Biologisk Institut

 

 
  1. Udgivet

    Single-cell exome sequencing reveals single-nucleotide mutation characteristics of a kidney tumor: Cell

    Xu, X., Hou, Y., Yin, X., Bao, L., Tang, A., Song, L., Li, F., Tsang, S., Wu, K., Wu, H., He, W., Zeng, L., Xing, M., Wu, R., Jiang, H., Liu, X., Cao, D., Guo, G., Hu, X., Gui, Y. & 19 flere, Li, Z., Xie, W., Sun, X., Shi, M., Cai, Z., Wang, B., Zhong, M., Li, J., Lu, Z., Gu, N., Zhang, X., Goodman, L., Bolund, L., Wang, J., Yang, H., Kristiansen, Karsten, Dean, M., Li, Y. & Wang, J., 2012, I: Cell. 148, 5, s. 886-895 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Evolutionary history influences the effects of water-energy dynamics on oak diversity in Asia

    Xu, X., Wang, Z., Rahbek, Carsten, Lessard, J. & Fang, J., 2013, I: Journal of Biogeography. 40, 11, s. 2146-2155 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Global beta-diversity of angiosperm trees is shaped by Quaternary climate change

    Xu, W. B., Guo, W. Y., Serra-Diaz, J. M., Schrodt, F., Eiserhardt, W. L., Enquist, B. J., Maitner, B. S., Merow, C., Violle, C., Anand, M., Belluau, M., Bruun, H. H., Byun, C., Catford, J. A., Cerabolini, B. E. L., Chacón-Madrigal, E., Ciccarelli, D., Cornelissen, J. H. C., Dang-Le, A. T., de Frutos, A. & 39 flere, Dias, A. S., Giroldo, A. B., Gutiérrez, A. G., Hattingh, W., He, T., Hietz, P., Hough-Snee, N., Jansen, S., Kattge, J., Komac, B., Kraft, N. J. B., Kramer, K., Lavorel, S., Lusk, C. H., Martin, A. R., Ma, K. P., Mencuccini, M., Michaletz, S. T., Minden, V., Mori, A. S., Niinemets, Ü., Onoda, Y., Onstein, R. E., Peñuelas, J., Pillar, V. D., Pisek, J., Pound, M. J., Robroek, B. J. M., Schamp, B., Slot, M., Sun, M., Sosinski, Ê. E., Soudzilovskaia, N. A., Thiffault, N., van Bodegom, P. M., van der Plas, F., Zheng, J., Svenning, J. C. & Ordonez, A., 2023, I: Science Advances. 9, 14, 19 s., eadd8553.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Deepened snow in combination with summer warming increases growing season nitrous oxide emissions in dry tundra, but not in wet tundra

    Xu, W., Frendrup, L. L., Michelsen, Anders, Elberling, Bo & Ambus, Per Lennart, 2023, I: Soil Biology and Biochemistry. 180, 12 s., 109013.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Deepened snow enhances gross nitrogen cycling among Pan-Arctic tundra soils during both winter and summer

    Xu, W., Priemé, Anders, Cooper, E. J., Mörsdorf, M. A., Semenchuk, P., Elberling, Bo, Grogan, P. & Ambus, Per Lennart, 1 sep. 2021, I: Soil Biology and Biochemistry. 160, 13 s., 108356.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    An efficient pipeline for ancient DNA mapping and recovery of endogenous ancient DNA from whole-genome sequencing data

    Xu, W., Lin, Y., Zhao, K., Li, H., Tian, Y., Ngatia, J. N., Ma, Y., Sahu, S. K., Guo, H., Guo, X., Xu, Y. C., Liu, Huan, Kristiansen, Karsten, Lan, T. & Zhou, X., 2021, I: Ecology and Evolution. 11, 1, s. 390-401 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Two novel truncating variants of the ASPM gene identified in a nonconsanguineous Chinese family associated with primary microcephaly

    Xu, S., Zhang, W., Zhou, R., Huang, H., Chen, W., Xiang, W., Liu, L. & Song, J., 2022, I: Clinical Dysmorphology. 31, 1, s. 1-5 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    The Discovery of Anti-defense Genes in Archaea

    Xu, Shuanshuan, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 117 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  9. Udgivet

    Association analysis of the MHC in Lupus nephritis

    Xu, R., Li, Q., Liu, R., Shen, J., Li, M., Zhao, M., Wang, M., Liao, Q., Mao, H., Li, Z., Zhou, N., Yin, P., Li, Y., Tang, X., Wu, T., Zhong, Z., Wang, Y., Ai, Z., Wang, O., Chen, N. & 23 flere, Yang, X., Fang, J., Fu, P., Gu, J., Ye, K., Chen, J., Dai, L., Liu, H., Liu, Z., Liao, Y., Wan, J., Ding, G., Zhao, J., Zhang, H., Fu, S., Sun, L., Zhang, X., Yang, H., Wang, J., Wang, J., Liu, J., Li, Y. & Yu, X., nov. 2017, I: Journal of the American Society of Nephrology. 28, 11, s. 3383-3394 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Dynamic evolutionary history and gene content of sex chromosomes across diverse songbirds

    Xu, L., Auer, G., Peona, V., Suh, A., Deng, Y., Feng, S., KU, thw266, Blom, M. P. K., Christidis, L., Prost, S., Irestedt, M. & Zhou, Q., 2019, I: Nature Ecology and Evolution. 3, 5, s. 834-844 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Genomic and microbial factors affect the prognosis of anti-pd-1 immunotherapy in nasopharyngeal carcinoma

    Xu, L., Ma, Y., Fang, Chao, Peng, Z., Gao, F., Moll, J. M., Qin, S., Yu, Q., Hou, Y., Kristiansen, Karsten, Fang, W., Brix, S. & Zhang, L., 2022, I: Frontiers in Oncology. 12, 11 s., 953884.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Distinct nutritional and endocrine regulation of prothoracic gland activities underlies divergent life history strategies in Manduca sexta and Drosophila melanogaster

    Xu, L. C., Nunes, C., Wang, V. R., Saito, A., Chen, T., Basak, P., Chang, J. J., Koyama, Takashi & Suzuki, Y., 2020, I: Insect Biochemistry and Molecular Biology. 119, 13 s., 103335.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Distinctly different behavioral responses of a copepod, Temora longicornis, to different strains of toxic dinoflagellates, Alexandrium spp.

    Xu, J., Hansen, Per Juel, Nielsen, L. T., Krock, B., Tillmann, U. & Kiørboe, T., feb. 2017, I: Harmful Algae. 62, s. 1-9 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Transcriptomic Profile of the Mouse Postnatal Liver Development by Single-Nucleus RNA Sequencing

    Xu, J., Hao, S., Shi, Q., Deng, Q., Jiang, Y., Guo, P., Yuan, Y., Shi, X., Shangguan, S., Zheng, H., Lai, G., Huang, Y., Wang, Y., Song, Y., Liu, Y., Wu, L., Wang, Z., Cheng, J., Wei, X., Cheng, M. & 6 flere, Lai, Y., Volpe, G., Esteban, M. A., Hou, Y., Liu, C. & Liu, L., 2022, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 11 s., 833392.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    A spatiotemporal atlas of mouse liver homeostasis and regeneration

    Xu, J., Guo, P., Hao, S., Shangguan, S., Shi, Q., Volpe, G., Huang, K., Zuo, J., An, J., Yuan, Y., Cheng, M., Deng, Q., Zhang, X., Lai, G., Nan, H., Wu, B., Shentu, X., Wu, L., Wei, X., Jiang, Y. & 38 flere, Huang, X., Pan, F., Song, Y., Li, R., Wang, Z., Liu, C., Liu, S., Li, Y., Yang, T., Xu, Z., Du, W., Li, L., Ahmed, T., You, K., Dai, Z., Li, L., Qin, B., Li, Y., Lai, L., Qin, D., Chen, J., Fan, R., Li, Y., Hou, J., Ott, M., Sharma, A. D., Cantz, T., Schambach, A., Kristiansen, Karsten, Hutchins, A. P., Göttgens, B., Maxwell, P. H., Hui, L., Xu, X., Liu, L., CHEN, Ao, Lai, Y. & Esteban, M. A., 2024, I: Nature Genetics. 56, s. 953-969 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Deep sequencing of 1320 genes reveals the landscape of protein-truncating variants and their contribution to psoriasis in 19,973 Chinese individuals

    Xu, H., Zhen, Q., Bai, M., Fang, L., Zhang, Y., Li, B., Ge, H., Moon, S., Chen, W., Fu, W., Xu, Q., Zhou, Y., Yu, Y., Lin, L., Yong, L., Zhang, T., Chen, S., Liu, S., Zhang, H., Chen, R. & 8 flere, Cao, L., Zhang, Y., Zhang, R., Yang, H., Hu, X., Akey, J. M., Jin, X. & Sun, L., 2021, I: Genome Research. 31, 7, s. 1150-1158 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Mucosal vaccination with heterologous viral vectored vaccine targeting subdominant SIV accessory antigens strongly inhibits early viral replication

    Xu, H., Andersson, A. C., Ragonnaud, Emeline, Boilesen, D., Tolver, Anders, Jensen, Benjamin Anderschou Holbech, Blanchard, J. L., Nicosia, A., Folgori, A., Colloca, S., Cortese, R., Thomsen, Allan Randrup, Christensen, Jan Pravsgaard, Veazey, R. S. & Holst, Peter Johannes, apr. 2017, I: EBioMedicine. 18, s. 204–215 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Application of Next-­generation Sequencing Technology in Reproductive/Developmental Sciences and Diagnostics

    Xu, F., 2018, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  19. Udgivet

    Survival and Genome Diversity of Vibrio parahaemolyticus Isolated from Edible Aquatic Animals

    Xu, D., Peng, Xu, Xie, L. & Chen, L., 2022, I: Diversity. 14, 5, 23 s., 350.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Novel tRNA Gene Rearrangements in the Mitochondrial Genomes of Poneroid Ants and Phylogenetic Implication of Paraponerinae (Hymenoptera: Formicidae)

    Xiong, Z., He, Ding, Guang, X. & Li, Q., 2023, I: Life. 13, 10, 17 s., 2068.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Draft genome of the leopard gecko, Eublepharis macularius

    Xiong, Z., Li, F., Li, Q., Zhou, L., Gamble, T., Zheng, J., Kui, L., Li, C., Li, S., Yang, H. & KU, thw266, 2016, I: GigaScience. 5, 6 s., 47.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    An esophageal squamous cell carcinoma classification system that reveals potential targets for therapy

    Xiong, T., Wang, M., Zhao, J., Liu, Q., Yang, C., Luo, W., Li, X., Yang, H., Kristiansen, Karsten, Roy, B. & Zhou, Y., 25 jul. 2017, I: OncoTarget. 8, 30, s. 49851-49860 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Chord: an ensemble machine learning algorithm to identify doublets in single-cell RNA sequencing data

    Xiong, K., Zhou, H., Lin, C., Yin, J., Kristiansen, Karsten, Yang, H. & Li, G., 2022, I: Communications Biology . 5, 11 s., 510.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    RED-ML: a novel, effective RNA editing detection method based on machine learning

    Xiong, H., Liu, D., Li, Q., Lei, M., Xu, L., Wu, L., Wang, Z., Ren, S., Li, W., Xia, M., Lu, L., Lu, H., Hou, Y., Zhu, S., Liu, X., Sun, Y., Wang, J., Yang, H., Wu, K., Xu, X. & 1 flere, Lee, L. J., maj 2017, I: GigaScience. 6, 5, s. 1-8 8 s., gix012.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Sulfolobus Replication Factor C stimulates the activity of DNA Polymerase B1

    Xing, X., Zhang, L., Guo, L., She, Q. & Huang, L., 2014, I: Journal of Bacteriology. 196, 13, s. 2367-2375 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt