, K., Zhang, W., Martinez-Alvarez, L., Peng, X., Tremblay, D., Moinau, S., Solonenko, N., Sullivan, M. B., Lee, Y. J., Mulholland, A., Weigele, P. R. & 3 flere, de Crécy-Lagard, V., Dedon, P. C. & Hutinet, G., 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 17, s. 9214-9226 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Crosstalk between tumor acidosis, p53 and extracellular matrix regulates pancreatic cancer aggressiveness

    Czaplinska, D., Ialchina, Renata, Andersen, Henriette Berg, Yao, Jiayi, Stigliani, Arnaud, Dannesboe, Johs, Flinck, M., Chen, X., Mitrega, J., Gnosa, S. P., Dmytriyeva, O., Alves, F., Napp, J., Sandelin, Albin Gustav & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2023, I: International Journal of Cancer. 152, 6, s. 1210-1225 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Warmer winters result in reshaping of the European beech forest soil microbiome (bacteria, archaea and fungi) - With potential implications for ecosystem functioning

    Dahl, M. B., Kreyling, J., Petters, S., Wang, H., Mortensen, M. S., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Urich, T. & Weigel, R., 2023, I: Environmental Microbiology. 25, 6, 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Investigating Design Rules for Photoinduced Electron Transfer Quenching in Triangulenium Probes

    Jensen, Jesper Dahl, Jakobsen, R. K., Yao, Z. & Laursen, Bo Wegge, 2023, I: Chemistry - A European Journal. 29, 46, 10 s., e202301077.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    A Chinese indicine pangenome reveals a wealth of novel structural variants introgressed from other Bos species

    Dai, X., Bian, P., Hu, D., Luo, F., Huang, Y., Jiao, S., Wang, X., Gong, M., Li, R., Cai, Y., Wen, J., Yang, Q., Deng, W., Nanaei, H. A., Wang, Y., Wang, F., Zhang, Z., Rosen, B. D., Heller, Rasmus & Jiang, Y., aug. 2023, I: Genome Research. 33, 8, s. 1284-1298 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Long-term immersion of compostable plastics in marine aquarium: Microbial biofilm evolution and polymer degradation

    Delacuvellerie, A., Brusselman, A., Cyriaque, V., Benali, S., Moins, S., Raquez, J. M., Gobert, S. & Wattiez, R., 2023, I: Marine Pollution Bulletin. 189, 10 s., 114711.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Ecological Indicator Values for Europe (EIVE) 1.0

    Dengler, J., Jansen, F., Chusova, O., Hüllbusch, E., Nobis, M. P., Van Meerbeek, K., Axmanová, I., Bruun, H. H., Chytrý, M., Guarino, R., Karrer, G., Moeys, K., Raus, T., Steinbauer, M. J., Tichý, L., Tyler, T., Batsatsashvili, K., Bita-Nicolae, C., Didukh, Y., Diekmann, M. & 14 flere, Englisch, T., Fernández-Pascual, E., Frank, D., Graf, U., Hájek, M., Jelaska, S. D., Jiménez-Alfaro, B., Julve, P., Nakhutsrishvili, G., Ozinga, W. A., Ruprecht, E. K., Šilc, U., Theurillat, J. P. & Gillet, F., 2023, I: Vegetation Classification and Survey. 4, s. 7-29 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Role of H+,K+ -ATPase and pH-sensitive K2P channels in pancreatic cancer

    Deshar, Ganga, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 114 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  21. Udgivet

    Circular and Circulating DNA in Inflammatory Bowel Disease: From Pathogenesis to Potential Molecular Therapies

    Di Vincenzo, F., Yadid, Y., Petito, V., Emoli, V., Masi, L., Gerovska, D., Araúzo-Bravo, M. J., Gasbarrini, A., Regenberg, Birgitte & Scaldaferri, F., 2023, I: Cells. 12, 15, 29 s., 1953.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Activation and substrate specificity of the human P4-ATPase ATP8B1

    Dieudonné, T., Kümmerer, Felix, Laursen, M. J., Stock, C., Flygaard, R. K., Khalid, S., Lenoir, G., Lyons, J. A., Lindorff-Larsen, Kresten & Nissen, P., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 14 s., 7492.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Indirect maternal effects via nest microbiome composition drive gut colonization in altricial chicks

    Diez‐Méndez, D., Bodawatta, Kasun Harshana, Freiberga, I., Klečková, I., Jønsson, Knud Andreas, Poulsen, Michael & Sam, K., 2023, I: Molecular Ecology. 32, 13, s. 3657-3671 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Out with a flash: Inactivation mechanism, structure and kinetics of copepod luciferases with gaussia luciferase as a representative example

    Dijkema, F. M., 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 255 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  25. Udgivet

    DoxoDB: A Database for the Expression Analysis of Doxorubicin-Induced lncRNA Genes

    Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 4, 24 s., 39.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    T2DB: A Web Database for Long Non-Coding RNA Genes in Type II Diabetes

    Distefano, R., Ilieva, M., Madsen, J. H., Ishii, H., Aikawa, M., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: Non-coding RNA. 9, 3, 20 s., 30.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt