- Udgivet
SOAPdenovo-Trans: de novo transcriptome assembly with short RNA-Seq reads
Xie, Y., Wu, G., Tang, J., Luo, R., Patterson, J., Liu, S., Huang, W., He, G., Gu, S., Li, S., Zhou, X., Lam, T., Li, Y., Xu, X., Wong, G. K. & Wang, J., 2014, I: Bioinformatics. 30, 12, s. 1660-1666 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Noninvasive prenatal paternity testing by maternal plasma DNA sequencing in twin pregnancies
Xie, Y., Qu, N., Lin, S., Jiang, H., Zhang, Y., Zhang, X., Liang, H., Chen, F. & Ou, X., 2020, I: Electrophoresis. 41, 12, s. 1095-1102Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatial chromatin accessibility sequencing resolves high-order spatial interactions of epigenomic markers
Xie, Y., Ruan, F., Li, Y., Luo, M., Zhang, C., Chen, Z., Xie, Z., Weng, Z., Chen, W., Chen, W., Fang, Y., Sun, Y., Guo, M., Wang, J., Xu, S., Wang, H. & Tang, C., 2024, I: eLife. 12, 20 s., RP87868.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shotgun metagenomics of 250 adult twins reveals genetic and environmental impacts on the gut microbiome
Xie, H., Guo, R., Zhong, H., Feng, Q., Lan, Z., Qin, B., Ward, K. J., Jackson, M. A., Xia, Y., Chen, X., Chen, B., Xia, H., Xu, C., Li, F., Xu, X., Al-Aama, J. Y., Yang, H., Wang, J., Kristiansen, K., Wang, J. & 5 flere, , 2016, I: Cell Systems. 3, 6, s. 572-584.e3 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An integrated gene catalog and over 10,000 metagenome-assembled genomes from the gastrointestinal microbiome of ruminants
Xie, F., Jin, W., Si, H., Yuan, Y., Tao, Y., Liu, J., Wang, X., Yang, C., Li, Q., Yan, X., Lin, L., Jiang, Q., Zhang, L., Guo, C., Greening, C., Heller, R., Guan, L. L., Pope, P. B., Tan, Z., Zhu, W. & 4 flere, , 2021, I: Microbiome. 9, 20 s., 137.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
ERK and USP5 govern PD-1 homeostasis via deubiquitination to modulate tumor immunotherapy
Xiao, X., Shi, J., He, C., Bu, X., Sun, Y., Gao, M., Xiang, B., Xiong, W., Dai, P., Mao, Q., Xing, X., Yao, Y., Yu, H., Xu, G., Li, S., Ren, Y., Chen, B., Jiang, C., Meng, G., Lee, Y. R. & 4 flere, , 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 19 s., 2859.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
High-fat feeding rather than obesity drives taxonomical and functional changes in the gut microbiota in mice
Xiao, L., Sonne, S. B., Feng, Q., Chen, N., Xia, Z., Li, X., Fang, Z., Zhang, D., Fjære, E., Midtbø, L. K., Derrien, M., Hugenholtz, F., Tang, L., Li, J., Zhang, J., Liu, C., Hao, Q., Vogel, U. B., Mortensen, A., Kleerebezem, M. & 8 flere, , 8 apr. 2017, I: Microbiome. 5, 12 s., 43.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A catalog of the mouse gut metagenome: [incl. Author Correction]
Xiao, L., Feng, Q., Liang, S., Sonne, S. B., Xia, Z., Qiu, X., Li, X., Long, H., Zhang, J., Zhang, D., Liu, C., Fang, Z., Chou, J., Glanville, J., Hao, Q., Kotowska, D. E., Colding, C. S., Licht, T. R., Wu, D., Yu, J. & 17 flere, , 2015, I: Nature Biotechnology. 33, 10, s. 1103-1108 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A reference gene catalogue of the pig gut microbiome
Xiao, L., Estellé, J., Kiilerich, P., Ramayo-Caldas, Y., Xia, Z., Feng, Q., Liang, S., Pedersen, A. Ø., Kjeldsen, N. J., Liu, C., Maguin, E., Doré, J., Pons, N., Le Chatelier, E., Prifti, E., Li, J., Jia, H., Liu, X., Xu, X., Ehrlich, S. D. & 4 flere, , 2016, I: Nature Microbiology. 1, 6 s., 16161.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of a disease-causing mutation in a Chinese patient with retinitis pigmentosa by targeted next-generation sequencing
Xiao, J., Guo, X., Wang, Y., Shao, M., Wei, X., Du, L., Li, L., Sun, Y. & Yang, Y., 8 nov. 2017, I: European Journal of Ophthalmology. 27, 6, s. 791-796 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- E-pub ahead of print
Hypoxia in tomato (Solanum lycopersicum) fruit during ripening: Biophysical elucidation by a 3D reaction–diffusion model
Xiao, H., Verboven, P., Tong, Shuai, Pedersen, Ole & Nicolaï, B., 2024, (E-pub ahead of print) I: Plant Physiology.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hypoxia in tomato fruit during ripening caused by contrasting tissue-specific diffusion resistance and respiration
Xiao, H., Tong, Shuai, Salagovic, J., Pedersen, Ole, Verboven, P. & Nicolaï, B. M., 2022, s. 48.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Integrative analysis of genomic sequencing data reveals higher prevalence of LRP1B mutations in lung adenocarcinoma patients with COPD
Xiao, D., Li, F., Pan, H., Liang, H., Wu, K. & He, J., 18 maj 2017, I: Scientific Reports. 7, 8 s., 2121.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enhancing CRISPR-Cas9 gRNA efficiency prediction by data integration and deep learning
Xiang, X., Corsi, G. I., Anthon, C., Qu, K., Pan, X., Liang, X., Han, P., Dong, Z., Liu, L., Zhong, J., Ma, T., Wang, J., Zhang, X., Jiang, H., Xu, F., Liu, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Bolund, L. & 4 flere, , 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 9 s., 3238.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification and functional analysis of circulating extrachromosomal circular DNA in schizophrenia implicate its negative effect on the disorder
Xiang, X., Pan, Xiaoguang, Lv, W., Chen, S., Li, J., Zhang, H., Liao, Y., Yu, J., Li, J., Dang, Y., You, Z., Wang, L., Chen, W., Han, Peng & Tang, J., 2023, I: Clinical and Translational Medicine. 13, 11, 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Single base-resolution methylome of the silkworm reveals a sparse epigenomic map
Xiang, H., Zhu, J., Chen, Q., Dai, F., Li, X., Li, M., Zhang, H., Zhang, G., Li, D., Dong, Y., Zhao, L., Lin, Y., Cheng, D., Yu, J., Sun, J., Zhou, X., Ma, K., He, Y., Zhao, Y., Guo, S. & 13 flere, , 2010, I: Nature Biotechnology. 28, 5, s. 516-20 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Global dispersal and adaptive evolution of domestic cattle: a genomic perspective
Xia, X., Qu, K., Wang, Y., Sinding, Mikkel Holger Strander, Wang, F., Hanif, Q., Ahmed, Z., Lenstra, J. A., Han, J., Lei, C. & Chen, N., 2023, I: Stress Biology. 3, 1, 13 s., 8.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete resequencing of 40 genomes reveals domestication events and genes in silkworm (Bombyx)
Xia, Q., Guo, Y., Zhang, Z., Li, D., Xuan, Z., Li, Z., Dai, F., Li, Y., Cheng, D., Li, R., Cheng, T., Jiang, T., Becquet, C., Xu, X., Liu, C., Zha, X., Fan, W., Lin, Y., Shen, Y., Jiang, L. & 38 flere, , 2009, I: Science. 326, 5951, s. 433-6 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ursolic acid induces cell death and modulates autophagy through JNK pathway in apoptosis-resistant colorectal cancer cells
Xavier, C. P. R., Lima, C. F., Pedro, D. F. N., Wilson, J. M., Kristiansen, Karsten & Pereira-Wilson, C., 2013, I: Journal of Nutritional Biochemistry. 24, 4, s. 706-712 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel Sequencing Approaches for the High-Throughput Identification of Full-length Poly(A) RNA Transcripts at the Single-cell Level
XIE, Z., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 88 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
The needle mycobiome of Picea glauca – A dynamic system reflecting surrounding environment and tree phenological traits
Würth, D. G., Dahl, M. B., Trouillier, M., Wilmking, M., Unterseher, M., Scholler, M., Sørensen, Søren Johannes, Mortensen, M. & Schnittler, M., 2019, I: Fungal Ecology. 41, s. 177-186 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic structure of fragmented November moth (Lepidoptera: Geometridae) populations in farmland
Wynne, I. R., Loxdale, H. D., Brookes, C. P. & Woiwod, I. P., 2003, I: Biological Journal of the Linnean Society. Vol. 78, Issue 4, s. 467-477Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
When less is more: shortening the Lpp protein leads to increased vancomycin resistance in Escherichia coli
Wykes, H., Le, Van Hung Vuong, Olivera, Catrina Diane Peralta & Rakonjac, J., 2023, I: Journal of Antibiotics. 76, s. 746-750 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Purification and sequence determination of a yellow protein from sexually mature males of the desert locust, Schistocerca gregaria
Wybrandt, G. B. & Andersen, S. O., 2001, I: Insect Biochemistry and Molecular Biology. 31, s. 1183-1189Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cuticle-catalyzed coupling between polyamino acids and N-acetyldopamine
Wybrandt, G. B. & Andersen, S. O., 1994, I: BBA General Subjects. 1201, s. 15-18Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Historical mammal extinction on Christmas Island (Indian Ocean) correlates with introduced infectious disease
Wyatt, K. B., Campos, P. F., Gilbert, M Thomas P, Kolokotronis, S., Hynes, W. H., DeSalle, R., Daszak, P., MacPhee, R. D. E. & Greenwood, A. D., 2008, I: PLoS ONE. 3, 11, s. e3602Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Histone H3 lysine 56 acetylation and the response to DNA replication fork damage
Wurtele, H., Kaiser, G. S., Bacal, J., St-Hilaire, E., Lee, E., Tsao, S., Dorn, J., Maddox, P., Lisby, Michael, Pasero, P. & Verreault, A., 2012, I: Molecular and Cellular Biology. 32, 1, s. 154-172 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The genome of the fire ant Solenopsis invicta
Wurm, Y., Wang, J., Riba-Grognuz, O., Corona, M., Nygaard, S., Hunt, B. G., Ingram, K. K., Falquet, L., Nipitwattanaphon, M., Gotzek, D., Dijkstra, M. B., Oettler, J., Comtesse, F., Shih, C-J., Wu, W-J., Yang, C-C., Thomas, J., Beaudoing, E., Pradervand, S., Flegel, V. & 18 flere, , 2011, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108, 14, s. 5679-84 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Co-expression of mCysLT1 receptors and IK channels in Xenopus laevis oocytes elicits LTD4-stimulated IK current, independent of an increase in [Ca2+]i.
Wulff, T., Hougaard, C., Klærke, Dan Arne & Hoffmann, E. K., 2004, I: BBA General Subjects. 1660, 1-2, s. 75-9 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
mCysLT1 receptor mediated activation of various K+ channels by co-expression in Xenopus laevis oocytes
Wulff, T., Hougaard, C., Klærke, D. A. & Hoffmann, E. K., 2004, I: Acta Physiologica (Print Edition). A45-A163, s. A139Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Investigation of two different anoxia models by 2-dimensional gel electrophoresis
Wulff, T., Jessen, F. & Hoffmann, E. K., 2006, I: The FASEB Journal. 5, s. A1433Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning
- Udgivet
A comparison of two anoxia models by 2-DE and MS/MS
Wulff, T., 2008, Department of Biology: Museum Tusculanum. 198 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Comparison of two anoxia models in rainbow trout cells by a 2-DE and MS/MS-based proteome approach.
Wulff, T., Hoffmann, E. K., Roepstorff, P. & Jessen, F., 2008, I: Proteomics. 8, 10, s. 2035-44 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Activation of certain K+ channels by the eicosanoid leukotrine D4 (LTD4)
Wulff, T., Hougaard, C., Klaerke, D. A. & Hoffmann, E. K., 2003, I: Molecular Biology of the Cell. s. 222aPublikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Long term anoxia in rainbow trout investigated by 2-DE and MS/MS.
Wulff, T., Jessen, F., Roepstorff, P. & Hoffmann, E. K., 2008, I: Proteomics. s. 1009 - 1018Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ocean acidification and desalination: climate-driven change in a Baltic Sea summer microplanktonic community
Wulff, A., Karlberg, M., Olofsson, M., Torstensson, A., Riemann, Lasse, Steinhoff, F. S., Mohlin, M., Ekstrand, N. & Chierici, M., 1 apr. 2018, I: Marine Biology. 165, 4, 15 s., 63.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Next Generation Sequencing Library Preparation Technologies and Applications
Wu, Zongze, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 143 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Nanopore-based long-read metagenomics uncover the resistome intrusion by antibiotic resistant bacteria from treated wastewater in receiving water body
Wu, Bruce, Che, Y., Dang, C., Zhang, M., Zhang, X., Sun, Y., Li, X., Zhang, T. & Xia, Y., 2022, I: Water Research. 226, 10 s., 119282.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Atmospheric brightening counteracts warming-induced delays in autumn phenology of temperate trees in Europe
Wu, Z., Chen, S., De Boeck, H. J., Stenseth, N. C., Tang, Jing, Vitasse, Y., Wang, S., Zohner, C. & Fu, Y. H., 2021, I: Global Ecology and Biogeography. 30, 12, s. 2477-2487 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The sensitivity of ginkgo leaf unfolding to the temperature and photoperiod decreases with increasing elevation
Wu, Z., Lin, C., Wang, S., Gong, Y., Fu, Y. H., Tang, Jing, De Boeck, H. J., Vitasse, Y. & Zhao, Y., 2022, I: Agricultural and Forest Meteorology. 315, 8 s., 108840.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cooperative microbial interactions drive spatial segregation in porous environments
Wu, Y., Fu, C., Peacock, C. L., Sørensen, Søren Johannes, Redmile-Gordon, M. A., Xiao, K. Q., Gao, C., Liu, J., Huang, Q., Li, Z., Song, P., Zhu, Y., Zhou, J. & Cai, P., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 14 s., 4226.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tumor suppressor ASXL1 is essential for the activation of INK4B expression in response to oncogene activity and anti-proliferative signals
Wu, X., Bekker-Jensen, I. H., Christensen, J., Rasmussen, K. D., Sidoli, S., Qi, Y., Kong, Y., Wang, X., Cui, Y., Xiao, Z., Xu, G., Williams, K., Rappsilber, J., Sønderby, C. K., Winther, Ole, Jensen, O. N. & Helin, K., 2015, I: Cell Research. 25, s. 1205-1218 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fbxl10/Kdm2b recruits polycomb repressive complex 1 to CpG islands and regulates H2A ubiquitylation
Wu, X., Johansen, Jens Vilstrup & Helin, K., 28 mar. 2013, I: Molecular Cell. 49, 6, s. 1134-46 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conformational heterogeneity of Savinase from NMR, HDX-MS and X-ray diffraction analysis
Wu, S., Nguyen, T. T. T. N., Moroz, O. V., Turkenburg, J. P., Nielsen, J. E., Wilson, K. S., Rand, Kasper Dyrberg & Teilum, Kaare, 2020, I: PeerJ. 8, 17 s., e9408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic Properties of Savinase by Integrative Structural Biology — Indications to Structural Stability
Wu, S., 2017, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 253 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Integrated genome sequence and linkage map of physic nut (Jatropha curcas L.), a biodiesel plant
Wu, P., Zhou, C., Cheng, S., Wu, Z., Lu, W., Han, J., Chen, Y., Chen, Y., Ni, P., Wang, Y., Xu, X., Huang, Y., Song, C., Wang, Z., Shi, N., Zhang, X., Fang, X., Yang, Q., Jiang, H., Chen, Y. & 5 flere, , 2015, I: Plant Journal. 81, 5, s. 810-821 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The RNA exosome shapes the expression of key protein-coding genes
Wu, M., Karadoulama, Evdoxia, Lloret-llinares, M., Rouviere, J. O., Vaagensø, C. S., Moravec, M., Li, B., Wang, J., Wu, G., Gockert, M. A. M., Pelechano, V., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2020, I: Nucleic Acids Research. 48, 15, s. 8509-8528Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Investigation of the Impact of the RNA Exosome on Cellular Transcriptome and Function
Wu, M., 2021, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 154 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Computational identification of signals predictive for nuclear RNA exosome degradation pathway targeting
Wu, M., Schmid, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2022, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 4, 3, 18 s., lqac071.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interaction of extremophilic archaeal viruses with human and mouse complement system and viral biodistribution in mice
Wu, L., Uldahl, K. B., Chen, F., Benasutti, H., Logvinski, D., Vu, V., Banda, N. K., Peng, Xu, Simberg, D. & Moghimi, S. M., okt. 2017, I: Molecular Immunology. 90, s. 273-279 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Flest downloads
-
32536
downloads
Genetic diversity within lichen photobionts of the Lecanora varia group (Lichenes, Ascomycota)
Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
Udgivet -
9022
downloads
Long-term survival of dinoflagellate cysts in anoxic marine sediments.
Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
Udgivet -
7536
downloads
Danmarks biodiversitets fremtid: de væsentligste udfordringer og højest prioriterede virkemidler
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til rapport › Forskning
Udgivet
Seneste publikationer
Recommendations for the Organisational Framework for Excellence at UCPH
Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Rådgivning › fagfællebedømt
Fremme af spontan vegetation efter gran
Publikation: Andet › Udgivelser på nettet - Net-publikation › Formidling
A region of suppressed recombination misleads neoavian phylogenomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt